I nte rna t io na l J o urna l o f   E lect rica l a nd   Co m p ute r  E ng in ee ring   ( I J E CE )   Vo l.   9 ,   No .   2 ,  A p r il   201 9 ,   p p .   1 3 3 5 ~ 1 3 4 5   I SS N:  2 0 8 8 - 8708 ,  DOI : 1 0 . 1 1 5 9 1 / i j ec e . v9 i 2 . p p 1 3 3 5 - 1345          1335       J o ur na l ho m ep a g e :  h ttp : //ia e s co r e . co m/ jo u r n a ls /in d ex . p h p / I JE C E   Fa m ily   r ela tion   a nd  STR - DNA   m a tching usin g   fu zzy inferen ce       M a ria   Su s a n Ang g re a iny 1 ,  M .   Ra h m a t   Widy a nto 2 ,   B ela w a t i Widj a j a 3 ,   Nurt a m i So eda rso no 4 ,   P utut   T j a hjo   Wido do 5   1, 2, 3 F a c u l ty   o f   Co m p u ter S c ien c e ,   Un iv e rsitas   In d o n e sia ,   In d o n e sia   4 F a c u lt y   o f   De n ti str y ,   Un iv e rsitas   In d o n e sia ,   I n d o n e sia   5 DN A   L a b o ra to ry ,   In d o n e sia n   Na ti o n a l  P o l ice   Ce n ter o f   He a lt h   a n d   M e d icin e ,   In d o n e sia       Art icle  I nfo     AB ST RAC T   A r ticle  his to r y:   R ec eiv ed   Dec   26 ,   2 0 1 7   R ev i s ed   Sep t   2 9 ,   2 0 1 8   A cc ep ted   Oct  2 0 ,   2 0 1 8       D e o x y rib o se   Nu c leic   A c id   (D NA )   a re   th e   b a sic   e le m e n ts  th a t  m a k e   u p   a   w h o le  se c ti o n   o f   a n   in d iv id u a l.   T h e   b a sic   e le m e n ts  sto re   in f o r m a ti o n   t h a t  is   u n i q u e   t o   e a c h   in d iv id u a l  a n d   w il l  b e   p a ss e d   d o w n   th e   g e n e ra ti o n s.  DN A   a lso   h e lp s  in   i d e n ti f y in g   th e   f a th e r  in   p a tern it y   tes ti n g ,   lo c a t in g   m issi n g   p e rso n   in v e stig a ti o n s,  id e n ti f y in g   v icti m s  in   m a s s  d isa ste rs.   Id e n ti fi c a ti o n   o f   th e   v icti m s  h a s  a   p ro b lem   if   th e   c o m p a riso n   th e   f a th e r  a n d   m o th e r  n o   i n sta n c e   th e   v ictim ’s  p a re n ts  h a v e   d ied   o r   a re   v e r y   f a r  a wa y   f ro m   w h e re   th e   v ictim .   T h e re f o re ,   it   is  n e c e ss a r y   to   tr y   to   id e n ti fy   S h o rt  T a n d e m   R e p e a t  (S T R)   In f e re n c e   o f   l i v e   fa m il y   su c h   a s  sib li n g ,   g ra n d f a th e r/g ra n d m o th e r,   u n c le/a u n t,   c o u sin   a n d   n e p h e w .  In   th is  p a p e r,   w e   p e r f o r m e d   a   m e th o d   to   m e a su re   th e   sim il a rit y   o f   h u m a n   DN A   p ro fi les   u sin g   f u z z y   si m il a rit y .   In   th is  f u z z y   s y ste m ,     DN A  p ro f il e   d a ta   is  u se d   a s  a n   in p u t  th a t   sto re s  h u m a n   id e n ti ty   a lo n g   w it h   it s  DN A  p ro f il e .   T h e   d a ta  e n tere d   is   th e   re su lt   o f  p o ly m e r a s e   c h a in   re a c ti o n   ( P CR)  id e n ti f ica ti o n   w h ich   is  a n   e lec tro p h e r o g ra m   c o n sistin g   o f   1 6   lo c i  w it h   tw o   a ll e les   f o r  e a c h   lo c u s.    O u tp u t  i n   th is  f u z z y   s y ste m   is  th e   v a lu e   o f   in d iv id u a l  sim il a rit y   w it h   re f e re n c e   a n d   w it h   si m il a rit y   l e v e ls,   n a m e l y   s m a ll ,   m e d iu m   a n d   h ig h .   K ey w o r d s :   DN A   p r o fi le   Fu zz y   I d en ti fi ca tio n   Si m i lar it y   ST R - DN A   Co p y rig h t  ©   2 0 1 9   In stit u te o f  A d v a n c e d   E n g i n e e rin g   a n d   S c ien c e .    Al l  rig h ts  re se rv e d .   C o r r e s p o nd ing   A uth o r :   Ma r ia  Su s a n   An g g r ea i n y ,     Facu lt y   o f   C o m p u ter   Scien ce ,     Un i v er s ita s   I n d o n esia,    Dep o k   C a m p u s ,   Dep o k - 1 6 4 2 4 ,   W est J av a,   I n d o n esia.    E m ail:  m ar ia. s u s a n 6 1 @ u i.a c. id       1.   I NT RO D UCT I O N   D e o x y rib o se   Nu c leic   Ac id   ( DNA )   is   u s ed   to   id en ti f y   cr i m in a ls ,   clea r   s u s p ec ts   an d   e x o n er a te  p er s o n s   m is tak e n l y   ac cu s ed   o r   co n v icted   o f   cr i m es  w it h   i n cr ed ib le  ac cu r ac y   w h e n   b io lo g ic al  e v id en ce   e x is t s   [ 1 ] .   DN A   P r o f ile  i s   r elate d   to   th e   p r ev en tio n   o r   d etec tio n   o f   cr i m e,   r elate d   to   id en ti f icatio n   o f   a  d ec r ea s ed   p er s o n ,   is   in   t h e  i n ter est  o f   Natio n a l  Secu r it y   o r   in   a  co u n ter - ter r o is m   i n v esti g atio n   [ 2 ] .   I f   th er e  is   d a m a g e  to   all  o r   p ar t  o f   th e  b o d y   o f   th e  v ict i m   o r   s u s p ec t  th er e  is   lit tle  ev id en ce   o f   a  cr i m e,   th er e  w il l  b e  d if f ic u ltie s   id en ti f y i n g   w h ich   ca u s e s   p r o b le m s ,   i s s u es  s u c h   as  th e  lo n g   o f   th e  s ettle m e n t  o f   a  ca s e.   T h er ef o r e,   v icti m s   o r   s u s p ec ts   u s ed   DN A   as  t h e  p r i m ar y   m ea n s   o f   id en ti f icatio n .   T h is   is   d o n e  b ec au s e  t h e  DN A   ca n   b e  f o u n d   i n   al m o s t   all  o f   t h e  h u m a n   b o d y ,   in   ad d itio n   to   t h e  u n iq u e   p r o p er ties   o f   DN A  ca n   b e  u s ed   f o r   id en tific atio n .   I d en tif icat io n   o f   DN A  co n s is t s   o f   a n al y zi n g   s a m p les  to   i s o l ate  a  u n iq u e   s et  o f   DN A  m ar k er s .   A n   a n al y s t   th e n   co m p ar es  t h e  DN A  p r o f iles   to   d eter m i n e  w h et h er   a  p er s o n 's  DN A   s a m p le  w as  m atc h ed   w ith   e v id e n ce   o b tain ed   f r o m   th e  cr i m e  s ce n e   o r   o f   a  f a m il y   r elatio n s h ip .     I n   a  f a m il y ,   a  ch ild ' s   DN A   p r o f ile  is   a  co m b in atio n   o f   b o th   p ar en ts '   DN A   p r o f ile s   b ec a u s e  th e  ch il d   h as  a  c h r o m o s o m e  t h at  o n e  al lele  h a n d ed   d o w n   b y   h i s   f at h e r   an d   th e  o t h er   allele  is   d er i v e d   f r o m   t h e  m o t h er .   An   i n d iv id u al  ca n   b e  d ec lar ed   as  a  ch ild   o f   a  f at h er   o r   m o th er   if   it  h as  a  s i m ilar   DN A   ab o u t  5 0 %  o f   t h e  to ta l   DN A   b ec au s e  5 0 %  o f   t h e  D NA   is   d ir ec tl y   p ass ed   d o w n   b y   t h e  f a th er   o r   m o t h er   [ 3 ] .   Fu r th er m o r e,   it  ca n   b e  Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  9 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 1 9   :   1 3 3 5   -   1345   1336   co n clu d ed   t h at  t h e  s i m ilar it y   w it h   th e   b io lo g ical  g r an d m o t h er   o r   g r an d f at h er   w as   ab o u t   2 5 %.  I n   p r ev io u s   s tu d ie s   u s ed   a  co m p ar is o n   to   f a m ilies   i n   t h e  f o r m   o f   th e  f at h er   an d   th e  b io lo g ical  m o t h er ,   an d   b io lo g ical   g r an d p ar en ts .   T h e  co m p ar ato r   is   co n s id er ed   to   b e  v er y   g o o d   b ec au s e   th e   r es u lti n g   m atc h   v alu e  i s   v er y   h ig h   o r   ca n   b e  alr ea d y   p er f ec t.  Ho w e v er ,   b eh in d   t h e  p er f ec t io n   o f   it,  th er e  i s   a  d r a w b ac k   t h at  m a y   b e  d if f icu lt  to   o v er co m e,   th er e  is   n o   ce r tain t y   t h at  s u ch   a  co m p ar is o n   i s   th er e  to   tak e   th e  DN A   p r o f ile  o f   th e  v icti m ,   f o r   ex a m p le,   th e  p ar en ts   o f   t h e  v icti m s   h a v e  d ied   o r   p ar en ts   ar e  in co m p lete  o r   v er y   f ar   aw a y   f r o m   w h er e  th e   v icti m .   I t  i s ,   t h er ef o r e  n ec es s ar y   f o r   ca s e  id en tifi ca tio n   D NA  w id er   f a m i l y   r elatio n s   s u ch   as   u n cle s ,   au n t y ,   co u s i n s ,   a n d   all  th e  o t h er   p o s s ib ilit ies  s u r v i v in g   f a m il y .   