I nte rna t io na l J o urna l o f   E lect rica l a nd   Co m p ute E ng in ee ring   ( I J E CE )   Vo l.   6 ,   No .   6 Dec em b er   201 6 ,   p p .   3 1 0 3 ~ 3 1 1 1   I SS N:  2 0 8 8 - 8708 DOI : 1 0 . 1 1 5 9 1 / i j ec e . v 6i 6 . 1 1 8 1 0          3103       J o ur na l ho m ep a g e h ttp : //ia e s jo u r n a l.c o m/o n lin e/in d ex . p h p /I JE C E   A Nov el  H u m a STR Si m ila rity M ethod  u sing  Cas c a de  Statistica Fu zz y   Rules w ith  Triba l Infor m a tion Inf e rence       M .   Ra h m a t   Widy a nto ,   Reg g io   N.   H a rt o no ,   Nurt a m i So eda rso no   F a c u lt y   o f   Co m p u ter S c ien c e ,   Un iv e rsit y   o f   In d o n e sia ,   In d o n e sia       Art icle  I nfo     AB ST RAC T   A r ticle  his to r y:   R ec eiv ed   Au g   13 ,   2 0 1 6   R ev i s ed   Oct   2 0 ,   2 0 1 6   A cc ep ted   No v   4 ,   2 0 1 6     A n o v e h u m a n   S T (S h o rt  T a n d e m   Re p e a t)  si m il a rit y   m e th o d   u sin g   c a s c a d e   sta ti stica f u z z y   ru les   w it h   tri b a in f o rm a ti o n   in f e re n c e   is  p ro p o se d .   T h e   p ro p o se d   m e th o d   c o n sists   o f   tw o   c a sc a d e   F u z z y   In f e r e n c e   S y ste m (F IS ).   T h e   f irst  F IS   is  to   d isc ri m in a te  th e   tri b a sim il a rit y ,   a n d   th e   se c o n d   F IS   is  to   c a lcu late   th e   S T si m il a rit y .   B y   u sin g   th e   a ll e le  m a r k e r’s   sta ti stica l   d istri b u ti o n   p r o b a b il it y   d e n sit y   fu n c ti o n   a th e   m e m b e rsh ip   f u n c ti o n   in   th e   F u z z y   Ru les   o f   th e   f irst  F IS ,   th e   n e w   m e th o d   m a k e it   p o ss ib le  to   tell  th e   tri b a sim il a rit y   b e twe e n   tw o   S TR  p ro f il e s.  A   7 2 7   d a ta  a c q u ired   f ro m   tri b a g ro u p o f   In d o n e sia   is  u se d   to   e x a m in e   th e   m e th o d   p ro d u c e d   p ro m isin g   re su lt ,   b e in g   a b le  to   in d ica te  h i g h e tri b a sim il a rit y   sc o re   w it h in   a   tr ib a l   g ro u p   a n d   lo w e sim il a rit y   b e t w e e n   tri b a l   g ro u p s.  I n   t h e   li g h t   o f   I n d o n e sia ’s  d iv e rse   tri b a g ro u p s,   th e se   p r o p e rti e a re   a b le  to   b e   lev e ra g e d   a a   n e w   w a y   to   im p ro v e   th e   v e rsa ti li ty   o f   e x isti n g   DN A   m a tch in g   a lg o rit h m .   K ey w o r d :   C ascad f u zz y   r u les   Sh o r t an d e m   r ep ea t   S tatis t ical  d is tr ib u tio n   T r i b al  i n f o r m at io n   Co p y rig h ©   2 0 1 6   In stit u te o A d v a n c e d   E n g i n e e rin g   a n d   S c ien c e   Al rig h ts  re se rv e d .   C o r r e s p o nd ing   A uth o r :   M.   R ah m at  W id y a n to ,     Facu lt y   o f   C o m p u ter   Scien ce ,     Un i v er s it y   o f   I n d o n e s ia,   Dep o k   C a m p u s ,   Dep o k - 1 6 4 2 4 ,   W est J av a,   I n d o n esia.   E - m a il:  w id y a n to @ cs. u i.a c. id       1.   I NT RO D UCT I O N   DN A   ( Deo x y r ib o n u c leic  A ci d )   is   a   g en et ic  m ater ial  w h ic h   co n ta in s   i n f o r m atio n   t h at  i s   u n iq u f o r   ea ch   i n d iv id u al.   Fo r   t h is   r ea s o n   DN A   h as   b ee n   u s ed   f o r   h u m a n   id en ti f icatio n   [ 1 ] .   C u r r e n tl y   t h er ar m a n y   DN A   an al y s is   m eth o d s   [ 2 ] ,   e. g .   R estrict io n   Fra g m e n P o l y m o r p h is m   ( R F L P )   an al y s i s ,   Fra g m e n L e n g th   P o ly m o r p h is m   ( F L P ) ,   an d   Sh o r T an d em   R ep ea ( ST R )   an al y s i s .   T h Fed er al  B u r ea u   I n v esti g a tio n   ( FB I )   h as   ch o s en   1 5   lo cu s   a n d   a m elo g e n in   b ased   o n   ST R   a n al y s is   to   b th s ta n d ar d   o f   h u m a n   id en tif icat io n   [ 3 ] .   M. R .   W id y a n to   et  al.   [ 4 ]   h as  p r o p o s ed   ST R - B ased   DN A   s i m il ar it y   m atc h in g   u s in g   f u zz y   i n f er e n ce   s y s te m   f o r   h u m a n   id en ti f icatio n .   T h er a r m an y   ai m s   o f   h u m an   id e n t if icatio n   u s i n g   DN A ,   e. g . ,   f a m il y   r elatio n   p r o o f ,   cr i m i n al  ac tio n   ev id en ce ,   a n d   d is aster   id en t if ica tio n .   Ho w e v er ,   in   t h ca s o f   m as s   n u m b e r   o f   DN A   s u s p ec ts ,   it  is   i m p o r tan to   r ed u ce   t h e   n u m b er s   o f   s u s p ec t s .   I n f o r m at i o n   r eg ar d in g   th e   p o s s ib le   tr ib an d   et h n icit y   m a y   h elp   r ed u ci n g   DN s u s p ec ts   f o r   m a s s   s cr ee n in g .   P r ev io u s   r esear ch   o n   tr ib al  i n f o r m atio n   o n   DN h as  b ee n   in v e s ti g ated .   I h as   b ee n   o b s er v ed   th at  th er ar s tatis t ical  an d   p r o b a b ilis tic  p r o p er ties   o f   DN A   in   r eg ar d s   o f   th p r o f ile s   et h n icit y   [ 5 ] .   T h er ar s tu d ie s   s u g g esti n g   t h a th er ar e   ce r tain   S h o r T an d em   R ep ea t   ( ST R )   allele  p r o p o r tio n s   w h ich   o cc u r   d is ti n cti v el y   d i f f er en ac r o s s   tr ib al  g r o u p s   [ 6 ] .   Ho w e v er ,   th r esear c h   is   co n d u cted   o n   ass u m p tio n   t h at  th er is   n o   n o is an d   u n ce r tai n t y   co n d itio n   d u r in g   DN A   d ata  ac q u is itio n .   