I A E S  I n t e r n at io n al  Jou r n al  of  A r t if ic ia l  I n t e ll ig e n c e  ( I J - AI )   V ol .   14 , N o.   3 ,  J une   2025 , pp.  1752 ~ 1762   I S S N :  2252 - 8938 ,   D O I :  10.11591/ ij a i. v 14 .i 3 .pp 1752 - 1762          1752     Jou r n al  h om e page :  ht tp : // ij ai . ia e s c or e .c om   E xp l or i n g  p at i e n t - p at i e n t  i n t e r ac t i on s gr ap h s b y n e t w or k   an al ysi s       Z ah e r  S al ah 1 ,  E s r aa A b u  E ls ou d 2 ,  K am al  S al ah 3   1 D e pa r t m e nt  of  I nf or m a t i on  T e c hnol ogy,   F a c ul t y of  P r i nc e  A l - H us s e i n bi n A bd ul l a h I I  f or   I nf or m a t i on T e c hnol ogy,     T he   H a s he m i t e  U ni ve r s i t y , Z a r qa , J or da n   2 D e pa r t m e nt  of  C om put e r  S c i e nc e , F a c ul t y of  I nf or m a t i on  T e c hnol ogy, Z a r qa   U ni ve r s i t y, Z a r qa , J or da n   3 D e a ns hi p of   P r e pa r a t or y Y e a r   a nd  S uppor t i ng S t udi e s ,   I m a m  A bdul r a hm a n B i n F a i s a l  U ni ve r s i t y, D a m m a m , S a udi  A r a bi a       A r t ic le  I n f o     A B S T R A C T     A r ti c le  h is to r y :   R e c e iv e d  S e p   18 ,  2024   R e vi s e d  N ov   18 ,  2024   A c c e pt e d  N ov   24 ,  2024       Understanding  how  patient  demographics  and  sha red  experiences  impact  interactio ns  is  essential  for  strengthenin g  pa / tient   support  networ ks  and  optimizing  health  outcomes  as  personalized  healthcare   becomes  mo re  and  more  important.  To  this  end,  this  study   explores  the  patient - patient  interactio ns  (PPIs)  graph  as   a  network  and   applies  selected  network   a nalysis  approaches  to  examine  the  PPIs  network   of  accutane  drug .   Two   main  research  questions   are  addressed  by   gaining  deeper   insight   at  the   hidden  patterns  of  reactivity  and  connectivity  among  interchanging  nodes.   There  was  a  negative  response  to  the  first  research  question,  which   as ked  if  patients  react  to   others  that   have  similar   gender  and/or   age  profile s  in  a   consist ent  way.  Patient s  tended  to   interact  with  people  o f  different  g enders  and  ages,  indicating  a  high  degree  of  heterogeneity  in   the  network.  N egative  responses  were  likewise  given  to  the  second  research  question,   which   asked  if  communities  inside  the  n etwork  could  identify   patients  based  on   ge nder  or  age  profile.  Network  analysis  approaches   for  community  det ection  fa iled  to  distinguish between groups with similar demogr aphic charact eristics .  Rather,  groups  seemed  to  emerge  based  on  other  factors,  like  similarity  in  patient  opinions.  The  results  imply  that  gender  and  age  do  not  have  a   major  influence   on  community  membership.  Future  resear ch  will  concentr ate  on  applyin g  more  sophis ticated   graph  mining   techniqu es  to   expand   these  approaches t o cover mo re and larg er PPIs  networks.   K e y w o r d s :   A r ti f ic ia l  in te ll ig e nc e   G r a ph ne twor k a na ly s is   M e di c a l  da ta   a na ly s is   N a tu r a l  la ngua ge  pr oc e s s in g   O pi ni on mi ni ng   T e xt  m in in g   T e xt   vi s ua li z a ti on   This is an  open  acce ss artic le unde r the  CC BY - SA   license.     