B ased   o n   t h e  r e s ea r ch   t h at  h as  b ee n   d o n e,   th e  s i m ilar it y   b et w ee n   a n   i n d i v id u al   an d   h i s   s ib lin g s   is   ap p r o x i m ate l y   4 5 % to   5 4 %,  i n   o t h er   w o r d s   ab o u t   5 0 %  to   n o te  th at  th ese  s ib li n g s   h a v e  a  f ath er   an d   m o th er   to g et h e r   w ith   i n d iv id u als  w h o   ar e  b ein g   id e n ti f ied   ( f u ll   s ib lin g ) .   I n   co n tr ast,  if   o n l y   t o   h av e  th e  s a m e  f at h er   o r   m o th er ,   n o t  b o th ,   th en   t h e  r ese m b lan ce   th er e  is   2 5 %  ( h alf - s ib lin g ) .   An o th er   f a m il y   m e m b er ,   n a m el y   u n cle  o r   au n t  al s o   s i m ilar   2 5 %  a n d   2 5 %  w it h   a   r ec o r d   n ep h e w   h ad   th e  s a m e  p ar en tal   r elatio n s h ip .   Fro m   th er e  it  ca n   b e  co n clu d ed   th at  th er e  is   o n l y   1 2 . 5 %  s i m ilar it y   w it h   t h e  co u s in s   [ 4 ] .   DN A   p r o f ile s   w i ll b e  co m p ar e d   h av e   1 6   lo ci,   ea c h   DN A  lo c u s   is   co m p r is ed   o f   t w o   al leles,   o r   co p ies,   o f   t h e  m ar k er - o n e   i n h er ited   f r o m   t h e  m o th er   an d   o n e  i n h er ited   f r o m   t h e  f at h er .   Si x tee n   lo c u s   s h o u ld   b e   co m p ar ed   e v er y t h i n g   to   m a k e  a  d ec is io n   w h et h er   t h er e  is   an y   r elatio n s h ip   b et w ee n   th e   D NA  p r o f ile  e v id en c e   th e  b io lo g ical  b y   co m p ar i s o n .   T h e  s ix tee n   lo ci  ar e  as  f o llo w s ,   C SF 1 P O,   D1 3 S3 1 7 ,   D1 6 S5 3 9 ,   D 1 8 S5 1 ,   D1 9 S4 3 3 ,   D2 1 S1 1 ,   D2 S1 3 3 8 ,   D3 S1 3 5 8 ,   D5 S8 1 8 ,   D7 S7 2 0 ,   D8 S1 1 7 9 ,   FGA ,   T H0 1 ,   T P OX,   VW A ,   a n d   Am elo g e n i n   [ 5 ] .     I n   p r ev io u s   r e s ea r ch   a lg o r it h m s   m atc h i n g   DN A - b ased   ST R   p r o f iles   u s e s   0   o r   1   m ea s u r e  o f   s i m ilar it y   [ 6 ] .   W e  p r o p o s e  m eth o d s   f o r   b u ild in g   f u zz y   s i m ilar ities   to   id en ti f y   m atc h i n g   b ec au s e  ST R - DN A  d ata  is   p r o d u ce d   b y   P C R   m ac h in e s   co n ta in i n g   i m p r e s itio n   w h ile  f u zz y   lo g ic  is   d e s ig n ed   to   h a n d le  d ata  co n tain i n g   i m p r esi t io n   an d   u n ce r tain t y .  T h e  n ee d   to   h av e  f u zz y   r ese m b la n ce   s tep s   is   tr i g g er ed   b y   th e  f ac t  t h at   ST R   p r o f iles   o f ten   s h o w   r ea l  v alu e s   as  allele  m ar k er s ,   n o t  n atu r al   n u m b er ,   th is   m u s t  b e  a  n o is e  ef f ec t  in   t h e  p r o ce s s   o f   an al y zi n g   ST R   p r o f iles   [ 7 ] .   Usi n g   f u zz y   i n f er en ce   m ea s u r e  o f   s i m ilar i t y ,   t wo   alleles  w it h   s m al l   d if f er e n ce s   w ill  s t ill  g et  s i m i l ar it y   s co r es  in s tead   o f   s h ar p   0 ,   w h ic h   eli m in ate s   th e  p o s s i b ilit y   o f   t w o   allele s   th at  h a v e  th e  s a m e  v al u e   al th o u g h   o n l y   s l ig h tl y   d i f f er en t,  w h ich   ca n   o cc u r   d u e  to   n o is e  d u r in g   DN A   d ata  ac q u is itio n .       2.   P RO P O SE D  M E T H O D     T o   im p r o v e  t h e  ac cu r ac y   o f   D NA   a n al y s i s ,   th e  p r o ce s s   o f   c h ec k i n g   to   d o   as  m u c h   as  p o s s ib le  s o   a s   to   g et  o b j ec tiv e  r esu lt s .   T h is   r eq u ir es  th e  p r ese n ce   o f   DN A   s a m p le s   in   la r g e  n u m b er s .   On   t h e  o th er   h a n d ,   th e  s a m p le  DN A   i s   h i g h l y   s u s ce p tib le  to   n o is e,   s u ch   as  b lo o d   m i x ed   w i th   o th er   DN A   s a m p les  o r   d am a g e  d u e   to   te m p er atu r e   an d   w ea th er .   T h is   ca n   i n cr ea s e  t h e   h ab it s   o f   th e  d ata   s o   t h at   an al y s is   o f   th e  p r o ce s s   to   b e  le s s   v alid   id en ti f icatio n .   I n   f o r e n s i c  s cien ce ,   k n o w n   to   s o m e  k in d s   o f   m et h o d s   o f   DN A   p r o f i les,   n a m el y :   1.   R estrictio n   f r a g m en t le n g th   p o l y m o r p h is m   ( R F L P )   a n al y s i s :    R F L P   is   a  m et h o d   f ir s t  in tr o d u ce d .   R F L P   is   a  DN A   f i n g er p r in ti n g   tec h n iq u e  b ased   o n   t h e   d etec tio n   o f   DN A  f r a g m en ts   o f   v ar y i n g   len g t h .   W it h   t h e  d ev e lo p m en t  o f   D N A   a n al y s i s   tec h n iq u es   an d   t h e  n e w er   a n d   m o r e  s tr ea m li n ed ,   R F L P   n o   l o n g er   is   u s ed   b ec au s e  it  r eq u i r es  a  r elativ el y   lar g e  s a m p le  o f   DN A .   I n   ad d itio n ,   s a m p les   ar e  u s u all y   o b tain ed   also   u s u a ll y   d eg r ad ed   b y   e n v i r o n m e n tal  f ac to r s ,   s u c h   a s   d ir t   o r   m i ld e w   th at   ca n   n o t b e  u s ed   f o r   R F L P   [ 8 ] .   2.   Mito ch o n d r ial  DN A   ( m tDN A )   a n al y s is :    Mito ch o n d r ial  DN A   ( m tDN A)   is   v er y   g o o d   to   u s e  as  a  to o l  f o r   th e  an al y s i s   o f   DN A   b ec au s e  it  h a s   th r ee   i m p o r tan t  p r o p er ties ,   n am el y   DN A   h as  a  h i g h   co p y   n u m b er   o f   ab o u t  1 0 0 0 - 1 0 0 0 0   an d   is   i n   th e  ce l ls   w h ic h   h a v e  n o   n u cle u s   s u ch   a s   r ed   b lo o d   ce lls   o r   er y th r o c y t es.  Mito ch o n d r ial  DN A   ca n   b e  u s ed   f o r   an al y s is   d esp ite  th e  li m ited   n u m b er   o f   s a m p le s   f o u n d ,   ea s il y   d e g r ad ed   an d   in   co n d itio n s   t h at  d o   n o t  allo w   f o r   an al y z in g   th e   DN A  co r e.   Sec o n d ,   th e   h u m an   m ito ch o n d r ial  DN A  is   p ass ed   d o w n   m ater n all y ,   s o   th at   ea c h   in d iv id u al  o n   th e  s a m e  m ater n al  li n e  h av e  id e n tical   m ito c h o n d r ial  DN A   t y p es.   C h ar ac ter i s tics   o f   m ito ch o n d r ial  DN A  ca n   b e  u s ed   f o r   t h e  i n v e s ti g atio n   o f   c ases   o f   m is s in g   p er s o n s   o r   d eter m i n e  a  p er s o n 's   id en tit y   b y   co m p ar i n g   t h e  m i to ch o n d r ial  DN A  o f   v ict i m s '   b r o th er   l y s ed   m ater n a l  li n ea g e.   T h ir d ly ,   t h e  m ito c h o n d r ial  D NA  p o l y m o r p h i s m   h as  a  h i g h   r ate  o f   t h e  r ate  o f   ev o l u tio n   is   ab o u t  5 - 1 0   ti m e s   f aster   t h an   n u clea r   DN A .   Mit o ch o n d r ial  DN A   is   a  te ch n iq u e  th at  is   v er y   e x p en s i v e  an d   ex clu s i v e  m atr il in ea l   an d   th er ef o r e  les s   in f o r m a tiv e.   3.   Y - C h r o m o s o m e  a n al y s is :   An al y s i s   o f   Y  ch r o m o s o m e  i s   u s ed   f o r   in v es tig a tio n   o n   h u m an   e v o lu tio n   an d   f o r   f o r en s i c  p u r p o s es  o r   an al y s i s   f at h er   [ 9 ] .   DNA - p o l y m o r p h is m s   o n   th e   h u m a n   Y  c h r o m o s o m e  ar e  v alu ab le  to o ls   f o r   u n d er s ta n d in g   h u m an   e v o l u tio n ,   m ig r atio n   a n d   f o r   tr ac i n g   r elatio n s h ip s   a m o n g   m ale s .   Ma j o r ity   o f   t h e  len g t h   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       F a mily  r ela tio n   a n d   S TR - DN A   ma tch in g   u s in g   fu z z y  in feren ce   ( Ma r ia   S u s a n   A n g g r ea in y )   1337   o f   th e  h u m a n   Y  ch r o m o s o m e  is   in h er ited   as  a  s i n g le  b lo ck   in   li n k ag e  f r o m   f at h er   to   m ale  o f f s p r in g   as   a  h ap lo id   en tit y .     