T h is   p ap er   p r o p o s es  n o v e l   m et h o d   to   i n f er   t h s i m ilar i t y   o f   tr ib al   in f o r m a tio n   u s in g   s tati s tical   f u zz y   r u les  [ 7 ]   to   d ea w i th   u n ce r tai n t y   a n d   i m p r ec is e n es s   o f   ST R .   T h is   p ap er   is   i m p r o v e m e n o f   [ 4 ]   to   in cl u d tr ib al  in f o r m atio n   i n f er en ce   o n   ST R - B ased   DN A   s i m ilar it y   m atc h i n g   u s i n g   s ta tis tical  f u zz y   r u le s   w h er th alle le  m ar k er s   s t atis tical  d is tr ib u tio n   p r o b ab ilit y   d en s it y   f u n c tio n   is   u s ed   a s   th m e m b er s h ip   f u n ctio n   i n   t h f u zz y   r u le s .   T h p r o p o s ed   m eth o d   co n s is ts   o f   t w o   ca s ca d Fu zz y   I n f er e n ce   S y s te m s   ( FIS) .   T h f ir s t   w h ich   i s   b ased   o n   T ak ag i - S u g en o   FIS   [ 8 ]   is   to   d is cr i m i n ate  th e   tr ib al  s i m ilar it y ,   a n d   t h s ec o n d   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I J E C E     Vo l.  6 ,   No .   6 Dec em b er   2 0 1 6   :   3 1 0 3     3 111   3104   w h ic h   i s   b ased   o n   Ma m d a n FIS  [ 9 ]   is   to   ca lc u late  th e   ST R   s i m i lar it y .   I n   t h li g h o f   I n d o n esia s   d iv er s e   tr ib al  g r o u p s ,   th e s p r o p er ties   ar ab le  to   b e   lev er a g ed   as   a   n e w   w a y   to   i m p r o v e   t h v er s atilit y   o f   e x i s ti n g   DN A   m atch in g   al g o r ith m .   T h ex p er i m e n o n   7 2 7   I n d o n esi an   DN p r o f iles   s h o w n   th at   t h n e w   m et h o d   is   ab le  to   d if f er en tiate  DN A   p r o f iles   b et w ee n   tr ib al  g r o u p s   al th o u g h   th d ata  is   h i g h l y   n o n - d is cr i m i n ati v e.   I n   Sectio n   2 ,   th e   F u zz y   ST R   s i m ilar it y   m et h o d   is   d escr ib ed .   I n   Sectio n   3 ,   t h s tatis tic al  p r o p er ty   o f   tr ib al   in f er en ce   is   e x p lai n ed .   I n   Se ctio n   4 ,   t h p r o p o s ed   ca s ca d s tati s tical   f u zz y   i n f er en ce   s y s te m   w it h   tr ib al   in f o r m atio n   i n f er e n ce   i s   d is c u s s ed .   Sectio n   5   d is cu s s e s   t h ex p er i m e n tal   r esu lts   o f   t h e   p r o p o s ed   m et h o d .   C o n cl u s io n   is   d escr ib ed   in   Sec tio n   6 .       2.   F U Z Z ST SI M I L AR I T Y   DN A   P r o f ile  is   s et  o f   n u m b er s   w h ic h   r e f lects   p er s o n s   DN A   m ak e u p ,   in   co n tr ast   to   f u ll  g en o m e   s eq u en c in g .   T h er ar m a n y   m eth o d s   to   d o   th is   w o r k   [ 2 ] ,   b u ST R   ( Sh o r T an d em   R ep ea ts )   an al y s i s   i s   p r ef er r ed   [ 3 ]   as  u s ed   b y   t h U n ited   Ki n g d o m   a n d   Un i ted   St ates.  ST R   an al y s is   co u n ts   t h r ep etitio n   co u n o f   p atter n s   o f   t w o   o r   m o r n u c le o tid es  w h ich   ar r ep ea ted   an d   th e   r ep ea ted   s eq u e n ce s   ar d ir ec tl y   ad j ac en to   ea ch   o th er .   T h id ea   is   to   ca p t u r th ST R   v alu o f   f e w   lo ca ti o n s   in   p er s o n s   g e n etic  m ak e u p   ca lled   lo cu s ,   as  illu s tr ated   in   Fi g u r 1   ( Or ig i n al  p ictu r f r o m   Natio n al  I n s tit u te  o f   Sta n d ar d s   an d   T e ch n o lo g y   ( NI ST ) ) .   P r ev io u s   r esear ch   h as  b ee n   u n d er tak en   to   h ar n e s s   t h f lex ib i lit y   o f   Fu zz y   Set  to   th D N A   ( Deo x y r ib o n u cl eic   A cid )   P r o f ile  m atc h i n g s   p r o b le m .   M.   R .   W id y an to   et  al.   [ 4 ]   p r o p o s ed   m et h o d   to   as s ig n   f u zz y   s i m ilar it y   m ea s u r [ 1 0 ]   b etw ee n   t w o   all ele  m ar k er s ,   i n   co n tr ast  to   cr is p   0   o r   1   s im ilar it y   m ea s u r u s ed   in   co n v e n tio n al   ST R   b ased   DNA   p r o f ile  m atc h in g   al g o r it h m   [ 1 1 ] .   T h n ee d   to   h av f u zz y   s i m ilar it y   m ea s u r is   tr i g g er ed   b y   th f ac th at   ST R   p r o f iles   o f t en   s h o w ed   r ea l - v al u ed   n u m b er s   as  a n   al lele  m ar k er   v al u e   in s tead   o f   n at u r al   n u m b er s .   T h is   i s   s u p p o s ed l y   th e f f ec o f   n o is in   th p r o ce s s   o f   an al y zi n g   t h ST R   p r o f ile.   Usi n g   f u zz y   s i m ilar it y   m ea s u r e,   t w o   al leles   w i th   s m all  d i f f er e n ce   w il l sti l l g et  s i m ilar it y   s co r i n s tead   o f   cr is p   0 ,   w h ic h   d is ca r d   th p o s s ib ilit y   o f   th e   t w o   alle les  h av in g   s i m ilar it y   v alu e   alt h o u g h   o n l y   d if f er   s l i g h t l y ,   w h ic h   co u ld   o cc u r   b ec au s o f   t h n o is d u r in g   DN A   d ata  ac q u is i tio n .           Fi g u r 1 .   T h L o cu s   in   C h r o m o s o m al  P o s itio n s       I n   DN A   p r o f ile  m a tch i n g   p r o b le m ,   f o r     (     )   am o u n t o f   in d i v id u a l s ,   th d ataset  i s   d escr ib ed   as     *           +         ,   ( 1 )     w h er       is   v ec to r   o f   DN A   p r o f ile  e v id en ce   a n d         is   v ec to r   o f   DN A   p r o f i le  r ef er e n ce .   T h v ec to r         an d           ar th     (     )   d im e n s io n al  v ec to r   co n s is tin g   o f   th v al u o f   1 5   lo ci   w i th o u t a m elo g e n i n   as  h as  b ee n   u s e d   b y   Fed er al  B u r ea u   o f   I n v esti g atio n   ( FB I )   [ 3 ] .   