Co m pu ter Sci ence a nd Inf or mat i on  Tec h no lo gies   Vo l.   1 , No .  3 ,  Novem ber   2020 , p p.   106 ~ 11 5   IS S N:  27 22 - 3221 ,   DOI: 10 .11 591 / csi t.v 1i 3 .p 106 - 11 5          106       Journ al h om e page :  http: // ia esprime .com/i ndex. php/csit   Genome  featur e op timizati on and  corona ry ar tery di sease  predicti on  using cu ckoo se arch       E. N eel im a 1 , M.S . Pr asad  Babu 2   1 Depa rtment of  Com pute r  Scie n ce   & Engi ne eri n g ,   GITAM   Univ ersity ,   Visakha p at nam,   Andhra  P rad esh,   India   2 Depa rtment of  CS &SE,   Andhra   Univer sit y ,   Visa khapa tn am,  And hra   Prade sh ,   Indi a       Art ic le  In f o     ABSTR A CT   Art ic le  history:   Re cei ved   Ja n 2 3 , 2 0 2 0   Re vised  Ju n   11 , 20 2 0   Accepte d  J un   2 8 , 20 2 0       Cardi ovasc u la r  d isea ses   ( CVD )  is  among  th e  m aj or  health  ail m ent   issue   le ad ing  to   m il l i ons  of  de at hs  e ver y   y e ar .   In   r ec en t  p ast,  an aly z ing  g ene  expr ession  da ta ,   par ticula r l y   usin g  m ac hine  learni ng  strat eg ie s  to   pre dict  and   cl assif y   th e   given  unl abele d   gen e  expr ession   re c ord  is   a   g ene r o us  rese arch   issue.   Conce rn in g  thi s,  a  subs ta n tial  req u ire m ent   is  fea tur e  opti m i za t ion,   whic h   is  since  th e   ove ral l   gen es  obser ved  in   hum an   b od y   ar e  cl osel y   25000  and   among  the m   63 6  are  c ard io  v asc ula r   relat ed  ge nes.   Henc e,  it  c om ple xes  th e   proc ess  of  tr ai n i ng  the   m a chi ne   learni ng  m odels   using  the se  e nti re  ca rd i o   vasc ula r  g ene  f ea tur es.   T h is  m anusc ript   uses   b idi re ct ion al   pool ed  var i ance   strat eg y   of   AN OV A  standa rd  t o  sele c t  opt imal   fea tur es.   Along   the   sid e  to   surpass   the  con strai nt   observe d   in   tr adi t ional  c la ss ifi ers,  whi ch   is   unstable   ac cur acy   at  k - fo ld  cro ss   va li da tion,  th is  m anusc r ipt   proposed   a   class ifi cation   strat eg y   that  bu il d  upon   the  sw arm  int ellige n ce   te chn ique  c a ll ed   cuc ko o   sea rch .   Th e  exp e rimenta l  stud y   in dic a ti ng  th at   the   num ber   of  opti m al   fe at ur es   those  sel ec t ed  b y   propos ed  m odel   is  subs ta ntially   low  th at   compare d  to  t h e   othe r   contem pora r y   m odel  tha t   se le c ts  fe at ur es  usi ng  forward   fe at u re  se lecti o n   and  class ifi es  u sing  SV M  cl assifie r  (FF S&S VM ).   The   expe r i m ent al   stud y   evi nc ed  th at   the   proposed  m odel ,   which  sel ects  fe at ure   b y   bidi r ecti onal   pool ed   var ia n ce   esti m ation  and  cl assifi e s  using  proposed  cl assifi cation  strat eg y   that   buil d  on   cuc koo   sea rch   (BPV E&CS ) outperforme d  th e s e lecte d   co nte m pora r y   m odel   (FF S&S V M).   Ke yw or d s :   Cl assifi cat ion   Com pu te r  intel li gen ce   Corona ry arte r y disease   Cuck oo sea rch   Gen e  exp ressio n  ca d gen e s   Pr e dicti ve  anal ysi s   This   is an  open   acc ess arti cl e   un der  the  CC  B Y - SA   l ic ense .     Corres pond in g  Aut h or :   E.  Neelim a ,   Dep a rtm ent o f C om pu te r  Scie nce & E ng i nee rin g,     GI T AM  Un i ve rsity , V isa kh a pa tnam , A ndhra  Pr a des h,   I nd ia .   Em a il :  eadh a.ne el i m a@g m ai l. com       1.   INTROD U CTION   Am on g  th e  va r iou s  healt h  as pe ct s  that  le ad  to  deat hs ,  ca r dio va scular   dise ases   ( CV D )  ar e  on e   of  the   m ajo r   fact or s   that  le ad   to  m i ll ion s  of  deat hs  gl ob al ly   eve ry  ye ar  [1 ] .   A cute  MI  (My oc ard ia l  in far ct i on)  i s   resu lt ant  el em ent  of  t he  m yocard ia l  ti ssu e   f orm ation   becaus e  of  re duced   bl ood  s upply  t o  t he  hear t  a nd  it   causes   resu lt s  in   m i ll i on s   of  deaths   [1] .  Ma ny  sci entifi c  stu dies  hav e   f ocused  on  so l utions  in  te rm s  of   diagnosi s ,   pr e ve ntion,  a nd  c ur e  f or   M I,   bu t  sti ll   the  optim al   su ccess  not  accom plishe d  in   te rm s  of   m it igati ng   the  m or ta li ty   rati o  le d  res ult ing   du e  t o  MI  issues.  In   t he  pr ese nt  sce nar i o,   pr e do m inan tl y  clinical   sy m pto m s  are  us ed  f or  diag nosis  of  MI.  Ce rtai n  sym pto m s  li ke  com plexiti es  in  breat hing,  i ncon ven ie nce  or  uneasi ness  face d  by  the   patie nts  li ke   ch est   pain ,  repo rts  of  a bnorm al   Ele ct ro   Ca rd i o  Gr am   (ECG )  re su lt s,  a bnorm al  fall   in   the   ci rc ul a ti on  le vels  of  c Tns  ( card ia c  t rop on i ns )   [ 2].  T ho ugh  t her e   are   m any  de velo pm ent s  that  has   ta ke n  place  i n  t he  do m ai n,   sti ll   there  are  c ertai n  li m it at io ns   a nd  c on st raints  face d  i n  at ta ining  accu rate   analy sis  usi ng  the  cu rr e nt  dia gnos ti c   syst e m s.  Fo r  i ns ta nce ,   the  c on te m po ra ry  m et ho ds   a nd  s olu ti ons  that  wer e  pro posed   in  hs - c  T n  as say s  ha s   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol.         Geno me  fe at ure  opti miza ti on  and  c oro na ry   ar te ry  disease   pr e dicti on   us in g  c uckoo  searc h … ( E. Neel im a )   107   resu lt ed  i n  im pro ved   sc ope  of   detect ing   t he   lowe r  ci rc ulati ng   T n  co nc entrati ons  ( with   inc rease d  se ns it ivit y  towa rd s   analy s is).  Howe ver,  on e   of  t he  key  co ns trai nts   f r om   the  pro ces s  is  the  rise  of  false  al arm   rates  as  a  gr eat er   num ber   of   no n - disease d  pe op le   are   al so  sho wn  as   pron e   to   c onditi ons,   becau se   of  change   re su lt in g  i n  cTns  due  to   the   oth e r  c om plication  (this   ref le ct s  reduce d  se nsi ti vity )  [3 ] .  T he   oth e r  diag nos ti c  m et ho d  u se d  f or  detect ion   is  the   card ia c  m i  RNAs  that  c on si de red   as  sensiti ve  bi om ark ers  [4 ] ,  bu t  few   li m it a ti on s  li ke  the  lo w   abun dan ce ,   ti ssu e  sp eci fic   e xpressio n  issues   a nd  the   sm al l  siz e  ha s  im paired   t he  reli abili ty   ove r  t he  m od e l.  T he   ro le   li ke   the   bio m ark ers   has   beco m e  m or e  sign ific a nt  bec ause  of  in ve ntion  of  fast,   im p rove d,   a nd  a ut om at ed  detect ion   syst e m s   [5 ] .  I n  som e  of   the  oth e r  stu dies  that  carried  out  in  the  li nes  of  de fining  bio m ark ers  f or   diag nosis,  CR P,  B NP   a nd  oth er   su c h  ki nd  of  inflam m at or y  m ark ers   to o  consi der e d,  howev e r  only   m a rg i nal  i m pr ovem ents in  the ac cu racy l evels  wer e att ai ned  a s the  ou tc om e [6 - 8].     Do m ai n  kn ow l edg e   of  the   pa tho lo gical   a nd   physi ol og ic al   as pects  the   ke y  aspects   reli ed  upon   f or   dev el op i ng  m a ny  of  the  ea rlie r  car diac  bi oma rk e rs.   Wherea s,  the  m ic ro arra y  platfo rm s  c on si der   t he  e xpressi on   of  la r ge  num ber   of  gen es   in   si m ultaneou s   m ann er ,  t hat  f ocuses  on  e na bling  gen e   e xpressio n  pro fili ng  ac r os s   var ie d  path wa ys  in  sim ultan eo us.  