Indonesi an  Journa of El ec t ri cal Engineer ing  an d  Comp ut er  Scie nce   Vo l.  9,  No.  3,   Ma rch   2018,  pp.  72 2 ~ 7 30   IS S N: 25 02 - 4752, DO I: 10 .11 591/ijeecs .v9.i 3.pp 72 2 - 7 30          722       Journ al h om e page http: // ia es core.c om/j ourn als/i ndex. ph p/ij eecs   Assessin g t h e Crown  Closu re of  Nypa on  UAV  Im ages usin Mean - Sh ift Segmentati on  Algorith m       Robert  Pa r uli an   Sil ala hi 1 ,  I Nen gah Sura t i Jay a 2 , T atang Ti ry ana 3 , F ai rus Mul ia 4   1, Bogor   Agric ul t ura Univ ersity ,   Campus   IPB Dramaga, Bogor, I ndonesia     2 ,3 Depa rtment   of   Forest  Man agem ent ,   Fa cul t y   of   Forestr y ,   Bogor   Agric ul tura l   Un ive rsit y ,   Campus   IPB Dramaga,   Bogor,   Indon esia       Art ic le  In f o     ABSTR A CT    Art ic le  history:   Re cei ved   Sep  19, 201 7   Re vised Dec  30, 2 017   Accepte Ja n 1 7,   2018       Util izati on  of  v er y   h igh - re solu t ion  images  becom es  new  tre nd  in  fore st   m ana gement,  pa rti cularl y   in  the   det e ct ion   and  id ent ifica ti on  of   f ore st  stand   var ia b le s.  Thi p ape d esc ribe th use  of  m ea n - s hift   segm ent at io al gori thm  on  unm anne ae rial  vehi c le (UA V)  i m age to  m ea sure  cro w cl osure  of  n y pa   (N y pa  fru ticans)  and   gap .   T he  27  combinat i ons  of  the  par am et er   val u es   such  as  spatial  r adi us  (hs),  r ange  ra dius  (hr) ,   and   m ini m um   re gion  size   (M) .   Gap  det e ct ion  an n y pa crown  clos ure   m ea surem ent s were   per for m ed  using a   h y brid  b et wee n   pixe l - base ( m axi m um   li kel ihood  cl assifie r)   and  obje ct - base appr oac h es  (segm ent at i on).     For  eva luation  of  the   appr oach   per form anc e ,   th ac cur acy   asses sm ent   was  done   b y   compari ng  obje c t - b ase d   cl assifi ca t ion  re s ult (segm ent ati on)  and  visua in te rpre ta t ion  (gro und  che ck ).  The   stud y   found   tha t the   b est com bina ti on   of  segm ent a ti on  p ara m eter  was t h e   combinat ion  of  hs  10,   hr  10  and  50,   with  the   over a ll   a cc ur a c y   of  76 , 6%   and  kapp a accur acy   of   55. 7% .   Ke yw or d s :   Nypa   U nm ann e ae rial  v ehicl es  (UAV)   M ean - s hift   S egm entat ion   Copyright   ©   201 8   Instit ut o f Ad vanc ed   Engi n ee r ing  and  S cienc e   Al l   rights re serv ed .   Corres pond in Aut h or :   Rob e rt Pa ru li a Sil al ahi   Bogor A gr ic ultur al   U niv er sit y, Ca m pu s IPB   Dr am aga,    Bogor,  Ind on e sia  1668 0   Em a il ins - j ay a@ap ps .i pb.ac.i d       1.   INTROD U CTION     Ind on esi is  on of   th tro pica countries  ha vi ng   wide  var i et of   ecosyst e m s ,   sta rting   from   coastal  forest / lowla nd   (m ang rove,  sw a m forest,  pe at   swam fo res t ) dry - lo la nd  f or e st,  up   to  m ou ntain ous   f or est s su b - al pi ne  a nd  al pin e ) T obta in  s ound  basis  f orest   m anag em ent  pla nn i ng,  the re  is   nee to  pr ov i de  accurate  a nd  t i m ely  su pp or ti ng  data   relat ed  to   ecosyst e m   ty pe,   forest   cl asses,  forest   de ns it y,  biodi ver sit y,  sta nd i ng   stoc k,  et c.  On of  the  un i qu ec os yst em   ty pes,   wh ic ec onom ic al l y,  ecolog ic al ly so ci al l an culturall play an  i m po rtant   ro le   is  the  m angr ov ec os yst e m In   Indon esi a,  this  m ang r ove  ecosyst e m   is   highly   vu l ner a ble  ecosyst em   to  co nv e rsion.  On of  the  veget at ion   that  go es  into  a ass oc ia ti on   of  m ang r ove   ecosyst em   is  nypa  ( Ny pa  frut ic an s ).   Nypa   veg et at io is  c omm on   in  est uar a reas  a ffec te by   ti de  [ 1].  I Ind on esi a ,   the  inf or m at ion   on   the  dynam ic   g r ow t h,   sta tus  and  pote ntial   of  ny pa  has  not  bee m uch   st ud ie d,   since  the  nypa   ecosyst em   is  le ss  at tract ive  and   e ve f requen tl co ns ide red   as  wastel a nd.  S om research e r s   ind ic at that  ny pa  veg et at io can  pro vid po te ntial   econom ic  value,   ei ther  at   sm a ll - sca le   or  la rg e - s cal e   bu si ness.  Ny pa   is  on ty pe  of   ve getat ion   t hat  m ay   pr ov i de  daily   nee pro du ct   f or  ho us e ho l co nsu m pt ion Seve ral  of   ny pa   researc fou nd   that  ny pa   ha po te ntial   to  be  so urce   of   foo beca us of  it have  hig carbo hydr at a nd   protei n   [ 2] ,   e ve acco r din t the   stu dy   [ 3 ] ,   nypa   c onta ins  a et ha no t pr oduce   fu el   energy .   