Valu o f   e v er y   D N A   lo ci  is   r ep r esen ted   b y   f u zz y   n u m b er   ( as  s h o w n   b y   Fi g u r 2 )   w h er th e   f u zz in e s s   v al u is   s et  to   b 0 . 4   th r o u g h   e x p er i m e n ts   [ 4 ]   an d   th ce n ter   o f   t h f u zz i n es s         is   th e   v al u o f   th e   co r r esp o n d in g   lo ci.   T h s im il ar it y   v al u [ 1 0 ]   b e t w ee n   an   a llele  o f   DNA   p r o f ile  ev id en c an d   DNA   p r o f ile   r ef er en ce   is   g i v en   b y                  )       . (             )     (             ) / . (             )         / )     ,       -   ,   ( 2 )   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I J E C E     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A   N o ve l H u ma n   S TR  S imila r ity  Meth o d   Usi n g   C a s c a d S ta ti s tica l F u z z R u les   . . . .   ( M.  R a h ma t W id ya n to )   3105   w h er           is   th v al u o f   th j - th   lo ci  o f   th e   DN A   p r o f ile  e v id e n ce   an d           is   t h v alu e   o f   t h j - th   lo ci   o f   th DN A   p r o f ile  r ef er e n ce .   Fu r t h er   b y   b r ea k i n g   d o w n   th f o r m u latio n   t h r o u g h   d o in g   s i m p le  m u ltip licat io n   o p er atio n s ,   it is   o b tain ed                   )       (                     )           .   (3)     An d   b y   d iv id i n g   a n d   m u ltip l y i n g   t h co ef f icie n t s ,   f i n all y   th s i m p le  li n ea r   f o r m   is   b eg o tte n                   )                             .   (4)     T h s i m ilar it y   b et w ee n   t w o   DN A   alleles   is   t h u s   ca lc u late d   as  th a v er ag o f   t h s i m il ar it y   o f   t h e   en tire   lo cu s ,   w h ic h   in   t u r n   is   a r ith m etic  m ea n ,   w h ich   i s   ex p r ess ed   as                                     )         ( 5 )     w h er       is   th v alu o f   s i m i lar it y   b et w ee n   DN A   p r o f ile  e v id en ce   an d   DN A   p r o f ile  r e f e r en ce   o f   t h i - th   in d iv id u al.   T h n ex s tep   to   o b tain   th ST R   s i m ilar it y   v alu is   to   ca lcu late  t h s i m ilar it y   b et w ee n         an d         (     )   w h ic h   i s   t h f a m il y   r e f er en ce   v al u o f   t h i - t h   i n d iv id u al  t h r o u g h   Ma m d a n FIS  [ 9 ]   w h ic h   co n s is t   o f   9   r u les as  f o llo w .   1.   I f         is   lo w   a n d         is   lo w   th e n   ST R   Si m ilar i t y   i s   lo w ,   2.   I f         is   lo w   a n d         is   med iu m   th en   ST R   Si m ilar it y   is   lo w ,   3.   I f         lo w   is   a n d         h ig h   is   th en   ST R   Si m ilar it y   is   med iu m ,   4.   I f         med iu m   is   an d         is   lo w   t h en   ST R   Si m ilar it y   is   med iu m ,   5.   I f         is   med iu m   an d         is   h ig h    th en   ST R   Si m ilar it y   is   med iu m ,   6.   I f         is   med iu m   an d         is   h ig h   th en   ST R   Si m ilar it y   is   med iu m ,   7.   I f         is   med iu m   an d         is   lo w   t h en   ST R   Si m ilar it y   is   med iu m ,   8.   If         is   h ig h   an d         is   med iu m   th en   ST R   Si m ilar it y   is   med iu m ,   9.   If         is   h ig h   an d         is   h ig h   th en   ST R   Si m ilar it y   is   h ig h .             Fig u r 2 .     Fu zz y   S i m ilar it y   b et w ee n   T w o   L o c u s       Fo r   th a n tece d en t h f u zz y   m e m b er s h ip   f u n c tio n   f o r   lo w med iu m ,   an d   h ig h   ar g i v e n   b y   F ig u r 3 .   T h lo w   m e m b er s h ip   f u n ct io n   v alu i s   1   w h en           is   0   u n til  0 . 1 8 ,   an d   b ec o m 0   w h e n           is   0 . 3 .   T h med iu m   m e m b er s h ip   f u n ctio n   h a s   its   p ea k   at         is   0 . 3 5   an d   h av in g   ze r o   v alu at          is   0 . 2   an d   0 . 5 .   T h h ig h   m e m b er s h ip   f u n ctio n   h as z er o   v alu at          is   0 . 4   an d   1   at          is   0 . 5   u n ti l 1 .   Fo r   th co n s eq u e n th f u zz y   m e m b er s h ip   f u n ctio n   f o r   lo w med iu m h ig h   ar g iv en   b y   Fig u r 4 .   T h lo w   m e m b er s h ip   f u n ctio n   v al u is   1   w h e n   s i m ilar it y   is   0 ,   a n d   b ec o m e s   0   w h e n   s i m ilar it y   is   0 . 4 .   T h med iu m   m e m b er s h ip   f u n ctio n   h as  it s   p ea k   at  s i m ilar it y   i s   0 . 5   an d   h as  ze r o   v alu e   w h e n   s i m ilar it y   is   0 . 3   an d   0 . 8 .   T h h ig h   m e m b er s h ip   f u n ctio n   h as   ze r o   v alu at  s i m ilar it y   is   0 . 8   an d   1   at  s i m ilar it y   i s   1 .   μ     )   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I J E C E     Vo l.  6 ,   No .   6 Dec em b er   2 0 1 6   :   3 1 0 3     3 111   3106             Fig u r 3 .   Fu zz y   Me m b er s h ip   Fu n ctio n   f o r   A n tece d en t   Fig u r 4 .   Fu zz y   Me m b er s h ip   Fu n ctio n   f o r   C o n s eq u en t       3.   T H E   S T A T I S T I CS O F   T RI B AL   I NF E R E NC E   I n   f o r e n s ic  s cie n ce ,   it  h as   b ee n   t h s tan d ar d   to   p r o f ile  DN A   s a m p le s   w i th   th e   S h o r T an d e m   R ep ea ( ST R )   ch ar ac ter is tic  o f   ce r tai n   lo ci  [ 1 1 - 1 2 ] .   T h Fed er al  B u r ea u   I n v esti g atio n   ( FB I )   h a s   ch o s e n   1 5   m ar k er s   ( ca lled   lo cu s )   an d   a m elo g e n i n   b ased   o n   ST R   an al y s is   to   b th s tan d ar d   f o r   h u m a n   id en ti f icatio n .   