C or r e s pon di n g A u th or :   Z a he r  S a la h   D e pa r tm e nt  of  I nf or m a ti on T e c hnol ogy   F a c ul ty  of  P r in c e  A l - H us s e in  bi n A bdul la h I I  f or  I n f or m a ti on T e c hnol ogy,  T he  H a s he m it e  U ni ve r s it y   P .O . B ox 330127, Z a r qa   13133,  J or da n   E m a il :  z a he r @ hu.e du.j o       1.   I N T R O D U C T I O N   A   ne w   he te r oge ne ou s   ne twor k  e m be ddi ng  te c hni que   c a ll e d  s e lf - da ta   he te r oge ne ous   in f or m a ti on   ne twor k  e m be ddi ng  ( S D H I N E ) ,  w hi c h  in c or por a te s   pa ti e nt - pa ti e nt   in te r a c ti ons   ( PPI s)   da ta   in to   dr ug   e m be ddi ngs   a nd  is   a ppl ic a bl e   to   va r io us   ki nds   of   a dve r s e   dr ug  r e a c ti on  ( A D R )   pr e di c ti on  ta s ks ,  w a s   de s c r ib e d  by  B a of a ng  e t  al .   [ 1] .  T he   a ut hor s   f ir s t  de s ig n e d  va r io us   m e ta - pa th - ba s e d   pr oxi m it ie s   to   c a lc ul a te   dr ug  s im il a r it ie s ,  pa r ti c ul a r ly   ta r ge t  pr opa ga ti on  m e ta - pa th - ba s e d  pr oxi m it y  ba s e d   on  P P I   ne twor k,  a nd  th e n  bui lt  a  s e m i - s upe r vi s e d s ta c ki ng de e p ne ur a l  ne twor k m ode l  th a t  is  j oi nt ly  i m p r ove d by the  de f in e d m e ta - pa th   pr oxi m it ie s   in   or de r   to   in te gr a te   m ix e d  dr ug  in f or m a ti on  a nd  l e a r n  dr ug  r e pr e s e nt a ti ons .   T he   e f f ic a c y  of   th e   S D H I N E   m ode l  is   pr ove n  by  c om p r e he ns iv e   e va lu a ti ons   on  th r e e   A D R   pr e di c ti on  ta s ks   us in g  th r e e   m ode r n   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I nt  J  A r ti f   I nt e ll     I S S N :   2252 - 8938       E x pl or in g pati e nt - pat ie nt  i nt e r ac ti ons  gr aphs  b y  ne tw or k  analy s i s   ( Z ahe r  Sal ah )   1753   ne twor k e m be ddi ng t e c hni que s . A ddi ti ona ll y, by ma ppi ng t he  dr ug r e pr e s e nt a ti ons  i nt o 2 D   s im pl e r  s pa c e , t he   a ut hor s   c om pa r e d  th e   dr ug  r e p r e s e nt a ti ons   in   te r m s   of   dr ug   di s c r im in a ti on.  T he   r e s ul ts   de m ons tr a te d  th a t  th e   pr opos e d  te c hni que   pe r f or m e d  be tt e r   th a n  th e   c om pa r a ti ve   m e th ods .  Z ha o  e t  al .   [ 2 ]   us e d  th e   ne twor k   e m be ddi ng  te c hni que   known  a s   M a s hup   in   th e ir   r e s e a r c h   to   e xt r a c t  im por ta nt   a nd  in f or m a ti ve   dr ug  f e a tu r e s   f r om  a  numbe r  of  d r ug he te r oge ne ous  ne twor ks  t ha t  r e pr e s e nt e d va r io us  pha r m a c ol ogi c a l  f e a tu r e s . I n or de r  t o   e xt r a c t  s id e   e f f e c t  f e a tu r e s ,  a   n e twor k  w a s   a ls o  c ons tr uc te d  f o r   s id e   e f f e c ts .  T he s e   f unc ti ons   a r e   c a pa bl e   of   ga th e r in g  c r uc ia l  da ta   a t  th e   ne twor k  le ve l  on  dr ugs   a nd  th e ir   a dve r s e   s id e   e f f e c ts .  E a c h  p a ir   of   dr ug  a nd  s id e   e f f e c t  w a s   r e pr e s e nt e d  by  c om bi ni ng  a s pe c t s   of   th e   dr ug  a nd  t he   a dve r s e   e f f e c t.   