T he  af or esai d  m et ho d  has  the   cap abili ty   to  ind i cat e  broa d   ra ng e   of   path ophysiol ogic al   processes   of   CV D   in   m or e   ec onom ic   and  e ff ic ie nt   m ann e r   [ 9].   Ge ne   e xpressio n  prof il in g  exten ds  dee pe r   tha n  the   bi oma rk e rs   to   ide ntify  m or e  pote nt ia l  bio m ark ers   that  earli er   repor te d t o  be   ass ociat ed   with  C VD.  G ene  e xpres sio ns   us ually   en able  us  to   ide ntify  a nd  discov e r   insig htf ul   an d  m or e  se ns it ive   bio m ark ers   tha t  can  r eflect   up on  CV D.   Ma jo rity   of   t he  stu di es  that  ha ve  f ocused  i n  t his  sect ion   has  pro vid e d  sign ific a nt  resul ts  from   the  process.   I n  [ 10] ,  a  stu dy  ca rr ie d  ou t   f or  gen e   e xpressi on  a naly sis  to  unde rsta nd  a nd   disco ver  co nte m po rar y  an d  s ensiti ve  bi om a rk e rs  of   C V D   identifie d  48 2  gen es   that  a re  in  as so ci at ion  to   com po sit ion   of  coro nar y  at heroscler otic  plaq ues  a nd  m ajo rity   of   t hem   nev e r  ta gged   to  t he  at heroscler os is   [10].   In   [1 1],  wide  scal e  gen e   ex pr essi on  pro fili ng   c om pr isi ng  56  div e rg e nt   genes  f or  at he ro scl e ro ti c  an d  no n - at heroscler otic  hu m an  co r on a r y  arterie s  e xp l ored ,  of   w hich  49  of  them   wer e   associat ed   wit h  C AD  earli er  [11].   In  [ 12] ,  t he   aut hors   ha ve   f oc use d  on   ide ntifyi ng   a   set   of  cl a ssifyi ng  gen e s  base d  on  dem og ra phic s  a nd  it   ha s   strongly  de picte d  t he   obstr uc ti ve  CA D   in   non - diabeti c  patie nts  [ 12] .  Dive rg e nt  ra ng e   of  ge ne  e xpres s ions   identifie d  that   dif fer e ntiat ed   the  isc hem ic  an d  non - isc hem ic   card iom yopathy  c ondi ti on s  of  the  pa ti ents  confro nting   e nd - sta ges  [ 13 - 14] .  I n  [ 15 ] ,  the  auth or s  ha ve  w orke d  on  m ic r oarray   analy sis  and   ge ne  ex pressi on   prof il in g  t hat  a re  us e d  f or  discov e rin g  ge nes   relat ed   to   heart   fail ures  base d  on  e xpres sio n  pro file s  of  pa ti ents   with  hear t  fail ure  com plica ti on s.  I n  [ 16] ,  the  stud y  has  ta r ge te d  on  norm al   con t ro ls  a nd  M I  patie nts  ha ve  fou nd   that  the   ge neti c  m ark et s  an d  the  der e gula te d  path ways   tha t  are   ass ociat ed  with   the   dise ase  rec urre nce   in  first  tim e MI p at ie nt s [ 16] .    It  is  i m per at i ve  that  the  ef fic acy   with  w hich  the  bloo d  tran scriptase   denotes  the  changes  of   transc riptio nal  el e m ents  in  he art,  im pr ov es  t he  accu racy  of   diag nosis.  I n  [ 17 ] ,  t he  aut hor s  hav e  re porte d  that  upon  co nducti ng   a  ge no m e  wide  s urvey  by   us ing   m ic roarr ay s  an d  the   expresse d  se qu e nc e  ta gs  ha ving     the  per ip he ral  blood t ra ns cri pt  m e to the  tra nsc ript m e o f   nin e  oth e r h um a n  ti ss ues  i nclu ding t he one s  of  hear t,   m or e  than   80 %   of  overla pp i ng  is  est im at ed  at   ti ssu e  le vels .  84%  of  overla pping  with   hear t,   ind ic at in g  t hat  study   of   pe rip her al   b lood  tra ns c ript ase  can   be   an   e conom ic   and   r eadil y  acce ssib le   too l  for  pro xy   gen e   ex press ion   i n   oth e r  ti ssu es  [ 17 ] .  T houg h  m any  stud ie s  hav e  f ocu se d  in  the  dom ai n  of   diff e re ntial   expressio n  i n  CV D  ou tc om es,  in  [ 18 ] ,  t he  a uthor s  ha ve  f oc us e d  on  usi ng  diff e re ntial   ex pr e ssion  f or   cl as sifyi ng  the  patie nt  r eco r d  ou tc om es.  Su c h  a n  ap proac h  pr ov i des  e ff i cacy   to  im pr ove  t he  diag no sis  to   s ub - cl as sify  patie nts .  Also,     the  disc rim inatory  featur e s  f or  dif fer e ntiat ing  over  norm al   pr of il es  a nd   t he  pa ti ents  with  MI ,  CA D  an d  t he  on e s   com pr isi ng  un sta ble  an gin a   ov e r  ge ne  e xp ressio n  i n  blood  cel ls.  Bl oo d  tra ns c riptase   that  us e d  with  easi ly   acce ssible  ti ss ue  f or  the   dia gnos ti c   pur pose s  an d  m ajo rity   of  s uch  c on t rib utions  de pict  that  the   c om pu ta ti on al   ov e r head   res ulti ng   f r om   den s e  nu m ber   of   ge ne  feat ur es   are   adap te d  in  t he   le arn in g  proce ss.  I n  this  pa pe r,   a  t - te st  dep e nde nt f eat ur e  o ptim izati on   m od el  p r opos e d  w hich  co ul d  e ff ect ive ly   reduce  t he  c ount o f   fe at ur e s  use d  for  analy sis.  T he  s olu ti on  use s  le sser  num ber  of   featu res  when  co m par e d  to   m any  of   the   ea rlie r  m od el s.  D espite   of   us i ng   li m it e d  set   of   featu r es,  the  acc ura cy   le vels  of  di agnosis  with  r edu ce d  false  a la rm   rates  has  bee n     the outcom e for  the  prop os e d solutio n.        2.   RELATE D  W ORK S   In   [ 19 ] ,  t he  st ud y  has  detect ed  var ie d  iss ue s  of  im balances  that  m igh t  cree p  up   i n  t he  us a ge  of  m ic ro arr ay ,  be cause  of   noisy ,   huge  volum e  and   i rr el e van t  sam ples.  Be ca us e  of   t he  af ore - sta te d  c om pl exiti es,   researc hers  f oc us e d  to  us e  swa rm   intel l igence   te chn i qu e s  f or  addressi ng   t he  issue.  T he  stu dy   us ed   the  te c hniq ue  of   ACO  sam pl ing ,  w hich  de velo ped  base d  on  A nt  Colo ny   Op ti m iz a ti on   ( ACO )  al go r it h m   fo r  el im i nating    the  noisy   a nd   i rr el eva nt  featu res  in   the  proc ess  of  feature   s el ect ion .  S VM   cl assifi ers  were  ada pt ed  beca us e  of   it s  prom inence   f or  high   dim e ns io nal  data   cl assifi cat ion  e ve n  with   sm al l  set   of   sam ples.  The   issue s  of  unsta ble  cl assifi cat ion   pe rfor m ance  ide ntifie d  i n  cr os s   validat io n  pro cess  are  a   m ajo r  facto r.   I n  [ 20] ,  the  a utho rs   ha ve  adap te d  a  hy br i d  m o del   f or  sel ect in g  op ti m al   feature s  by  us in g  Ar ti fici al   Be e   Col on y   ( AB C)  a nd    Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                          IS S N :   2722 - 3221   Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol. ,  V ol.  1 , N o.   3, N ov em ber   20 20:  106   –   11 5   108   the  cl assifi cat ion  car ried   out  us in g  t he  S VM   cl assifi ers.  AB C  us e d  for  cl us te ring  an d  s el ect ing   op ti m al   featur es,   wh ic h  re duces  the  searc h  s pac e.  Ex per im ental   stud ie s  de pict   that  the  unsta ble  accu racy  at   the  le vel  of  10 - f old   cl assifi cat ion .  I n  [21],  the   m od el   pr opos es   th e  us a ge  of  AC O,   a nd  R oughe st  t heory  ( RS T )  in   com bin at ion  f or  achievin g  the   op ti m iz ed  featur e   co unt.  Acc ur acy   of  feature   sel ect ion  is  i nv e rsely   propo rtion at e  t o  t he  le vel  of   dim ension al it y  in   the   f eat ure  set .   In  [22],  it   e xplo re s  the   us a ge  of  BA T  al gorithm   fo r   reduci ng     the d im ension a li ty  o f  feat ur e a nd selec ti on of  op ti m al  f eat ur e s.    In   [23],  f uzzy   based   m od el   dep ic ti ng  the   ru le s  dep e nd ing   on   relat io ns hi p  am on g  the  f eat ures  dev el op e d,  us i ng   t he  c om bin at ion   of   ACO   an d  BA T  te ch nique.  