I nte rna t io na l J o urna l o f   E lect rica l a nd   Co m p ute r  E ng in ee ring   ( I J E CE )   Vo l.   11 ,   No .   2 ,  A p r il   2 0 2 1 ,   p p .   1 5 6 1 ~ 1 5 6 9   I SS N:  2 0 8 8 - 8708 ,  DOI : 1 0 . 1 1 5 9 1 / i j ec e . v 1 1 i 2 . pp 1 5 6 1 - 1 5 6 9          1561       J o ur na l ho m ep a g e :  h ttp : //ij ec e. ia esco r e. co m   An ICA - ense m bl e  learning  appro a c hes for p redict io n of  RN A - seq   m a la ria  vec tor g ene express io n  da ta cla ss ificatio n       M ichea l O l a o lu Ar o w o lo 1 ,   M a rio n O .   Adebiy i 2 ,   Ay o dele  A.   Adebiy i 3 ,   Cha rit y   Are m u 4   1, 2, 3 De p a rtm e n t  o f   Co m p u ter S c ien c e ,   L a n d m a r k   Un iv e rsit y ,   O m u - A ra n ,   K w a ra   S tate ,   Nig e ria   4 De p a rtme n t  o f   Ag ricu lt u re ,   L a n d m a rk   Un iv e rsit y ,   O m u - A ra n ,   K wa ra   S tate ,   Nig e ria       Art icle  I nfo     AB ST RAC T   A r ticle  his to r y:   R ec eiv ed   Feb   4 ,   2 0 20   R ev i s ed   J u l 1 7 ,   2 0 20   A cc ep ted   Sep   2 3 ,   2 0 2 0       M a laria   p a ra sites   in tro d u c e   o u tstan d i n g   li f e - p h a se   v a riatio n s  a s  th e y   g ro w  a c ro ss   m u lt ip le atm o sp h e re s o f   th e   m o sq u it o   v e c to r.   T h e re   a re   tran sc rip to m e s   o f   se v e r a l  th o u sa n d   d if f e r e n t  p a ra sites .   Rib o n u c leic   a c id   se q u e n c i n g   ( RNA - se q )  is  a   p re v a len t  g e n e   e x p re ss io n   t o o l  lea d i n g   to   b e tt e r  u n d e rsta n d i n g   o f   g e n e ti c   in terro g a ti o n s.  RNA - s e q   m e a su re s  tran sc rip ti o n s  o f   e x p re ss io n s  o f  g e n e s.  Da ta  f ro m   RN A - s e q   n e c e ss it a te  p ro c e d u ra l  e n h a n c e m e n ts  in   m a c h in e   lea rn in g   tec h n iq u e s.  Re se a rc h e rs  h a v e   su g g e ste d   v a rio u s a p p ro a c h e d   lea rn in g   f o r  th e   stu d y   o f  b io lo g ica l  d a ta.  T h is  stu d y   w o rk s  o n   IC A   fe a tu re   e x tra c ti o n   a lg o rit h m   to   re a li z e   d o rm a n t  c o m p o n e n ts  f r o m   a   h u g e   d i m e n s i o n a l   R N A - s e q   v e c t o r   d a t a s e t ,   a n d   e s t i m a t e s   i t s   c l a s s i f i c a t i o n   p e r f o r m a n c e ,   E n s e m b l e   c l a s s i f i c a t i o n   a l g o r i t h m   i s   u s e d   i n   c a rr y in g   o u t  th e   e x p e rim e n t.   T h i s  stu d y   is   tes ted   o n   RNA - se q   m o sq u it o   a n o p h e les   g a m b iae   d a tas e t.   T h e   re s u lt s  o f   th e   e x p e ri m e n t  o b tain e d   a n   o u t p u t  m e tri c s w it h   a   9 3 . 3 %   c las sif ica ti o n   a c c u ra c y .   K ey w o r d s :   E n s e m b le  class if ier   I C A   Ma lar ia  v ec to r   RN A - s eq   T h is i s  a n   o p e n   a c c e ss   a rticle   u n d e r th e   CC B Y - SA   li c e n se .     C o r r e s p o nd ing   A uth o r :   Mic h ea l O lao l u   A r o w o lo   Dep ar t m en t o f   C o m p u ter   Scie n ce   L a n d m ar k   U n i v er s it y   O m u - A r a n ,   K w ar a   State,   Ni g e r ia   E m ail:  ar o w o lo . m ic h ea l@ l m u . ed u . n g       1.   I NT RO D UCT I O N   Nex t - g e n er atio n   s eq u e n ci n g   t ec h n o lo g y   h as   cr ea ted   s ev er al   w id e  d atase ts ,   t h at  allo w s   b i o lo g is ts   to   ex a m in e   an d   d eter m in e   d if f ic u lt  g e n e  tr an s cr ip ts   s u c h   a s   R N A   r elatio n s h ip s   a n d   ail m e n ts   s u ch   as  ca n ce r ,   co n tag io n s   ( m alar ia) ,   tu m o r s ,   h er ed ities ,   b io lo g ical,   a m o n g   o t h er s   [ 1 ] .   I n   Af r ica,   m o s q u ito   an o p h ele s   g a m b iae  ar e  b lo o d - s u c k i n g   p ar asit es  w it h   lar g e  p at h w a y s   to   P las m o d iu m   F alcip ar u m .   A n o p h eles  m o s q u ito e s   is   a  d ea d ly   m alar ia  p ar asit e,   ac co u n tab le  f o r   t h o u s a n d s   o f   d ea th s .   A s   b attle  w it h   an t i m alar ia  s u p p o s ito r ies   b an q u ets  u p s u r g es,  p er ce p tiv e s   f o r   s tate - of - t h e - ar t  d r u g s   n ec ess itate s   i m p r o v ed   b io lo g ical  k n o w led g e  o f   th e s e  k in d .   Mo s q u i to   an o p h eles  o r g an i s m   ap p r o v ed   p r ec is e  g en e  ex p r ess io n   co n tr o ls   h as  b ee n   a  m aj o r   co n ce r n   n ee d in g   an   i m p r o v ed   q u an titat iv e  p r ed ictiv e  m a lar ia  v e cto r   t r an s cr ip ts   m o d el  [ 2 ,   3 ].   R N A - s eq   lear n in g   p r o d u ce s   s en s iti v e  b io lo g ica l  p er ce p tiv e  i n v esti g atio n s   b y   r ec o g n iz in g   a   p r eli m in ar y   b io lo g ical  en h a n c ed   s eq u en ci n g   p u r p o s e f u l   p lan   an al y s is .   R N A - s eq   d ata  in cl u d es  th e  r e m o v al  o f   th e  h ig h - d i m e n s io n alit y   c u r s es  in   a  d ata,   s u c h   as :   d is tu r b an ce s ,   r ep etitio n s ,   i n co n s is t en cies,  r ed u n d an c y ,   ir r elev an t,  in co r r ec t,  i n v alid ,   a m o n g   o t h er s   [ 4 ] .   R ec e n t  i n n o v atio n s   h a v e  e n h an ce d   ap p r o ac h es  f o r   d esi g n in g   s tate - of - th e - ar t  h ea l th ca r e  m o d els  s u c h   as  ad ap ted   th er ap ie s ,   in telli g e n t  h ea lt h   s u r v eilla n ce   s y s te m s ,   a m o n g   o th er   d is ea s e  d iag n o s es  [ 5 ].   N u m e r o u s   m a c h i n e   l e a r n i n g   m e t h o d s   w i t h   p r a c t i c a l   a d v a n c e s   h a v e   p e e n   d e v e l o p e d   t h r o u g h   t h e   y ea r s   to   an al y ze   th e  e n o r m o u s   v o lu m e  o f   R N A - s eq   an d   d ata  ex p r ess io n   o f   n e x t  g e n er atio n   g en e  s eq u e n ci n g   b y   s tu d y in g   t h e  r elate d   b io lo g ic all y   o u tli n es  [ 6 ] .   R esear c h er s   h a v e  u s ed   m ac h in e  lear n i n g   tec h n iq u es  w it h   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  11 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 2 1   :   1 56 1   -   1569   1562   v ar iab le  p er f o r m a n ce   le v els  f o r   R N A - s eq   g e n e  ex p r es s io n   d ata  [ 7 ,  8 ].   C o m p u tatio n a l  ap p r o ac h es  h a v e   r e m ain ed   ap p lieca b le  to   lar g e   g e n etic   ail m en t s   d atab ase s   o f   p er s o n s ,   g e n es   ca n   b e  f o u n d   r esp o n s ib le  f o r   th e   p r esen ce   o f   ail m e n ts .   