Currentl y,  the  us of  rem ote  sensing  te ch nolog in  natu ral  resou rce  m anag em ent  is  m u st,  an eve for  sm all  sca le   fo rest  m anag em ent .   Now,   t her is  tren of   usi ng  ve ry  h igh - res olu ti on   i m ages   fo detai le forest  m anag em ent  up   to  the  tree - le vel  f or es m anag em ent .   Since  the  la unch  of  natu ral  re so urces  sat el li te for   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci     IS S N:  25 02 - 4752       Assessin t he C ro wn Cl osure  o f N y pa on U AV Im ag es  usi ng Me an - Shif t   ( Rob ert   Paruli an S il al ahi )   723   ci vili an  us i the  19 70 s the  dev el op m ent  of  rem ote  sensi ng   te c hnol og has  grown  rap i dly,  sta rtin f r om   low m od erate   to  ver high  reso l utions.  In  li ne  with   thei de vel op m ent,  the  rem ote  sensing  has  bee al so  widely   us ed  f or   sup portin ei ther  reg i on al   le vel,  nationa le vel  or   ind ivid ual  tree  le vel  fo rest  inv e nt or y .   To day,  the  ad ven of  the  hi gh   a nd   ve ry  hi gh   re s olu ti on   had   pro vid e d   go od  oppo rtu nity   as  wel as  a   chall enge   al at   on ce T he  hig he the   spa ti al   reso l ution,  th m or detai le in form at ion   cou l be  der iv ed,   t he   m or e com plex  and reli able a ppr oac hes  a re r e qu i red.    In   ver hi gh - reso l ution   im a ger y,  the  us of  ordi nar pi xe l - base ap proa ch  su c as  s uperv ise an un s uper vise c la ssifie is   of t en  pro vid e le ss  accu rate  in f or m at ion sinc the  cl assifi c at ion   is  s olely   al on e   base upon  th bri ghtness   va lues  ( re flect ance )   of  t he  obj ect .   T he  a dvent   of  obj ect - base cl assifi cat io te chn iq ue   of te cal le the  obj ect - based  im a ge  analy sis ( O BIA), which c on si der   not o nly t he  br ig htn e s s v al ue s   of   t he  ob j ect   bu al s the  s patia aspect  of  the  obj ect   be ing   a naly zed  has  offer e prom i sing   so lu ti on   to   ov e rc om the  dr a w back   of   t he  existi ng  pi xel - based   a nal ysi s.   The  o bje ct - base proc e ssing   is  c on si de red   to  hav a   bette pe rfor m ance  in  processi ng   hi gh - res olu ti on  di gital   i m age  b ecause,  in  a dd it ion   to  c on si der i ng   the   value o the  p i xel it sel f,  it  als c onsider s the  size (a rea) an d sha pe of  the  obj ect   withi th e i m age.    In   t he  la st  fe w   deca des,   t he  s patia reso l utio of  im ages  ha bee im pr oved  ra pid ly In   add it io to   sat el li te   i m age ry,  one  of  the  i m aging   platfo r m s   that  pr od uc ver hi gh - r es ol utio im ages  is  UAV  ( Un m an n e Aer ia Veh ic le ).   T he   U A i al so  cal le t as   dr on e   ( dy nam ic   rem ote ly   op e rated   na vig at io e quip m ent).   Now  cam era  te chnolo gy  us e in  the   U AV  is  m ai nly   convent ion al   cam era  that  m ay   pr ovid sp at ia res olut io up  to  cm .   H ow e ve r,   it rec ordin platfo r m   is  ver pe rs pecti ve  becaus it   can  be  fl own   un der   t he  cl oud weathe ( fly   be low  the  cl oud) unm ann e d,   l ow   c os t,  fast  a nd   relat ively   low  risk.  Th us,   t he  U AV   te c hnol og beco m es  go od  al te r native  be cause  t he  data  obta ined   w oul be  ver detai l   and   real  ti m e,  as  well   as  c ould  be   ob ta ine easi l with  chea pe r   pri ce T he  u ti li zat ion   of   U AV   te c hnolog has  bee widely   us e to  i m any  aspects  su c as  m app in act ivit [4 ] quantify ing   s patia gap   patte r [5 ] cha ng detect ion   [ 6],   fo rest   inv e nt ory   act ivit ie [7 ] ca nopy  s pectral  m app in [ 8],  m easur in sta nd   va riables  s uch  as  cr own   diam e te r,   canopy  pe rce nt age  an num ber   of   tree [ 9 10]   as  well   as  est i m ation   of  the  sta ndin stock  a nd   sit ind e qu al it y o te ak   sit es [ 11] .   The  In c reasin res olu ti o of  the  di gital   i m a ges  from   low  reso l ution  to  ve ry  hi gh  res ol ution  ha ve   encou rag e dev el op m ent  of   i m age  pr oce s sing.  The  cu rrent  i m age  pr oc essing  tre nds  are  the  us of  obj ect - base cl assifi c at ion  m et ho ds,  as a co m pli m e ntary of th e p i xe l - base a ppr oa ch.   A   pix el - ba sed  a ppr oach   c an be   us e as  lo ng   as   pix el   is  the  s a m siz as  par ti cular  ob j ect   [12].  