In  ad diti on,   the  r ules  ca n  be   in  use   f or  sel ect in g  op ti m al   feature s  in  dynam ic   m ann er .  Am on g  the   co ns trai nt s  that  en visag ed  in   the  m odel ,  there   is  nee d  f or   expos ur e   to   en su re   sel ect ion  of  p rio r  at trib ut es  that  s uppor ts  in  sel ect in g  the  dep e ndent  at tribu te s,   base d  on   dev ise d  fu zzy   r ules.  RST   an d  BC O  com bin e d  in  [ 24 ]   wh e re in,  the  em ph asi s  is  on  cl us te ring  the  featu res  base d  on  phen otype   or  the   patte rn  that  ide ntifie s   the  optim al   featur es.   It  u se d  the   local it y  s ensiti ve  discri m inant  analy sis  ( LS D A )  for  re duci ng  dim ension al i ty   of   featu re  se ts,  wh ic h  f ur t he r  cl us te rs ,  the   ou tc om e  us ing   f uzzy  c - m eans  ( FCM )  al go rithm .  FCM   us e d  in   c om bin at ion   wit h  ABC  a pproa ch  for  featu re  si m il arity  assessm en t   wh il st   f or m ing  the  cl us te rs.   T he  FCM   inc orporated  with  a rtific ia l  bee  co lon y  ( ABC )  a ppr oac h  that  use d  f or   featur e   sim il ari ty   assessm ent  durin g  cl ust er  f or m at ion .  Ot he r  co ntem po rar y   m od el s  in  the  featur e   opti m izati on   are  bin a ry  bat  al gorithm   ( BBA )   a nd   ABC  wer e   us ed   [ 25 ] ,  a nd  in   [ 26 ]   m ini m u m   red unda ncy   an d  m axim u m   releva nce  ( M - RMR ),   a nd  PS O a nd   DT   i n  [ 27] .  The   M - RM R  [ 26 ]   is  a n  e ffec ti ve m et ho d  for  re du ct io n  of  noise   and irrele va nt fea tures  a pa rt fr om  r edu ci ng th e d im ension al it y.    In  order  to   s urpass   t he  c ons trai nts   obser ve d  i n  e xisti ng  m et a - heu risti c   swa rm   intel lig ence - based   featur e   sel ect ion  m od el s,   a  c ouple  of  featu r e  sel ect ion  te c hn i qu e s  cal le d  f orwa rd  feat ure  sel ect io n,  f orwa r d  featur e   i nclusi on,  a nd   bac kw ard  f eat ur e   el i m inati on   discu ssed   in   [ 28] .  T he  ex per im ent al   stu dy  i nd ic at ing  that,  a m on g  these  t hree  strat e gies  f orward  featu re   sel ect ion   is  op tim a l.  Howe ve r,   the   pe rfo rm a nce  ob se r ved  in  10 - fo l d  cl assifi cat ion  done   by  SVM ,  m axi m u m   c la ssific at ion   ac cur acy   li m it ed  to  89 %   a nd  no t   co ns ist ent   bet we e n  div e rg e nt  f old s .   The  cl assifi er s  dep ic te d  ab ove  ha ve  var ie d  le vels  of   perf or m ance  eff ic a cy   that  influ en ced  by   pre - pr ocessin g  sta ges   f or  dataset s.  P re - proc essing  sta ge s  de picte d  i n  feat ur e   sel ect ion  proces s  c ou l d  le ad  t o  bette r  perf or m ances   f or  cl ass ifie rs.  Feat ures   re duct ion  in   t he  dataset s  is   on e   of  the   crit i cal   aspects   fac ing  the  cl assifi er.  Ma ny   of   t he  ea rlie r  te ch niques  of  feat ur e  sel ect ion   or   re du ct i on  has   de picte d  that  it   c ou l d  be  a  resou rcef ul  so l ution  f or   cl ass ific at ion   purpo ses.  I n  a ddit ion ,  t he  acc ur ac y  and   pe rfo rm ance  of   cl assi f ic at ion   m igh t de pe nd  on the  qual it y of featu re s el ec ti on  tech ni qu es  ad a pted.        3.   CORO NAR Y AR TE RY D I S EASE P REDICTIO N  F ROM GE NOME   FEATU RES  US I NG  CUCK OO  SE ARCH   In   t his  sect io n  of   stu dy,  the  process  of  feat ur e  optim iz at i on   f or   ge no m e  featu res  a nd   i n  te rm s  of   pr e dicti ng   t he  coro nar y  arte r y  disease  he ur ist ic   scal e - bas ed   de fini ng  ba sed  on   C uc koo  sear ch  is  propose d.    The   f ur t her  sec ti on s,   fi rstly   th e  m et ho ds  an d  m at er ia ls  us ed   in  the   dev ise d  m od el   discusse d.  F ur t her ,   the   m et ho d  of  fe at ur e   optim iz ation   base d  on   A NOV A   sta nda rd  te r m ed  as   bi dire ct ion al   poole d  va riance   est i m at ion   discusse d. I n f ur t her a nce,  t he  searc h process  and label  pred ic ti on  b a sed  on  cu c koo sea rc h disc u sse d.       3.1.   Metho ds  an d   mat eri als   3.1.1.   The fe ature se t   The   63 6  ge nom es  am on g  t he   total   25000  genom es  are  r el at ed  to   the   CVD   [ 29] ,  whic h  is  usual ly   dep ic te d  as   C A D  ge nes.  In  te r m s  of   e valuati ng  th e  c orrelat ion  am ong  t he   636  ge nom e  fe at ur es,   high   le vels  of  process   c o m pl exity   are   im per at ive,  a nd  it   ca us es   sig nifican t  ra ng e   of  false   al arm ing   over   t he  predict io n  m od el s.   Hen ce ,  in  orde r  to  en sure  li ne r  an d  lo wer   l evels  of  com plexity ,  ens ur in g  trun cat i on   of   false  al arm   rat es  to  m in i m al   le vels  is  ve ry  esse ntial .  E ver y   rec or d  of  t he  datase t  ada pted   f or  t r ai nin g  a nd  te st ing  phases   c om pr ise  the  s i ng le   nu cl eotide   poly m o rphism   ( SNP )   of  e ver y   ge ne,  de noti ng  ge ne ti c  var ia ti on   of  var i ou s   ge ne s.  In  add it io n,  the  i ni ti al   le ng th  of  e ver y  recor d  is  636  value s  depi ct ing   the   S NPs  of  al l  t he   63 6  ge no m es  that  li ste d  in  CA D  Gen e s.   In it ia l  dataset   com pr ise s  the  s et   of   rec ords  t ha t  ei ther  la belle d  as  pro ne  t o  C VD  or  the   ones   that  are  sal ubrio us  with  no  t race  of  a ny  CV D   im pl ic at ion s.  I n  ad diti on,  t he   dim ension al it y  of   ge nes   co un t  has   to   reduce   f ro m   th e  c urren t   num ber   of  636  to   c onside rab ly   le ss er  value s.   A N OVA   sta ndar d  te rm ed  as  bid ir ect ion al   pooled   var ia nc e  est im a ti on   is  adap te d  f or  the   process   of   re duci ng  the   dim ension al it y  to   opt i m iz e  the  ge ne  count   and  buil ding  t he   pro pose d  s cal e.  I n  a dd it ion ,  t he   detai ls   of   bi directi on al   po oled   va ri ance   est i m at ion   t hat  is   adap te d for  fea ture o pti m iz ati on pr ocess  e xp lore d  in  the  f ollow in g sec ti on.     3.1.2.   Bi dire ctiona l   pooled  va ri ance  est im at io n   Attrib utes  of  e ver y  rec ord  i n  the  ch os e n  dataset   denotes  eac h  ge ne  of   C ADGen e s  f or   t he  c ount  of  636.   Hen ce ,  eve ry  r ecord  c om pr ise s  636  SN P s  a s  values  pe rtai ning  to  al l  the  genom es.  To  de fu se  t he  num ber   of   gen e s  that   co nsi der e d  for  opt i m al   featur es,   the  c ov a riance   am idst  values   de noti ng  e very   ge ne  in   the   r ecord   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol.         Geno me  fe at ure  opti miza ti on  and  c oro na ry   ar te ry  disease   pr e dicti on   us in g  c uckoo  searc h … ( E. Neel im a )   109   la belle d  ei the r   as  pro ne  or  s al ubrio us   f or  a ll   the  fe at ur e s.   Ge nes   are   op t i m al   featur es   com pr isi ng  ef f ect ive   cov a riance   am i ds t  value s  pe rtai nin g  t o  pro ne   or  the   sal ubrio us  rec ords   c ho s en.  F or  est im at i ng  var ia nce   of   SN Ps ,   com pr isi ng   val ues  of   a  ge ne  r el at ed  to  pr on e  or   s al ubrio us   r ecords  of   t he  c ho s en  t rainin g  set ,  the  m et ho d  ada pts   ANO VA  sta nd ard  bid irect io na l  poole d  va ria nce  e stim at ion .  