T h e   s tan d ar d   is   ca lled   C O DI ( C o m b i n ed   DN A   I n d ex   S y s te m )   [ 3 ] ,   en ab les  u n i f o r m   r ep r esen tat io n   o f   D N p r o f ile  an d   ex c h a n g D N A   b et w ee n   co u n tr ies.  T h 1 5   lo cu s   ar C SF F1 P O,   FG A ,   T H0 1 ,   T P OX,   VW A ,   D2 1 S1 1 ,   D3 S1 3 5 8 ,   D5 S8 1 8 ,   D7 S 8 2 0 ,   D8 S1 1 7 9 ,   D1 3 S3 1 7 ,   D1 6 S5 3 9 ,   D1 8 S5 1 ,   D1 9 S 4 3 3 ,   D2 S1 3 3 8 ,   p lu s   a m elo g e n i n .   I n   t h f r eq u e n c ase  w h er n o   id en t ical  ST R   m atc h   is   f o u n d ,   a n y   in te llig e n ce   w h ich   co u ld   b e   in f er r ed   f r o m   th e   s a m p le  i s   v er y   p r ec io u s   in   aid in g   th e   i n v esti g a tio n ,   e s p ec iall y   i n   r ed u c in g   t h n u m b er   o f   in ter v ie w s   an d   s u s p ec ts .   I n f o r m atio n   r eg ar d i n g   t h p r o b ab le   eth n icit y   an d   tr ib al  in f o r m ati o n   o f   an   o th er w is e   to tall y   u n k n o w n   o f f en d er   m a y   h elp   in v es tig ato r s   to   lo o k   f o r   tar g ets  an d   s etti n g   p r io r ities   f o r   m as s   s cr ee n i n g   o r   in ter v ie w s   [ 3 ] .   On o f   t h in f o r m atio n   th a co u ld   b i n f e r r ed   is   th tr ib al  i n f o r m atio n   o f   th e   p er s o n   f r o m   w h ic h   th DN A   s a m p le  is   p r o f iled .   T h er h av b ee n   lo o f   s tu d ie s   co n ce r n i n g   th v a r iatio n   o f   th ST R   p r o f ile  p r o p o r tio n   b et w ee n   tr ib al  p o p u latio n s   [ 1 3 - 1 4 ] .   I n   o n e   s t u d y ,   Gil et  al.   [ 1 5 ]   h av d escr ib ed   d is tr ib u tio n s   f o r   t h r ee   tr ib al  g r o u p s   e m p lo y i n g   f o u r   d if f er e n s i n g le  lo cu s   p r o b es.  T h c o n f ir m atio n   th at  th e   tech n iq u i n   [ 1 5 ]   ca n   p r o v id e   q u ali f ied   in d icat io n s ,   b u n o t   tr ib al  ca teg o r ical  co n c lu s io n s   ar g i v e n ,   it  h as   b ee n   d escr ib ed   b y   E v ett  et   al.   [ 6 ] .   I n   co n tr ast,  i n   t h i s   p ap er ,   th n o v el   m e th o d   to   i n f er   tr ib al  in f o r m at io n   o f   a   p er s o n   is   p r o p o s ed .       4.   T H E   P RO P O SE T R I B AL   I NF E R E NC E   T h d ev elo p m e n o f   t h F u zz y   I n f er en ce   S y s te m   ( FI S)  f o r   th DN A   p r o f ile  m atc h i n g   w a s   f o cu s ed   o n   h o w   to   in f er   s tatis ticall y   u s ef u i n f o r m atio n   f r o m   t h DN A   p r o f i les.  T h id ea   o f   t h p r o p o s ed   m eth o d   i s   to   in co r p o r ate  th s tatis tica p r o p er ty   o f   P r o b ab ilit y   Den s it y   Fu n ctio n   o f   th d is tr ib u tio n   o f   allele  m ar k er s   o f   ce r tain   tr ib al  in f o r m atio n   a n d   in co r p o r ate  th ca lcu latio n   u s in g   T ak ag i - S u g e n o   FIS  [ 8 ] .   Fig u r 5   s h o w s   th e   o v er v ie w   o f   h o w   th a lg o r it h m   i s   ca r r ied   o u t.  Star s tep   is   to   co m p ar t h DN p r o f ile  ev id en ce   w i th   DN p r o f ile  r ef er en ce   f r o m   D N A   d atab ase.   I f   al l r ef er e n ce s   h a v n o t b ee n   ch e c k ed ,   p ick   th e   n e x t r e f er en ce   p r o f i le.   I f   all   lo ci   h av e   n o b ee n   co m p ar ed   th en   co m p ar t h n e x lo ci  u s i n g   th e   p r o p o s ed   FIS.   I f   all  lo cu s   h av e   b ee n   co m p ar ed ,   th e n   ch ec k   w h et h e r   all  r ef er en ce s   h a v b ee n   ch e ck ed   o r   n o t.  I f   all  r ef er en ce s   h av b ee n   c h ec k ed   th en   ca lc u late  t h a v er ag tr ib al  s i m ilar it y .   Af ter   t h at,   ca lcu l ate  th ag g r eg a te  tr ib al  s i m ilar it y   v a lu e.   T h p r o p o s ed   FIS  ca n   b co n f i g u r ed   to   u s e   as  m a n y   p r o f il es  as  in te n d ed ,   an d   t h er e f o r g iv in g   t h e   in v e s ti g ato r   th f le x ib ilit y   i n   t esti n g   d i f f er e n tr ib al  g r o u p s .   T h f o llo w i n g   ex p lai n s   in   d et ail  th w al k t h r o u g h   o f   th f r a m e w o r k   th a is   e m b o d ied   in   th p r o p o s ed   FIS,   w h ic h   u s es  t h allele  m ar k er s   d is tr ib u tio n   a s   m e m b er s h ip   f u n ctio n .   An d   th en   ad j u s th s etti n g s   o f   t h T ak ag i - Su g e n o   FIS  an d   p er f o r m   s o m ca lc u latio n s   to   o b tain   th v al u t h at  r ef lec t s   th tr ib al  i n f o r m atio n   s i m ila r it y   b et w ee n   t w o   ST R - B ased   DN A   p r o f iles .   T h h y p o t h esi s   in   e m b ed d in g   t h t r ib al  in f o r m atio n   i n f er en ce   i n   th p r o p o s ed   FIS  is   to   s o m e h o w   i n co r p o r ate  th s tatis t ical  p r o p er ty   o f   th e   tr ib al  ch ar ac ter is tic  s o   th at   t h tr i b al  in f o r m atio n   i s   n o lo s t   in   th ST R   s i m ilar it y   ca lcu latio n .   I h a s   b ee n   n o ted   th at  alt h o u g h   M.   R .   W id y a n to   et  al  [ 4 ]   w er ad eq u ate  i n   ass i g n in g   f u zz y   s i m ilar it y   m ea s u r b et w ee n   t w o   a lleles,  t h s tati s tical   in f o r m atio n   r eg ar d in g   t h t w o   p r o f ile s   tr ib al   in f o r m atio n   is   lo s t.  T h is   lo s i n f o r m atio n   i s   w h at  t h s y s te m   is   tr y i n g   to   r eg ain .   I n itial  s tatis tical  a n al y s i s   o f   th DN A   p r o f ile s   s h o w ed   an   in ter esti n g   p atter n .   