Nu m er o u s   ap p r o ac h es  ar e  u s ed   in   d etec tin g   d i f f er e n tiall y   e x p r e s s ed   g en e s   ( DE G) .   P r o ce d u r es   o f   d ata m i n in g   ar e  s ig n i f ica n t  i n   id e n ti f y in g   t h e  d if f er e n ce s   b et w ee n   g e n e s   d er iv ed   f r o m   t h e   h u m a n   g e n o m e.   Nu m er o u s   m ac h in e   lear n in g   m et h o d s   ar e  e m u lated   a n d   u s ed   i n   e x a m in in g   a n d   id en ti f y i n g   ex p r ess io n   o f   v ar io u s   g en e  p r o f ilin g   d is ea s e s .   Gen e  ex p r e s s io n   p r o f ili n g   an d   its   ap p r o ac h es  b y   m ea n s   o f   n u m er o u s   d ata m i n i n g   ar e  in d is p en s ab le.   R e s ea r ch   w o r k s   h av e  b ee n   p r o p o s ed   b y   n u m er o u s   au t h o r s   in   th is   ar ea ,   ex is tin g   r esear ch e s   ar e  k n o w n   i n   s tu d y i n g   g e n e  ex p r es s io n s   [ 5 ] .   B lo o d - b ased   s ig n at u r e  g en e  ex p r ess io n   an d   d at a m i n in g   f o r   d is ea s es  in   id en tify i n g   tr a n s cr ip ts   t h at  ca n   b e  u s ed   in   clas s i f icatio n   is   p r o p o s ed   [ 9 ] .   Usi n g   Gen e  e x p r ess io n   o m n ib u s   d atab ase  f r o m   R N A   d ata   an d   u s in g   m ac h in e   lear n i n g   al g o r ith m s   lan g u ag e   to o ls ,   w o r k s   o n   R N A - s eq   d ata  h a v e  b ee n   p r o p o s ed   b y   d i m e n s io n alit y   r ed u ctio n ,   cl u s ter in g   a n d   class i f icat io n   b y   p er f o r m in g   a n   i n teg r ated   r e v i e w ,   t h at  h a v e  r ec en tl y   ar o s e  as  p r ed o m i n a n t  s h i f t s ,   u s in g   in d ir ec t  an d   d ir ec t   m et h o d s   w ith   r ed u ci n g   s c - R N A - s eq   d ata  d i m e n s io n   ap p r o ac h es,  r ep o r tin g   s c R N A - s eq   d ata  [ 1 0 ] .   T h is   s t u d y   p r o p o s es a   d i m en s i o n alit y   r ed u ctio n   m o d el,   b y   u s in g   I C A  f ea t u r e  ex tr ac tio n   tec h n iq u e,   to   r ea lize  th e   r elev a n t  co r r elate d   laten t  co m p o n e n t s   i n   a   h i g h   d i m en s io n al   d ataset   in   t h e  g e n e  e x p r ess io n   d ata   an al y z s is ,   a  S u b - s p ac e  g r o u p   E n s e m b le  class i f icat io n   s y s te m   is   u s ed   in   lear n i n g   d is cr ete  b io lo g ical  o u tlin e s   th at  h elp s   ac h ie v e  d ev elo p ed   class i f icatio n   ac c u r ac y   a n d   s u g g e s ted   as  a n   e f f ec ti v e  p r o ce d u r e  f o r   t h e  f in d i n g   o f   in n o v ati v e  g en e s   f o r   m alar i a.       2.   P RO P O SE D   M E T H O D   I n   th i s   s t u d y ,   a  s u m m ar ized   p r o p o s ed   f r am e w o r k   i n   Fi g u r e   1   is   ad o p ted ,   th e  f u n d a m en ta l   id ea   is   to   p r ed ict  m ac h i n e  lear n i n g   tas k   o n   h i g h   d i m e n s io n al  R N A - s e q   d ata,   f o r   ce lls   an d   g e n es  i n t o   lo w er   d i m e n s i o n a l   d a t a s e t .   T h e   p l a n   i s   a d j u s t e d   t o   f e t c h   o u t   i m p o r t a n t   d a t a   i n   a   g i v e n   d a t a s e t   b y   u t i l i z i n g   I C A   f e a t u r e   e x t r a c t i o n   m e t h o d   a s   a   s t a g e .   T o   e v a l u a t e   t h e   p e r f o r m a n c e   o f   R N A - s e q   d a t a s e t ,   E n s e m b l e   cla s s i f ica tio n   al g o r ith m s   ar e   co m p ar ed .             Fig u r e  1 .   P r o p o s ed   f r am e w o r k       Nu m er o u s   ap p r o ac h es  o n   m ac h in e  lear n i n g   h av e  b ee n   em u lated   to   ex a m in e  a n d   id en ti f y   g e n e   ex p r ess io n   p r o f iles   o f   s e v er al  ail m e n ts .   T h er e  is   d i s cu s s io n   o f   t h e  n ec es s it y   f o r   ex p r es s io n   o f   g en e   p r o f ili n g   an d   ap p r o ac h es  u s i n g   s p ec i f ic   d ata m i n i n g   tech n iq u es.  N u m e r o u s   i n v e s ti g atio n s   ca r r ied   o u t  b y   r esear ch er s   i n   th is   ar ea   ar e  co n s u lted ,   r ec en t  in v est ig at io n s   in   a n al y s i n g   g en e  e x p r ess io n s   ar e  r e v ie w e d   [ 5 ] .   A   s u p er v is ed   m ac h in e   lear n i n g   m et h o d   f o r   v ar iet y   o f   R N A - s eq   s e g m en t  w a s   p r o p o s ed   b y   r an k i n g   h u g e  s ets   o f   s e g m en t s   m ea s u r ed   w it h   R N A - s eq ,   u s i n g   r an d o m   f o r est  class i f ier   v ar iab le  r an k   m ea s u r e m e n t s ,   s p ec if y i n g   th e  E P S   ( ex tr e m e  p s e u d o - s a m p les)  f r eq u en c y ,   w i th   v ar iatio n al  a u t o en co d er   r eg r ess o r s   in   th e  R NA - s eq   ex tr ac tio n  r an k s   o f   ca n ce r   d ata s ets  w it h   ab o u t  1 , 2 1 0   s a m p le s .   R es u lts   i n   t h e  R N A - s eq   tr ai n i n g   d e m o n s tr ated   a   s u p er v i s ed   h id d en   lear n in g - b ased   f ea t u r e  s e lectio n   m e th o d   an d   h i g h li g h ted   th e   n ee d   f o r   g en e  a s s o r t m en t   m et h o d s   f o r   g en e  e x p r ess io n   an al y s is   [ 1 1 ] .   C lass i f ica tio n   o f   R N A - s eq   d ataset  u s in g   s u p er v is ed   m o d el  w a s   p r o p o s ed   f o r   a   g en er alize d   m et h o d   o f   h ig h l y   ac c u r ate  s i n g le  ce ll  clas s i f icatio n s ,   b y   in teg r at in g   u n b iased   co llectio n   o f   co n d e n s ed   d i m en s io n al  s p ac e  f ea tu r e  s elec t io n   tech n iq u e.   Sc - P r ed   w a s   u s ed   o n   R N A - s eq   p an cr ea tic  tis s u e,   co lo r ec tal  tu m o u r   ce ll   r e m o v al,   m o n o n u cl ea r   ce lls ,   a n d   m i x i n g   d en d r iti c  ce lls   d ata s ets.  Sc - P r ed   d em o n s tr ated   a  h i g h   cla s s if ied   d is cr ete  ce ll s   ac cu r ac y   [ 1 2 ] .     R N A - DN A   m ac h i n e  lear n in g   an al y s i s   w a s   p r o p o s ed   o n   a  lo w   e x p r ess ed   g e n o m e  t h at   c o u ld   b e   af f ec ted   co llectiv el y   b y   P A H  d is ea s e.   A   s tate - of - t h e - ar t  f ea tu r e  s elec tio n   p r o ce d u r e  to   class i f y   a n   ir r elev a n t  r an g e  o f   v er y   b en e f icial  g e n e s .   