Ba sed   on  res ults  en visag ed   in   [ 30 - 31 ] ,   the   m et ho d  is  chosen   f or  a naly sis.  T he  bid irect io nal  po ol ed  va riance   es tim a ti on   is  a da pted  f or   s el ect i ng  opti m a l  featur es  per ta ini ng  to  e ver y  recor d  ( bo th  pro ne  a nd  sa lubrio us )  f or   a   trai ning  set   c hose n.   Diff e re ntial   values  am idst  two  disti nct v ect or s  d e picte d by th e u sa ge of  b i directi on al   poole d varia nce esti m at ion  as foll ows:       = ( ⟨ 1 ⟩ − ⟨ 2 ⟩ ) √   ( 1 ) +  ( 2 )     In the e quat ion ab ov e     ⟨ 1 ⟩ , ⟨ 2 ⟩   ind ic at es  the  m ean  values  i de ntifie d  f or  rel evan t  vecto rs  1 , 2   and   t hese  vector s   i nd ic at e  th e  SN Ps   c onsti tuted  as   values   to   a  ge ne  per ta i ni ng  to   rec ords   la belle d  a s  pro ne   an d  sal ubri ous  res pecti vely   in g i ven trai ni ng set.     The   re pr e se ntati on s  ( 1 ) ,  ( 2 )   si gnify   t he   m ean  s qu a r e  dista nce   of   the  vecto rs 1 , 2 resp ect i vely .   The  bid i recti onal   poole d  var ia nce  est im ation   is  the  rati o am i ds t  the   m ean  va riat ion   of  r el at ive  vect ors   and  t he  s quare   root  of  s um   of  m ean  s qu a re   di sta nces   of  t he   r el at ive  vect or s .   I n  f ur t her a nce,   the   p - value   ( de gr e e   of  pr ob a bili ty )  [ 32 ]   is   at ta ined  base d   on  t - t able  [ 33] .  P - va lue  is  m uch   le sser  t han  the   pro ba bili ty   thresh ol d,   wh ic h reflect s  that t he vect ors  v a ry.  Hen ce , t he feat ur e  den oting res pecti ve  v ect ors a re  of optim al  f eat ure.      3.1.3.   Cu ck oo se arc h   The   nat ur al   el em ents  bas ed   m et a - he ur ist ic s  m od el s  de velo pe d  a re  am ong  the  best  set   of  al gorithm s   to  address   the  iss ues  of  op ti m iz a ti on .  The   pr opose d  w ork  e valu at es  the  fitness  for  a   gi ven  ge ne   vect or   f or  co r on a ry   artery  disease  pro ne  set   and   t he  sal ubri ou s  s et s  based   on   c onte m po rar y  m e ta - he ur ist ic   m o del  of   C ucko o   Searc h  (CS)  [ 34] .  CS   dev el op e d  base d  on  obli gate  bro od  par a sit ism   of   the   c ucko o  sp eci es.   Its  m ai n  c har act e risti c  is  to   le t  the  eg gs   in   the  nests  of  oth er  bir d  s pecie s  that  are  relat ively   m a tc hin g.  Th ree  key  f undam ental s  based   on   su c h  nestin g  process   f ollo we d  by  Cuc koo  are:   Cuc koo  eg g  de no te s   a  s olu ti on  t o  the   iss ue  a nd  it   dr op s   ra ndom ly   in  a  c hosen   nes t.  H ow e ve r,   on ly   on e  e gg  le ft  at   ever y  i ns ta nc e.  T he  nests  t hat  com pr ise   hi gh e r  qu al it y  of  e gg s   hav e   t o  pass   to   the   f uture   ge ne rati on   Nest  owne r   sh al l   ide nti fy  a   cuc koo  egg  base d  on  pro ba bili ty   ∈   [ 0,  1].   In  the  instance  of  su ch  occ urrenc e,  the  ne st  owner   le a ves  the  nest  an d  de vel op s  oth e r  nest  in  a  var ie d  loc at io n.   The  c um ulati ve  num ber   of  ne sts  is  the  fi xed v al ue.  N ot  al l  the p re viously  m entioned  r ule s  are  es s entia l, as  the  cucko o  searc h  us e d  in  the  pro po s ed  m od el ,  only   for  ide ntifyi ng   the  fitness  of   featu res  f or   a  cho s en  in put  gene   record .  He nce,   the  pro po sal   is  to  dev el op  nest s  in   a  t rad it io na l  m ann er  a nd  the  sea rch  perf or m ed  us in g  ra ndo m   appr oach.  Tra di ti on al   searc h  dro ps   on ly   one  egg   i n  the  c hos en  ne st,  but  in  the  pro posed  s olu ti on,  it   cl ones  the   egg   t o  var ie d  num ber   of  com patible   nests  an d  places  one  e gg   in  eve ry  com patible   nest.  It  al so   est im at es  fit ness   of eve ry eg g f or e ntire n e st hi erarc hy.      3.1.4.     The d ata se t   Data  set   ge ne ra te d  base d  on  re cords   de noti ng  coro nar y  a rtery   s us cepti bili ty   m od e  ( NCBI  G EO   Dataset   ID :   G DS4 527)  an d  Atheroscl ero ti c  C oro nary   A rtery  Disea se  pron e   (N C BI  GE O  Datas et   I D:  GDS36 90)   ar e   gathe red  f ro m   NCBI  gen e   ex pr essi on  om nib us  ( NCBI  GE O)   [ 35 ] ,  a uth e ntica te d  as  ge ne   ex pr essi on  da ta set   reposit ory .  T he   dataset   G DS452 7  c om pr ise   ge ne  ex pressi on s   of  20   sub je ct s.  Am on g  them   10   rec ord s  are  cat egorized  as   sal ubrio us   a nd  rest  of  the   rec ords   are  cat e gor iz ed a s  pro ne t o c oronary  arte ry  disease . T he   oth e r  dataset   G DS  3690  c om pr ise s  153  rec ords  of   w hich   66  rec ords   cat eg or iz e d  as  sal ubrio us   and  rests   of  t hem   as  pro ne  to  c oro nar y  a rtery  dis ease.  Ba sed   on  the  rec ords  of   t wo   dataset s  represe ntin g  173  s ubje ct s,   values   ob s er ved  for   CAD Gen e s,   w hich   are   c ollec te d   as   recor d  f or  e ver y   s ubj ect .   Stat ist ic s  of  fi nal  datase ts  that   gen e rated  fro m  the  process  d e picte d  in  the  fo ll ow in g  T a ble   1 .        Table  1 .   Cl assi ficat ion   of  da ta set s   Data   Su b jects   Cu m u lativ e  record s   173   Leng th  of  eac h  r ec o rd   636   Reco rds  with d isea se p ron e labelin g   97   Reco rds  of  salu b riou s lab elin g   76         Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                          IS S N :   2722 - 3221   Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol. ,  V ol.  1 , N o.   3, N ov em ber   20 20:  106   –   11 5   110   3.2.   Opt im iz ing g e no me  f e atures   As  a  pa rt  of  portio ning  proc ess  of  la belle d  rec ords  i n  th e  dataset ,  w hich  cl assifi e d  t o  tw o  s et s   ind ic ti ng  co r onary  a rtery  disease  pro ne  a nd   sal ubrio us   rec ords  res pecti ve ly .  The  set s  are   in  the   form   of   m at rix  siz e  of   rec ords  countin g  as  row  co unt  an d  C AD   ge nes  c ount ed  as  col um n  count,  wh ic h  a r e  fixe d  to  63 6  [ 29] .  E ve ry  r ow   of  the  m at rix  sh al l  be   a  vect or   de no ti ng  SNPs  at ta in ed  f or  al l  the  C ADGe nes  per t ai nin g  to  in div id ual  c ase  an d  e ver y  colum n  in  the  vecto r  in dicat es  SNPs  gathered  f r om   sp eci fic  gen e  i n  the   chose n  cases.  C on te xt  of  opti m al   feat ur e   sel ect ion  is   ab out  a  ge ne  com pr isi ng  a  va ried  vect or  of   S NP s   pe rtai nin g  t o  pro ne  a nd   sa lu br i ou s   recor d  s et s  .  In  a dd it io n,  it   a pp li es   bi directi onal   pool ed  var ia nce   es tim a ti on   te st   ov e r  t he  at ta in ed value  f or  a   gen e  p e rtai ning to  both  labell ing   set s usi ng t he follo wing  proces s.      ste p 1:   ∀ = 1 | | { ∃ ∈ ∧ ∃ ∈ }   Be gin   ste p 2:   ⟨ ⟩ = ∑ { ( ) } | | = 1 | | //   ob ser ving  t he   m ean ⟨ ⟩   of   t he  al l  values  com pr ise d  in  c olum n  vector     of   t he   set     de noti ng S NP s  f ound in  re cords o f    for g ene    ste p 3:   ⟨ ⟩ = ∑ { ( ) } | | = 1 | | //   obser ving  t he   m ean ⟨ ⟩ of  the   al l  v al ue s  c om pr ise d  i n  col um n  vecto r    of  the   s et     that de note s S NP s  obser ve d  i n  al l rec ords  of  the set    f or g e ne    ste p 4:    ⇌ = √ ∑ ( ) − ⟨ ⟩ | | = 1 | | − 1 + ∑ ( ) − ⟨ ⟩ | | = 1 | | − 1   //   obse rvi ng  the   r oo t   m ean  s qua re   distance  ⇌ of  t he vect ors    an d      ste p 5:   ⇌ = ( ⟨ ⟩ − ⟨ ⟩ )  ⇌ //  Estim a ti ng  the  bid irect io na l pool  var ia nc e  score  of  t he ve ct or   an d  vect or    com par ison   ste p 6:    ( ( ⇌ ) <  )   //   Up on  insta nce  of  de gree  of   pro bab il it y  ( ⇌ )   identifie d  for   ⇌ is   le sser  tha n  t he pr obabili ty  thresh old   (usuall y 0.0 1,   0.0 5 or 0 .1)  giv e n   ste p 7:    ← { }   //   then  the  ℎ   gen e  of  the  C ADGen e s  set   is  de li ber at ed  as  optim a l  a nd   m oved  to  t he   op ti m al  g ene s et      ste p 8:   En d     3.3.   