I s ee m s   th at  t h allele  m ar k er s   p r o b ab ilit y   d is tr ib u ti o n s   w it h i n   tr ib al  g r o u p   f o r m   Gau s s ia n   d is tr ib u tio n   w it h   d i f f er en s ta n d ar d   d ev iatio n s   b et w ee n   tr ib al  g r o u p s .   l o w   m e d i u m   h i g h   l o w   m e d i u m   h i g h   h i g h   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I J E C E     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A   N o ve l H u ma n   S TR  S imila r ity  Meth o d   Usi n g   C a s c a d S ta ti s tica l F u z z R u les   . . . .   ( M.  R a h ma t W id ya n to )   3107   Fig u r 6   d ep icts   t h p lo o f   t h d is tr ib u tio n   o f   t h D1 9 S4 3 3   allele  m ar k er s   o f   tr ib al  g r o u p   in   I n d o n esia   i.e .   J av an ese.             F ig u r 5 .   T h Ov er v ie w   o f   t h e   T r ib al  I n f o r m atio n   I n f er e n ce           Fig u r 6 .     T h Gau s s ia n   d is tr i b u tio n   o f   A l lele  Ma r k er   Val u e       A lt h o u g h   it  h a s   b ee n   s aid   th at   ea ch   tr ib al  g r o u p   h as  th eir   u n iq u allele  d is tr ib u tio n ,   th er is   ca v ea t   th at  t h d i f f er en ce   i n   th eir   d i s t r ib u tio n   i s   v er y   t ig h a n d   h ar d ly   d is cr i m i n ati v e.   T ak in g   t h i s   s tatis tical   p r o p er ty ,   th lo g ical  h y p o th e s is   i s   to   e m b ed   t h i s   Ga u s s ian   P r o b ab ilit y   De n s it y   Fu n ctio n   ( P DF)   as  th m e m b er s h ip   f u n ctio n   in   th p r o p o s ed   FIS   th at  is   b u ilt .   T h is   w a y ,   th Gau s s ia n   f u n ctio n   ac ts   s i m ila r   to   a   m e m b er s h i p   f u n ctio n   t h at   as s ig n   a   v alu e   t o   an   al lele  m ar k er ,   to   w h ich   tr ib al  g r o u p   i b elo n g s   to .   T h Gau s s ia n   P DF   is   d escr ib ed   as       (     )           .         /           ( 6 )     W h er in   t h li g h o f   th e   s tat is tical  i n f o r m atio n ,                 is   th m ea n   o f   t h d is tr ib u tio n   ( th e   p ea k   o f   t h cu r v e) ,   an d           is   t h s tan d ar d   d ev iatio n   o f   t h d is t r ib u tio n .   Fi g u r 6   s h o w s   h o w   th Ga u s s i a n   m e m b er s h ip   f u n ctio n   g e n er a ted   f r o m   t h av er a g an d   s tan d ar d   d ev iatio n   o f   th d at f it s   th e   m ar k er   d is tr ib u tio n   o f   t h alle le  m ar k er   ( m ar k ed   b y   t h s p ik y   li n f l u ctu a tio n s ) ,   th u s   m o d eli n g   th e   p r o b ab ilit y   d en s it y   6 8 10 12 14 16 18 20 0 0 . 1 0 . 2 0 . 3 0 . 4 0 . 5 0 . 6 0 . 7 0 . 8 0 . 9 1   F I S   t r i ba l   t r i ba l   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I J E C E     Vo l.  6 ,   No .   6 Dec em b er   2 0 1 6   :   3 1 0 3     3 111   3108   f u n ctio n .   A p p ar en tl y ,   th i s   ap p r o ac h   co u ld   ass i g n   m e m b er s h ip   v al u e,   o r   in   t h is   ca s e,   t h p r o b ab ilit y   t h at  a   m ar k er   v al u       f allin g   w i th in   t h Ga u s s ian   i n ter v al  b elo n g s   to   p ar ticu lar   tr ib al  g r o u p .   Fi g u r 7   s h o w s   t h e   d is cr ete  d is tr ib u tio n   o f   s tatis t i ca tr ib al  d ata:  r a w   d ata   an d   Fi g u r 8   s h o w s   t h ad j u s ted   d is c r ete  d is tr ib u tio n   o f   s tatis t ical  tr ib al  d ata:  af ter   n at u r al  ad j u s t m e n t .                               Fig u r 7 .   T h Dis cr ete  Dis tr ib u tio n   o f   Stati s tical  T r i b al  Data R a w   Dat a                       Fig u r 8 .   T h A d j u s ted   Dis cr ete  Dis tr ib u tio n   o f   Statis t ical  T r ib al  Data : A f ter   Natu r al  A d j u s t m en t       T h p r o p o s ed   m et h o d   co n s is t s   o f   t w o   ca s ca d F u zz y   I n f er en ce   S y s te m s   ( FIS) .   T h f ir s t   w h ich   i s   b ased   o n   T ak ag i - S u g e n o   FI [ 8 ]   is   to   ca lcu late  t h tr ib al  s i m ilar it y ,   a n d   t h s ec o n d   th a is   b ased   o n   Ma m d a n FIS  [ 9 ]   is   to   ca lcu late  th ST R   s i m ilar it y .   T h T ak ag i - Su g e n o   FIS  tak e s   t w o   in p u ts   a n d   t w o   o u tp u ts ,   w i t h   t h f ir s o u tp u t   b ein g   t h i n p u f o r   th s ec o n d   FIS  a n d   t h s ec o n d   o u tp u i s   t h tr ib al  s i m i lar it y   th at  i n d icate s   h o clo s th co n tr o p r o f ile  an d   th q u er y   p r o f ile  eth n icall y .   T h is   is   in   co n tr ast  to   p r ev io u s   ex i s ti n g   DN m atc h in g   a lg o r it h m s   w h ic h   o n l y   p r o d u ce   o n ST R   s i m ilar it y   s co r [ 4 ] .   T h tr ib al  s i m il ar it y   s co r i s   o n l y   u s e f u w h e n   t h ev id en ce   p r o f ile  is   co m p ar ed   to   g r o u p   o f   r ef er en ce   p r o f iles   w h o s eth n icit y   is   k n o w n   b ef o r eh an d .     Fi g u r 9   s h o w s   t h ar r an g e m e n t o f   t h FIS.             Fig u r 9 .   T h C o n f i g u r atio n   o f   th T ak ag i - Su g e n o   FIS       5.   E XP E RM E NT AL   R E SU L T S   T o   ex am i n t h d is cr i m i n ati n g   ab ilit y   o f   t h p r o p o s ed   f u zz y   i n f er e n ce   s y s te m   ( FI S),   p r o to ty p i s   i m p le m en ted   a n d   an   ex p er i m e n u s i n g   r ea d ataset  co n tai n in g   7 2 7   p r o f iles   f r o m   t h p eo p le  o f   I n d o n esia  is   co n d u cted .   