A ob j ec t - base ap proa ch  is  now  a po pu la appr oach in  hi gh and  ve ry h i gh - re so l ution i m age pro ces sing.    Ba sic al ly t he  o bject - cl assif ic at ion   m et ho c onsist o f   two  par ts  nam el seg m e ntati on  a nd   cl assifi cat ion Conve ntion al l y,  the  se gm entat ion   is  the   init ia process  of   a obj e ct - ba sed  cl assifi e r,  the fo ll owe by  cl assifi cat ion I m age  segm ent at ion   is  gen e ra ll def ined  as  pr oc ess  of  div idin an  im a ge  int gro up s   w hich   are  s patia ll or   s pectrall un ifor m   [13].  Object - based  a ppro ac hes  ha ve  been  ap plied   in  s om works  s uc as   cl assifi cat ion   of  a gr ic ult ur al   l and  usi ng  S POT - [ 14] e xp l or at io of  the   urba in form ation   i Ci anjur   [ 15 ] m app in of   c or al   reef  ha bi ta [16 ] m app in la nd  c ov ers  c hanges  c hanges  i m angr ov ecosyst em [1 7],  detect in of  f or e sts  cha ng es  cause by  hurr ic a nes  [18 ] the  ob j ect - ba sed  cl assifi ca ti on   of   la nd   us e  in O ntario, Ca na da h ad  al s o be e xa m ined  by  [ 19 ] .   In   t his  stu dy,   the  a uthors  fo c us e on  e xam ining   the   ap propriat obj ect - base c la ssific at ion   par am et ers  for   analy zi ng   t he   nypa  c row c losure  da ga p.  This  st ud in te gr at ed  t he  pi xel - based   ap proach  with  m axi m u m   li kelihoo c la ssifie an the  m ean - sh ift  al gorithm   in  segm entat ion   m et hod.   T he  us e   of   th e   m ean - sh i ft  seg m entat ion   al go rithm   is  widely   us ed  i earli er  stu dies  f or  be nth ic   m app in [ 20] en vir on m ental  m anag em ent  m on it or ing   [ 21] la nd   c over  c la ssific at ion   [ 22] cha nge  detect ion   in  SA R   i m age  [23],  m edical   diag nosis  [24].   Although  the   m ean - sh ift  al gorithm   had   be en  su cces f ully   exa m ined  in   cl assify ing   buil ding  obj ect i s ub urba ar ea  [ 25 ] the  a pp li cat ion  in   cl assify ing  ny pa  ve getat ion   is  sti ll   chall eng in g.  U t now ,   ver high - resol ution   im age  ut il iz ation   resea rch   for  nypa  e cosyste m   asse ssm ent  is  still   ver ra re.  The   m ai obj ect ive  of  th stud is  to  dev el op  cl assifi cat ion   te ch nique  for  assessi ng  the  n ypa  c rown   cl osu res  an their   gap   by  com bi ning  the  m ean - s hi ft  segm ent at ion   al gorith m   and   m axi m um   l ikeli ho od   cl assifi er  of   th pix el - base cl assifi c at ion .       2.        RESE A R CH MET HO D   2.1  Si te d escri pt ion       The  resea rc was  co nduct ed  within  t he   con cessi on   area  of   IUP HHK  PT  Ka nd el ia   Alam geog raphical ly   locat ed  bet w een  10 9°34 ' 10 ,82”   E   109°4 1' 14 , 85"  E   and   betwee 0°  35' 18,21 0°39 ' 53, 45 "   S.   A dm inist rati vely the  st ud y   sit is  locat e within   K ub Ra ya   Re gency W est   Kali m antan  Pr ovi nce  (F ig ure  1).  Fiel ob serv at io an f ie ld  m easur em ents  wer c ondu ct e in  20 16,  especial ly   in  area s   cov e re d by U A ( U nm ann ed   Aer ia Veh ic le im ager y.    Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                          IS S N :   2502 - 4752   Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci,   Vo l.   9 ,  No.  3 Ma rc h 201 8   :   72 2     7 30   724       Figure  1.  Stu dy  sit m ap       2.2 Da ta and  So f tware     The  m ai data  us e in  this  stu dy  is  UAV  im age  hav i ng   10  cm   sp at ia re so luti on,  bits   rad iom et ric  value,   ba nds,  nam el Red G ree n,   Bl ue and   Alpha.   The  pr e proc essing   work   s uch   as  recti fi cat ion,   rad i om et ric  co rr ect io n,   a nd   ge om et ric  cor recti on   was  done   by  data  su pp li er.  The  us e UAV  im ages  wh ic cov e ap pro xi m at ely  40 87  ha wer recor de in  Fe bruar y   2016 Ot her   s upportin data   us ed  i this  stud are   the  data  c ollec te from   gr ou nd  m e asur em ents  su c as   an   in div id ual  diam e te of  nypa,  le ng t a nd  diam et er  of   le aves,  num ber   of  le aves,  nu m ber   of  stu m and   weig ht  of   sam ple  nypa   (100 - 200  gra m ).   The  p r oce ssing  and   data  analy sis  wer e   done  us in s om so ftwar su c as   QGIS  2.18,  Orfeo   To olbo Mon te ve rd 1.24,  ERDA S I m agine 9. a nd Mi cro s of t  Ex cel   20 10.       