Cu ck oo Se arc h for  fitnes s  asse ssmen t   This  sect io n  e xp l or es   the   pro cess  of  fitness   assessm ent  thr ough  c ucko o  s earch .  T he  ove rall   proces s  include s  nest  f or m at ion ,  hier arch ic al   sea rc h  to  noti fy  the   f it ness  of   t he  optim al   featur es   of  th e  giv e n  r ecord  towa rd s   pro ne   to   Co rona ry  a rtery  disease   a nd  sal ubrio us  sta te .  Nest   f or m at ion ,  sea rc h  an d  la bel   pre dicti on   process  explo r ed  in  foll owin g sec ti on s     3.4.   Nest  f orm at i on   In   orde r  to  perform   the  cuckoo   searc h,   t he  hierar c hy  o f  th e  nests  s hould   gen e rate  f or   c orres pondi ng   disease  pro ne   and  sal ubrio us  set s , .  The   op ti m al   gen e   feat ures  re pr ese nt   t he  nests   in   a  hi erarch y   s uch  t hat   each  set   of  opti m al   gen e  f eat ures  re pr ese nts  a  un i qu e   nest  i n  hierar c hy  that  r efer red  f ur t her   as  nest  represe ntati ve   set .  T he   opti m al   ge ne   feat ur e   set s  ex plored   su c h  t hat  eac h  set   co ntains   m or e   tha n  one   ge ne  featu re   tha t  are  highly   c orrelat e  in   reg a rd  t o  the  t heir   res pe ct ive  S NP s   as   values   fou nd  i n  rec ords   of  th e  c orrespo nd i ng  set s   , .Furthe r,   t hese  nest  re pr es enta ti ve se ts  ref e rred  as     an d l et   the  hie rar c hies   ,  form ed respect ive  to   disease  pro ne  and  s al ub rio us  set s ,   us in g  t he se  ne st  re pr e se ntati ve  set s   Further ,  t he  un i que  value   set s   { 1 , 2 , . . , } as  eggs,  s uch   that  each  eg g  represents  t he   values  of   a  gen e  featu res  in  nest  re pr e s entat ive  set { ∃ ∈  }   an d  exists   in  at   le ast   on e   reco rd  of  the   r especti ve   rec ords - set ,  s houl d  place  i n  t o  t he   ne st   represe nted by  { ∃ ∈  } .     3.5.     Asses sing  f it n ess b y  nes t  se ar ch   The  fitness   of  the  giv e n  rec ord   est i m at es  base d  on  the   nu m ber   of  com patible   nests   noti ced   in  res pecti ve   hierar c hies  ,  .  C on ce r ning  t his,   f or  eac h  nest,   a ny  e gg  of  t he   re sp ect ive   ne st  is  i den ti cal   to   the   values  ob s er ved   i n  gi ven   rec ord  f or   the  ge ne  feat ures  in  co rr es pondin g  ne st  repre sentat ive  set   th en  the  fitness  of  the   giv e n  record   in   relat ed  t o  c orr esp onding  hier arch y  w il l  incr e m ent  by  1.  T hi s  pr act ic e  delivers   the  fitness   relat ed   to  disease  pro ne   an d  sal ubri ous  sta te   for  gi ve n  rec ord .  F ur t he r  the  fitness  ra ti o  of  the  giv e n  recor d  ab out  to  bot h  hierar c hies  will   m easur e,  whic h  is  the  a verage  of  the  fitn ess  relat ed  to   nu m b er  of   nes ts  in  co rr es po nd i ng  hierar c hies.   T he n  t he  root  m ean  s quare  d ist ance of  th e fitne ss v al ues   co rr e sp on ding  t o  bo th h ie rar c hies   s hould  m easur e.   The n  these  fitness   r at ios  an d  r oo t  m ean  squa re  distances  c orres pondin g  t o  both   hiera rc hies  will   use   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol.         Geno me  fe at ure  opti miza ti on  and  c oro na ry   ar te ry  disease   pr e dicti on   us in g  c uckoo  searc h … ( E. Neel im a )   111   to  c onf irm   the stat e  of  the   gi ve n  recor d  is   pr on e   to   co r on a r y  vasc ular  dise ase  or not  that  ex pl or e d  i n  f ollow in g  sect ion .  Th e  m at hem atical   m o del to a ssess t he  f it ness  foll ows   ste p 1: Let      be   the   nest  represe ntati ve  set s  ( see  sec  3. C)   of  disea se  pro ne  a nd  sa lubrio us  hierar c hies  ,  respec ti vely ,  suc h  t hat  eac h  ne st  r epr ese ntati ve   s et   co ntains   a   s et   of   hi gh ly   c orrelat ed   featur e s  ob ta in ed fr om  o ptim al  g ene  f eat ur e s d isc ov e re d  ( s ee sec  3. B )   ste p 2: Let   be  t he reco rd co ntains  SNPs res pecti ve  to  al l o ptim al  f e at ur e  ge nes  sel ect ed  (see  sec  3. B)   ste p 3: Let      be   the  set   represe nting  th e  set s  of  value s  as  e ggs  to   pl ace  in  nests,   s uch  that  eac h  e gg  co ntain s   the v al ues o bs e rv e d  i n    for  t he  g e nes of res pe ct ive n est   re pr e sentat ive set { ∃ ∈  } .   ste p 4:  = ∑ { 1 ∃ ∈ ∃ ∈  ∧ ∈  } |  | = 1   // add   1  t o  dis ease  pro ne  fitn ess  of   t he  gi ve n  rec ord    relat ed  to  pr one h ie ra rch y     if  egg  is com patib le  to plac e i n nest    in  pron e   hierar c hy  .   ste p 5: ⟨  ⟩ =  |  |   // Find in g  t he f it ness  rati o  ⟨  ⟩   relat ed  to  disease   pro ne hierarc hy   ste p 6:   = ∑ { √ ( 1 − ⟨  ⟩ ) 2 } + ⟨  ⟩ ∗ ( | | −  ) |  | = 1 |  |   //   T he  fitnes s  rati o  discar ds  f r om   1  for  nu m ber  of   ne sts   com patible   to   the   eg gs  e xist  i n     a nd  t he   fitn ess  rati o  m ultip li es  by  t he  nu m ber   of  i nco m patible   nests,   wh ic h  is  th e  di ff e ren ce   bet we en  total   nu m ber   of  nests  a nd  nu m ber   of  co m pat ible  nests   that  de note d  a s   |  | −      ste p 7:  = ∑ { 1 ∃ ∈ ∃ ∈  ∧ ∈  } |  | = 1   // ad d  1  to   sal ubrio us  fit ness  relat ed  t o   sal ubri ous   hierar c hy     if e gg  is com patible  to plac e in  n es t    in sal ubrio us hiera rch y  .   ste p 8: ⟨  ⟩ =  |  |   // Find in g  t he f it ness  rati o  ⟨  ⟩   relat ed  to  sal ubri ou s  h ie rar c hy   ste p 9:   = ∑ { √ ( 1 − ⟨  ⟩ ) 2 } + ⟨  ⟩ ∗ ( |  | −  )  = 1 |  | //  f ind i ng the  r oo t   m ean s qu a r e d ist ance  of t he  salu br io us    ste p 10 : fitness  us in g  t he  sim il ar p r oce ss d e fine d for  pro ne  fitne ss  r m sd  calc ulati on  in  step  6     3.6.   Disco verin g  t he recor d s tat e   The  fitness   rati os   ⟨  ⟩ , ⟨  ⟩   a nd  r oot  m ean  s quare   dist ances   ,     obta ine d  in  res pecti ve  to  disease   pro ne   an d  sal ub rio us  hiera rc hies  ,  fo r   giv e n  i nput  record   shou l d  us e   to   la bel  t he   rec ord   is  pro ne  to  d ise as e or salu bri ous.  