S m all  e x p r ess io n   cl u s ter ed   g en e s   w er e  d i s co v er ed   at  p r e d ictin g   tr an s f o r m ed   P A H  p r o ce d u r es  [ 1 3 ] .   Sto m ac h   c an ce r   g en e  e x p r ess io n   d ata  class i f icatio n   w as  d e v elo p ed   u s in g   d ee p   lear n i n g   ap p r o ac h ,   Hea t m ap s ,   P C A ,   an d   C N N  al g o r ith m .   R N A - s eq   g en e   d ata  ex p r es s io n   s t u d ied   th e  g en e s   a n d   an al y s ed   t h e m ,   9 5 . 9 6 %  an d   5 0 . 5 1 %  w er e  ac h ie v ed   [ 1 4 ] .   T r an s cr ip tio n s   o f   R N A - s eq   m alar i a  d ata  t h r o u g h   d is s i m ilar it y   o f   tec h n iq u es  t o   d ec o n v o lu te  d is p ar it y   tr an s cr ip tio n   f o r   d is s i m ilar   m ala r ia  p ar asit es  w er e   r ev ea led   u s i n g   h id d en   tr an s cr ip tio n al  d is cr ete  s ig n at u r es  [ 1 5 ] .   Su p er v is ed   d atam i n i n g   a p p r o ac h es  s u ch   a s   C 4 . 5 ,   b o o s ted   an d   b ag g ed   e n s e m b le  cla s s i f icat io n   al g o r it h m   f o r   ca n ce r   d ata   w er e  p r o p o s ed   o n   o p en l y   av ailab le  o n co g e n ic  m icr o ar r ay   d ata  an d   co r r elate d ,   th e  b o o s t  an d   b ag   e n s e m b le  clas s i f ica tio n   o u tp er f o r m   th e   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A n   I C A - en s emb le  lea r n in g   a p p r o a ch es fo r   p r ed ictio n   o f  …  ( Mich ea l O la o lu   A r o w o lo )   1563   C 4 . 5   [ 1 6 ] .   A   d iag n o s tic  cla s s i f icatio n   u s i n g   en s e m b le  al g o r ith m   m et h o d   f o r   g en o m ic  ca n c er   d ata  ex p r ess io n   w a s   d esig n ed   u s i n g   R FE  to   f etch   ef f icie n t  f ea tu r es  f o r   en h an ce d   class i f icatio n   r esu lt s   u s in g   A d a B o o s t  [ 1 7 ] .   C las s i f icatio n   o f   ca n ce r   g e n e   d ata  ex p r ess io n ,   w as  ca r r ied   o u t  u s i n g   ef f ec ti v e  e n s e m b l e  lear n in g   m eth o d   u p s u r g i n g   t h e  p er f o r m a n ce   o f   th e  class if icatio n   o f   t h e  o u tc o m e  r es u lt s ,   w it h   a  r ed u ce d   am o u n t  o f   d ep en d en t   o n   o r ig i n alitie s   o f   in d i v id u a l  t r ain in g   s et  [ 1 8 ] .   An   e n h an ce d   en s e m b le  cla s s i f icat io n   lear n in g   w r ap p er - b ased   f ea t u r e  s elec t io n   a n d   r a n d o m   tr ee s   p r o ce d u r e  to   i m p r o v e  k n o w led g e,   m ak e s   a   s u b s et   b y   u s i n g   b a g g ed   a n d   r an d o m   tr ee s .   I r r elev an t  f ea tu r es  w er e  r e m o v ed   to   s elec t  th e  b est  f ea tu r es  f o r   class i f icati o n ,   u s i n g   R F,  SVM ,   an d   NB   w i th   9 2 %  ac c u r ac y   [ 19 ] .   T ex t  clas s if icatio n   alg o r ith m s   w a s   p r o p o s ed   u s in g   v ar io u s   te x t   d i m en s i o n al it y   r ed u ct io n   m eth o d s   [ 2 0 ].       3.   RE S E ARCH   M E T H O D   Data m i n i n g   f o r   h ig h   d i m e n s i o n al  d ataset  en h a n ce m en ts   h a v e  b ee n   ca r r ied   o u t  b y   s ev er al  au th o r s ,   I n d ep en d en t  co m p o n e n t  a n al y s is   ( I C A )   a n d   clas s if icatio n   u s in g   al g o r ith m   i s   p r o p o s ed   f o r   R N A - s eq   m a lar ia  v ec to r   d ata.     3 . 1 .   M a t er ia l   A   w es ter n   Ken y a  m o s q u ito   g en e  d ataset  w it h   7   attr ib u te s   g en e s   an d   2 4 5 7   in s tan ce s   w er e  u s ed ,   co n tain i n g   m o s q u ito   g en e s   f r o m   2 0 1 0   to   2 0 1 2 ,   T h e  p r o f ile  tr an s cr ip ts   co n tai n s   A G A P 0 0 3 7 1 4 ,   A G A P 0 0 4 7 7 9 ,   C PL C   G 3   [ A GA P0 0 8 4 4 6 ] ,   C Y P6 M 2   [ A GA P0 0 8 2 1 2 ] ,   A GA P0 1 2 9 8 4 ,   A GA P0 0 2 7 2 4 ,   A GA P0 0 9 4 7 2   a n d   C Y P6 P3   [ A GA P0 0 2 8 6 5 ] ,   R NA - s e q   d e l t am eth r in - r e s i s t an t   t r a n s c r i p t o m e   d is t in ct i o n s   an d   s u s c e p t i b le   w e s t e r n   K e n y an   m o s q u i t o   A n o p h e le s   g am b i ae   g en e s   av a i la b l e   d a ta s et   f r o m   N at i o n a l   I n s t itu t e   o f   H e a lt h   [ 21 ] ,   a   s u m m ar y   ex p lan atio n   o f   t h e  d ataset  is   s h o w n   i n   t h e  T ab le  1 .       T ab le  1 .   Data s et  d escr ip tio n   D a t a se t   A t t r i b u t e s   I n st a n c e s   M o sq u i t o   A n o p h e l e s G a mb i a e   7   2 4 5 7       3 . 2 .   M e t ho ds     T h e  ex p er i m en ta l  to o l  u s ed   MA T L A B   to   an a l y ze   t h e  d at a  o b tain ed   [ 21 ] ,   u s in g   I C A   to   f etc h   late n t   f e a t u r e s ,   a n d   c a r r y   o u t   c l a s s i f i c a t i o n   u s i n g   e n s e m b l e   a l g o r i t h m   a p p r o a c h   [ 2 2 ]   o n   t h e   M A T L A B   t o o l   e n v i r o n m e n t .     3 . 2 . 1 .   I nd epen dent  co m po ne nt  a na ly s is   ( I CA)   I C A   is   a   v al u ed   P C A   ex te n s io n   th at  h as  r e m ai n ed   co n s er v ativ e  s in ce   t h e  v i s o r   p ar tin g   o f   in d ep en d en t  b a s es  f r o m   t h e ir   d ir ec t  g r o u p in g   [ 2 0 ] .   T h e  o r ig in al  f ac t  o f   I C A  is   t h e  p o s s es s io n s   o f   u n co r r elatio n   o f   t h e  g e n er al  P C A .   B u il t  n  x   p  on  d ata  m ed iu m   X ,   w h o s e  r o w s      ( = 1 … , )   r ec k o n   to w ar d   v ar iab les   o b s er v ed   also   w h o s e    ( = 1 … , )   co lu m n s   ar e  th e  en titi e s   o f   m atc h i n g   v ar iab les,  t h e  I C A   X   m o d el,   w r itte n   as   f o llo w s :     =    ( 1 )     W ith   co m p lete  o v er v ie w ,   A  is   a     f u s io n   m a tr ix ,   w h er e  S  is   a     is   a  b asis   m a tr ix   u n d er   th e  n ee d   o f   b ein g   s tati s tical l y   in d ep en d en t  as  co n ce iv ab le.   I n d ep en d e n t  co m p o n en ts   ar e  th e  in n o v a tiv e  v ar iab les  k ep t   in   t h e  r o w s   o f   S ,   to   w it,  t h e  v ar iab les  d etec ted   ar e  li n ea r l y   co m p o s ed   i n d ep en d en t  co m p o n en t s .   T h e  in d ep en d en t   co m p o n e n ts   ac h iev ed   b y   lear n i n g   t h e  p r ec is e  lin ea r   g r o u p i n g s   o f   t h e  v ar iab l es   o b s er v ed ,  s u b s eq u en t l y   m i x in g   ca n   b e  in v er ted   as:       =   = − 1 =    ( 2 )     3 . 2 . 2 .   