T h p r o p o s ed   ca s ca d Fu zz y   I n f er e n ce   S y s te m   ( FIS)   is   i m p le m e n ted   in   M icr o s o f . NE T   p latf o r m   u s i n g   C #   as  th e   p r o g r a m m i n g   la n g u a g a n d   u s i n g   Vi s u al   St u d io   2 0 1 5   I DE .   T h d atab ase  is   s to r ed   in   a   M y SQ L   DB MS  s to r in g   7 2 7   p r o f ile  d ata.   T h Fu zz y   L o g ic  L ib r ar y   i s   b ased   o n   Fu zz y L o g ic L ib r ar y   ( h ttp :// f u zz y n et. s o u r ce f o r g e. n et/) ,   m o d if ied   to   s o m e x ten t   to   s u p p o r th f ea t u r es  u s ed   in   t h FIS   d esig n   w h ic h   is   p r ev io u s l y   u n a v ailab le  in   t h d e f au lt  p ac k a g e.   T h d atab ase  is   ac ce s s ed   an d   m ap p ed   u s in g   t h O R Vici  C o o ls to r ag ( h t tp ://v icip r o j ec t.c o m / ).     5 . 1 .   ST Si m ila rit y   E x peri m e nt  Desig n   T h f ir s ex p er i m e n is   to   ex a m i n th ST R   Si m ilar it y   p er f o r m an ce   b y   co m p ar i n g   th e   p r o p o s ed   C ascad FIS,   th p r ev io u s   F u zz y   S h o r T an d em   R ep ea ( ST R )   Si m ilar it y   [ 4 ] ,   an d   th e   co n v en tio n al  ST R   m atc h   [ 1 1 ] .   T h d ata  is   7 2 7   o f   I n d o n esia   ST R   B ased   D N A   p r o f iles .   T h e x p er i m e n is   d e s i g n   to   ca lc u late  th e   s i m ilar it y   b et w ee n   ea ch   ST R   p r o f ile  w it h   h is   o r   h er   f a m i l y   ST R   p r o f ile  i.e .   f ath er   o r   m o th er   o r   s ib lin g   av ailab le  i n   t h d atab ase.   I f   th ST R   s i m i lar it y   is   g r ea ter   th a n   0 . 5   th en   th f a m il y   r el atio n s h ip   is   co r r ec t   o th er w is f alse.  T h T ab le  1   b elo w   s h o w s   t h co r r ec tn es s   p er ce n tag o f   t h t h r ee   m eth o d s   co m p ar ed .   T h S T R   S i mi l a r i t y   T r i b a l   S i mi l a r i t y     I n p u t   t o   M a m d a n i   F I S     Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I J E C E     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A   N o ve l H u ma n   S TR  S imila r ity  Meth o d   Usi n g   C a s c a d S ta ti s tica l F u z z R u les   . . . .   ( M.  R a h ma t W id ya n to )   3109   tab le  s h o w s   th a th p r o p o s ed   m e th o d   ac h ie v es  th ac c u r ac y   o f   1 0 0 %,  m ea n w h ile  th p r ev io u s   Fu zz y   ST R   Si m i lar it y   m eth o d   [ 4 ]   also   ac h iev es   t h ac c u r ac y   o f   1 0 0 %.  I n   co n tr ac t,  t h co n v e n tio n a l S T R   m atc h   [ 1 1 ]   o n l y   ac h iev e s   7 6 . 3 ac cu r ac y .   T h is   is   s u p p o s ed ly   t h ef f ec o f   n o is in   th p r o ce s s   o f   an a l y zi n g   t h ST R   p r o f ile.   T h f alse  ca lcu latio n   is   d u to   th cr is p   ca lcu latio n   w h er t wo   lo cu s   h av i n g   s lig h tl y   d if f er   v alu g o s i m ilar it y   s co r 0 .   Usi n g   f u zz y   s i m ilar i t y   m ea s u r e,   t w o   a lleles  w i th   s m al d if f er en ce   w ill  s till   g et   s i m ilar it y   s co r e   in s tead   o f   cr is p   0 .   T h r esu lt  s h o w s   t h at  t h p r o p o s ed   C ascad Fu zz y   I n f er e n ce   s y s te m   d o es  n o   u n d er - g r ad th p er f o r m a n ce   o r   p r ev io u s   Fu zz y   ST R   Si m i l ar it y   as  h as  b ee n   p r o p o s ed   in   [ 4 ] .   Mo r e o v er ,   th p r o p o s ed   C ascad Fu zz y   I n f e r en ce   S y s te m   is   ab le  to   ca lcu l ate  th tr ib al  s i m ilar it y   w h ic h   ca n n o b f o u n d   i n   th p r ev io u s   m et h o d .   T h ex p er im e n o n   h o w   t h e x p er i m en o f   t h p r o p o s ed   m eth o d   in   ca lcu la tin g   tr ib al   s i m ilar it y   i s   d is c u s s ed   i n   th n ex t s u b - s ec tio n .       T ab le  1 .   C o r r ec tn ess   P er ce n tag o f   Fa m il y   R ela tio n s h ip   Si m ilar i ty   C o mp a r e d   M e t h o d   C o r r e c t n e ss Pe r c e n t a g e   T h e   p r o p o se d   C a sca d e   F u z z y   I n f e r e n c e   S y st e m   1 0 0 %   T h e   p r e v i o u s F u z z y   S T R   S i mi l a r i t y   [ 4 ]   1 0 0 %   T h e   c o n v e n t i o n a l   S T R   M a t c h   [ 1 1 ]   7 6 . 3 %       5 . 2 .   T riba l Si m ila rit y   E x peri m e n t   Desig n   T h ex p er i m en o b j ec tiv is   to   s ee   w h e th er   t h p r o p o s ed   T r ib al  Si m ilar it y   i s   ab le  t o   in d icate   co r r ec tly   th a p r o f iles   w h ic h   b elo n g   to   d if f er en tr ib al  g r o u p s   s h o u ld   g et  lo w er   tr ib al  s i m ilar it y   s co r th an   th o s w h ic h   b elo n g   to   th e   s a m tr ib al  g r o u p .   T h is   w a s   d o n b y   f ir s lab eli n g   t h p r o f il es  to   t w o   s ep ar ate  g r o u p s ,   t h o s w h o   b elo n g   to   t r ib al  g r o u p   A ,   an d   th o s w h ic h   d o   n o b elo n g   to   g r o u p   A .   T h en ,   ev er y   p r o f il e   f r o m   ea c h   o f   t h tr ib al  g r o u p s   w as   co m p ar ed   in   d if f er en w a y s   as  i llu s tr ated   i n   t h d ia g r a m s   b el o w   a n d   t h s tatis t ics  o f   tr ib al  s i m ilar it y   s co r r esu lts   ar o b s er v ed . to tal  o f   7 2 7   p r o f iles   w er av ailab le,   w ith   3 9 8   p r o f iles   k n o w n   to   b o f   J av an ese  tr ib al  g r o u p .   T h r est  o f   t h p r o f iles   eth n icit y   w as  u n k n o w n ,   s o   th e y   w er e   test ed   ag ai n s t h J av a n ese  p r o f iles .   T h er w er t h r ee   m o d e s   o f   te s ti n g   i.e .   