Th e  label s houl d  de fine  u si ng the c onditi ona l flo w  that  fo ll ow s:   ste p 1:    ( ⟨  ⟩ ≅ ⟨  ⟩ )   Be gin   ste p 2:   (   <   )   Be gin   ste p 3:   Label the  r ec ord  as  d ise ase  pr on e   ste p 4:   En d  // of step  2   ste p 5:   Else    (   >   ) Be gin   ste p 6:   Label the  r ec ord  as  salu br i ou s   ste p 7:   En d  //  of ste p 5   ste p 8:   Else  // of  c ondit ion  i n  ste p 5    ste p 9:   Re cord  sta te   is   am big uous //   s ince  the   fitnes s  rati os  an d  r oot  m ean  sq uare  distance   ob ta ined   f or  bot h  hierar c hies is  s a m e   ste p 10 :   En d  // of step  1   ste p 11 :   Else  Begin  //  of c onditi on in  s te p  1    ste p 12 :    ( ⟨  ⟩ > ⟨  ⟩ ) Be gin   ste p 13 :   Label the  r ec ord  as  d ise ase  pr on e   ste p 14 :   En d  // of step  11   ste p 15 :   Else    ( ⟨  ⟩ < ⟨  ⟩ ) Be gin   ste p 16 :   Label the  r ec ord  as  salu br i ou s   ste p 17 :   En d  // of  ste p 1 4   ste p 18 :   Else  Begin// of  conditi on in  step  15   ste p 19 :   Re cord  sta te   is  a m big uous/ /  since  the  fitne ss   rati os   an d  roo t  m ean  sq ua re  distance  ob ta in ed  f or   both   hierar c hies a re  no t m eet ing  th e prescri bed co nd it io ns   ste p 20 :   En d  //  of ste p 1 8   ste p 21 :   En d  // ste p 11     3.7.   Empi ri cal  ana lysis o f th e  pr oposed  mo del   The  e xperim e ntal  stu dy  co nducted   on  da ta set   exp l or e d  in   sect io n  3.4).  I n  orde r   to  e xp l ore     the  pe rfor m ance  sign ific a nce  of   t he  pr opos e d  m od el   that  in corp or at ed   the  featur e   opti m izati on   by  bid i re ct ion al   pooled   var ia nc e  an d  cuc koo  search   m od el   cl assifi er  (BP VE&CS ),  the   exp e rim ental   resu lt s  ob ta ine d  a nd   com par ed  to   th e  oth e r  Co ntem porar y  m od el   [ 28 ]   that  sel ect s  op ti m al   featur es  us in g  for ward   sel ect ion   te ch ni que   and cla ssifie s  usi ng SV M  clas sifie r  ( FFS &S VM).    Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                          IS S N :   2722 - 3221   Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol. ,  V ol.  1 , N o.   3, N ov em ber   20 20:  106   –   11 5   112   The st at ist ic s  of   the  da ta set   use d ca n  de pict  in  ta ble  1 t hat  exp l or e d i n  3.4 ) . T he   cl assifi ca ti on   pr oces s   on   sai d  dataset   us in g  the  bo t h  m od el s  do ne  i n  4  f old s.  In   a dd it ion ,  the  perform ance  assessm ent  of   the  pro po s ed  m od el   and   co ntem po rar y  m od el   dep ic te d  us in g  cl assifi c at ion   assessm ent  m e tric s  [3 6]   su ch  as  pr ec isi on,   sensiti vity ,  sp e ci fici ty ,  and   a ccur acy .  The  r esults  obta ine d  for  bo t h  the  pro po se d  a nd  con te m po ra ry  m od el  dep ic te d i n  T a ble  2. T he   nota ti on   us e d  as  r ow a nd co l um n  head e rs  a re:      PPV :  Po sit ive   pr e dicti ve valu e ( or) precisi on     TPR:  True P osi ti ve  Ra te  ( or)   Sens it ivit y     TNR: Tr ue Ne gative Rat e  (or )  S pecifici ty     FN R:  False  Ne gative  rate ( or)   m issi ng   rate     FPR:  False P osi ti ve  Ra te  ( or)   fall ou t     ACC:  A cc ur ac y   The  pr e dicti on  accuracy  of   t he   bo t h  the  m odel s  ob se r ved   from   the  exp eri m ents  dep ic te d  in  Fig ur e   1.   The  resu lt s  depi ct ed  in  Fig ure   1  e vin ci ng  that   the  cl assifi cat ion   accu racy  ob serv e d  for  BP VE &CS   is  sta bl e  an d  su bst antia ll y  hig h  with  great er  than  93%  that  com par ed  to  FFS &SV M ,   wh ic h  obser ve d  as  inc on sis te nt     and less t ha n 9 0% .           Figure  1 .   The  c la ssific at ion  ac cur acy   rati os   of BP VE&CS  a nd FFS& S VM  ob s er ved f ro m  4 - fo l d  cl assifi c at ion       Table  2 .   T he  m et rics an d  th e  va lues  ob ta ine d from  4 - f old  cla ssific at ion   us in g pro po se d  a nd     con te m po ra ry  m od el .           PPV   TPR   TNR   FNR   FPR   ACC   BPVE & CS   Fo ld # 1   0 .95 8   0 .95 8   0 .94 7   0 .04 2   0 .05 3   0 .95 3   Fo ld # 2   0 .92 3   1   0 .89 5   0   0 .10 5   0 .95 3   Fo ld # 3   1   0 .91 7   1   0 .08 3   0   0 .95 3   Fo ld # 4   0 .95 7   0 .91 7   0 .94 7   0 .08 3   0 .05 3   0 .93   FFS&S VM   Fo ld # 1   0 .88   0 .91 7   0 .84 2   0 .08 3   0 .15 8   0 .88 4   Fo ld # 2   0 .87 5   0 .87 5   0 .84 2   0 .12 5   0 .15 8   0 .86   Fo ld # 3   0 .91 7   0 .91 7   0 .89 5   0 .08 3   0 .10 5   0 .90 7   Fo ld # 4   0 .84   0 .87 5   0 .78 9   0 .12 5   0 .21 1   0 .83 7       Figure s   2  a nd  3  dep ic ts  t he   pe rfor m ance  adv a ntage   of  t he  BP VE &CS   over   F FS& S VM  to wa rd s   sensiti vity   and  sp eci fici ty   tho se  re fe rs  the   sign ific a nce  of   disease  sc ope  pre dicti on   and   sig nifican ce  of   sal ubrio us   sta te   pr e dicti on  resp ect ively .   The  pr opose d  m od el   cl early   ou t perfor m ed  the  FFS &SV M     in  this  reg a rd.   The  Fi gures  4  and  5  evi ncin g  the  false  ne gat ive  rate  or  m is sing   rate,  false   posit ive  rate  or  fall - ou t  t hose  in di cat es  predict io n  fail ur e   rate  of  disease   sc ope  a nd  sal ub riou s   sta te   re spe ct ively   ob se r ved  f or   BPVE&C S  a nd  FFS &S VM.   From   the  de picte d  res ults  of  pre dicti on  fail ur e   rate   f or   disease   sco pe   an d  sal ubrio us  stat e is m uch  lo w for  pro po se d  m od el  t hat c om par ed  to FFS &S VM.       Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol.         Geno me  fe at ure  opti miza ti on  and  c oro na ry   ar te ry  disease   pr e dicti on   us in g  c uckoo  searc h … ( E. Neel im a )   113         Figure  2 .   The  s ensiti vity  ( dise ase p red ic ti on  rate)  of  BPVE&C S a nd F FS& SV M  obser ve d from  4 - f old   cl assifi cat ion     Figure  3 .   The  s pecifici ty  ( sal ubri ou s  stat e  pr e dicti on r at e)  of BP VE&CS   and FF S&S V M  ob s er ved f ro m  4 - fo l d  cl assifi c at ion             Figure  4 .   The   disease  pr e dicti on   fail ur e  r at e  (f al se  neg at ive  r at e ) of B PV E & CS  and FF S&S V M  ob s er ved f ro m  4 - fo l d  cl assifi c at ion     Figure  5 .   The  s al ubrio us  stat e  pr e dicti on f ai lu re r at e  (f al se  posit ive  rate)  of BPV E &CS a nd FF S &SV M  ob s er ved f ro m  4 - fo l d  cl assifi c at ion       The  proces s  c om plexity   ob s erv e d  i n  both  trai ning  a nd  te sti ng   phases   de picte d  i n  Fi gures   6  a nd  7  resp ect ively .  F ro m   the  de picte d  fi gures ,  it   is  obvi ou s   to  c oncl ude  that  pro cess  com pleti on   ti m e  of   BPV E&C S   in  trai ning  a nd   te sti ng   phases   is  sign ific a nt,   since  they   ar e  m uch   le sser   than  t he  pr oc ess  com pleti on  tim e   ob s er ved f or F FS&SVM  in  r e sp ect ive tr ai ning a nd test ing p hases.             Figure  6 .   Proce ss Com pleti on   tim e o f  trai ni ng  ph a se  ob se r ved f or   both B PVE&C S a nd  FFS&SVM i n 4 - fo l d  cl assifi c at ion     Figure  7 .   Proce ss Com pleti on   tim e o f  te sti ng  ph a se  ob s er ved f or both B PV E &CS  and FFS& SVM  in 4 - fo l d  cl assifi cat ion         4.   CONCL US I O N   Gen e  e xpressi on s  f or m s  as  t he  com bin at io n  of  m any  genes  a m ong  the  thousa nds  of  ge nes  de fin e d  un ti l  now.  Among   these   th ou san ds   of  ge nes ,  636  ge nes   id entifi ed   as   car dio  va scular   re la te d  that   are   usual ly   ref e rs  as  CA D Gen e s  [ 29 ] .  Sti ll   this  cou nt  of  ge nes  is  h ig h  dim ension   to  app ly   m achine - le arn i ng   m et ho ds   t o  Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                          IS S N :   2722 - 3221   Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol. ,  V ol.  1 , N o.   3, N ov em ber   20 20:  106   –   11 5   114   le arn   car dio   va scular  r el at ed  inf or m at ion .  