2.3  Fie ld  Me asure men t and Data Pr ocessi ng     2.3.1  Fie ld me as ureme nt     Fo c om par iso an accu rac assess m ent  pu r poses  as  wel as  to  ob ta in  qu a ntit at ive  an qual it at ive   inf or m at ion   ab ou the  a ct ual  conditi on   of  ve getat io i th fiel d ,   the n   groun obse rv at i on   a nd  m easur e m ent  wer perform e d.   T hese  fiel ob s er vations  and   m easur em e nts  wer c onduct ed  on  f our  cl us te plo ts  ha ving  siz of   60  m   100  m Each  cl us te was  div id ed  int 15  s ub  cl us te rs  ( cl us te el em ents),   ha ving  siz of   20   m   20  m   each.  The  posit ion   of  the  cl us te was   m ade  in  su ch  way  so   that  i ts  po sit ion   rela ti vely   per pe nd i cula r   to the ri ve r flo w.     2.3.2 Pr e - pr oc essing     Pr e processin of  U A Vs  inclu des  im age  cro ppin that  fit  the  sel ect ed  cl us te locat ions.  Crop ping  wa s   done  t f a ci li tate  the  pr ocess  of   segm entat ion   a nd  cl assifi c at ion The   siz of  the  U AV  im age  f or   eac area  of   interest   is  1100   11 00  pi xels  or   a ppr ox im at e ly   11 110  m et ers  in  siz e.    T he  area  of  interest   was  sel ect ed  t cov e three  cl asses  nam el m ang r ove,  ny p and   ga p.   Ea ch  cr opping  pr ocess  of  the  a rea  of   inte rest  (A O I)  i m age w as car r ie out by fi rstly   re m ov in th al ph ba nd, so that the im age o nly h as  Re ba nd, Gree n band ,   and Bl ue ba nd.       2.3.3 Se gme ntati on     Segm entat ion   process  is  the   init ia ste i ob j ect - based  i m age  cl assifi cat ion   ( OBI A ),   w he re  it s   cl assifi cat ion   a lgorit hm   was  do ne  by  m erg in sm al le segm ents  into  la r ge ob j ect base on  it hom ogeneit (i.e.,   sim i la rit of   s pectral  va lue  an s patia char act erist ic s)  of  t he  im age.  The   segm entat ion   m e tho use in   this  resea rch   is  us in m ean - s hift  al go rithm   of   Orfe T oo l box/ M on te verdi  1.2 4.  I this  st udy,  the   segm entat ion   appr oach   us ed   was  base on   sp ect ral  an sp at ia app r oac hes.   T he  m ean - sh i ft  al go rit hm   was  first  intr oduce by  [ 26 ]   a nd   has  bee pro ven  that  this   m et ho is   ve rsati le non - pa ram et ric  m e t hod  for  est i m ating   gr a dients  i the  cl us te rin pro cess.   S om research  suc cess fu ll y   im ple m e nted  t he  m et ho f or   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci     IS S N:  25 02 - 4752       Assessin t he C ro wn Cl osure  o f N y pa on U AV Im ag es  usi ng Me an - Shif t   ( Rob ert   Paruli an S il al ahi )   725   so lvi ng   prob le m s   at   low - le ve vision   [ 27] .   The  pa ram et e rs  us e in  se gm enta ti on   pro cess  us in m e an - s hift   al gorithm   are  the  s patia ra diu s,   ra nge  ra di us,   a nd  m ini m u m   reg ion  siz e.    I this   stu dy ,   t he  a uthor e xa m ined   27   c om bin at io ns   of  se gm entat ion   pa ram et ers  to  obta in  se gm entat ion   inf orm ation   on  ca nopy  a nd   ga of   nypa   veg et at io a r esearch  locati on  (Tab le   1) .               Table  1.   C om bin at ion   of the  param et er ex am ined o the  se gm entat ion   No   Settin g   hr   hs   M   Co m b in atio n   No   Settin g   hr   hs   M   Co m b in atio n   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   Settin g  01   Settin g  02   Settin g  03   Settin g  04   Settin g  05   Settin g  06   Settin g  07   Settin g  08   Settin g  09   Settin g  10   Settin g  11   Settin g  12   Settin g  13   Settin g  14   5   5   5   5   5   5   5   5   5   10   10   10   10   10   10   10   10   20   20   20   30   30   30   10   10   10   20   20   50   100   150   50   100   150   50   100   150   50   100   150   50   100   5 - 10 - 50   5 - 10 - 100   5 - 10 - 150   5 - 20 - 50   5 - 20 - 100   5 - 20 - 150   5 - 30 - 50   5 - 30 - 100   5 - 30 - 150   10 - 10 - 50   10 - 10 - 1 0 0   10 - 10 - 1 5 0   10 - 20 - 50   10 - 20 - 1 0 0   15   16   17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27     Settin g  15   Settin g  16   Settin g  17   Settin g  18   Settin g  19   Settin g  20   Settin g  21   Settin g  22   Settin g  23   Settin g  24   Settin g  25   Settin g  26   Settin g  27   10   10   10   10   15   15   15   15   15   15   15   15   15   20   30   30   30   10   10   10   20   20   20   30   30   30   150   50   100   150   50   100   150   50   100   150   50   100   150   10 - 20 - 1 5 0   10 - 30 - 50   10 - 30 - 1 0 0   10 - 30 - 1 5 0   15 - 10 - 50   15 - 10 - 1 0 0   15 - 10 - 1 5 0   15 - 20 - 50   15 - 20 - 1 0 0   15 - 20 - 1 5 0   15 - 30 - 50   15 - 30 - 1 0 0   15 - 30 - 1 5 0   Remarks:    hs     Spatial  r adi us (p i x el) hr  R ange radius/spec tr al   v alue  (DN )   and           M   :   Minim um   re gion   siz (p ix el )       Sp at ia rad ius  is  par am e te that  has  fu nc ti on   to  co ntro l   the  distance,  m easur ed  by    nu m ber   of  pix el s.  