ev er y   J av a n es co m p ar ed   ag ain s t   ev er y   J av an e s e,   all  n o n - J av a n ese  ag ain s th J av a n ese,   an d   ev er y   p r o f ile  ag ain s th e m s e lv es.  P r o f iles   w it h   k n o w n   et h n icit y   w er n ee d ed   as  co n tr o g r o u p   b ec au s th m o d el  ass u m es   k n o w n   eth n icit y   o f   t h p r o f ile   b ein g   u s ed   a s   co m p ar is o n .   F o r   all  th 3   m o d es  o f   e x p er i m en tal  co m p ar is o n ,   v ar io u s   t y p e s   o f   m e m b er s h ip   f u n ctio n   d is cu s s ed   in   th p r ev io u s   s ec tio n   ar u s ed   in   th ex p er i m e n ts   to   s ee   w h ic h   o n is   m o s s u itab le  f o r   th is   p ar tic u lar   s tat is tica clas s if icatio n   p r o b lem .   T h tab les   in   t h f o llo w i n g   s h o w   t h e x p er i m e n tal  r es u lt s .   Natu r all y   it  w o u ld   e x p ec ted   th at  t h r esu lt  f r o m   th s a m tr ib al  g r o u p   to   s co r h ig h e r   th an   t h o s f r o m   d if f er e n tr ib al  g r o u p .   E ac h   m o d es  an d   t y p es   o f   test i n g   p r o d u ce   d if f er en t   r es u lts   a n d   t h s i m ilar it y   s co r es  o f   all   th tes w it h in   m o d i s   th en av er a g ed   to   s ee   h o w   g o o d   it is   g e n er all y .     T ab le  2   s h o w s   tr ib al  s i m ilar it y   av er ag e,   m a x ,   an d   m ea n   v al u e .       T ab le  2 .   T r i b al  Si m ilar it y   A v e r ag e,   Ma x ,   an d   Me an   Va lu e   C o n t i n u o u s F o r m         M o d e   1   M o d e   2   M o d e   3     A v e r a g e   0 . 8 9 7 4 2   0 . 3 9 6 3 4   0 . 5 9 6 5 8   0 . 5 0 1 0 8   M a x   0 . 9 2 3 2 9   0 . 5 2 0 7 6   0 . 6 2 1 4   0 . 4 0 2 5 3   M i n   0 . 5 9 0 5   0 . 1 9 0 9 9   0 . 2 9 0 9   0 . 3 9 9 9 5 1   D i scre t e   F o r m           M o d e   1   M o d e   2   M o d e   3     A v e r a g e   0 . 7 8 9 5 8   0 . 3 8 5 5 8   0 . 5 8 6 7 4   0 . 4 0 4   M a x   0 . 8 8 6 8 5   0 . 5 8 1 8 2   0 . 6 8 3 3 3   0 . 3 0 5 0 3   M i n   0 . 5 9 0 8   0 . 2 8 7 7 8   0 . 2 8 8 6 4   0 . 3 0 3 0 2   A d j u st e d   D i scre t e   F o r m       M o d e   1   M o d e   2   M o d e   3     A v e r a g e   0 . 9 2 4 3 6   0 . 1 9 0 3 8   0 . 5 9 1 5 3   0 . 7 3 3 9 8   M a x   0 . 9 8 7 6 4   0 . 5 8 2 4 2   0 . 6 8 3 9 5   0 . 4 0 5 2 2   M i n   0 . 6 0 3 3 7   0 . 1 0 0 2 3   0 . 2 0 1 1 2   0 . 5 0 3 1 4       T h ∆  co lu m n   s h o w s   t h d if f er en ce   o f   t h s i m ilar it y   s co r e   b et w ee n   Mo d 1   an d   2 .   T h p o s itiv ∆  v alu co n f ir m ed   th co r r ec tn ess   o f   t h p r o p o s ed   T ak ag i - Su g en o   FIS.   T h b en ch m ar k   is ,   th b ig g er   th e   d if f er e n ce ,   t h b etter   d is cr i m in ated   ar th e   p r o f iles .   T h r e s u lt  s h o w s   t h at  t h u s o f   d is cr ete  f o r m   o f   m e m b er s h ip   f u n ctio n   to   m o d el  th d is tr ib u tio n   o f   t h allele  m ar k er s   r es u lted   i n   av er ag e l y   lo w er   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I J E C E     Vo l.  6 ,   No .   6 Dec em b er   2 0 1 6   :   3 1 0 3     3 111   3110   d is cr i m i n atio n   o f   t h p r o f iles .   Ho w e v er   w h e n   ad j u s ted ,   th r esu lt s   s h o w ed   u p   s i g n i f ica n t   i m p r o v e m en t.  T h e   m o s t i m p o r tan t t h i n g   is ,   t h r esu lt  s h o w n   t h at  t h p r o p o s ed   m et h o d   o f   ap p l y in g   T ak ag i - S u g en o   FIS  w it h   th r e e   d if f er e n m e m b er s h ip   f u n ctio n s   h as e x ce lle n t r es u lts .         5.   CO NCLU SI O NS   A   n o v el  h u m an   ST R   ( Sh o r T an d e m   R ep ea t)   s i m ilar it y   m et h o d   u s i n g   ca s ca d s ta tis tica f u zz y   r u le s   w it h   tr ib al  i n f o r m atio n   in f er e n ce   is   p r o p o s ed .   T h p r o p o s ed   m et h o d   co n s i s ts   o f   t w o   ca s ca d es F u zz y   I n f er en ce   S y s te m s   ( FI S).   T h f ir s FIS  i s   to   d is cr i m i n ate  t h tr ib al  s i m i lar it y ,   a n d   t h s ec o n d   FI S i s   to   ca lcu la te  t h ST R   s i m ilar it y .   B y   u s in g   t h allele  m ar k er s   s tatis tical  d is tr ib u tio n   p r o b ab ilit y   d e n s it y   f u n ctio n   as  th m e m b er s h ip   f u n ctio n   in   t h F u zz y   R u les  o f   th f ir s FIS,   t h n e w   m et h o d   m ak e s   it  p o s s ib le  to   tell  th tr ib al  s i m ilar it y   b et w ee n   t w o   ST R   p r o f iles .   A   7 2 7   d ata  ac q u ir ed   f r o m   tr ib al  g r o u p s   o f   I n d o n esia  is   u s ed   to   ex a m in t h e   m et h o d   p r o d u ce d   p r o m i s in g   r esu lt.  I n   th f ir s ex p er i m en t h p r o p o s ed   m et h o d   ac h ie v es   1 0 0 ac cu r ac y   in   r ec o g n izi n g   f a m il y   r ela tio n s h ip   w h ic h   i s   t h e   s a m p er f o r m a n ce   co m p ar ed   to   t h p r ev io u s   F u zz y   ST R   Si m i lar it y   m e th o d .   I n   co n tr ac t,  th co n v e n tio n a ST R   m atc h   o n l y   ac h ie v es  7 6 . 3 %   ac cu r ac y .   T h is   is   s u p p o s ed l y   t h ef f ec o f   n o i s e   in   t h p r o ce s s   o f   an a l y zi n g   t h ST R   p r o f ile.   Ho w e v er   t h p r o p o s ed   m et h o d   is   ab le  to   ca lcu late  T r ib al  Si m i l ar it y   t h at  ca n n o b p er f o r m e d   b y   t h p r ev io u s   Fu zz y   STR  Si m ilar it y .   