C on ce r ning  this,   reducin g  the  dim ension al it y  of   the  C ADG enes  is   essenti al   facto r   to  im pr ov e  th e   perform ance  of  the  m achine  le arn i ng   proces s  that  ap plied  on  these  C ADG enes  set .  T his  m anu s cript  dep ic te d  a   novel   opti m a l  featur e   sel ect io n  te c hn i qu e   tha t  us es   bi directi on al   po oled  va r ia nce  est i m ation   (BP VE)   for  c oron a ry  artery  disea se  pr e dicti on.  Learn i ngs  f rom   the  con te m po ra ry  li te ratur e   sta ti ng  that  existi ng   c la ssifie r s  a re  unsta ble   to ward s  cl assifi cat io n  accu racy  a nd   inc onsta nt  t o  la bel  the   in divi du al   record ,  he nce  t he  la bel  pre dicti on   for  giv e n  r ecord  of  the   in div id ual  is   hi ghly   false  al a rm ed.  Co ns ide rin g  t his,   a  novel  cl assifi er  as p re dicti on  scal e p r opose d  her e  i n  t his ar ti cl e.  The  de picte d  cl assifi e r  buil t  over  t he   swar m   intel li gen ce  te chn i qu e  cal le d  Cuck oo   Searc h  (CS ).   T he  e xp e rim ental   st ud y  sta ti ng   t ha t  the  propose d  m od el   BPVE&C S  is   the  best  t o  re duce  dim ension al it y  of   t he   CA D Gen e s  am ong  t he  m od el s   f ound  i n  rece nt   li te ratur e .   The  e xperim ental   stud y  c om par ed   the  res ults  obta ine d  fro m   pr opos e d  m od el   with   the  r esults  obta ine d  from   con te m po ra ry  m od el   that  se le ct s  featu res  thr ough  forw a rd  feat ur e   sel ect ion   a nd  cl a ssifie s  us in g  SVM   (F FS &S VM)  [ 28 ] .   The   propose d  m od el   e vin ce d  18  genes  as  optim al   featur e s,  w hich  is  best  c ount   tha t   com par ed   to   a ny  of  th e  c onte m po rar y  m od e l  f ound  i n  rece nt  li te ratu re.   T he   la bel  predic ti on  strat egy   th rou gh   the  propose d  cl assifi er  t hat  bui ld  ov e r  c uc koo  search   is  c onsis te nt  in  cl assi ficat ion   acc uracy ,   evi nced  le ss  fa ll ou t  and  m issi ng  r at e and   high se nsi ti vity  an d  sp e ci fici ty . Th e p r ocess  c om pletio n  ti m e o f  the  pro po se d  m od e l al so   fou nd  as   m uch  le ss   an d  li near  that   com par e d  to   the   F FS& S VM.   The   fu t ure  res earc h  can   exten d  this   w ork   to   disco ver  the  p ossi bili ti es  of  us ing  ot her ANO VA  sta nda rds  l ike W il c oxon  Sign e d  ra nk,   E ntr op y   te st  to   r edu ce   the d im ension a li ty  o f  the  featu re s et .        REFERE NCE S   [1]   Thom  T,  Haa se   N,  Rosam ond  W ,   How ard   VJ ,   Rum sfeld  J,  Manol i o  T,  Zh eng  ZJ ,   F le ga l  K,   O' Donn el l   C,   Ki tt n er  S,  Ll o y d - Jones  D.   “ Hea rt  dise ase   a nd  stroke   statisti cs -- 2006  upda te :   a   rep or t  from   t he  Am eri c an  He art   As soci at ion   Stat isti cs  Com mi tt e e and  Strok e S ta ti s tics Subco m m it te e. ”   Circu l ati on .  vol.  113 ,   no.   6 ,   pp .   e85 ,   2 006.     [2]   Th y g ese n   K,   Al per t   JS ,   W hite   HD ,   Jaff e AS ,   Ap ple  FS ,   Ga lva ni   M, K at us   HA ,   Newb y   LK ,   R avkilde   J,   Chaitm an  B,   Cle m m ense n  PM .   Univer sa l  d e fini ti on   of   m y o c ard ial  infa r ct ion Kristia n   Th y ges en,  Jos eph  S.   Al per t   and   Harve y   D.  “ W hit e  on  beh alf  of  th e  Joint   E SC /ACCF /AH A /WH F  Ta sk  Force   for   th e  Red ef ini ti on   of  M y oc ard ial  Inf arc t ion. ”   European  Heart   Journal .  vo l.  28 ,   no.   20 ,   pp.   2525 - 38 ,   2007 .    [3]   Egge rs  KM ,   L in d  L,  Venge   P,   L i ndahl   B .   “ W il l  t he  univ ersa l  d e fi nit ion  of   m y oc ar dia l  infa r ct ion   cr it eria  r esult   in  an   over dia gnosis of   m y oc ard ial  infarct ion .”   The  Am eric an  Journal  o f  Cardiolog y .  vo l.   103 ,   no .   5 ,   pp .   588 - 91 ,   2009 .    [4]   W ang Z,   Luo X ,   Lu Y ,   Yang B.  “ m iRNAs   at   the   hea rt of  the   m atte r. ”   Journal   of M ole cu lar  Me dici ne .  vol .   86 ,   no .   7 ,  pp.   771 - 83 ,   200 8 .   [5]   De  Plane l l - Sagu er  M,  Rodi ci o  MC.  “ Dete ction  m et hods  for  m ic roRNA s  in  cl inic  pra ct i ce. ”   Cl in ic al  Bi och emistry .    vol.   46 ,   no .   10 ,   p p.   869 - 8 78 ,   201 3.     [6]   Mela nder   O,   Ne wton - Cheh  C ,   A lmgren  P,   Hedbl ad  B ,   B erg lund   G,  Engström  G ,   Perss on  M,  Sm it h  JG ,   Magnuss o n  M,  Christ ensson  A,  Stru ck   J.   “ Novel   and   conve nt i onal  biomarke rs   for  pr edi c ti on   of   inc id ent  c ard iov asc ula r   eve nts   in   the   comm unity . ”   Jama .  vol.  302 ,   no.   1 ,   pp .   49 - 57 ,   2009.   [7]   Shah  T ,   Casas  J P,  Cooper   JA ,   T zoul ak i  I ,   Sofat   R,   McCorm a ck  V,  Sm ee th   L ,   Dea nfi el d   JE,   Lo we  GD ,   Rum ley  A,   Fow kes  FG .   “ Crit ical   appr ai sal   o f  CRP   m ea sure m ent   for   the  pre dic ti on   of   cor on ar y   h ea rt   dise ase   ev ent s:  n ew  d ata   and s y st ematic r ev ie w  of   31  pros pec t ive   cohor ts. ”   Inte rnationa l  Jo urnal  of Ep ide mi ology .  vol.  38 ,   n o.   1 ,   pp.   217 - 31 ,  2009.     [8]   W il son  PW ,   Pen ci na  M,  Ja cque s  P,  Selhub  J,  D' A gostino  R,   O' Do nnel l  CJ.  “ C - re a ct iv e  protein  and   Rec l assific a ti on   of  Cardiovascul ar  Risk   in   th e  Fr amingham  Hea rt   Stud y   C li ni ca l   Perspec ti v e . ”   C i rculat ion:   Cardi ovasc ular  Quali t y  and  Outcome s .  v ol.   1 ,   no .   2 ,   pp .   92 - 9 7 ,   2008 .    [9]   Pedrotty   DM ,   Morle y   MP ,   Ca ppola   TP.   “ Trans cri ptomic  bio m ark ers  of  ca r diova scul ar  dise ase . ”   Progress   in   Cardiovascul ar  Diseases .   vol .   55 ,   no .   1 ,   pp .   64 - 9 ,   2012 .   [10]   Randi   AM ,   Big uzz i  E,  Falciani  F,  Merli n i  P,  Bla kemore  S,   Bramucc i  E,   Luc r ez io tt i  S,   L enno n  M,  Faioni  E M,   Ardiss ino  D,  Mannuc ci   PM .   “ Ide nti ficat ion  of  diff ere nt ia l l y   expr essed  gene s  in  cor o nar y   at h ero scl er oti c  p la ques  fro m   p at i ent s  with  st a ble   or  unst abl e   a ngina   b y   cDNA   arr a y   ana l y sis. ”   Journal  of  Thr ombos is  and  Haemos tasis .  vol.   1 ,   no.   4 ,   pp .   829 - 8 35 ,   2003 .    [11]   Archa cki  SR ,   A nghel oiu   G,   T ian  XL,  Ta n   FL,   DiPaola  N,   She n  GQ ,   Morave c   C,   El l is  S,   Top ol  EJ,   W ang  Q.   “ Ide nti ficati on   of  new  gene s  diffe ren ti a lly   ex pre ss ed  in  cor onar y   arter y   di sea se  b y   expr e ss ion  profil ing. ”   Phy siologi cal genom ic s .  vol .   15 ,   no.   1 ,   pp .   65 - 74 ,   2003.   [12]   El ashoff   MR,   W ingrove  JA ,   B eineke   P,   Dani el s  SE,   Ti ngl e y   W G ,   Rosenb erg   S,   Voros   S,  Kraus   W E,   Ginsburg   GS ,   Sc hwart z   RS ,   Ellis  SG .   “ Deve lo pm ent   of   a   bloo d - base d  g ene  ex pre ss ion  a lgori th m   for  assess m ent   of   obstruc ti v e   cor onar y   arter y   di sea se  in  non - d i abe t ic   p atient s. ”  BMC  Me d ic al   G enomic s .  vo l.  4 ,   no.   1 ,   pp .   26 ,   20 11 .    [13]   Kitt le son   MM ,   S hui  QY ,   Iri za rr y   RA,  Minhas   KM ,   Edne ss   G,   Cont e  JV ,   Parm igi an i   G,   Mill er   LW,   Chen  Y,   Hal l   JL,   Garc ia  JG .   “ Ide nti ficat ion  of   a   gen e  expr essio n  profile   that  d iffe ren ti a te s   betw ee n  ische m ic  and  no   isch emi c   ca rdiom y opat h y . ”   Circu lat ion .  vo l.   110 ,   no .   22 ,   pp .   3444 - 51 .     [14]   Kitt le son   MM ,   Minhas  K M,  Iri za rr y   RA,   Shui  QY ,   Edne ss   G,   Bret on   E,  Con te  JV ,   Tomaselli  G,  Gar ci a   JG ,   Har e   JM .   “ Gene   expr ession  anal y sis  of  ische m ic  and   nonische m ic  cardiom y opat h y :   s har ed  and  dist in ct   gen es  in  the  deve lopment   of heart failure. ”   P hysiol ogic a l  Gen omics .  vol .   21 ,   n o.   3 ,   pp .   299 - 30 7 ,   2005 .   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