T he  s pa ti al   rad ius  wil gr ou num ber   of   pix el i nto   on se gm e nt  or   one  ob j e ct wh e reas  th range  rad i us   is  se gm entat ion   pa ra m et er  that  correspo nd s   to  t he   sp ect ral  valu of  each   pi xe l.   The  ra ng r adius   ref e rs  to  sp ect ral  var ia bili ty   (d ist anc in  n - dim ension al   sp at ia sp ace)  to  gro up   nu m ber   of   pix el s   into  sing le  se gm ent.   Furthe rm or e,  it  is also d efin ed  that t he  m in i m u m   reg ion   siz e (M)  is a p ar a m et er r el at ed  to the   m ini m u m  s iz of  the  nu m ber   of   pix el s that f or m  a sing le  obj ect . O bj ect s t ha t ha ve  the nu m ber  o pix el belo the  pa ram et er  value  will   be  com bin ed  with  t he  nea rest  ob j e ct Af te t he  pa ram et er  values  are  determ ined,   t he   segm entat ion   process  is  perf or m ed  on  al fo ur  res earc cl us te rs At  the  end   proces s,  si nce  the  se gm e ntati on   was   proces sed  on   the  ra ste r - f or m at te data,  an  outp ut  of   th segm entat ion   would  al so   ra ste form at   Fi nal l y,  it  is n eede t o conve rt r ast er   data into  a  vect or form at .           Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                          IS S N :   2502 - 4752   Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci,   Vo l.   9 ,  No.  3 Ma rc h 201 8   :   72 2     7 30   726   Figure  2. Flo w   diag ram  o t he  stu dy pro ce ss    2.3.4  Clas si ficat i on     In   this  stu dy,  the  auth or   a ppli ed  the  hybr i betwee the   obj ect - base (seg m entat ion ,   OBIA)  a nd   pix el - base m axim u m   l ikelih oo cl assifi er   (MLC).  T he  resu lt of   se gm entat ion   cl assifi cat ion   re sul ts  of   segm entat ion   r un   us i ng   O rf e T oo l box/Mo nteve rd i   was  t hen   i nc orporat ed  with   th re su lt of  s up e r vised  cl assifi cat ion   r un   us in ERD AS   im agine.   Du ri ng   the  cl assifi cat ion   us i ng   MLC sever al   cl asses  wer de fine d,   nam ely  nypa  canopy,  m angrove  ca nopy,   bar e   la nd,  ga p,   a nd  water   body T he  r esults  of  s upe rv ise cl assifi cat ion   ha ve  the us e an  at tribu te   of  each  poly gon  ob ta ine du ring   se gm entat i on .   T he  cl assif ic at io ste p ou tl ine i this  stu dy is  dep ic te d i n Fi gure  2.       2.3.5  Accur ac y Assessme nt   On of   t he  im portant  issue in  determ ining   the  optim al   se gm entat ion   is  i the  acc ur acy   assessm en t.  Althou gh the re  are  s om m et h od to  ass ess th e p er f or m ance o f segm entat ion  s uch as  fr a gm entat ion  in de [ 28] ,   the  area  fit  ind ex  [ 29]   and   there  is  al so   ano t her   m et ho to  evaluate  the  segm entat i on   re su lt   us in area,   per im et er  and   sh a pe  ind e x   (SI)  [ 30 ] T his   stud us e co m par ison   betw een  the  segm e ntati on   res ults  with   ref e ren ce  area     To  ide ntify  th m os accurat segm entat ion   pa ram et er  fo asse ssin the  ny pa  cr own  cl osure  a nd   gaps,  the  c onve ntion al   c onf usi on   m at rix  an al ysi was  perf or m ed.   The  da ta   ref ere nce  use f or   e xpressi ng   t he  act ual  crown   c losure  an ga ps  der i ved   is  th data  der i ved   from   visu al   interp retat ion   a nd  groun obse rvat ion.   The  c om par ison  betwee th aut om at ed  cl assifi cat ion   ( OBI a nd  M LC)  was  t hen  us e to  cal cu la te   the  ov e rall  accu rac y (OA)  and  ka pp a  accu racy  a s the  fo ll ows   [ 31 ] .                            1        100       (1)                            1 -                       1   2 -                           100                       (2)     Rem ark s :   OA   : Ov e rall  accu r acy  ( %)   K   : Kappa acc ura cy  ( %)   X ii   : C oin ci de d val ue  (num ber  of  pix el )   N   : Total   pi xel   K   Kappa acc ura cy   (%)   X i+   The  s um  o c olu m j   X +i   The  s um  o f r ow  i     2.3.6  Cro w n   Clos ur e   The  resu lt of   the  accu racy  a ssessm ent  fo al com bin at ion of   t he  pa ra m et er  set ti ng   wer us e t identify   the  optim al   seg m entat ion   param eter s.  