E ns e m b le  cla s s if ier   E n s e m b le  class i f ier s   ca n   b e  p r o f icien t  u s in g   o n   u n r elate d   s u b s ets  o f   t h e  d ata  tr ain in g ,   d iv er s e  class i f icatio n   co n s tr ai n ts ,   o r   with   d i v er s e   s u b s et  f ea t u r es   i n   r an d o m   s u b s p ac e  m o d el  [ 2 3 ].   E n s e m b le  cla s s i f ier   co m p r is e s   o f   in teg r ati n g   f a llo u ts   o f   as s o r ted   class i f ier s   to   p r o d u ce   a  co n clu d i n g   d ec is io n ,   i t  is   f r eq u en tl y   u s ed   f o r   g ain i n g   h i g h l y   ac c u r ate   r esu lts .   E n s e m b le  cla s s i f ier s   ar e  r elativ el y   co m m o n   i n   m a c h i n e  lear n i n g   co m p lica tio n s ,   an d   ca n   b e  e m p lo y ed   i n   b io in f o r m atic s   f ield .   C las s i f icatio n   d ec is io n   i s   ac h iev ed   b y   m er g in g   th e  d ec is io n   o f   ea c h   clas s i f ier   [ 2 4 ] .   E n s e m b le  ap p r o ac h es  is   m ac h in e  lear n i n g   tech n iq u e s   c o m b i n es  d ec i s io n s   to   ad v an ce   t h e  p er f o r m a n ce   o f   th e  g en er al  cla s s i f icat io n .   Se v er al  ter m s   h av e  b ee n   d is co v e r ed   in   th e  l iter atu r e   to   s ig n i f y   co m p ar ab le  co n n o tatio n s   s u c h   as;   m u lt i - s tr at eg y   lear n i n g ,   ag g r eg at io n ,   i n teg r at io n   m u ltip le   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  11 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 2 1   :   1 56 1   -   1569   1564   class i f ier s ,   cla s s i f ier   f u s io n ,   c o m b i n atio n ,   co m m ittee,   a n d   s o   o n .   E n s e m b le  clas s i f ier   m a y   h av e   co m p lete  a n d   i m p r o v ed   p er f o r m an ce   t h a n   d is cr ete  b ase  class i f ier s .   T h e  ef f icien c y   o f   e n s e m b le  ap p r o ac h es  is   e x tr e m e l y   d ep en d en t  o n   th e  u n co n v en t io n alit y   o f   er r o r   d ev o ted   b y   d is cr ete  lear n er .   E n s e m b le  ap p r o ac h es  p er f o r m a n ce   h in g e  o n   t h e  ac cu r ac y   an d   v ar iet y   o f   t h e  b ase  lear n er s ,   e n s e m b le  class i f icatio n   h as c o m m o n   tech n iq u es;    B o o s tr ap   ag g r eg at in g   ( B ag g i n g )   e m p lo y s   tr ain in g   th e  d a ta  b y   ar b itra r il y   ch a n g in g   t h e  u n iq u e   tr ain i n g   T   b y   ite m s   N  d ata.   T h e  tr ai n in g   a u x iliar y   s et s   ar e  c alled   b o o ts tr ap   d u p licates  w it h   s o m e  o cc u r r en ce s   n o t  ap p ea r in g   w h ile  o th er s   g iv e  t h e  i m p r es s io n   m o r e  th an   o n ce .   T h e  C * ( x )   f i n al  class i f ier   is   b u ilt  b y   co m b i n i n g   C i( x ) .   A ll  C i( x )   ta k es a n   eq u i v ale n t d iv i s io n .   A d ap tiv e  b o o s ti n g   ( A d aB o o s t )   tech n iq u e  e f f ec ts   th e  tr ain i n g   d ata.   Or i g i n all y ,   th e   p r o ce d u r e  allo ca tes  a l l   x i   i n s t a n c e   b y   m e a n s   o f   a n   e q u i v a l e n t   m a s s .   I n   i n d i v i d u a l   i t e r a t i o n   i ,   k n o w l e d g e   a l g o r i t h m   a t t e m p t s   t o   d i m i n i s h   t h e   t r a i n i n g   s e t   w e i g h t e d   e r r o r   a n d   a   c l a s s i f i e r    ( )   i s   y i e l d e d .   T h e    ( )   w e i g h t e d   e r r o r   i s   ca l cu lated   an d   u s e f u l  i n   in f o r m i n g   th e   tr ain in g   i n s ta n ce s   x i  w ei g h ts .      w ei g h t  r is e s   g i v i n g   to   i ts   ef f ec t s   o n   th e   p er f o r m a n ce   o f   clas s if ier ’ s   th at  allo ts   a  w ei g h t  h ig h er   f o r   a   m is c lass if ied   x i  a n d   a  s m all  w ei g h t  ai m ed   at  a n   ac ce p tab ly   clas s i f i ed   x i.  T h e  co n clu d in g   class if ier   C * ( x )   is   cr ea ted   b y   a  d is cr ete  C i ( x )   w ei g h ted   v o te  r en d er in g   to   it s   b u ilt  ac c u r ac y   o n   th e  tr ai n in g   w ei g h t ed   s et  [ 1 9 ] .   A d o p tin g   Ka m r a n ,   et  al .   [2 0 ] ,   th e y   s h o w ed   h o w   a  b o o s tin g   alg o r ith m   w o r k s   f o r   d atasets ,   th e n   tr ain ed   b y   m u lti - m o d el  d esig n s   ( en s e m b le  lear n in g ) .   T h ese  ad v an ce s   r e s u l t e d   i n   t h e   a d a p t i v e   b o o s t i n g   ( A d a B o o s t ) .   P r e s u m e   c o n s t r u c t i n g   D t   s u c h   t h a t   1 ( ) = 1   g i v e n   D t   a n d   h t:     + 1 { } =   ( )   { −    =   ℎ ( )      ≠   ℎ ( )   ( 3 )     ( ) e xp   ( − ℎ ( ) )   ( 4 )     w h er e    s tates to   t h e  n o r m a lizat io n   f ac to r   an d     is   as f o llo w s ;     = 1 2  ( 1 − ∈ ∈ )   ( 5 )     B asic  en s e m b le  cla s s i f icat io n   tech n iq u es   n a m el y :  T h e  m ax   v o tin g   ( MV ) ,   w ei g h ted   av er a g in g   ( W A )   an d   Av er ag in g .   Ma x   v o tin g   ( MV )   ex is ts   [ 2 5 - 2 7 ]   E n s e m b le  lear n in g   h av e  t h r ee   co m b i n atio n al  m et h o d s :   s tac k i n g   ( ST K) ,   b len d in g   ( B L D) ,   b ag g i n g   ( B AG)   an d   b o o s tin g   ( B OT )   [ 2 8 - 3 1 ].     3 . 3 .   E v a lua t io n per f o r m a nce   Data m i n i n g   m o d el  p er f o r m a n ce   ev alu atio n   r eq u ir es  m etr ic s   o f   v alid atio n s ,   clas s i f icatio n   alg o r ith m s   u s e s   th e  co n f u s io n   m atr i x   i n   an al y z in g   f o u r   f ea t u r es  k n o w n   as  th e;  tr u e  p o s itiv e  ( T P ) ,   f alse  p o s itiv e  ( FP ) ,   tr u e  n eg at iv e  ( T N)   an d   th e  f alse  n eg ati v e  ( FN) .   T h ese  f ea tu r es  r ec o g n ize  th e  co r r ec tl y   a n d   in co r r ec tly   clas s i f ied   in s ta n ce s   f r o m   t h e  g iv e n   s a m p le  o f   d ataset   u s ed   in   test in g   t h e  m o d el  [ 5 ,  3 2 ] .     3 . 4 .   Appl ica t io ns   An   e n h an ce d   p at h   o f   g en e   ex p r ess io n   a n al y s i s   i n   d e n ti f y i n g   R N A - s eq   d ata  d i s co v er ies   f o r   r elate d  g en e s   ca n   b e  h elp f u l  in   th e   d ev elo p m e n t  o f   v ar io u s   ap p licatio n s   s u ch   as  m o d i f ied   tr ea t m e n t,  d is ea s e s   d etec tio n ,   g e n es   a n d   d r u g   d is co v er y ,   t u m o r   r ec o g n i tio n ,   ai l m e n ts ,   a m o n g   o th er s .   