4.   Sin g le  n u cleo tid e   p o l y m o r p h is m   ( SNP )   t y p in g :   Sin g le  Nu c leo tid e  P o ly m o r p h is m   ( SNP )   ty p i n g   is   a  DNA   s e q u en ce   v ar iatio n   o cc u r r in g   w h e n   a  s in g le  n u cleo tid e  ( A ,   T ,   C ,   o r   G)   in   th e  g en o m e  s eq u e n ce   is   alter ed .   Fo r   ex am p le,   an   S NP   m a y   c h a n g e  t h e   DN A   s eq u e n ce   AAGG C T AA   to   A T GGCT A A   [ 10 ] .   E x ce s s   SNP   is   u s e f u l  i n   s o m e  S NP   lo ci  ar e  p o s itio n ed   v er y   clo s e   to g et h er   to   d ef i n e  t h eir   h ap lo t y p e s   a n d   h ap lo t y p e   d ev elo p m en t  tag s .   Di s ad v a n t ag es  SNP   is   i n   n ee d   o f   g en e tic  s eq u e n ce   in f o r m a tio n   f o r   a  tar g et  g e n e  an al y s is   an d   r eq u ir e  p r o cu r e m e n t   o f   eq u ip m e n t  an d   m ater ials   t h at  ar e  co s tl y   an d   n ee d s   a  lar g e  m u ltip le x in g   tes t.   5.   P C R   P C R   is   u s ed   to   m a k e  m i llio n s   o f   co p ies  o f   DN A   f r o m   b io lo g ical  s a m p les.  Am p li f icatio n   o f   DN A  u s i n g   P C R   ca u s ed   DN A   an al y s i s   o n   b io lo g ical  s a m p le s   r eq u ir es  o n l y   a  s m all  s a m p le  a n d   ca n   b e  o b tain ed   f r o m   t h e  s a m p le  as  f i n e  as  h a ir .   T h e  ab ilit y   o f   P C R   to   a m p lify   s m all  a m o u n t s   o f   DN A  m ak e s   it  p o s s ib le  to   an al y ze   s a m p le s   th at  ar e  d eg r ad ed ,   th o u g h .   Sti ll,  it  m u s t  b e  p r ev en ted   co n ta m i n atio n   w i th   o th er   b io lo g ical   m ater ials   f o r   th e  id en tific atio n ,   co llectio n   an d   p r ep ar in g   s a m p les [ 11 ].   6.   ST R   ST R ,   a  p o p u lar   m et h o d   u s e d   to   r ep lace   R FL P   m et h o d .   B y   a g e n c y   FB I   ( Fed er al  B u r ea u   o f   I n v e s tig a tio n ) ,   t h i s   m et h o d   is   p r o p o s ed   as  a  s ta n d ar d   to   d o   a  DN A   p r o f i le.   A s   a  r es u l t,  th e   p r o f ile  ST R   p r o f ilin g   m et h o d   ac ce p ted   b y   m an y   f o r en s ic  lab o r ato r ies  i n   th e  w o r ld   as  a   m eth o d   f o r   p r o f ilin g .   F u r t h er m o r e,   th e  Ag en c y   FB I   also   p r o p o s ed   to   u s e  a  n u m b er   o f   lo ci  ST R   p r o f ilin g   r es u lts   f o r   t h e  p u r p o s es  o f   id en ti f icat io n   o f   h u m an   id en ti t y .   So m e  lo c i  ar e  th en   r ef er r ed   to   as  t h e  h u m an   DN A   p r o f ile s .   A   p er s o n 's   DN A   p r o f ile  ca n   b e   m atc h ed   DN A   p r o f ile  d ata  r ese m b lan ce   to   o n e  an o t h er .   Fo r   t h e  s i m ilar it y   m atc h i n g   p r o ce s s ,   th e  ag en c y   NI ST   ( Natio n al  I n s ti tu te  o f   Sta n d ar d s   an d   T ec h n o lo g y )   m ak es  a  s o f t w ar e  ( s o f t w ar e)   n a m ed   au x iliar y   ST R _ Ma tch Sa m p le s .   Ma tch i n g   r esu l ts   co u ld   lead   to   ce r tain   co n cl u s io n s   r eq u ir ed   b y   t h e   p ar ties   co n ce r n ed .   A  p r o b lem   ar is es,   i f   t h e  p r o f il in g   p r o ce s s   co n ta m in at io n   o n   b io lo g ical  ev id e n ce   co llected   b y   o th er   c h e m ical s   ( d eg r ad ed   q u alit y ) .   A s   a  r es u lt,  th e   DN A   p r o f i le  o b tain ed   w il l  co n ta in   th e   v a lu e  u n ce r t ain t y   ( u n ce r ta i n t y ) .   Fo r   th is   ca s e,   th e  s o f t w ar e  is   n o t  ab le  to   h an d le  it  ST R _ Ma tc h Sa m p les  aid s   f o r   s o f t w ar e  S T R _ Ma tch Sa m p les   w o r k i n g   w it h   cr is p   lo g ic  [ 12 ].     2 . 1 .   Ca lcula t io n o f   lo cus   s i m ila ri t i es bet w ee n t wo   ind iv idu a ls   I n   p r ev io u s   s t u d ies,  p r o p o s ed   f o r m u las  f o llo w   f o u r   co n d itio n s ,   n a m el y :  th e  f at h er   an d   th e  b io lo g ical  m o th er   t h er e,   o n e  f r o m   th e  f at h er   an d   th e  b io lo g ical  m o t h er   is   n o t  th er e,   th er e  ar e  s ib lin g s   o f   in d iv id u als  w h o   w a n t  to   b e  id en t i f ied ,   i f   b io lo g ical  p ar en ts   ar e  n o t  t h er e,   s ib lin g s   u s ed   to   r ep r esen t  b o th   p ar en ts .   T h e  r es u lt  o f   f u zz y   in f er e n ce   o f   th e  p r o p o s e d   m et h o d ,   s ib lin g s   ca n   b e  u s e d   as  a  s u b s titu te  f o r   a  p ar en t  b ec au s e  th e  r es u lti n g   v alu e  i s   q u ite  g o o d   an d   q u ite  clo s e  to   th e  v a l u e  o f   s i m ilar it y   w it h   p ar en ts .   T h e  p r esen t  s t u d y   also   f o llo w s   th e   s a m e  m et h o d ,   n a m el y   b y   p ay in g   a tten tio n   to   e x ter n al  f ac to r s   s u c h   a s   te m p er atu r e  a n d   w ea th er   t h at  co u ld   ca u s e  a  ch a n g e  o r   s h i f t  i n   th e   v alu e  o f   ST R   DN A .   Fo llo w i n g   t h e  ass u m p tio n   o f   a  tr ian g l e  as  in   th e  s t u d y ,   w it h   th e   ST R   p o s itio n   a s   t h e  m id p o in t  o f   t h e  tr ia n g le.   T h en   as s u m ed   Si m ilar l y ,   a  s h i f t  t h at  co u ld   h ap p en   is   a  m ax i m u m   o f   0 . 2   s o   th a t  th e  b ase  o f   th e  tr ia n g le  is   eq u al  to   0 . 4   to   0 . 2   v alu es  to   t h e  le f t  o f   t h e  v al u e  o f   ST R   an d   0 . 2   v al u es   to   t h e  r i g h t  v al u e  ST R .   T h e  h ei g h t  o f   t h e  tr ian g le   i s   as s u m ed   to   1   ( o n e)   b ec au s e   th e   v alu e   i s   th e  g r ea te s t si m ilar it y   v alu e.     T h e  h u m an   g e n o m e  i s   co m p o s ed   o f   r ep etitiv e  DN A   s tr an d   u n its   i n   v ar io u s   s izes a r e  p atter n ed .   R eg io   DN A   w ith   a  s h o r t  r ep etitio n   u n it s   ( r o u g h l y   alo n g   t h e  2 - 6   b p )   is   ca l led   Sh o r t  T an d e m   R ep ea ts   ( ST R ) .   An   i n d iv id u al  i n h er it s   o n e  co p y   o f   ea ch   ST R   p ar en ts .   T h e  r ep etitio n   o f   th is   u n it  b ec o m e  ST R   DNA   m ar k er s   th at  h av e  h i g h   v ar iat io n   i n   a  g r o u p   o f   i n d iv id u als,  s o   it  is   v er y   e f f ec ti v e  DN A   ST R   m ar k er s   ar e  u s ed   f o r   id en ti f icatio n   p u r p o s es o n l y   h u m a n   [ 1 3 ].   T h e  s m aller   t h e  ST R   alleles   t h at  m ak e  u p   t h e  b etter ,   b ec au s e  th e  le v el  o f   v ar iat io n   g iv e n   th e  h ig h er   an d   g iv e n   th a t  ST R   f o u n d   a t  f o r en s ic  test in g   co u ld   d eg r ad atio n   th e  r esu lt  o f   e n v ir o n m en tal  in f l u en ce s .   I n   ad d itio n ,   t h e  s ize  o f   t h e  s m all  ca n   m a k e  a n   ST R   ca n   b e  s ep ar ated   ea s il y   i n   th e  DN A   to   av o id   elec tio n   lo cu s   ad j ac en t  to   av o id   d is r u p tio n   o f   p atter n s   th e  r a n d o m   d is tr ib u tio n   o f   t h e  s tat is tical  a n al y s i s .   T h e  v alu e  o f   ST R   u s ed   in   f o r en s ic  tes t  is   th e   C o m b i n ed   DNA   I n d e x   S y s te m   ( C ODI S),   w h ic h   co n s is t s   o f   1 6   lo ci,   n a m el y   C SF 1 P O,   FG A ,   T H0 1 ,   T POX,   VW A ,   D3 S1 3 5 8 ,   D5 S8 1 8 ,   D7 S8 2 0 ,   D8 S1 1 7 9 ,   D1 3 S3 1 7 ,   D1 6 S5 3 9 ,   D1 8 S5 1 , D2 1 S1 1 ,   D1 9 S4 3 3   a n d   D2 S1 3 3 8   an d   a m elo g en i n   to   d eter m i n e  t h e  s e x .   