T he   best  com bin at ion   of  segm entat ion  par am et er  was  then   us e to   cal cul at the  value   of  cr own   cl osu r e   (Cc)   of  n ypa   in  eac cl us te r.   Pr io t a ny   f ur the proces s,  the   cl us te was  si m ula te into se ver al  p lot form acco rd i ng  to the  sha pe   an s iz of  the f ie ld p lot . S el ect ion  o t he   m os op tim a plo siz si m ul at ion   was  done   by  con si der i ng   the  c oeffici ent  of   c o va riance  (CV val ue   of   the   bio m ass volu m and   nypa   densi ty   var ia ti on.    T he   pe rc entage  of  c rown  cl osure   is  the  rati bet w een  total   crow c ov e rage (m 2 and p l o t si ze (m 2 ).       3.         RESU L TS  A ND AN A LYSIS     The  sel ect io of   t he  best  se gm entat ion   par a m et ers  is  done   by  eval uatin t he  a ver a ge  val ue  of  overall   accuracy  (OA )   an k ap pa  acc ur acy   (KA)  f or  al f our  cl us te rs.   Re ca pitula ti on   of  accu rac values   of   O a nd  KA  are   su m m arized  i Fi gur 3 .   T he  acc uracy   value   was   der i ved  by  c om par ing   the   se gm entat ion   an visu a l   interp retat ion  a s w el l as  fiel d ob s er vation as  ref e ren ce  d at a.   Of   the  27  com bin at io ns   of  th segm entat ion   par am et er  exam ined we  fou nd   t hat  the  rel at ively   hig accuracy  in  pr edict ing   the  c r own  cl osure  of  nypa  we re  pr ov i ded   by  the  set ti ng - 10   (10 - 10 - 50),   set ti ng - 01  ( 5 - 10 - 50),   set ti ng - 04  ( 5 - 20 - 50)  and   set ti ng - 19  (1 5 - 10 - 50 ha ving  overall   accuracy  bet we en  76. 5 an 76. 6 %   and   k a pp acc ur acy  b et wee 55. 6   a nd  55. 7%   (F ig ure  3) .   The  cl assifi cat ion   acc uracy   ob ta ined  by  a pp l yi ng   the   com bin at ion  of   m ean - sh i ft alg or it hm  an pi xe l - base m axi m u m  li kelihood  cl assifi er is s li gh tl y l ow er t han  t he  accuracy  of   t he  com bin at io m ean - sh ift  al gorithm   and   support  vector   m a chine  ( SV M)  cl assi ficat io Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci     IS S N:  25 02 - 4752       Assessin t he C ro wn Cl osure  o f N y pa on U AV Im ag es  usi ng Me an - Shif t   ( Rob ert   Paruli an S il al ahi )   727   exam ined  by  [ 25 ] T his  is  m is  du to  t he  siz e,  sh a pe  an bri ghtness  va lue  of  the  ny pa  ve getat ion   m or com plica te than  siz e,  sh a pe a nd brig htn es value o the  bu il din g o bj e ct s.      0 . 0 1 0 . 0 2 0 . 0 3 0 . 0 4 0 . 0 5 0 . 0 6 0 . 0 7 0 . 0 8 0 . 0 9 0 . 0 1 0 0 . 0 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 A c c u r a c y (% )   Pa r a m e te r   Se tti n g   K a p p a   a n d   O v e r a l l   A c c u r a c i e s   Ka p p a OA     Figure   3 .   O veral l and   Ka pp a   Accuracy  fo a ll  co m bin at ion   of seg m entat ion   par am et er       Fr om   these  accuracy  val ues,  it   is  no te tha the  var ia ti on   in  the  value of  sp at ia rad i us  and   r an ge   rad i us   do e no t   pro vid e   si gnific ant  di ff e ren ce  of  acc ur acy   (F i gure  4).  No  sig nificant  dif fer e nce  i acc uracy   was  obta ined   wh e t he  s pat ia rad iu was   increas ed   or  decr ease d.  Of   al set ti ng it   seem that  the  m os t   accurate  sp at ia rad ius  pa ram et er  fo pr e dic ti ng   the  crow cl os ur is  10   pix el s.  Wh e the  sp at ia rad i us   is   change to  1 then  the  accu ra cy   decr eased Fr om   the  ran ge   rad ius  po i nt  of   vie w,   the  in crease  of  range   rad iu s   from   10   to  20  causin t he  de cl ine  in  OA  f r om   76 . 6%  to   76. 3%,   ve ry  ti ny   change   (s ee  set ti ng - 10  ( 10 - 10 - 50)   and   s et ti ng - 13  (10 - 20 - 50) )   (Fi gure  4 b ) T he   range  ra di us  di ff ere sig nific antly   wh e it   r ai sed  f ro m   20   to  30  pix el (F ig ure  4 b ), causi ng a  decr ease  of  ov erall  accu racy  2.8% a nd  kapp a accu racy o a bout  5.1%.       7 6 . 5   5 5 . 6   7 6 . 6   5 5 . 7   7 6 . 5   5 5 . 6   0 . 0 2 0 . 0 4 0 . 0 6 0 . 0 8 0 . 0 1 0 0 . 0 OA Ka p p a Sp a ti a l   R a d i u s   (h s )   Se t t i n g   0 1 Se t t i n g   1 0 Se t t i n g   1 9   a)   7 6 . 6   5 5 . 7   7 6 . 3   5 5 . 2   7 3 . 5   5 0 . 1   0 . 0 2 0 . 0 4 0 . 0 6 0 . 0 8 0 . 0 1 0 0 . 0 OA K a p p a R a n g e   R a d i u s   (h r )   S e t t i n g   1 0 Se t t i n g   1 3 S e t t i n g   1 6   b)   7 6 . 