M or e ove r ,  th e y  w e r e   in put   in to   th e   r a ndom  f or e s t  ( R F )   ne twor k  m ode l,   a   pr e di c ti on  m ode l  c r e a te d  by  th e   R F   a lg or it hm .  F ol lo w in g   s e ve r a l  r ounds   of   te s ts ,  th e   a ve r a ge   M a tt he w s   c or r e la ti on  c oe f f ic ie nt s   f or   th e   ba la nc e d  a nd  unba la nc e d  da ta s e ts   w e r e   f ound  to   be   0.640  a nd   0.641,  r e s p e c ti ve ly ,  a c c or di ng  to   th e   e xp e r im e nt a l  r e s ul ts   e va lu a ti ng   th e   R F   ne twor k  m ode l.   C om pa r e d  to   e a r li e r   m ode ls   u s in g  ot he r   m a c hi ne   le a r ni ng  a lg or it hm s ,  th e   R F   ne twor k  m ode l  pe r f or m e d be tt e r .   A   ne w   a ppr oa c h  to   pr e di c ti ng  pos s ib le   dr ug  s id e   e f f e c ts   w a s   e s ta bl i s he d  in   th e   r e s e a r c h  w or k   de s c r ib e d  in   [ 3] .  T hi s   a ppr oa c h  is   ba s e d  on  m or e   c om pl e te   in f or m a ti on  a bout   dr ugs   th a t  in te gr a te s   th e   dr ug ’ s  f or m s   of   e f f e c t  on  pr ot e in s   of   in te r e s t.   A   c e r ti f ie d  he te r oge ne ous   in f or m a ti on  ne twor k  is   u s e d  to   m ode l   s e ve r a l  s or ts   of   dr ug  in f or m a ti on.  U s in g  two  bi a s   r a ndom  w a lk  m e th ods   to   e xt r a c t  dr ug  s e que nc e s   a nd   tr a in   a   s ki p - gr a m   m ode l  to   le a r n  dr ug  e m be ddi ng,  th e   a ut hor s   pr e s e nt e d  a   ve r if ie d  he te r oge ne ous   in f or m a ti on  ne twor k  e m be ddi ng  f r a m e w or k  f o r   le a r ni ng  dr ug   e m be ddi ng  a nd  pr e di c ti ng  dr ug  s id e   e f f e c ts .  B y  c ont r a s ti ng   th e   out c om e s   of   th e   e xpe r im e nt s   w it h   th e   m os t   a dva nc e d  te c hni que s ,  th e   pr opos e d  m e th od ’ s   pe r f o r m a nc e   w a s  pr ove d. M or e ove r , a  c a s e  s tu dy ’ s  out c om e s  va li da te  t he  hy pot he s is  t ha t  dr ugs  e f f e c ts  on t a r ge te d pr ot e in s   a r e   be ne f ic ia l  f or   s id e   e f f e c t  pr e di c ti ng.  Y a ng  a nd  Z ha o   [ 4]   de ve lo pe d  a   s ys te m a ti c   m e th od  th a t  u s e s   onl in e   he a lt h  c om m uni ti e s   ( M e dH e lp )   a nd  pha r m a c e ut ic a l  r e pos it or ie s   ( P ha r m G K B   a nd  S I D E R )   to   id e nt if y   r e pos it io ni ng  dr ugs   th r ough  he te r oge ne ous   ne twor k  a na ly s is .  T he   a ut hor s   c r e a te d  a   he te r oge ne ous   he a lt h  ne twor k  c om pr is in g  dr ugs ,  di s e a s e s   a nd   A D R s   by  u s in g  A D R s   a s   th e   in te r m e di a r y.  T he y  a ls o  c r e a te d     pa th - ba s e d he te r oge ne ou s  ne twor k m in in g t e c hni que s  f or  dr ug r e pos it io ni ng.    A ddi ti ona ll y,  th e y  lo oke d  in to   how   th e   e f f e c ti ve ne s s   of   dr u g  r e pos it io ni ng  is   im pa c te d  by   th e   in f or m a ti on  s our c e s .  T he   out c om e s   of   th e   e xp e r im e nt   s how n   t ha t  m e r gi ng  P ha r m K G B   a nd  M e dH e lp   of f e r e d  479  r e pos it io ni ng  dr ugs   m or e   th a n  th e   nu m be r   of   r e pos it io ni n g  dr ugs   di s c ove r e d  th r ough  ot he r   a ppr oa c he s .  