C ODI S  is s u ed   b y   t h e  FB I   L ab o r ato r y   as a n   i n ter n at io n al  s tan d ar d   f o r   id en ti f icatio n   o f   i n d iv id u als.     A lle les o f   a  lo cu s   DN A   p r o f i l e  h u m a n   t h e  r es u lti n g   f r o m   t h e  p r o ce s s   id en ti f icatio n   o f   DN A   e v id en ce   s o m eti m es  w o r th   i m p r o p er .   T h is   co u ld   s e v er al  h av e  b ee n   th e  ca u s ed   b y   f ac to r s   s u c h   as  th e  ef f ec t s   o f   w ea t h er   an d   te m p er at u r e,   e v id en ce   o f   co n ta m i n atio n   b y   o t h er   s u b s tan ce s   ev e n   th e   p o s s ib ilit y   o f   er r o r s   d u e  to   P C R   m ac h in e.   T h is   w ill  b e  t h e  m ai n   ca u s e  m is id en ti f icatio n   o f   v i cti m s   in   DN A   p r o f ile   m a tch i n g   p er f o r m ed   cr is p .   Fo r   m in i m ize  er r o r s   id en t i f ic atio n   o f   DN A   p r o f ile s   th e n   m atc h in g   DN A   p r o f ile s   is   d o n e  w it h   u s in g   f u zz y .   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  9 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 1 9   :   1 3 3 5   -   1345   1338   I f   a  v ict i m   h a s   al lele  s h o r t  ta n d em   r ep ea t  ( ST R )   2 0   an d   r e f e r en ce   allele   h ad   2 0 . 2   ST R ,   t h e n   b o th   allele s   h av e   v alu e   0 . 5   s i m ilar it y   s o   t h at  b o th   al leles   ca n   b e  s aid   to   s i m i lar .   F u zz y   s i m ilar it y   m ea s u r e m e n t  i s   p er f o r m ed   b y   m ea s u r in g   t h e  DN A   p r o f ile  a  s e m b lan ce   o f   an   allele. Ass u m in g   t h at  a  tr ian g u lar   s h ap ed   allele  w it h   s h o r t  tan d e m   r ep ea t ( ST R )   o f   a n   all ele  s h o w   m id d le  v al u e,   t h e  s ec o n d   leg   is   th e   s a m e  d is tan ce   o f   0 . 4   an d   h i g h er   f o r   th e  s a m e  allele  w it h   1 .   T h en   t o   s i m ilar it y   m ea s u r e  ea ch   allel es o f   a  lo cu s   co m p ar ed   to   u s e  th e  eq u atio n .            -                      ( 1 )     w h er e :  I n d i v id u a l  allele   f o c u s   1   <in d i v id u al   allele  f o cu s   2   a n d   th e   v a lu e   o f   t,   a1 ,   a2   an d   b 1   u s ed   d o u b le  d ata   t y p e.     t =   s i m i lar it y   s co r e   a2   =  f ir s t a llele   a2   =  a1   +  0 . 2   b 1   =  s ec o n d   allele  – 0 . 2   r ep lace   th e  s y m b o ls   a3 ,   b 1   an d   a2   ( r ef er r in g   t o   t h eir   o r ig in a l   d ef in it io n )   w it h   o n l y   th e  alle l e  v alu e  1   an d   as t h e  allele  v al u e  2 ,   an d   as a   s y m b o l   o f   s i m ilar it y ,   i t b ec o m e s :                      ) -    -               ) -     ( 2 )     f u r t h er   b r ea k in g   d o w n   t h e  f o r m u latio n   b y   d o in g   s i m p le  m u l tip licatio n   o p er atio n s :                               )           ( 3 )     f i n all y ,   d i v id e  an d   m u ltip l y   t h e  co ef f icie n t s ,   an d   f i n all y   t h e  s i m p lest   l in ea r   f o r m   is   b eg o tte n :                                 ( 4 )     As  o b v io u s   as  it  s ee m s ,   t h e  f i n al  f o r m u latio n   t u r n s   o u t  to   b e  a  s i m p le  li n ea r   eq u atio n .   T h is   n e w  f u n ctio n   f its   p er f e ctl y   i n to   f ir s t - o r d er   T ak ag i - S u g en o   FIS  o u tp u t,  w h ich   tak e s   ar g u m e n ts   a s   th e   v ar iab le  o f   t h e   f u n ctio n   an d   b u ild i n g   a  lin ea r   m o d el  a s   an   o u tp u t.      2 . 2 .     DNA  s i m i la rit y   m ea s ure m en t   m et ho d    I n   Fig u r e  1   g iv e n   a  DN A   s a m p le  allele  d is tr ib u tio n   o f   b o th   p ar en ts   to   th r ee   ch ild r en .   T h e  f ir s t  c h ild   h ad   in h er ited   o n e  allele  f r o m   h er   m o th er ,   w h ile  t h e  s ec o n d   allele  f r o m   t h e  f at h er .   T h e  s ec o n d   ch ild   h as  o n e  o f   th e  alleles  f at h er   an d   t w o   allel es  o f   th e  m o t h er .   T h e  th ir d   ch ild   h as  o n e  o f   th e  allele s   f at h er   an d   t w o   alleles  o f   t h e  m o t h er .   Fro m   th e   ex a m p le  o f   F i g u r e  1   ca n   b e  in f er r e d   th at,   i f   a  c h ild   h as   alleles   o n e  o f   th e   f ath er s ,   th e  t w o   alleles a s ce r tain ed   m o th er ' s ,   an d   v ice  v er s a.     T h e  f ir s t  allele  w i ll  b e  co m p ar ed   w it h   th o s e  o f   t h e  p atr ilin ea l,  t h en   t h e  s ec o n d   allel e  w ill   b e   co m p ar ed   w it h   t h o s e  o f   t h e  m atr ilin ea l.  T h is   ca u s e s   t h er e  will  b e  t w o   t i m e s   ca lc u latio n   f o r   ea ch   co m p ar is o n .   T h e  f ir s t  is   to   co m p ar e  th e  f ir s t  w it h   r ef er e n ce   allele  f at h er   a n d   co m p ar in g   alle le  b o th   w ith   r ef er en ce   m o t h er s .   T h e  s ec o n d   is   to   co m p ar e  b o th   w it h   r e f er en ce   alleles   an d   al lele  f at h er   f ir s t   w it h   r e f er en ce   m o t h er s .   T h e  id ea   o f   th e s e  m et h o d s   is   ( eg   a  co m p ar is o n   th at  t h er e  f at h er   an d   m o th er   d o   n o t e x is t) :   1.   T ak e  th e  f ir s t  alle le  o f   a  s ib li n g ,   if   t h e  allele  i s   p r esen t  at  o n e  allele  f r o m   t h e  f a th er ,   th e n   t h e  s ec o n d   allel e   ce r tain l y   b elo n g ed   to   th e  m o th er .   I f   n o ,   th en   it i s   th e  f ir s t a lle le  th at  b elo n g ed   to   th e  m o t h er .   2.   Do   th e  s a m e  f o r   s u b s eq u e n t si b lin g s   T h e  v alu e  tak e n   i s   t h e  g r ea te s t  o f   th e s e  t w o   p o s s ib ilit ies   i n   ac co r d an ce   Ge n er alize d   m o d u s   p o n e n s   ( GM P ) .   Sin ce   its   in tr o d u ct io n ,   in   L .   A .   Z ad eh ’ s   p ap er ,   Gen e r alize d   Mo d u s   P o n en s   ( GM P )   h as  b ec o m e  o n e  o f   th e  m o s t  p o w er f u l  to o ls   in   ap p r o x i m ate  r ea s o n i n g   [ 1 4 ] .   Ho w ev er ,   GM P   h as  b ee n   u s ed   w i th o u t  an y   ass u m p tio n s ,   w h ic h   if   v er i f ied ,   w o u ld   i n cr ea s e  t h e  s p ec if icit y   o f   t h e  i n f er r ed   co n clu s io n .   On e  s u c h   h y p o t h esi s   is   th e  g r ad u al  r elatio n s h ip   b etw ee n   th e  p r e m i s e  an d   th e  co n s eq u en ce .   Fi g u r e  2   is   an   ex a m p le  o f   a  f a m il y   tr ee   th at  co n tai n s   th e  co m p lete  f a m il y   m e m b er s .     Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       F a mily  r ela tio n   a n d   S TR - DN A   ma tch in g   u s in g   fu z z y  in feren ce   ( Ma r ia   S u s a n   A n g g r ea in y )   1339       Fig u r e  1 .   DNA   s a m p le  allele  d is tr ib u tio n   o f   p ar en t  an d   c h ild   [ 1 1 ]           Fig u r e  2 .  Fa m il y   tr ee   ex a m p le       As f o r   th e  f o r m u la  p r o p o s ed   f o r   th is   r esear ch   ar e  as f o llo w s :   1.   I f   th er e  i s   a  co m p ar i s o n   t h at  i s   th e   b io lo g ical  f ath er   a n d   m o th er ,   th e n   s ib lin g s   in   th e   f a m il y   s h o u ld   n o t  b e   co m p ar ed .   T h e  eq u atio n   ap p lies   :     Si m i lar it y = lik e   ( Vict i m ,   Fa th e r ) + lik e  ( Victi m ,   Mo t h er )     Var iab le  co m p atib ilit y   is   a  m atc h   v al u e  o b tain ed   in   t h e   p r o ce s s   id en tif icatio n ,   in   o t h er   w o r d s ,   th e  f i n al  r es u lt  o f   t h e  i m p le m en tatio n .   