Data m in i n g   tec h n iq u e  i s   u s ed   i n   id en t if y i n g   t h e  d esi g n s   an d   p o s s e s s es   f a n ta s tic  ap p l icab le  alg o r ith m s   to o ls .   I n   t h i s   s t u d y ,   M A T L A B   to o l  is   u s ed   to   ca r r y   o u t  t h e  p r o g r a m   d u e  to   i ts   u s er - f r ien d l y   en v ir o n m e n t  [ 1 6 ] ,   to   p r ed ict  R N A - s eq   tech n o lo g y   f o r   t h e  p r o g n o s is   an d   d ialn o s is   o f   m alar ia  ail m en ts   u s in g   a n   8 GB   R A M   s ize,   6 4 - b it  S y s te m ,   iC o r e2   p r o ce s s o r   an d   MA T L A B   2 0 1 5 A   to o l.       4.   RE SU L T S  A ND  D I SCU SS I O NS   T h is   s t u d y   d eter m in e s   R N A - s eq   in n o v atio n   o f   2 4 5 7   in s ta n c es  m o s q u ito es ’   d ata.   I C A  al g o r ith m   w a s   ap p lied   to   f etch   o u t  laten t  co m p o n en ts   f r o m   th e  a n o p h eles ’   d ata,   th e  I C A   f ea tu r e  e x tr ac ti o n   d is tin g u is h es  a n d   r e m o v e s   u n c o r r e l a t e d   v a r i a b l e s ,   t o   c h o o s e   t h e   d e t e r m i n a n t   v a r i a n c e   w i t h   a   r e d u c e d   n u m b e r   o f   i n d e p e n d e n t  c o m p o n e n t s   t o   g i v e   i m p o r t a n t   u s e f u l   g e n e   e v i d e n c e   v a l u a b l e   f o r   s u p p l em e n t a r y   e x a m i n a t i o n .   E n s e m b l e   A d a B o o s t   class i f icatio n   alg o r it h m   i s   ap p lied   o n   th e  ex tr ac ted   I C A   4 5   laten t  s i g n i f ica n t  f ea tu r e s   o f   g e n es  r ea lized   i n   7 . 8 4 8 6   Seco n d s .   10 - f o ld s   cr o s s   v alid atio n   is   u s ed   to   ev al u at e  th e  cla s s i f icatio n   ex ec u tio n   p er f o r m a n ce ,   u s i n g   0 . 0 5   p ar am eter   h o ld o u t to   tr ai n in g   t h e  d ata  an d   5 % f o r   test i n g   th e  cla s s i f icat io n   ac cu r ac y .   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A n   I C A - en s emb le  lea r n in g   a p p r o a ch es fo r   p r ed ictio n   o f  …  ( Mich ea l O la o lu   A r o w o lo )   1565   Ass es s m en t  lear n in g   p r o ce d u r e  class if ica tio n   is   u s ed   to   tr ai n ,   test   a n d   e v al u ate  t h e   ex p er i m en t  u s i n g   a  1 0 - f o ld   cr o s s   v alid atio n   in   eli m i n ati n g   t h e  s a m p li n g   p ar t ialities .   R es u lt  e v al u atio n   is   ca r r ied   o u t  o n   th e   co m p u tatio n al  ti m e  an d   p er f o r m an ce   m etr ics  [ 32 ] .   C las s if i ca tio n   o f   t h e  m o d els,  u s i n g   A d a B o o s t  en s e m b le  class i f ier   i s   ca r r ied   o u t  w i th   9 3 . 3 %  p er f o r m an ce   ac cu r ac y .   T h e  r es u lt s   a n d   p r o ce d u r es  ar e  s h o w n   i n   th e   f i g u r es  b elo w .   I C A   f ea t u r e  ex tr ac tio n   al g o r ith m   i s   u s ed   to   ex tr ac t  th e  h id d en   f ea tu r es  f r o m   m o s q u ito   an o p h eles  d ata  s h o w n   i n   Fi g u r e  2 .   T h e  ex tr ac ted   f ea tu r es  ar e  cl ass i f ied   u s i n g   en s e m b le  alg o r it h m ,   t h e   s ca tter ed   p lo t  an d   r esu lt s   ar e  s h o w n   in   th e  f i g u r es  b elo w   u s in g   t h e  co n f u s io n   m atr i x   to   g iv e   a  r esu lt  to   th e   p er f o r m a n ce   m etr ics.   I n   Fi g u r e   3   a  s ca tter ed   p lo t  is   s h o w n   f o r   t h e  class if icatio n ,   t h e  co r r ec tl y   clas s i f ied   an d   m i s class if ied   u s i n g   d o ts   an d   cr o s s   s i g n s   to   r ep r esen t  v al u es  f o r   th e  v ar ia b les,  in d icati n g   v al u es  f o r   in d iv id u al  d ata  p o in t s ,   th is   p lo t  is   u s ed   in   o b s er v i n g   t h e  r elatio n s h ip s   b et w ee n   th e  c lass i f ied   v ar iab les .  Fi g u r e  4   a n d   Fig u r e  5   s h o w s   th e  co n f u s io n   m atr i x   f o r   t h e  cl ass i f icatio n s   o f   t h e  ex p er i m e n t,  u s i n g   b a g g ed   a n d   b o o s ted   e n s e m b le  clas s i f ier s .   T h e  co n f u s io n   m atr ix   tab le  i s   th en   u s ed   i n   d escr ib in g   th e  p e r f o r m an ce   o f   th e  cla s s i f icatio n   m o d el  o f   t h e  s et s   o f   th e  tes ted   d ata  w it h   th e  k n o w n   tr u e  v al u e s   w ith   t h e  co n f u s io n   m atr i x   r ep r esen ted   w it h   tr u e  p o s itiv e,   f a ls e   p o s itiv e,   tr u e  n eg at iv e  a n d   f al s e  n eg ati v e  v alu e s .           Fig u r e  2 .   T h e  m o s q u ito   an o p h eles g a m b iae  d ataset           Fig u r e  3 .   C lass if ica tio n   s ca t ter ed   p lo t   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  11 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 2 1   :   1 56 1   -   1569   1566       Fig u r e  4 .   C o n f u s io n   m atr ix   f o r   en s e m b le  s u b s p ac e  d is cr i m i n an t c las s i f icatio n   T P =3 8 ;  T N= 1 8 ; FP =3   FN=1           Fig u r e  5 .   C o n f u s io n   m atr ix   f o r   en s e m b le  b ag g ed   tr ee   class if icatio n   T P =3 5 ;  T N= 1 4 ; F P =7 ;   FN=4       T esti n g   t h e  d ata m i n i n g   lear n in g   p er f o r m a n ce   m et h o d s ,   th e  R N A - s eq   d ata  w as  co p ied   f r o m   t h e   h ttp s :/ /f i g s h ar e. co m /ar tic les/ Ad d itio n al_ f ile_ 4 _ o f _ R N Aseq _ an al y s es_ o f _ c h an g e s _ in _ th e_ An o p h eles_ g a m b i ae _ tr an s cr ip to m e_ ass o ciate d _ w it h _ r esi s tan ce _ to _ p y r eth r o id s _ in _ Ken y a_ id en t if ica tio n _ o f _ ca n d id ater esis ta n c e_ g en es_ a n d _ ca n d id ater esis ta n ce _   SNP s /4 3 4 6 2 7 9 /1   r e p o s ito r y .   I C A   f ea t u r e  ex tr ac tio n   t ec h n iq u e  w as  u s ed   o n   th e  2 4 5 7   g en e s   f ea tu r es,  a n d   ex tr ac ted   1 5 7 2   f ea tu r es  w it h   4 5   laten t c o m p o n e n ts .   E n s e m b le  class i f icatio n   is   u s ed   to   p r ed ict  th e   p er f o r m a n ce .   R es u lt  d e m o n s tr ated   th e  e f f icie n c y   o f   d ata m i n in g   ap p r o ac h ed   in   g e n es.  T h e   p er f o r m a n ce   r es u lt s   f o r   t h e  p r o p o s ed   ap p r o ac h   ar e  r ev ea led   an d   r elate d   in   T ab le   2 .   