Com pu t. Sci.  I nf. Tec hnol.         Geno me  fe at ure  opti miza ti on  and  c oro na ry   ar te ry  disease   pr e dicti on   us in g  c uckoo  searc h … ( E. Neel im a )   115   [15]   Min  KD ,   As akur a  M,  Li ao   Y,  Na kamaru  K,  Oka z aki   H,   Ta k aha sh i  T ,   e t  a l.   “ Ide n tification  of   gene s   relate d   to  h ea rt   fai lur e  using   glo bal   g ene  expr ession  profiling  of   h um an  fai l ing  m yoca rdium. ”   B ioch  and  B iophy  Res   Comm .  vol.  39 3,   no .   1 ,   pp .   55 - 60 ,   2010.     [16]   Suresh  R,   L i  X,   Chiriac  A ,   Goe l  K,  Te r zi c   A,  P ere z - Te r zi c   C,   Nelson  TJ.   “ Tr a nscript   m e  from   ci r cul a ti ng  cell s   suggests  d y sre g ula t ed  p at hwa ys  associate d   wi th  long - te rm   r e cur ren t   ev ent s   foll owing  first - t ime  m y o ca rdi al   infa rc ti on. ”   Jour nal  of   Molecul ar   and  Ce ll ular   Cardiology .  vol .   74 ,   pp .   13 - 21 ,   201 4 .    [17]   Li ew   CC,   Ma  J ,   Ta ng   HC, Zheng   R,   Dem pse y   A A.  “ The pe r iphe r al   b lood   tra nscr i pt  m e   d y namic all y   r efl e ct s s y ste m   wide  biol og y :   a   pote ntial  d ia gno stic   too l. ”   Journ al  of  Labor atory   and  Cli ni cal   Me dic in e . vol .   147 ,   np.   3 ,   pp.   126 - 32 ,  2006 .    [18]   Kaz m i  N,   Gaunt   TR .   “ Diagnosis   of   cor on ar y   h eart  d isea ses  using   gen e  expr ession   profi li ng;   stab le  cor on ar y   ar t e r y   disea se,   c ard i ac   i sche m ia   with   an d  without m y oc a rdia l   necros is. ”   Pl oS  on e .  vol. 1 1,   no .   3 ,   pp .   e01 49475 ,   2016 .   [19]   Yu  H,  Ni  J,  Zh ao  J.  “ ACO Sampl ing:   An  an t  c olon y   op ti m ization - base d  under   sam pli ng  m et hod  for  cl assif y ing   imbala nc ed  DN A m ic roa rra y   da ta . ”   N euroc omputing .  vol. 101 ,   no.   2 ,   pp .   309 – 3 18,   2013 .   [20]   Uze r  MS ,   Yilma z  N,   In an  O .   “ Fe at ure   sel ection   m et h od  base d   on   ar ti fi ci a l   bee  colon y   a lgori thm  a nd  support   vecto r   m ac hine s  for  m e dic a l  da ta sets   cla ss ifi ca ti on . ”   The  Sci en ti fic  World   Journal .  vo l.  201 3,   no.   11,   pp.   419 187,   2013. 2013 .   [21]   Arafa t  H,  El aw a d y   RM,  B ara k at   S,  El rashid y   NM .   “ Us ing  rough  set  and  ant   co lon y  opti m iz a ti on  in  f ea tur e  sel ec t ion. ”   Inte rnational   Jo urnal  of Emergi ng  Tr ends  &   Technol ogy in  Com pute r Sc ie nc e  ( IJ ETT CS) .  vol.   2,   no.   1 ,   2013 .   [22]   Ta ha   AM ,   T an g  AY .   “ Bat  al g orit hm   for   roug h  set   at tr ibut e   r educ t ion. ”   Journal  o f  Theor et i cal  and   Applie d   Infor mation  Tec hnology .  vol .   51 ,   no.   1 ,   pp.   1 - 8,   2 013.   [23]   Kum ar  PG ,   Vijay   SA ,   Deva r aj  D.  A  h y br id  col on y   fuz z y   s y stem  for  ana l y z ing  di abe t es  m ic roa rra y   d at a .   InCom puta ti ona l   Inte l li ge nce  in  Bioi nform at i cs  a nd  Com puta ti on al   Bio log y   (CIB CB),   2013  IE EE  Symposium  on   IEE E ,   pp .   104 - 1 11,   2013 .   [24]   Sathi shkum ar  K,  Thi ag ara su  V,  R amali ngam  M.  A n  eff icien t  ar ti fi c ia l  b ee   col on y   an d  fuz z y   c  m ea ns  base d  cl ust eri ng   gene   expr ession  dat a .   Int ern ation al   Journal  of   Inn ovat iv e  Researc h  in  Com pute r  a nd  Com m unic at i on  Engi ne eri ng .   2013  Ju l;   1(5) .   [25]   Naka m ura   RY,  Pere ira  LA,  Ro drigue s  D,  Cost a  KA ,   Pap a  JP ,   Yang  XS .   “ Sw arm  Inte l li gen ce  and  B io - Inspire d  Com puta ti on:   9.   Bina r y   B at   Algo rit hm   for  Fe at ur e  Sel ec t ion. ”   El s evi er   Inc .   Ch apters .   2013 .   [26]   Alsham la n  H,  B adr   G,   Aloha li   Y.  “ MRM R - AB C:  a   h y brid   g en e   select ion   a lgori t hm   for  ca n ce r   c l assific a ti on  usin g   m ic roa rra y   gene  expr ession  profi l ing. ”   Bi o Me d  r e search  internati onal .  vo l. 2015,  no.   9 ,   pp .   1 - 15 ,   2015 .   [27]   Chen  KH ,   W ang   KJ ,   Tsai ML,   W ang  KM ,   Adria n   AM ,   Cheng  W C,   Yang TS ,   T en g  NC,  T an  KP ,   Chang  KS .   “ Ge ne  sele c ti on   for   cance r   ide n ti f ic a tion:  a  d ecision  tr ee  m odel  empow ere d  b y   p art i cle  sw arm  opt imiza t ion  al gori thm. ”   BMC   bioi nform at i cs.   vol .   15 ,   no .   1 ,   pp .   49 ,   2014 .   [28]   Shila skar  S,   Gh at ol   A.  “ Fea ture  select ion   for   m edi c al   d ia gnosis:   Evaluation  for   ca rdiov asc u lar  d isea ses. ”   E xpe rt   Syste ms   wit h   Ap pli cations .  vo l.  40 ,   no .   10 ,   pp .   41 46 - 53 ,   2013 .   [29]   Li u  H,  Li u  W ,   Li ao  Y ,   Cheng  L,   L iu  Q,  R en  X,  Shi  L,  Tu  X,   W ang  QK ,   Guo  AY .   “ CAD gene :  a  comprehe nsi ve   dat ab ase   for   cor onar y   ar te r y   dise ase   gen es. ”   Nuc l ei c   Acids R ese arch .  vo l.  39 ,   no.   1 ,   p .   D991 - 6 ,   201 1 .   [30]   Budak  H,  Ta şab at   SE .   “ A  Modif ie d  T - Score   for  Feat ure   Selecti o n . ”   Appl i ed  S ci e nce s  and  Engi ne ering,   vo l.  17,   p p .   845 - 845,   2016 .   [31]   Kumm er  O,   Sav o y   J,   Argand   R E .   “ Fea ture  sel ect ion  in   senti m ent  an aly sis. ”  Proc ee dings   of   th e   9t h  Conf ere nc e   on  Information  R et r ie va l  and   Applic ati ons,    [32]   Sahoo  PR ,   Th eo rems   TM.   “ Functi onal E qu at ions . ”  W orld  Sc ie nt if ic ,   1998.   [33]   htt p://ww w.sjsu.e du/facul t y / ger st m an/ Stat Prim er/t - ta bl e. pdf ,   2017 )   [34]   Yang  XS ,   Deb   S.  “ Cuckoo  se ar ch  vi a  Lé v y   fli g hts. ”   In   Nature   &   Bi ologi cal ly   I nspired  Computi ng ,   NaBIC   2009 .   W orld  Congress  on  IEEE, pp. 21 0 - 214,   2009 .   [35]   Barr ett  T ,   W il h i te   SE ,   L edoux  P ,   Ev ange l ista   C ,   Kim   IF,  Tomashevsk y   M ,   Marsh al l  KA ,   Phill ipp y   KH ,   Sherm an   PM ,   Holko  M ,   Yefa nov   A.   “ NCBI  GEO:   ar chi v e  f or  func ti on al  gen om ic s  data   sets — updat e . ”   Nuc l ei c   ac ids  resear c h .  vol.   41 ,   no .   D1 ,   pp.   D991 - 5,   201 3.   [ 3 6 ]   Pow ers  DM .   “ Eva luation:  from   pre ci sion ,   r ecal l   and  F - m ea sure   t o  ROC,  unfo rcedness,  nak edne s s  and  cor re la t ion . ”   Journal  of   Mac h ine   Learning   Te chnol ogi es ,  vol .   2,   no .   1 ,   pp .   37 - 63,   2011 .   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.