P r ed icate   s i m ilar   ( A ,   B )   is   a  f u n ctio n   th at  m ap s   S T R   v alu e s   o f   A  an d   B   t h e  r ea l   n u m b er s   [ 0 ;  0 , 5 ]   w h er e  0   i n d icate s   t h at  A  a n d   B   ar e  n o t  s i m ilar itie s   a n d   0 . 5   ar e  th at   A   a n d   B   h av e  s i m ilar   p er f ec t [ 1 5 ] .     2.   I f   o n e   o f   th e   b io lo g ical   f at h er   o r   m o th er s   is   n o t   t h er e,   b u t   th er e  ar e  b io lo g ical  s ib lin g   f r o m   th e   v icti m   w h o   w i s h   to   b e  id en t if ied .   Sib lin g s   w ill  b e  a  s u b s tit u te  f o r   a   p ar en t  w h o   d o es  n o t  e x i s t  b ec au s e  i n   DN A  s ib lin g s   t h er e  ar e  p ar en tal  DN A .   T h e  eq u atio n   ap p lies :        Si m alar i t y = l ik e  ( Victi m ,   Fat h er ) + P s eu d o L ik e1   ( Victi m ,   Fat h er ,   Sib lin g )     T o   ca lcu late  th e  s i m ilar it y   with   t h e  p ar en t,  if   t h e  f at h er   o r   m o th er   i s   n o t  th er e  t h en   o n e  o f   th e   f u n ctio n s   s i m i lar   w i ll  b e  w o r t h   0 .   I t  ce r tain l y   w o u ld   r ed u c e  th e  v al u e  o f   ac cu r ac y   th e  c alcu latio n   to   b e   p er f o r m ed .   th u s   in tr o d u ce d   a  n e w   f u n ctio n   t h at  is   P s e u d o L ik e  ( A ,   B ,   C )   th at  i s ,   a  f u n c ti o n   w h ic h   m ap s   ST R   A ,   B ,   an d   a  s et  o f   ST R - C   to   th e  v al u e  [ 0 ;  0 . 5 ]   in   w h i ch   th e  v al u e  g en er ated   is   th e  v alu e  o f   " h o p e"   r ese m b lan ce   b et w ee n   a  p ar en t   in   ad d itio n   to   B ,   f o r   ex a m p le,   B   is   th e  f at h er ,   th en   t h e  v a l u e  o f   s i m ilar it y   " h o p e "   th at  is   g en er ated   b et w ee n   th e  v icti m   an d   h i s   m o t h er .   Var iab le  C   o n   f u n ctio n   is   s et   o f   th e  v al u e  o f   ea ch   s ib li n g   ST R ,   b ec au s e  it is   ass u m ed   s ib li n g s   o p ted   co u ld   b e  m o r e  th a n   o n e.   3.   I f   b o th   p ar e n ts   ar e  n o t   th er e,   th e n   t h e   d ec is io n   d ir ec tl y   ta k en   f r o m   b io lo g ical   s ib li n g s ,   s ib lin g s   w il l   b e   u s ed   to   r ep r esen ts   b o th   p ar en t s .   T h e  eq u atio n   ap p lies :     Si m i lar it y = P s e u d o L i k e2   ( Vict i m ,   Sib li n g )     Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  9 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 1 9   :   1 3 3 5   -   1345   1340   I n   th e  ab o v e  f u n c tio n   u s e  a  n e w   f u n ct io n   P s eu d o L ik e2   ( A ,   B )   w h er e  t h e  f u n ctio n   o f   m a p p in g   t h e   v alu e   o f   t h e  s et  ST R   A   a n d   B   in to   a  v alu e   s i m ilar it y   [ 0 , 1 ]   w ith   0   i n d icate s   t h at  th er e  i s   n o   m atc h   b et w ee n   A   w i th   f a m il y   a n d   1   in d icate s   a  p er f ec t  m atc h .   4.   I f   b o th   p ar en ts   ar e  n o t t h er e,   th er e  is   n o   s ib li n g s ,   g r an d p ar en ts   ar e  s t ill t h er e.   T h e  eq u atio n   ap p lies :     Si m i lar it y = lik e  ( Vict i m ,   Gr a n d Fath er ) + lik e  ( Vict i m ,   Gr a n d Mo th er )     Si m i lar   p r ed icate   ( A ,   B )   is   a  f u n ct io n   t h at  m ap s   ST R   v alu e s   o f   A   a n d   B   to   th e  r ea l  n u m b e r s   [ 0 ;  0 . 2 5 ]   w h er e  0   i n d icate s   t h at  A  an d   B   d o   n o t  h av e   s i m ilar   a n d   0 . 2 5   s tates  th at   A   a n d   B   h av e   a  p er f ec t   r ese m b lan ce .     5.   I f   b o th   p ar en ts   ar e  ab s en t ,   t h er e  i s   n o   s ib li n g s ,   o n e  g r a n d p ar en t sti ll e x i s ts .   T h e  eq u atio n   ap p lies :     Si m i lar it y = lik e  ( Vict i m ,   Gr a n d Fath er )   o r   lik e  ( Victi m ,   Gr a n d Mo th er )       6.   I f   b o th   p ar en t s   ar e  ab s en t,  th er e  is   n o   s ib lin g s ,   g r an d p ar en ts   ar e  ab s en t,  a u n t y   an d   u n cl e  ar e  s till   t h er e,   th e  eq u ati o n   ap p lies :     Si m i lar it y = lik e  ( Vict i m ,   U n cl e) + lik e  ( Victi m ,   A u n t y )     Si m i lar   p r ed icate   ( A ,   B )   is   a  f u n ct io n   t h at  m ap s   ST R   v alu e s   o f   A   a n d   B   to   th e  r ea l  n u m b e r s   [ 0 ;  0 . 2 5 ]   w h er e  0   i n d icate s   t h at  A  an d   B   d o   n o t  h av e   s i m ilar   a n d   0 . 2 5   s tates  th at   A   a n d   B   h av e   a  p er f ec t   r ese m b lan ce .   7.   I f   b o th   p ar en ts   ar e  ab s en t,  t h er e  is   n o   s ib li n g s ,   g r a n d p ar en ts   ar e  ab s en t,  o n e  au n t y / u n cle  s ti ll  ex i s ts ,   th e  eq u atio n   ap p lies :     Si m i lar it y = lik e  ( Vict i m ,   U n cl e)   o r   lik e  ( Victi m ,   A u n t y )     8.   I f   b o th   p ar en t s   ar e  ab s en t,  th er e  is   n o   s ib lin g s ,   g r an d f at h er /g r an d m o th er   i s   m is s in g ,   a u n t y / u n cle  d id   n o t   ex is t,  t h er e  is   s t ill a  co u s in .   T h e  eq u atio n   ap p lies :     Si m i lar it y = P s e u d o L i k e3   ( Vict i m ,   C o u s i n s )     I n   t h e  ab o v e  f u n ctio n   u s e  a   n e w   f u n ctio n   P s e u d o L i k e3   ( A ,   B )   in   w h ich   th e   f u n ctio n   is   m a p p ed   v alu e   s et  ST R   A   an d   B   in to   a  s i m il ar it y   v al u e  [ 0 , 1 ]   w it h   0   in d ica tes  th at  t h er e  is   n o   m atc h   b et w ee n   A   an d   h i s   f a m il y   a n d   o n e  d ec lar ed   a  p er f ec t  m atc h .     9.   I f   b o th   p ar en t s   ar e  ab s e n t,  t h er e  is   n o   s ib li n g s ,   g r an d p ar en ts   ar e  ab s en t,  a u n t y   / u n cle  is   ab s en t,  co u s in s   ar e  ab s en t,  n ep h e w   s til l e x i s ts .   T h e  eq u atio n   ap p lies :     Si m i lar it y = P s e u d o L i k e4   ( Vict i m ,   Nep h e w s )     I n   th e  ab o v e  f u n ct io n   u s e  a  n e w   f u n ctio n   P s eu d o L i k e4 ( A ,   B )   in   w h ic h   th e  f u n ctio n   i s   m ap p ed   v alu e   s et  ST R   A   an d   B   in to   a  s i m il ar it y   v al u e  [ 0 , 1 ]   w it h   0   in d ica tes  th at   t h er e  is   n o   m atc h   b et w ee n   A   an d   h i s   f a m il y   a n d   o n e  d ec lar ed   a  p er f ec t  m atc h .     2. 3 .    F uzzy   i nfe re nce  o f   ea ch  DNA  pro f ile  lo cus   I n p u t  f o r   f u zz y   i n f er e n ce   is   th e  v alu e  o f   th e  s i m ilar it y   o f   t wo   alleles  o n   th e  co r r esp o n d in g   lo cu s ,   an d   th e  r es u lt  is   th e  s i m ila r it y   v a lu e  o f   ea c h   lo cu s   o f   t h e  DN A   p r o f ile.   T h er e  ar e  t w o   m e th o d s   u s ed   in   t h i s   in f er en ce :  Su g e n o   an d   Ma m d an i  m et h o d s .   I n   t h e  i m p le m e n t atio n   o f   w h ich   is   d i f f er en t   f r o m   t h e  t w o   m et h o d s ,   th e  d ef u zz i f icatio n   tec h n iq u e  is   u s ed   a n d   th e  m e m b er s h ip   s et  o u tp u t s   ar e  f u zz y   in f er en ce   s y s te m s .   T h e  i m p le m e n tatio n   eq u atio n   lies   i n   th e  n u m b er   o f   in p u t  f u z z y   i n f er e n ce   s y s te m s ,   in p u t  m e m b er s h ip   s ets,  a n d   in f er en ce   r u les   u s ed .   T h er e  a r e  t w o   f u zz y   i n f er en ce   s y s te m s ,   allele1   a n d   allele2 .   T h e  t w o   al leles   h a v e  th e   s a m e  m e m b er s h i p   s et.   Geo m et r icall y ,   an   o v er v ie w   o f   t h e  m e m b er s h ip   s e t c an   b e  s ee n   i n   Fi g u r e   3 .        Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       F a mily  r ela tio n   a n d   S TR - DN A   ma tch in g   u s in g   fu z z y  in feren ce   ( Ma r ia   S u s a n   A n g g r ea in y )   1341       Fig u r e  3 .  Gr ap h   m e m b er s h ip   f u n ct io n s   [ 1 5 ]       T h e  m e m b er s h ip   d eg r ee   o f   t h e  t w o   a lleles  is   d eter m in ed   b y   th e  s i m ilar it y   v al u e  p r o d u ce d .  T h e  f u zz y   in f er en ce   s y s te m   ( FIS)   is   a  s y s te m   t h at  u s es  f u zz y   s et  th eo r y   to   m ap   in p u ts   to   o u tp u t s   u s i n g   f u zz y   lo g ic   [ 1 6 ] .   FIS  m et h o d s   ar e  o f ten   u s ed   th er e  ar e  t w o   n a m el y   Ma m d an i  an d   S u g en o   m eth o d s .   T h e  Ma m d an i  f u zz y   in f er en ce   e n g in e   tak e s   f u zz y   in p u t s   a n d   p r o d u ce s   f u zz y   o u tp u t  b ased   o n   th e   p r e - d ef i n ed   r u les,  o n   t h e  o t h er   h an d ,   T ak ag i - S u g en o   f u zz y   i n f er e n ce   s y s te m   tak e s   f u zz y   in p u t s   a n d   p r o d u ce s   cr is p   o u tp u ts   [ 17 ] .   I n   th i s   p ap er ,   Su g e n o 's  f u zz y   m e th o d   is   u s ed   to   co n cl u s io n .   C o n clu s io n   p r o p o s ed   is   t h e  a v e r ag e  v a lu e   f o r   al l  s i m ilar it y   lo c u s   o f   r e f er e n ce   f at h er s   w it h   an   av er a g e  v al u e  f o r   all  s i m ilar it y   lo cu s   o f   r ef er en ce   m o t h er s .   T h e  t w o   s tate m e n ts   w o u ld   b e  th e  p r e m is e  f o r   s y s te m s   t h at  g e n er ate  v al u e  m atch   i n d i v id u al  m e m b er s h ip   i n   th e   f a m il y .   C o r r esp o n d in g   p r ev io u s   s t u d ies  ea c h   s i m ilar it y   v al u e  ( r e f er en ce   f at h er   a n d   m o t h er )   to   f o llo w   t h e   m e m b er s h ip   f u n ctio n   as f o llo w s ,                    )   {                                                                                   ( 5 )                       )   {                                                                                                                                   ( 6 )     f hi gh   x )       { 0 if   x   0 ,   1 if   x   0 ,   x - 0,   0, 1 if   0 ,    x  0 ,         ( 7 )     Fu zz y   i n f er e n ce   i s   a  p r o ce s s   o f   o b tain i n g   n e w   k n o w led g e   th r o u g h   e x i s ti n g   k n o w led g e   u s in g   f u zz y   lo g ic  [ 1 8 ] - [ 20 ] .   T h e  f u zz y   r u le s   ar e  ap p lied   ar e  as f o llo w s   [ 2 1 ]   s h o w n   i n   Fi g u r e  4 .           Fig u r e  4 .   Fu zz y   r u le        B ased   o n   Su g e n o   m e th o d ,   it  m u s t  f i n d   f u zz i f icatio n   w ei g h t s   f o r   w ei g h ted   av er a g e  f o r   ea ch   d eg r ee   o f   s i m ilar it y ,   n a m el y   s m a ll,  m ed i u m ,   a n d   lar g e.   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  9 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 1 9   :   1 3 3 5   -   1345   1342   g _ S m all= 0 . 1 5   ( p o in t c h an g e  i n   s lo p e  d o w n   i n to   a  f lat  lin e)   g _ Me d iu m = 0 . 3 5   ( th e  m id p o in t b et w ee n   0 . 2   an d   0 . 5 )   g_ Hig h= 0 . 5   ( p o in t c h an g e  i n   s lo p e  r is in g   to   f lat  li n e)   T h e  w ei g h ted   av er ag e  m et h o d   ch o s e n   f o r   t h e  ca lc u latio n s   i s   q u ite  ea s y   a n d   th e   n u m b er   o f   d eg r ee   o f   s i m ilar it y   o n l y   s li g h tl y .   T h e  g r ea test   v al u e  t h at  ca n   b e  g en er a ted   b y   t h ese  f u n ctio n s   al s o   f o ll o w s   t h at  t h e  v a lu e   is   in   th e  d iag r a m   f u zz y ,   t h u s   tu r n i n g   it  i n to   a  co n clu s io n   co u ld   v er y   ea s il y   b ec a u s e  o n l y   a  m ap p ed   v alu e   d ef u zz i f icatio n   r esu lts   w i th   t h e  v alu e s   in   t h e  d iag r a m   f u zz y .   Def u zz if icatio n   v al u e  w ill  b e  ca lcu lated   f o r   ea ch   r ese m b la n ce   to   h is   f a th er   a n d   m o t h er .   F u r th er m o r e,   th e  v alu e   o f   b o th   is   ad d ed   to g eth er   to   g e t  t h e  to tal  s i m ilar it y   v al u e.   O n ce   ca lc u lated ,   th e   m ax i m u m   v al u e  t h at   ca n   b e  o b tain ed   f r o m   th e   d ef u zz if icatio n   f u n ctio n   i s   0 . 5 .   T h is   h ap p en s   b ec au s e  t h e  v al u e  o f   0 . 5   is   th e   h i g h est   v alu e  th at  m a y   b e  g e n er ated   b y   t h e  p r o p o s ed   s i m ilar it y   f u n ctio n .   I n   o t h er   w o r d s ,   t h e  to tal  v al u e  co u ld   b e  g en er ated   is   1   w h ich   m ea n s   f u ll si m ilar it y .       3.   RE SU L T S  A ND  AN AL Y SI S     Data   u s ed   i n   th e  e x p er i m e n t  i s   a  DN A   p r o f ile  d ata  o b tain ed   f r o m   t h e  Facu lt y   o f   De n tis tr y ,   Un iv er s i t y   o f   I n d o n esia,  w h ic h   co n s i s ts   o f   1 0 0   DNA   p r o f ile  d ata  co n s is ti n g   o f   d ata  o n   4 3   m e n   an d   5 7   w o m e n   o f   d ata.   T h at  th en   t h e  d ata  is   s to r ed   o n   a  d atab ase  o f   DN A  p r o f iles .   Fo r   tr ial  s i m ilar it y   m ea s u r e m en t  r e f er en ce   D N A  p r o f ile  w ith   th e   b io lo g ical  f a m il y   d ata  u s ed   co n s is ts   o f   1 0   d ata  in cl u d in g   t h e  d ata  co n tain e d   in d iv id u als  w h ic h   h as a   b io lo g ical  r elatio n s h ip .   T h e  p r o ce s s   o f   th is   e x p er i m e n t  w ill  b e  co n d u c ted   in   s o m e   ca s es  alr ea d y   h ap p en ed   w it h   th e  r esu lts   p o s itiv e  t h at  t h e  v icti m s   w er e   in d ee d   m e m b er s   o f   th e   f a m i l y .   T h e  ex p er i m en t   w ill  b e  c o n d u cted   f o r   s o m e   co n d itio n s ,   n a m e l y   w i th   t h e  h elp   o f   o n e  o f   th e  p ar en t s   an d   all  m y   s ib li n g s   w it h o u t  a  p ar en t  o r   w it h   t h e  o n l y   s ib lin g ,   o r   w it h   g r an d p ar en t s ,   au n t s   u n cles,  co u s i n s ,   a n d   n ep h e w s .   I n   ea c h   s u c h   i n s tan ce   will b e  ca lc u lated   f o r   ea ch   v al u e  m atc h es  t h e  n u m b er   o f   f a m il ies  t h at  w ill  e v e n tu all y   lo o k   h o w   m a n y   f a m ili es  w er e  r eq u ir ed   to   p r o d u ce   a  v er y   h ig h   v alu e.       T h is   s y s te m   i s   i m p le m e n ted   b y   u s i n g   Ma tlab   R 2 0 1 6 b   an d   M y SQ L   as  d atab ase  m an a g e m en t  s y s te m .   T h e  d atab ase  co n s is t s   o f   t w o   tab les:   a  b io d ata  tab le  an d   a  DN A   r ef er e n ce   tab le.   I n   th e  DN A   r ef er e n ce   tab le   th er e  ar e  3 4   f ield s / co lu m n s   n a m e l y   id   ( s er ial  n u m b er   o f   r ef er en ce s ) ,   clas s i f icatio n   ( k in s h ip   r elatio n s h ip   b et w ee n   r ef er en ce s   w it h   in d i v id u al s   co n s i s ti n g   o f :  f at h er ,   m o th er ,   s ib li n g s ,   g r an d p a r en ts ,   u n cle s ,   au n ts ,   co u s i n s   an d   n iece s )   An d   3 2   lo cu s   v al u es  o f   1 6   lo cu s   ( s ix tee n   lo ci  ar e  C SF 1 P O,   D1 3 S3 1 7 ,   D1 6 S5 3 9 ,   D1 8 S5 1 ,   D1 9 S4 3 3 ,   D2 1 S1 1 ,   D2 S1 3 3 8 ,   D3 S1 3 5 8 ,   D5 S8 1 8 ,   D7 S7 2 0 ,   D8 S1 1 7 9 ,   FGA ,   T H0 1 ,   T P OX,   VW A   a n d   Am elo g e n i n )   r esp ec ti v el y   h a s   t w o   alleles.     A lle le  d ata  e n ter ed   w it h   d o u b le   t y p e  e x ce p t  f o r   lo cu s   a m elo g en i n   v ar ch ar   t y p e  w i th   ch ar ac te r   len g th   1 .   DN A  p r o f ile  d ata  o f   P C R   id en tific atio n   r esu l t  w h ic h   i s   elec tr o p h er o g r a m .   