T h e  o u tco m e  s h o w s   t h a t   S u b s p a c e   D i s c r i m i n a n t   e n s e m b l e   c l a s s i f i c a t i o n   o u t p e r f o r m s   b a g g e d   t r e e   e n s e m b l e   i n   t e r m s   o f   a c c u r a c y .   I n   t h is   s t u d y ,   a n   i m p r o v ed   i n v esti g atio n   o f   t h e  cla s s i f icati o n   o f   m alar ia   v ec to r   d ata  is   ca r r ied   o u t,   n u m e r o u s   w o r k s   h a v e   b e e n   p r o p o s e d   b y   i n v e s t i g a t o r s ,   t h e   f i g u r e   a n d   t a b l e s   a b o v e   h a v e   s h o w n   a n d   d e m o n s tr ated   th at,   d i m e n s io n alit y   r ed u cti o n   m o d el  w ith   I C A   f ea t u r e  ex tr ac tio n   m eth o d s   ca n   p r o g r ess   en s e m b le   class i f icatio n   r esu lts ,   Fi g u r e  6   s h o w s   t h e  p er f o r m a n ce   ch ar t  f o r   co m p ar i n g   t h e  o u tp u t   r esu lts .   T h i s   s t u d y   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A n   I C A - en s emb le  lea r n in g   a p p r o a ch es fo r   p r ed ictio n   o f  …  ( Mich ea l O la o lu   A r o w o lo )   1567   p r o p o s e d   a   p r e d i c t i o n   a n d   d e t e c t i o n   m o d e l   f o r   m a l a r i a   d i s e a s e   i n   h u m a n .   T h e   p r o p o s e d   m e t h o d   u s e d   a n   I C A   d i m e n s i o n a l i t y   r e d u c t i o n   a n d   e n s e m b l e   c l a s s i f i c a t i o n   d a t a m i n i n g   p r o c e d u r e s ,   t h e   in v es tig at io n   an d   p er f o r m a n c e   ass es s m en t o f   th e  r es u lt s   g o tte n   w er e  s h o w n   i n   th e  ta b les a n d   f ig u r es  b elo w .       T ab le  2 .   P er f o r m a n ce   m etr ic s   tab le  f o r   th e  co n f u s io n   m atr i x   P e r f o r man c e   M e t r i c s   En se mb l e   S u b sp a c e   D i s c r i m i n a n t   C l a ssi f i c a t i on   En se mb l e   B a g g e d   T r e e   C l a ssi f i c a t i o n   A c c u r a c y   ( %)   9 3 . 3   8 1 . 7   S e n si t i v i t y   ( %)   9 7 . 4   8 9 . 7   S p e c i f i c i t y   ( %)   8 5 . 7   6 6 . 7   P r e c i si o n   ( %)   9 2 . 7   8 3 . 3   R e c a l l   ( %)   9 7 . 4   8 9 . 7   F - S c o r e   ( %)   9 5 . 0   8 6 . 4           Fig u r e  6 .   P er f o r m a n ce   m etr ic s   g r ap h       5.   CO NCLU SI O N   An   en h a n ce d   class i f icatio n   a p p r o ac h   f o r   m alar ia  p r o g n o s is   an d   d iag n o s is   u s i n g   d i m e n s io n alit y   r ed u ctio n   a n d   clas s i f icatio n   a lg o r ith m   w as  p r o p o s ed ,   n u m e r o u s   w o r k s   b y   r esear ch er s   in   th is   ar ea   h a s   b ee n   r ev i w ed ,   r esu lt s   o f   th e  e x p er im en t  h a v e  d e m o n s tr ated   I C A  f ea tu r e  ex tr ac tio n   d i m e n s io n alit y   r ed u ctio n   ca n   s u p p o r t  th e  ad v an ce m e n t  o f   e n s e m b le  cla s s i f icatio n .   R ec en t  an d   f u tu r e  w o r k s   ca n   b e  e n h an ce d   u s in g   o t h er   en s e m b le  clas s if ier s   w it h   o th e r   f ea tu r e  ex tr ac tio n   al g o r ith m s .       RE F E R E NC E S     [1 ]   S h a n w e n   S . ,   C h u n y u   W . ,   Hu i  D. ,   Qu a n   Z . ,   “ M a c h i n e   L e a rn in g   a n d   i ts  A p p li c a ti o n s   in   P lan t  M o l e c u lar  S tu d ies , ”   Briefin g s i n   F u n c ti o n a l  Ge n o mic s ,   v o l.   1 9 ,   n o .   1 ,   p p .   4 0 - 48 ,   2 0 1 9 .   [2 ]   Da v id   F .   R. ,   Ka te  C. ,   Ya n k   Y.  L . ,   Ka rin e   G . ,   Ro c h   L . ,   “ P re d ictin g   G e n e   Ex p re ss io n   in   t h e   Hu m a n   M a laria   P a ra site  P las m o d iu m   F a lcip a ru m   Us in g   Histo n e   M o d if ica ti o n ,   Nu c leo so m e   P o sit io n in g ,   a n d   3 D  L o c a li z a ti o n   F e a tu re s,”   PL OS   C o mp u ta ti o n a l  B io l o g y ,   v o l.   1 5 ,   n o .   9 ,   p p .   1 - 2 3 ,   2 0 1 9 .   [3 ]   A li sta ir  M il e s ,   e t  a l. ,   “ G e n e ti c   d iv e rsity   o f  th e   Af rica n   m a laria   v e c to r  A n o p h e les   g a m b iae , ”   N a tu re ,   v o l.   5 5 2 ,     no .   7 6 8 3 ,   p p .   9 6 - 1 0 0 ,   2 0 1 7 .   [ 4 ]   A r o w o l o   M .   O . ,   A d e b i y i   M . ,   A d e b i y i   A . ,   “ A   D i m e n s i o n a l   R e d u c e d   M o d e l   f o r   t h e   C l a s s i f i c a t i o n   o f   R N A - s e q   A n o p h e l e s   G a m b i a e   D a t a , ”   J o u r n a l   o f   T h e o r e t i c a l   a n d   A p p l i e d   I n f o r m a t i o n   T e c h n o l o g y ,   v o l .   9 7 ,   n o .   2 3 ,   p p .   3 4 8 7 - 3 4 9 6 ,   2 0 1 9 .   [5 ]   Ka rth ik   S .   a n d   S u d h a   M . ,   “ A   S u rv e y   o n   M a c h in e   L e a rn in g   A p p ro a c h e s  in   G e n e   Ex p re ss io n   Cl a ss if i c a ti o n   in   M o d e ll i n g   Co m p u tatio n a l  Dia g n o stic  S y ste m   f o r  Co m p lex   Dis e a se s,”   In ter n a ti o n a l  J o u rn a l  o f  E n g i n e e rin g   a n d   Ad v a n c e d   T e c h n o lo g y ,   v o l .   8 ,   n o .   2 ,   p p .   1 8 2 - 1 9 1 ,   2 0 1 8 .   [ 6 ]   J o h n s o n   N .   T . ,   D h r o s o   A . ,   H u g h e s   K .   J . ,   K o r k i n   D . ,   “ B i o l o g i c a l   c l a s s i f i c a t i o n   w i t h   R N A - s e q   d a t a :   C a n   a l t e r n a t i v e l y   s p l i c e d   t r a n s c r i p t   e x p r e s s i o n   e n h a n c e   m a c h i n e   l e a r n i n g   c l a s s i f i e r s ? , ”   R N A ,   v o l .   2 4 ,   n o .   9 ,   p p .   1 1 1 9 - 1 1 3 2 ,   2 0 1 8 .   [7 ]   L ib b re c h t  M .   W .   a n d   No b le  W .   S . ,   “ M a c h i n e   lea rn in g   a p p li c a ti o n s  i n   g e n e ti c s  a n d   g e n o m ics , ”   Na tu re   Rev iews   Ge n e ti c s ,   v o l.   1 6 ,   p p .   3 2 1 - 3 3 2 ,   2 0 1 5 .   [8 ]   Ja g g a   Z.   a n d   G u p ta  D.,   “ Clas si f ica ti o n   m o d e ls   f o r  c lea r  c e ll   re n a l  c a rc in o m a   sta g e   p ro g re ss io n ,   b a se d   o n   tu m o r  RNA se q   e x p re ss io n   train e d   s u p e r v ise d   m a c h in e   lea rn in g   a lg o rit h m s,”   BM C  Pro c e e d in g s ,   v o l.   8 ,  2 0 1 4 ,  p p .   1 - 7 .   [9 ]   Oh   D.  H.,   Kim   I.   B. ,   Kim   S .   H.,   A h n   D.  H.,   “ P re d ictin g   A u ti sm   S p e c tru m   Diso rd e r  Us i n g   Blo o d - b a se d   G e n e   E x p r e s s i o n   S i g n a t u r e s   a n d   M a c h i n e   L e a r n i n g , ”   C l i n   P s y c h o p h a r m a c o l o g y   N e u r o s c i e n c e ,   v o l .   