I n   th e   lig h o f   I n d o n esia s   d iv er s tr ib al  g r o u p s ,   th ese  p r o p er ties   o f   th p r o p o s ed   m et h o d   ar a b le   to   b e   lev er ag ed   as   n o v el  an d   n e w   w a y   to   i m p r o v th v er s atil it y   o f   ex i s ti n g   D NA   m atc h i n g   al g o r ith m .       RE F E R E NC E S   [1 ]   H.  Kitak a m i,   e a l. ,   Ya m a to   a n d   A su k a DN A   Da tab a se   M a n a g . e m e n S y ste m , ‖  Pro c .   o 2 8 th   An n u a Ha w a ii   In t .   Co n f.   o n   S y ste m S c ien c e s ,   2 0 0 5 .   [2 ]   R .   C.   M ich a e li s,  e a l. ,   A   L it ig a to r‖ G u id e   to   DN A F ro m   th e   L a b o ra to ry   to   th e   Co u r tro o m ,   El se v ier  A c a d e m ic   P re ss ,   2 0 0 8 .   [3 ]   C.   M .   Ru it b e rg ,   e a l. ,   S T RBa se A   S h o rt  T a n d e m   Re p e a DN A   Da tab a s e   f o th e   Hu m a n   Id e n ti ty   Tes ti n g   Co m m u n it y , ‖  Nu c leid   a n d   Acid   R e se a rc h ,   v ol /i ss u e 29 ( 1 ) 2 0 0 1 .   [4 ]   M .   R.   W id y a n to ,   e a l. ,   V a rio u d e f u z z i f ica ti o n   m e th o d o n   DN A   si m il a rit y   m a tch in g   su in g   f u z z y   in fe re n c e   s y ste m , ‖  J o u rn a o f   Ad v a n c e d   C o mp u ta ti o n a l   In tell ig e n c e   &   In telli g e n I n fo rm a ti c s v ol /i ss u e 14 ( 3 ) ,   2 0 1 0 .   [5 ]   A .   L .   L o w e ,   e a l. ,   In f e rrin g   e th n ic   o rig in   b y   m e a n o f   a n   S T p ro f il e , ‖  Fo re n sic   S c ien c e   In ter n a ti o n a l v ol /i ss u e :   119 ( 1 ) ,   2 0 0 1 .   [6 ]   I.   W .   Ev e tt ,   e a l. ,   A n   in v e stig a ti o n   o f   th e   f e a sib il it y   o f   in f e rrin g   e th n ic  o r ig in   f ro m   DN A   p ro f il e s , ‖  J .   Fo re n sic   S c i v ol /i ss u e :   32 ( 4 ) ,   1 9 9 2 .   [7 ]   Z.   L iu   a n d   H.  X .   L i,   p ro b a b i li stic  f u z z y   lo g ic   s y ste m   f o m o d e li n g   a n d   c o n tr o l ,   IEE T ra n s   Fu zz y   S y ste ms v ol /i ss u e :   13 ( 6 ) ,   p p 8 4 8 -   8 5 9 ,   2 0 0 5 .   [8 ]   M .   S u g e n o ,   I n d u strial  a p p li c a ti o n s o f   f u z z y   c o n tro l ,   El se v ier S c ien c e   P u b .   Co . ,   1 9 8 5 .   [9 ]   E.   H.   M a m d a n i,   A p p li c a ti o n   o f   f u z z y   a l g o rit h m f o c o n tro l   o f   si m p le  d y n a m i c   p lan t,   Pr o c .   o t h e   In stit u ti o n   o f   El e c trica En g in e e rs v ol /i ss u e :   1 2 1 ( 12 ) ,   1 9 7 4 .   [1 0 ]   G .   Tao f i k   a n d   D.  Be n slim e a n ,   F u z z y   S im il a rit y   M e a su re ,   S p rin g e r,   2 0 0 6 .   [1 1 ]   J.   M .   B u tl e r,   S T RBa se   a n d   I n f o rm a ti o n   Re so u rc e o n   F o re n sic   DN A ,   Na ti o n a In stit u te  o f   S tan d a rd &   T e c h n o lo g y     U.S .   De p o f   Co m m e rc e ,   2 0 1 2 .   [1 2 ]   T .   M .   Cla y to n ,   e a l. ,   A n a ly sis  a n d   in ter p re tatio n   o f   m i x e d   stra i n u sin g   DN A   S T p ro f il in g , ‖  Fo re n sic   S c ien c e   In ter n a t io n a l v ol /i ss u e :   91 ( 1 ) ,   1 9 9 8 .   [1 3 ]   J.  M .   B u tl e r,   F o re n sic   DN A   Ty p in g Bio l o g y   a n d   T e c h n o lo g y   Be h in d   S T M a rk e rs ,   A c a d e m i c   P re ss ,   2 0 0 1 .   [1 4 ]   X .   F o se ll a a ,   e a l. ,   A ss ig n in g   in d iv id u a ls  t o   e t h n ic  g ro u p s   b a se d   o n   1 3   S T lo c i , ‖  Pr o c .   o I n ter n a ti o n a C o n g re ss   S e rie s ,   p p .   1 2 6 1 ,   2 0 0 4 .   [1 5 ]   M .   G ra y d o n ,   e a l. ,   In f e rrin g   e t h n icity   u sin g   1 5   a u to so m a S T l o c i Co m p a riso n a m o n g   p o p u latio n o f   si m il a a n d   d isti n c tl y   d if fe re n p h y sic a traits , ‖  Fo re n sic   S c ien c e   In ter n a ti o n a l:  Ge n e ti c s v o l.   3 ,   pp.   2 5 1 2 5 4 ,   2 0 0 9 .                             B I O G RAP H I E S   O F   AUTH O RS     Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I J E C E     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A   N o ve l H u ma n   S TR  S imila r ity  Meth o d   Usi n g   C a s c a d S ta ti s tica l F u z z R u les   . . . .   ( M.  R a h ma t W id ya n to )   3111     M .   Ra h m a W id y a n t o   re c e i v e d   B. S c .   f ro m   F a c u lt y   o f   Co m p u ter  S c ien c e   Un iv e rsity   o In d o n e sia   in   1 9 9 8 ,   M a ste a n d   Do c to De g re e   f ro m   De p a rt m e n o f   Co m p u tatio n a In telli g e n c e ,   T o k y o   In stit u te  o f   T e c h n o l o g y   J a p a n   in   2 0 0 3   a n d   2 0 1 6   re sp e c ti v e l y .   Cu rre n tl y   h e   is  a   se n io r   lec tu re a F a c u lt y   o f   Co m p u ter S c ien c e   Un iv e rsit y   o f   In d o n e sia .             Re g g io   N.  H a r t o n o   re c e iv e d   B. S c .   f ro m   S w iss - Ge r m a n   Un iv e rsit y ,   M a ste De g r e e   f ro m   F a c u lt y   o f   Co m p u ter  S c ien c e   Un iv e rsity o f   In d o n e sia .   C u rre n ty   p u rs u in g   h i Do c to De g re e   a A u c k lan d   Un iv e rsit y   o f   Tec h n o lo g y   A u stra li a .             Nu r t a m S o e d a r so n o   re c e iv e d   d rg .   f ro m   F a c u lt y   o f   De n ti str y   Un iv e rsit y   o f   In d o n e sia ,   a n d   Do c to De g re e   f ro m   T o k y o   M e d ica a n d   De n tal  Un iv e rsity   Ja p a n   in   2 0 0 6 .   Cu rre n tl y   h e   is  a   se n io lec tu re a De p a rtem e n o f   Ora Bio lo g y   F a c u lt y   o f   De n ti str y   Un iv e rsity   o f   In d o n e sia .       Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.