Me asu r e m en t  s i m i lar it y   o f   D NA  p r o f iles   u s in g   s ize  f u zz y   s i m ilar i t y   i n v o l v es  a s s i g n i n g   v alu e s   to   t h e  s i m ilar it y   ea c h   allele  ar e  th en   p r o d u ce d   f r o m   a  v alu e  s i m ilar it y   lo ci.   T h e  av er ag e  o f   all  lo c i  s i m ilar it y   v al u e  i s   th e  v al u e  s i m ilar it y   o f   DN A   p r o f iles .   T h e  DNA   p r o f il e  s u itab le  m atc h   ca n   b e  s aid   if   th e  v al u e  o f     s i m ilar it y   > 0 . 5 .     I n   T ab le  1   s h o w n   t h e  g r ea ter   th e  n u m b er   o f   s ib li n g s ,   th e  g r ea ter   th e  ac cu r ac y   v al u e.   Fro m   t h is   r es u lt,   s ev er al  t h i n g s   ca n   b e  an a l y ze d .   First,  th e   n u m b er   o f   s ib lin g s .   O n e  p er s o n   w ill  o n l y   p r o d u ce   o n e  o f   th e   t w o   s en io r   alle les r ep r ese n ted ,   s o   t h e  er r o r   v al u e  o r   e n tr o p y   is   5 0 %  w h er e  a n   er r o r   w ill   o cc u r   i f   th e   allele   v ic ti m   i s   n o t  o w n ed   b y   t h e  s ib li n g .   Me an w h ile,   if   th e  n u m b er   o f   s ib li n g s   m o r e  t h an   o n e  allele  t h at  i s   n o t  o w n ed   b y   t h e   r ep r esen ted   p ar en t  ca n   b e  f o u n d ,   th en   t h e  en tr o p y   v al u e  ca n   b e  0   if   b o th   alleles  ar e  f o u n d   an d   a  m a x i m u m   o f   0 . 5   if   all  s ib lin g s   h a v e  t h e  s a m e  allele.   v al u es.   T h e  s ec o n d   th i n g   t h at  ca n   b e  an a l y ze d   i s   th at  th e  n u m b er   o f   s ib lin g s   ca n n o t r ea c h   1 0 0 %.       T ab le  1 .   T h e  A v er a g e  Valu e  o f   a  Ma tch   w i th   Fu zz y   N u mb e r   o f     s i b l i n g s   N u mb e r   o f   C a se s   F a t h e r   M o t h e r   W i t h o u t   P a r e n t s   1   20   0 . 7 5   0 . 7 5   0 . 7 0   2   20   0 . 7 5   0 . 7 7   0 . 7 5   3   20   0 . 8 0   0 . 8 0   0 . 7 7       T ab le  2   s h o w n   s i m ilar itie s   ap p ea r   to   r is e  an d   r ea ch   a  m a x i m u m   in   t h e  n u m b er   o f   s ib li n g s   3 ,   b u t  o n l y   r ea ch   a  m a x i m u m   o f   0 . 3   f o r   th e  co l u m n   w it h o u t   p ar en ts   a n d   0 . 4 1   f o r   th e   m o t h er   co l u m n   e v en   th o u g h   th e   v alu e  is   m o n o to n o u s   u p .  I t  ca n   b e  s ee n   t h at  t h e  s i m ilar it y   v alu es  g e n er ated   b y   t h e  t  f u n ct io n   ar e  lo w er   t h a n   th e  v al u e s   g e n er ated   b y   t h e  p r o p o s ed   m et h o d ,   n a m el y   f u zz y .   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I n t J   E lec  &   C o m p   E n g     I SS N:  2 0 8 8 - 8708       F a mily  r ela tio n   a n d   S TR - DN A   ma tch in g   u s in g   fu z z y  in feren ce   ( Ma r ia   S u s a n   A n g g r ea in y )   1343   T ab le  2 .   T h e  A v er a g e  Valu e  o f   a  Ma tc h   w i th   t h e  F u n c tio n   t   N u mb e r   o f   S i b l i n g s   N u mb e r   o f   C a se s   F a t h e r   M o t h e r   W i t h o u t   P a r e n t s   1   20   0 . 2 5   0 . 3 6   0 . 2 1   2   20   0 . 3 0   0 . 4 1   0 . 2 7   3   20   0 . 3 0   0 . 4 1   0 . 3 3       T h e  ab s en ce   o f   o n e  p ar en t  c au s e s   a  lack   o f   o n e  s o u r ce   o f   allele s   th at  ca n   b e  u s ed   f o r   co u n ti n g .   T h e  c alcu latio n   o f   t h e  f u n ctio n   t  a n d   th e  f u zz y   f u n ctio n   is   al m o s t  t h e  s a m e   as  w i th   f u zz y   s i m ilar i t y   v al u es   o b tain ed   w i ll  b e  d iv id ed   i n to   t w o ,   s o   t h at  t h e  m a x i m u m   v al u e  is   0 . 5 .   T h is   is   b ec a u s e  o n l y   o n e  o f   t h e  alle les  i s   co m p ar ed   in   t w o   i n d i v id u al s ,   s o   th at  it  c a n   o n l y   b e  s aid   h al f   o f   all  alle les  t h at  ar e  ex p r ess ed   ar e  s i m ilar .   W h er ea s   t h e  o th er   al leles  w i ll  b e  co m p ar ed   to   o th er   p ar en ts '  lin ea g e s .   C a lc u latio n s   w it h   th e  f u n ctio n   t,   th e  v a lu e  co n tai n ed   in   ea c h   lo cu s   i s   v er y   i m p o r ta n t,  th er e f o r e  if   t h er e  is   a  ch a n g e   to   j u s t  o n e  lo cu s   in   a  D N A  r ef er en ce ,   th er e  co u ld   b e  a  s i g n i f ican t c h a n g e  i n   ca lc u lati n g   th e  m a tch   v al u e   Me asu r e m en ts   o f   f u zz y   s i m ila r it y   o f   D N A   p r o f iles   w it h   r ef e r en ce   to   DN A   p r o f ile  d ata  w er e  d o n e  b y   m ea s u r in g   f u zz y   s i m ilar i t y   o f   ea ch   allele  o f   ea ch   q ue r y   lo ci  w it h   ea ch   al lele  at  all  lo ci  w it h   e ac h   r ec o r d   c o n tain ed   i n   t h e  DN A   p r o f ile   d atab ase.   Fo r   ea ch   r ec o r d   th a t  h as   b ee n   c o m p ar ed   o r   m ea s u r ed   s i m ilar it y   w i ll   r esu lt  in   a   s i m ilar it y   s co r e.    As  o u tp u t   o n   th e   s y s te m   i n ter f a ce   f r o m   f u zz y   p r o f ile  s i m ilar it y   m ea s u r e m e n t s   t h e  DN A   w it h   th i s   DN A   p r o f ile  d atab ase  r ef er en ce   is   1 6   o f   th e  l ar g est s i m i lar it y   v al u es   o f   all  r ec o r d s   co m p ar ed .   T ab le  3   is   an   ex a m p le  o f   s i m ilar it y   m ea s u r e m en ts   f u zz y   p r o f ile  o f   th a t  DN A   t h e  s y s t e m   i s   d o n e   ag ain s t   th r ee   r ec o r d s   s to r ed   in   th e   d atab ase  p r o f ile   DN A  b ased   o n   q u er y   DN A  p r o f ile   a n d   s h o w   th e   v alu e   o f   s i m ilar it y   b et w ee n   th e  DN A   p r o f iles   o f   v icti m s   w i th   r ef er en ce   to   th e  b io lo g ical  m o th er   an d   s ib lin g s   is   1 .   Du e  to   t h e  p r esen ce   o f   t h e  f at h er   as  a  r e f er en ce   i s   n o t  av ai l ab le  th en   r ep lace d   b y   a   b io lo g ical  f at h er ' s   p ar en ts   ar e  s ib lin g s   o f   v icti m s   i n   o r d er   to   o b tain   b io lo g ical  ev id e n c e  is   m o r e  ac c u r ate  b ec au s e  i f   o n e  allele  i n h er i ted   f r o m   t h e  v icti m 's  b io lo g ical  f ath er   th e n   t h at  al lele  co u r s e  t h er e  p ass ed   o n   to   s ib lin g s .     W h en   r e f er en ce   i s   co m p ar ed   o n l y   w it h   t h e  b io lo g ical  m o t h er   o n l y   s i m ilar it y   v alu e  b et w ee n   D N A   p r o f ile s   o f   v icti m s   b y   u s i n g   f u zz y   0 . 3 .   Af ter   ad d in g   a   r ef e r en ce   s ib li n g s   to   r ep lace   th e   b io lo g ical  f a th er .   Va lu e   s i m il ar it y   b et w ee n   D N A  p r o f iles   o f   v ic ti m s   r o s e  to   1 .   T ab le  4   s h o w s   t h e   v al u e  o f   th e  s i m ilar it y   b et w ee n   t h e  v icti m 's  D N A   p r o f ile  a n d   th e  n u m b er   o f   co u s in s   u s i n g   f u zz y   in cr ea s e s   an d   t h e  f u n ctio n   t  i n cr ea s es.  B u t  w i th   f u zz y   f u n ctio n s   it  lo o k s   b etter   th an   th e  f u n ctio n   t.   An al y s i s   at   f u n ctio n   t   is   lo w er   b ec a u s e   th e   ca lc u latio n   is   d o n e  b y   ca lc u lat in g   t h e   a v er ag e   v al u e  o f   t h e   s u itab il it y   o f   t h e  co u s i n 's  D NA   p r o f i le  an d   co m p ar i n g   i t   w it h   t h e  i n d iv id u al  ST R   v a lu es.  T h is   v al u e  is   co n s id er ed   s u itab le  f o r   a  lo cu s ,   if   o n e  o f   th e  t w o   a lleles  at  th e  lo cu s   is   t h e  s a m e.   T h en   l o o k   f o r   th e  av er a g e   v alu e s   f o r   all  lo ci  an d   th e n   lo o k   f o r   th e  av er ag e  f o r   all  s ib lin g s   test ed .   