1 5 ,   n o .   1 ,   p p .   4 7 - 5 2 ,   2 0 1 7 .   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  11 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 2 1   :   1 56 1   -   1569   1568   [1 0 ]   Re n   Q.,   A n ju n   M . ,   Qin   M . ,   Qu a n   Z. ,   “ Clu ste rin g   a n d   Clas sif ic a ti o n   M e th o d s  f o r  S in g le - c e ll   RNA - se q   Da ta, ”   Briefin g s i n   Bi o i n fo rm a ti c s ,  v o l.   2 1 ,   n o .   4 ,   p p .   1 - 1 3 ,   2 0 1 9 .   [1 1 ]   S tep h e n   W .   a n d   R u h o ll a h   S . ,   “ Us in g   S u p e rv ise d   L e a rn in g   M e th o d s  f o r  G e n e   S e lec ti o n   in   RNA - se q   Ca se - Co n tr o l   S tu d ies , ”   Fro n t ier s in ,   v o l.   9 ,   n o .   2 9 7 ,   p p .   1 - 6 ,   2 0 1 8 .   [1 2 ]   A lq u icira - He rn a n d e z ,   J.,   S a th e ,   A . ,   Ji,  H.  P . ,   Nq u y e n   Q.,   P o w e ll   J.  E. ,   “ sc P re d :  A c c u ra te  S u p e rv i se d   M e th o d   f o r   Ce ll - ty p e   Clas si f ic a ti o n   f ro m   S in g le - c e ll   RN A - se q   Da ta,”  G e n o me   Bi o l o g y ,   v o l.   2 0 ,   n o .   2 6 4 ,   p p .   1 - 1 7 ,   2 0 1 9 .   [1 3 ]   Cu i  S . ,   W u   Q.,   W e st  J.,   Ba i  J.,   “ M a c h in e   L e a rn in g - b a se d   M icro a rra y   A n a l y se s  In d ica t e   L o w - Ex p re ss io n   G e n e s   M ig h t  Co ll e c ti v e l y   In f lu e n c e   P A H Dise a se , ”   PL OS   Co mp u ta ti o n a l  Bi o l o g y ,  v o l.   1 5 ,   n o .   8 ,   p p .   1 - 2 5 ,   2 0 1 9 .     [1 4 ]   S h o n   H.  S . ,   Yi  Y.  G . ,   Kim   K.  O.,   Ch a   E.   J.,   Kim   K.  A . ,   “ Clas si f ic a ti o n   o f   S to m a c h   Ca n a c e r  G e n e   Ex p re ss io n   Da ta  U s i n g   C N N   A l g o r i t h m   o f   D e e p   L e a r n i n g , ”   J o u r n a l   o f   B i o m e d i c a l   T r a n s l a t i o n   R e s e a r c h ,   v o l .   2 0 ,   n o .   1 ,   p p .   1 5 - 2 0 ,   2 0 1 9 .     [1 5 ]   A d a m   J.  R. ,   e t  a l. ,   “ S in g le - c e ll   R NA - se q   re v e a ls h id d e n   tran sc rip t i o n a l  v a riatio n   i n   m a laria   p a ra sites , ”   e L IFE ,  T o o ls   a n d   Res o u rc e s ,   v o l.   7 ,   p p .   1 - 2 9 ,   2 0 1 8 .     [1 6 ]   T a n   A .   C.   a n d   G il b e rt  D.,   “ En s e m b le  M a c h in e   L e a rn in g   o n   G e n e   Ex p re ss io n   Da ta  f o r  Ca n c e r  Clas sif ic a ti o n , ”   Ap p li e d   Bi o in fo rm a t ics ,   v o l.   2 ,   n o .   3 ,   p p .   7 5 - 8 3 ,   2 0 0 3 .   [1 7 ]   S o n g   N.,   W a n g   K.,   X u   M . ,   X ie   X . ,   Ch e n   G . ,   W a n g   Y.,   “ De sig n   a n d   A n a ly sis  o f   En se m b le  Clas sif ier  f o r  G e n e   Ex p re ss io n   Da ta o f   Ca n c e r, ”   Ad v a n c e me n t  i n   Ge n e ti c   En g i n e e rin g ,   v o l.   5 ,   n o .   1 ,   p p .   1 - 7 ,   2 0 1 6 .     [1 8 ]   T a re k   S . ,   El w a h a b   R.   A . ,   S h o m a n   M . ,   “ G e n e   Ex p re s sio n   Ba se d   Ca n c e r  Clas si f ica ti o n , ”   Eg y p ti a n   I n fo rm a ti c s  J o u rn a l ,   v o l .   1 8 ,   n o .   3 ,   p p .   1 5 1 - 1 5 9 ,   2 0 1 7 .   [1 9 ]   L i  K.,   Zh o u ,   G . ,   Z h a i,   J.,   L i  F . ,   S h a o   M . ,   “ Im p ro v e d   P S O _ A d a Bo o st  E n se m b le  A l g o rit h m   f o r  I m b a lan c e d   Da ta,”  S e n so rs ,   v o l .   1 9 ,   n o .   6 ,   p p .   1 - 18 ,   2 0 1 9 .   [2 0 ]   Ka m ra n   K.,   Kia n a   J.  M . ,   M o jt a b a   H.,   S a n jan a   M . ,   L a u ra   B. ,   Do n a ld   B. ,   “ T e x t  Cla ss i f ica ti o n   A lg o rit h m s:  A  S u rv e y , ”   In fo rm a ti o n   M DPI ,   v o l.   1 0 ,   n o .   1 5 0 ,   p p .   2 - 6 8 ,   2 0 1 9   [2 1 ]   M a rian g e la  B. ,   Eri c   O.,   W il li a m   A .   D.,   M o n ica   B. ,   Ya w   A . ,   G u o fa   Z. ,   Jo sh u a   H.,   M in g   L . ,   Ji a b a o   X . ,   A n d re w   G . ,   Jo se p h   F . ,   G u iy u n   Y.,   “ RNA - se q   a n a ly se s  o f   c h a n g e s  in   th e   A n o p h e les   g a m b iae   tran sc rip to m e   a ss o c iate d   w it h   re sista n c e   to   p y re th ro id s  i n   Ke n y a :  id e n ti f ica ti o n   o f   c a n d id a te - re sista n c e   g e n e s  a n d   c a n d id a te - re s istan c e   S NP s , ”   Pa ra sites   a n d   Vec to r ,   v o l .   8 ,   n o .   4 7 4 ,   p p .   1 - 1 3 ,   2 0 1 5 .     [2 2 ]   Ja m e s  G . ,   W it ten   D.,   Ha stie  T . ,   T ib sh iran i  R. ,   “ A n   in tro d u c ti o n   t o   sta ti stica l  lea rn in g   w it h   a p p li c a ti o n   in   R , ”   Ne w  Y o rk   ( NY ):  S p ri n g e r ,   2 0 1 3 .   [2 3 ]   Na g i  S .   a n d   Bh a tt a c h a ry y a   D.  K.,   “ Clas si f ica ti o n   o f   M icro a rra y   Ca n c e r  Da ta  Us in g   En se m b le  A p p ro a c h , ”   Ne two r k  M o d e li n g   An a lys is i n   He a lt h   In fo rm a ti c s a n d   Bi o in fo rm a t ics ,   v o l.   2 ,   p p .   1 5 9 - 1 7 3 ,   2 0 1 3 .   [2 4 ]   S a ra h   M . ,   A h m e d   I.   S . ,   L a b ib   M .   L . ,   “ Clas si f ic a ti o n   T e c h n iq u e s  in   G e n e   Ex p re ss io n   M icro a rra y   D a ta,”   In ter n a t io n a l  jo u rn a l  o f   Co mp u te r S c ien c e   M o b il e   C o mp u ti n g ,   v o l .   7 ,   n o .   1 1 ,   p p .   5 2 - 5 6 ,   2 0 1 8   [2 5 ]   G u z m a n   E. ,   El - h a lab y   M . ,   Bru e g g e   B. ,   “ En se m b le  M e th o d s  f o r  A p p   Re v ie w  Clas si f ic a ti o n :  A n   A p p ro a c h   f o r  S o f tw a r e   Ev o lu ti o n , ”   2 0 1 5   3 0 th   IEE E/ ACM   I n t.   Co n fer e n c e   o f   Au to m a ti v e   S o ft w a re   En g in e e rin g ,   L in c o l n ,   NE,     p p .   7 7 1 - 7 7 6 ,   2 0 1 5 .   [2 6 ]   Re n   Y.,   S u g a n t h a n   P .   N.,   S r ik a n th   N.,   “ En se m b le  m e th o d s  f o r  w in d   a n d   so lar  p o w e r  f o re c a stin g :  A   sta t e - o f th e - a rt   re v ie w , ”   Ren e we a b le S u sta in a b le   En e rg y   Rev o l u ti o n ,   v o l.   5 0 ,   p p .   8 2 - 9 1 ,   2 0 1 5 .     [2 7 ]   F len n e rh a g   S . ,   “ M a c h i n e   L e a rn in g   En se m b le,”  2 0 1 7 .   [ On l in e ] .   A v a il a b le:   h tt p :/ /f len n e rh a g . c o m /2 0 1 7 - 04 - 18 - in tro d u c ti o n - to - e n se m b les / ,     [2 8 ]   T sa i   C.   F . ,   Hs u   Y.  F . ,   Ye n   D.   