6   5 5 . 7   7 5 . 0   5 2 . 7   7 4 . 0   5 0 . 6   0 . 0 2 0 . 0 4 0 . 0 6 0 . 0 8 0 . 0 1 0 0 . 0 OA Ka p p a M i n i m u m   R e g i o n   Si z e   (M )   Se t t i n g   1 0 Se t t i n g   1 1 Se t t i n g   1 2   c)   Figure   4 .   O veral l and   Ka pp a   accuracy  for  al l par am et er           The  thir par a m et er  we  ob se rv e was  the  m ini m u m   reg ion   siz (M).   T his  par am eter   determ ine s   the  num ber   of   pix el that  m a com po se  sing le   se gm ent  (o bject ) W se up   the  siz on   the  basis  of   the   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                          IS S N :   2502 - 4752   Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci,   Vo l.   9 ,  No.  3 Ma rc h 201 8   :   72 2     7 30   728   ind ivi du al   diam et er  of   nypa   tree,  that  rangin from   0. m 2   ~   1. m 2 These  valu es  are  from   50   to  15 pix el s.   Th stu dy  f ound  t hat  the  high  acc ur a cy   set ti ng a re   obta ine f r om  the  value   of  50  pi xels.  T he   M   hav i ng   siz m o re  tha 50  pix e ls  reduce  the  overall   accu racy The  m ini m um  reg io siz diff e re sig nifi cantl wh e it   raised  to  100  pi xels  ( Figure  4c ),   an causin decre ase  of   ove rall   accuracy  2.6 %   and   ka ppa  accurac y   5.1%.       Am on the  t hree  segm entat ion   pa ram et ers  evaluated it   is  sh ow that  the   is  the  m os aff ect in par am et ers,   la r ger  tha t he  s pa ti al   rad ius   a nd  range   ra diu s This   is  in   li ne   with   the   stu dy  car ried  out  by  [ 2 7],   expressi ng   t hat  sp at ia rad i us   was  le ss  se ns it ive  than  t he  oth er  se gm entat i on   pa ram et er.  The  is  ex pressi ng   the  ny pa  siz e   ( crow c ov e ra ge ).   T he   ra diu s   range  w hich  e xpress es   the   ra ng e   of  sp ect r al   is  le ss  se ns it ive  in   disti nguish i ng the  ny pa  le a ve an ga p . Thu it   caus e s   le ss sign ific a nt   in   s egm entat ion   pr ocesses   of  t he  crow cl os ure a naly sis o the   ny pa.               (1)   (2)   (3)   a)  Clust er  1         (1)   (2)   (3)   b)  Cluste r   2         (1)   (2)   (3)   c)  Clust er  3         (1)   (2)   (3)   d)  Cluste r   4   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci     IS S N:  25 02 - 4752       Assessin t he C ro wn Cl osure  o f N y pa on U AV Im ag es  usi ng Me an - Shif t   ( Rob ert   Paruli an S il al ahi )   729   Figure   5 Com par is on b et wee sam ple o f  ori gin al  im age o f   the UA (le ft  colum n   : 1 ) wit se gm entat ion   resu lt us in g se tt ing - 10 ( m idd le  co lum n   2 a nd the  set ti ng - 04 (rig ht co l um n   : 3 at  clu ste r 1 ( a ~ cl us t er  (d).   To  inc rease  the  accu racy  of  crow cl osu re  de li neati on,   the  auth or a lso  ap plied  pix el - base cl assifi er  that   reli es  on   it s   sp ect ral   sig na ture.  T he  se gm entat ion   re su lt   was   the n   com bin ed   wi th  the   cl assifi cat ion   r esult  ob ta ine fr om   the  su pe rv ise cl assifi cat ion T his  is  in  li ne  with  t he  stud of  [ 20 ]   fo r   ident ific at ion  of   be nth ic   habi ta t.  How eve r,   his  fi nd i ng   pro vid e ver l ow  overall   acc ur acy   of   only   27.7% .   His  stu dy  note that  lo acc ur acy   m ay   be  du e   to  the   ga from   seg m entat ion   process  w hen  integ rati ng   phot o - transect  an cl us te r Be si des,  the  low  acc uracy   m ay   be  due  to  the  sam pl locat ion   that  do es   not  m a tch   wit the ob j ect  in  th e m ap.     The  ex am inatio on  the  use   of   pix el - base m et ho to  cl assify   crow cl os ure  a nd   t he  gap   was  al s perform ed.   Howev e r,   the  st udy  resu lt s how  that  it abili ty   to  identify   the   obj ect   is  sti ll   low.   O ne   of   it dr a w back s   is  i th la belin of  ob j ect s,  w hich  is  only   bas ed  on  the   bri ghtness   val ue  or  c olor  of  the  obj ect ,   without  co ns i de rin the  s patia aspects  su c as  locat io n,   siz e,  sh a pe,   te xture,  et c.  T he   su ccess  or   fai lure  of  pix el - base cl assifi cat ion   is   so le ly   deter m ined  by  it br i gh t ness  val ue.   Th us ,   the   qual it of   t he   obj ect   cl assifi cat ion   r esults  dep e nds  on   the  qu al it of   pix el - base qu al ific at io re su lt s.  The  diff i culty   in  determ ining  the  sp ect r al   separ at io of   c la ss  al so   bec om es  chall enge  in  pixe l - ba se cl assifi cat ion  par ti cula rly   in  us i ng   the  high - res olut ion   data.   