W h er ea s   w it h   f u zz y   co u s i n s   ar e   co n s id er ed   to   r ep lace   th e  f at h er 's  allele  an d   t h e  m o t h er 's  allele  s o   th at  b o th   f at h er   an d   m o th er   alleles  ar e   ad d ed .   I f   th e  p r esen ce   o f   t h e  f at h er   an d   th e  b io lo g ical  m o t h er   is   n o t  th er e,   th en   it  ca n   b e  id en ti fi e d   f a m ilie s   o f   th e  v icti m s   w h o   ar e  s t ill  aliv e.   Fi g u r e   5   s h o w s   th e  v a lu e  o f   s i m ilar it y   w it h   t h e  f u n ctio n s   t  a n d   f u zz y   b et w ee n   th e  DN A   p r o files   o f   v icti m s   w i th   r e f er en ce s   th a t  u n c le/au n t,  g r an d f at h er / g r a n d m o t h er ,   co u s i n s ,   n ep h e w .   th e   tr ial  o f   1 0   ca s e s   o f   id en ti ficatio n   o f   v ic ti m s   w it h   r ef er e n ce   u n cle/a u n t y     6 %  b y   s i m i lar it y   f u n ctio n   t,  w h er ea s   w it h   f u zz y   1 0 0 %,  an d   w ith   r e f er en ce   g r an d f a th e r / g r an d m o th er   5 2 %  b y   s i m ilar it y   f u n ctio n   t,  w h er ea s   w ith   f u zz y   1 0 0 %.  Fo r   id en tifi ca tio n   o f   th e  v icti m   w it h   r ef er en ce   co u s in s   an d   n ep h e w   d o   w it h   tr ial  1 5   ca s e s ,   t h e  r es u lts   o f   s i m ilar it y   w it h   th e   r ef er en ce   f u n c tio n   t  co u s in s   3 8 %  a n d   th e  s i m ilar it y   w i t h   th e  r ef er e n ce   f u zz y   n ep h e w   4 8 %.  Fo r   r ef er en ce   co u s i n s   a n d   n ep h e w   a r e  d o n e  w i th   th e   n u m b er   o f   s ib li n g s   a s   m u c h   a s   3 ,   w h ile  th e   n u m b er   o f   s ib li n g s   2   r es u lt s   s i m ilar it y   w ith   t h e  r ef er e n ce   co u s i n   t  f u n ctio n   3 8 %  an d   t h e   s i m ilar it y   w it h   a  f u zz y   6 9 %,  w it h   t h e  n u m b er   o f   s ib li n g s   1   r esu lt s   s i m ilar it y   w i th   r ef er en ce   co u s i n   t  f u n ct io n   2 1 %  an d   th e  r esu lt s   o f   s i m ilar it y   w it h   4 8 %  f u zz y .   T h at  th e  m o r e  t h e  n u m b er   o f   s ib li n g s ,   t h e  m o r e  th e  n u m b er   o f   lo ci  th at  m atch .       T ab le  3 .   Me asu r e m en t o f   S i m i lar it y   w it h   Mo th er   B io lo g ical  an d   Sib lin g s   L o c i   N a me   Q u e r i   M o t h e r   t   S i b l i n g 1   t   S i b l i n g 2   t     A l e l 1   A l e l 2   A l e l 1   A l e l 2     A l e l 1   A l e l 2     A l e l 1   A l e l 2     A m e l   X   X   X   Y   0   X   Y   1   X   Y   1   D 3 S 1 3 5 8   17   17   15   16   0 . 5   16   18   0   15   16   0   D 7 S 8 2 0   8   9   11   11   1   11   11   0   11   11   0   D 8 S 1 1 7 9   13   16   16   17   0 . 5   10   13   0 . 5   14   14   0 . 5   D 2 1 1 S 1 1   31   3 2 . 2   29   3 1 . 2   0   28   3 3 . 2   1   3 1 . 2   3 3 . 2   1   C S F 1 P 0   10   12   11   11   1   12   12   0   11   12   0 . 5   T H 0 1   7   7   6   8   0   7   7   9   9   0   0 . 5   D 1 3 S 3 1 7   10   10   8   11   0   11   11   0 . 5   10   13   0 . 5   D 1 6 S 5 3 9   9   10   9   11   0   12   12   0 . 5   9   9   0 . 5   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 0 8 8 - 8708   I n t J   E lec  &   C o m p   E n g ,   Vo l.  9 ,   No .   2 ,  A p r il 2 0 1 9   :   1 3 3 5   -   1345   1344   T ab le  3 .   Me asu r e m en t o f   S i m i lar it y   w it h   Mo th er   B io lo g ical  an d   Sib lin g s   ( C o n tin u e)   L o c i   N a me   Q u e r i   M o t h e r   t   S i b l i n g 1   t   S i b l i n g 2   t     A l e l 1   A l e l 2   A l e l 1   A l e l 2     A l e l 1   A l e l 2     A l e l 1   A l e l 2                                             D 2 S 1 3 3 8   19   22   18   19   0   19   22   0 . 5   23   25   0 . 5   D 1 9 S 4 3 3   13   14   15   1 5 . 2   0   13   1 5 . 2   0   13   1 5 . 2   0   V W A   17   18   15   17   0   17   17   1   16   19   1   T P O X   9   11   8   9   0   11   11   0 . 5   8   8   0 . 5   D 1 8 S 5 1   15   19   15   16   0 . 5   15   18   0 . 5   8   8   0 . 5   D S 5 8 1 8   12   13   10   10   1   12   12   0 . 5   11   11   0 . 5   F G A   22   22   21   21   1   22   25   0   20   21   0   F u z z y   0 . 3   F u z z y   1   F u z z y   1   F u n c t i o n   ( t )   0   F u n c t i o n   ( t )   0 . 5   F u n c t i o n   ( t )   0 . 7 5       T ab le  4 .   Sim i lar it y   Me a s u r e m en t D N A   P r o fi le  w i th   C o u s in s   L o c i   N a me   Q u e r i   C o u si n 1   t   C o u si n 2   t   C o u si n 3   t     A l e l 1   A l e l 2   A l e l 1   A l e l 2     A l e l 1   A l e l 2     A l e l 1   A l e l 2     A m e l   X   X   X   X   0   X   Y   0 . 5   X   X   0   D 3 S 1 3 5 8   16   16   16   17   0 . 5   16   17   0   8   12   0 . 5   D 7 S 8 2 0   11   12   8   9   0   8   8   0 . 5   8   12   0 . 5   D 8 S 1 1 7 9   12   15   15   16   0 . 5   12   16   1   14   14   0 . 5   D 2 1 1 S 1 1   30   30   30   30   1   31   3 1 . 2   0 . 5   29   30   1   C S F 1 P 0   12   14   11   11   0   11   12   0 . 5   29   30   1   T H 0 1   7   9   6   9   0 . 5   9   10   0 . 5   11   11   0 . 5   D 1 3 S 3 1 7   8   8   11   12   0   8   10   0 . 5   6   7   0 . 5   D 1 6 S 5 3 9   10   12   10   11   0 . 5   9   13   0 . 5   11   12   1   D 2 S 1 3 3 8   24   24   19   19   0   17   24   1   19   19   0 . 5   D 1 9 S 4 3 3   13   14   13   1 6 . 2   0 . 5   13   1 4 . 2   0 . 5   14   1 5 . 2   0 . 5   V W A   16   17   14   18   0   14   16   0 . 5   14   1 5 . 2   0 . 5   T P O X   8   11   8   8   0 . 5   8   8   1   8   8   0 . 5   D 1 8 S 5 1   15   16   15   16   1   13   16   1   14   16   1   D S 5 8 1 8   10   13   12   13   0 . 5   10   12   0   12   13   1   F G A   23   25   22   24   0   19   24   0   22   23   0 . 5   F u z z y   0 . 3   F u z z y   0 . 6 5   F u z z y   1   F u n c t i o n   ( t )   0   F u n c t i o n   ( t )   0 . 2 5   F u n c t i o n   ( t )   0 . 5           Fig u r e  5 .   C o m p ar is o n   c h ar t t  f u n ct io n s   w i th   f u zz y       4.   CO NCLU SI O N     I n   co n cl u s io n ,   t h e  f u zz y   i n f er en ce   b ased   o n   th e   r esu lts   o f   t h e  p r o p o s ed   m et h o d ,   s ib lin g s   c an   b e  u s ed   as  a  s u b s tit u te  f o r   a  p ar en t  b ec au s e  t h e  v al u e  g en er ated   en o u g h   g o o d   an d   q u ite  clo s e  to   th e  v alu e  o f   co m p ar is o n   w i th   p ar e n ts .   Ma tch i n g   DN A   p r o f i les  o f   i n d i v id u al s   ( q u er y )   w it h   t h e  DN A   p r o f i le  d atab ase   I n d o n esia ' s   co u n tr y   o r   w i th   t h e  b io lo g ical  f a m il y   r eq u e s ts   m ad e  b y   m ea s u r i n g   th e  s i m ila r it y   o f   ea c h   allele  at   th e  lo c u s   DN A   p r o f i le  s ix tee n th   u s i n g   f u zz y   s i m ilar it y .   T h e   f u ll  b io lo g ical  f a m il y   i s   u s ed   as  a   r ef er en ce ,   th e   h ig h er   t h e   s i m ilar it y   v al u es   m ea s u r ed   DN A  p r o f ile  a n d   a   la r g er   n u m b er   o f   lo ci  t h at  m atc h .   I f   t h e  s i m ilar it y   va lu e  i s   r elati v el y   s m a ll  b u t  al leg ed   th at  t h e  v icti m   w as  t h e  b io lo g ical  f at h er   an d   m o t h er   o f   ch ild r en   e x is tin g   r ef er en ce s ,   t h e  p r o ce s s   r eq u ir ed   a  r e - ex a m i n atio n   o f   b io lo g ical  m ater ial  e v id e n ce   o f   ca s u alties.  DN A   p r o f i le   s i m ilar it y   m ea s u r e m e n t  r es u lt s   u s i n g   f u zz y   s i m i lar it y   is   v er y   s a tis f y in g .   O f   al l  t h e  e x p er im en ts   ca r r ied   o u t   to   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.