C. ,   “ A   c o m p a ra ti v e   stu d y   o f   c las sif ier   e n se m b les   f o r  b a n k ru p t c y   p re d ictio n , ”   Ap p li c a ti o n   S o f t  Co m p u ti n g   J o u r n a l ,   n o .   2 4 ,   p p .   9 7 7 - 9 8 4 ,   2 0 1 4 .     [2 9 ]   M a y r   A . ,   Bin d e r  A . ,   G e f e ll e r   O.,   S c h m id   M . ,   “ T h e   Ev o lu ti o n   o f   Bo o sti n g   A l g o rit h m s  f ro m   M a c h in e   L e a rn in g   to   S tatisti c a l  M o d e ll in g , ”   M e th o d s I n fo rm a t ics   a n d   M e d icin e ,   v o l.   5 3 ,   n o .   6 ,   p p .   4 1 9 - 4 2 7 ,   2 0 1 4 .   [3 0 ]   Nisio ti   A . ,   M y lo n a s  A . ,   Yo o   P .   D.,   M e m b e r  S . ,   Ka to s  V . ,   “ F r o m   In tru sio n   De tec ti o n   t o   A tt a c k e r  A tt rib u ti o n :  A   Co m p re h e n siv e   S u rv e y   o f   Un su p e rv ise d   M e th o d s,”   IE EE   C o mm u n ica ti o n s  S u rv e y s  &   T u to ria ls ,   v o l.   2 0 ,   n o .   4 ,     p p .   3 3 6 9 - 3 3 8 8 ,   2 0 1 8 .   [3 1 ]   Ha f i z a h   S . ,   A riff in   S . ,   M u a z z a h   N.,   L a ti ff   A . ,   Kh a iri   M .   H.  H.,   A ri ff in   S .   H.  S . ,   e t  a l. ,   “ A   Re v i e w   o f   A n o m a l y   De tec ti o n   T e c h n iq u e s  a n d   Dist rib u te d   De n ial  o f   S e rv ice   (D Do S )  o n   S o f twa re   De f in e d   N e tw o rk   (S DN ), ”   En g i n e e rin g ,   T e c h n o l o g y   a n d   Ap p li e d   S c ien c e   Res e a rc h ,   v o l.   8 ,   n o .   2 ,   p p .   2 7 2 4 - 2 7 3 0 ,   2 0 1 8 .   [3 2 ]   A ro w o lo   M .   O.,   A b d u lsa lam   S .   O.,   Isia k a   R.   M . ,   G b o lag a sd e   K.  A . , ”   A   Co m p a ra ti v e   A n a l y sis  o f   F e a tu re   S e lec ti o n   a n d   F e a tu re   Ex trac ti o n   M o d e ls  f o r  Clas sify in g   M icro a rra y   Da t a se t, ”   Co mp u ti n g   a n d   In f o rm a ti o n   S y ste m ,   v o l.   2 2 ,   n o .   2 ,   p p .   2 9 - 3 8 ,   2 0 1 8 .       B I O G RAP H I E S   O F   AUTH O RS        Ar o w o lo   M ich e a l  O l a o l u ,   is  a   f a c u lt y   o f   th e   De p a rt m e n t  o f  Co m p u ter  S c ien c e   a t  L a n d m a rk   Un iv e rsit y ,   O m u - A ra n   Nig e ri a .   He   h o l d s  a   Ba c h e lo r  De g re e   f ro m   A l - Hik m a h   Un iv e rsit y ,   Ilo rin ,   Nig e ria  a n d   a   M a ste rs  De g re e   f r o m   K w a ra   S tate   Un iv e rsit y ,   M a l e te  Nig e ria,  h e   is  p re se n tl y   a   P h D  S t u d e n t  o f   L a n d m a rk   Un iv e rsity ,   O m u - A ra n   Nig e ria.  His  a re a   o f   re se a rc h   in tere st  in c lu d e s  M a c h in e   L e a rn in g ,   Bio in f o rm a ti c s,  Da ta m in in g ,   C y b e r  S e c u rit y   a n d   Co m p u ter  A rit h m e ti c .   He   h a s  p u b li sh e d   w id e ly   in   lo c a l  a n d   in tern a ti o n a l  re p u tab le  j o u r n a ls,  h e   is  a   m e m b e r  o f   I A EN G ,   A P IS E,   S DIW C,   a n d   a n   Ora c le C e rti f ied   Ex p e rt.       Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       A n   I C A - en s emb le  lea r n in g   a p p r o a ch es fo r   p r ed ictio n   o f  …  ( Mich ea l O la o lu   A r o w o lo )   1569     M a r io n   O lu b u n m i  A d e b iy i ,   is  a   f a c u lt y   o f   th e   De p a rt m e n t  o f   Co m p u ter  S c ien c e   a t  Lan d m a r k   Un iv e rsit y ,   O m u - A r a n ,   Nig e ria.  S h e   h o l d s  a   B. S c   De g re e   f ro m   Un iv e r sit y   o f   Ilo rin ,   Il o ri n   Nig e ria.  S h e   h a d   h e r  M . S c   a n d   P h . D  De g re e   in   Co m p u ter  S c ien c e   f ro m   Co v e n a n t  Un iv e rsity ,   Nig e ria  r e sp e c ti v e l y .   He r  r e se a r c h   in tere sts  in c lu d e ,   Bio in f o rm a ti c s  o f  In f e c ti o u s  (Af rica n )   Dise a se s/  P o p u latio n ,   Org a n ism ’s  In ter - p a th w a y   a n a l y sis,  Hig h   th r o u g h p u t  d a ta  a n a ly ti c s,   Ho m o lo g y   m o d e ll in   a n d   A rti f icia l  In telli g e n c e .   S h e   h a s  p u b li sh e d   w id e ly   in   lo c a l  a n d   in tern a ti o n a l  re p u tab le  jo u r n a ls  S h e   is  a   m e m b e r  o f  Nig e rian   Co m p u ter  S o c iety   (NCS),   th e   Co m p u ter Reg i stra ti o n   Co u n c il   o f   Nig e ria (CP N) an d   IEE E   m e m b e r.         Ad e b iy i,   Ay o d e le  Ar iy o ,   is  a   f a c u lt y   a n d   f o r m e r  He a d   o f   De p a rtme n t  o f   Co m p u ter  a n d   In f o rm a ti o n   S c ien c e s,  Co v e n a n t  Un iv e rsit y ,   Ota   Nig e ria.  He   is   c u rre n tl y   th e   H e a d   o f  De p a rt m e n t   o f   Co m p u ter  S c ien c e   a t  L a n d m a rk   Un iv e r sit y ,   O m u - A ra n ,   N ig e ria,  a   siste r  Un iv e rsit y   to   Co v e n a n t  Un iv e rsit y .   He   h o ld s  a   BS c   d e g r e e   in   Co m p u ter  S c i e n c e   a n d   M BA  d e g re e   f ro m   Un iv e rsit y   o f   Ilo rin ,   Ilo ri n   Nig e ria.  He   h a d   h is M S c   a n d   P h D d e g re e   in   M a n a g e m e n t  In f o r m a ti o n   S y st e m   (M IS )  f ro m   Co v e n a n t  Un iv e rsity ,   Ni g e ria  re sp e c ti v e l y .   His  re se a rc h   in tere sts  in c lu d e ,   a p p li c a ti o n   o f   so f t  c o m p u ti n g   tec h n i q u e s  i n   so lv in g   re a l  li f e   p ro b l e m s,  so f t w a r e   e n g in e e rin g   a n d   in f o rm a ti o n   s y ste m   re se a rc h .   He   h a s  su c c e ss f u ll y   m e n to re d   a n d   su p e rv ise d   se v e ra l  p o stg ra d u a te  stu d e n ts  a t  M a ste rs  a n d   P h D  lev e l.   He   h a s  p u b li s h e d   w id e ly   in   lo c a l  a n d   in tern a ti o n a l  re p u tab l e   jo u r n a ls.  He   is  a   m e m b e r   o f   N ig e rian   Co m p u ter  S o c iety   (NCS),   th e   Co m p u ter  Re g istratio n   Co u n c il   o f   Nig e ria (CP N) an d   IE EE   m e m b e r.         Ch a r ity   Ar e m u ,   is  a   f a c u lt y   a t  th e   De p a rt m e n t  o f   Ag ricu lt u re   a n d   th e   De a n ,   S c h o o l  o f  P o stg ra d u a te  S tu d ies ,   L a n d m a r k   Un iv e rsit y ,   O m u - A ra n ,   Nig e ria.  Ch a rit y   d o e s  re s e a rc h   in   Cro p   En v iro n m e n t  a n d   Im p ro v e m e n t,   P la n t  Bre e d i n g ,   Eco l o g y ,   Ev o lu ti o n a ry   Bio lo g y   a n d   G e n e ti c s.   S h e   is an   I n tern a ti o n a l  sc h o lar w it h   sc h o larly   p u b li c a ti o n s .         Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.