T he  low  accu racy  of   usi ng  sp ect r al   ran ge  ( ra diom et ric)  m igh be  due  to  the  im age   qu al it (b lu rr i ng /i m age  m oti on   a nd   lo s pe ct ral  reso luti on)  [ 32 3 3 ] T he  i m a ge  blu r r ing   due  to  the   hig i m age  m otion   aff ect   the  a bili ty   of   U AV   im age  in  ide ntify ing   the  obj e ct   of   i nterest  [ 32 33 ] T he  pr es ence  of   no ise   al so   re duces  the  acc urac of  segm entat ion .   I t he  very   high - res olu ti on  im ager y,  it   is  quit com m on  that   the  sm a ll   siz e   of   gap am ong  trees,  br a nc h e s,  tw gs,  a nd   l eaves  caus  ng  “sal and   pe ppe ”  no se The   o the r   so urce  of  no is m ay   co m fr om   the  m isregistrat ion  a nd  geo m et ric  corr ect ion   durin pr e - pr ocessin sta ge.   Ba sed  on  the  be st - sel ect ed  pa ram et er  seg m e ntati on   set t ing - 10,  the  cr own  cl os ure  of  ny pa   within  the  sa m pl in plo t a re r a ngin g from  3 8.4% t o 61.6% .       4.          CONCL US IO N   Fr om   the  fo re goin res ults  an disc us sio ns t his  stud co ncl ud e s   that  the  m os op tim a s egm entat ion   par am et ers  in  m easur in the   crow cl osure   of   n ypa   an ga is  prov i de by  the  set ti ng - 10 wh ic ha 10  f or   sp at ia rad ius ,   10   f or   range   rad ius  a nd   50   f or   m ini m u m   reg ion   siz e .   The  accu racy  of   this  segm entat ion  par am et er  co m bin at io prov i des  a ppr ox im a te ly   7 6.6 of   ov e rall   accu ra cy   and   5 5.7 for  kappa  acc ur acy .   This  stu dy  al so   co nclu de that  var ia ti on  of  m in i m u m   re gion  siz (M)  con t rib ute  sign i ficant  va riat ion   in   accuracy  asse ssm ent,  gr eat er  tha an ot he pa ram et er  sp at ia r adi us   (h s )   a nd   ra nge  rad i us   (hr) .   The   cl assifi cat ion   te chn i qu by  com bin ing   of  pix el - base an obj ect - base has  giv e prom isi ng   resu lt   in   delineat in ve ry sm all f eat ure  within t he  n ypa v e getat io n.       REFERE NCE S   [1]   Duke  NC.  Man grove   Floristi cs  and  Biog eogr a ph y .   In:   Roberts on  AI,  Alongi  DM .   Edi tors .   T ropic a Mangro v e   Ec os y st ems .   W a shington  DC:  A m eri ca G eoph ysica l   Union. 199 2.   63 - 100 .   [2]   Heri y ant o   NM ,   Subiandono  E ,   Karl ina  E.  Pote nsi  dan  seb ara Nipah  ( Ny fa  fru ct i cans  (Thunb. )   W urm b)  Sebaga i   Sum ber da y a   Pan gan.   Jurnal Pe n didi kan   Hutan  d an  Konservasi  A lam .   2011; 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                          IS S N :   2502 - 4752   Ind on esi a J  E le c Eng &  Co m Sci,   Vo l.   9 ,  No.  3 Ma rc h 201 8   :   72 2     7 30   730   Nee ds  And  For est  Inv en tory  C apaci t y Proce e dings  of  the   5 th   I nte rna ti ona DA AD   W orksh o p.     Durban  da n   Piet ermari tz burg .   2015:   163 - 181.     [11]   Kus nadi ,   Ja y a   I NS ,   Pus pani ngsih  N,  Basuki   M,  Hakim  L.  Model   Penduga  Kua li t as  Te m pat  Tum buh  Jati  ( Tect on a   gra ndis Mengg unaka Ci tra  Re solusi  Sangat   Tinggi  Pesawat   Tidak  Ber awa Di   KP Nganjuk.   Jurnal  Pe n eliti a Kehut anan  Wa llace .   2016;   5(2):   185 - 194.   [12]   Bla schke   T.   Obj ec B ase Im age   Anal y s is  for  Remote  Sensing.   ISPR Journal   of  Phot ogram metry   and  R emot Sensing .   2010 6 5(1):  2 - 16.   [13]   Pal  NR,  Pa NK .   A Re vi ew  on   I m age   Segm ent a t ion  T ec hniqu es.   Pat te rn   Recogni t ion .   1993 26(9) :   1277 - 1294 .   [14]   Duro  DC,  Frankli SE,   Dube  MG .   Com par ison  of  Pixel - B ase d   and  Obje ct - Bas ed  Im age   Anal ysis  W it Sele c ted   Mac hine   Le arn i ng  Algorit hm for  The   Cla ss ific at ion  of  Agric u ltural  L andsc ape s   Us ing  Spot  HR Im age r y .   201 2;  118:  259 - 272.   [15]   Sari  NM ,   Kus ha rdono  D.  Objec Segm ent at ion  on   UA V   Photo  Dat to  Support  the   Provision  of  Rur al   Area   Spatia l   Inform at ion.  For um Geografi .   20 15;  29(1):   49 - 58.   [16]   W ahi din  N,  Sire gar   VP ,   Naba ba B,   Ja y I ,   W outhu y ze S.  Obj ec t - b ase Im age  Anal y sis  for  Co ra Re ef  Bent h i c   Habit a Mapping   with  Sev eral  Cl assific a ti on  Algo rit hm s.  Proc edi a   Environm ent al   Sci en ce s .   2015; 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