F ur th e r m or e ,  P ubM e d  da ta   a id e d  31%   of   th e   479  r e pos it i oni ng  dr ugs   th a t  w e r e   di s c ove r e d.  A   ne w   c om put a ti ona l  m e th odol ogy  known  a s   gr a ph  a tt e nt io n - ba s e d   c onvolut io na l  le a r ni ng  f or   C ir c R N A - di s e a s e   pr e di c ti on  ( G A T C L 2C D )   w a s   pr e s e nt e d  in   [ 5]   in   or de r   to   p r e d ic t  uni de nt if ie d  c ir c R N A - di s e a s e   a s s o c ia ti ons   ( C D A s ) .  G a us s ia n  in te r a c ti ve   pr of il e   ke r ne l  ( G I P )   s im il a r it y  a nd  s e m a nt ic   s im il a r it y  f or   il ln e s s e s ,   c ir c R N A   s e que nc e   s im il a r it y  a nd  f unc ti on s im il a r it y,  a nd  G I P s   f or   c ir c R N A s   w e r e   f ir s t  c om put e d  by  th e   a ut hor s . T he y   th e n  jo in e d  th e m   to ge th e r   to   c r e a t e   a   he te r oge ne ou s   gr a ph.   A f te r   th a t,   th e   f e a tu r e   c onvolut io n  m a c hi n e   le a r ni ng  m ode l  G A T C L 2C D   w a s   de ve lo pe d.  I t  ge ne r a te d  va r io us   a ggr e ga te d  r e pr e s e nt a ti on s   of   f e a tu r e s   th a t  r e la te d  to   th e   node s   in   th e   he te r oge ne ous   gr a ph  w it h  th e   a s s is ta n c e   of   a   m ul ti - he a d  dyna m ic   a tt e nt io n   a ppr oa c h.  A   s in gl e - la ye r   c onvolut io na l  ne ur a l  ne twor k  e m pl o yi ng  f il te r   ke r ne ls   of   va r io us   s iz e s   w a s   th e n  us e d  to   e xt r a c t  be tt e r   hi ghe r - or de r   a tt r ib ut e s   f r om   e a c h  node ’ s   s ta c ke d  a tt r ib ut e   r e pr e s e nt a ti ons .   I n  th e   e nd,  a   m ul ti - la ye r   pe r c e pt r on  ne ur a l  ne twor k  w a s   s how n  a s   a n  e f f e c ti ve   c la s s if ie r   to   pr e di c t  pos s ib le   C D A s ,  a nd  a   pa ir w is e   e le m e nt - w is e   pr oduc t   ope r a ti on  w a s   e s ta bl is he d   to   id e nt if y  th e   in te r a c ti ons   of   hi ghe r - or de r   a tt r ib ut e   r e pr e s e nt a ti ons .  S ol id   e xp e r im e nt a l  f in di ngs   on  th r e e   di s ti nc t   da ta s e t s   us in g   5 - f ol d  c r os s - va li da ti on  s how n  th a t  G A T C L 2C D  out pe r f o r m e d f iv e  ne w  a ppr oa c he s . A ddi ti ona ll y, c a s e  s tu di e s  pr ove d t ha t  G A T C L 2C D  i s  a   good tool  f or  di s c ove r in g pos s ib le  c ir c R N A s  l in ke d t o di s e a s e s .  P r im e K G , a  m ul t im oda l  knowle dge  gr a ph f or   pr e c is io n dr ug a na ly s is , w a s  pr opos e d by the  a ut hor s  i n  [ 6] .  P r i m e K G  s ig ni f ic a nt ly  e xpa nde d pr e vi ous  e f f or ts   in   di s e a s e -   a s s o c ia te d  knowle dge   gr a phs   by  in te gr a ti ng  20  o ut s ta ndi ng  r e s our c e s   th a t  c ha r a c te r iz e   17,080  di s e a s e s   w it h  4,050,249  r e la ti on s hi ps   r e pr e s e nt in g  te n  m a jo r   bi ol ogi c a l  s c a le s :  di s e a s e - a s s o c ia te d  pr ot e in   pe r tu r ba ti ons ,  bi ol ogi c a l  pr oc e s s e s   a nd  pa th w a y s ,  a na to m ic a l  a nd  phe not ypi c   s c a le s ,  a nd  a n  e xt e n s iv e   li s t  of   a ppr ove d  dr ugs   w it h  th e ir   th e r a pe ut ic   e f f e c t.   P r im e K G   c a n  f a c il it a te   A I   in ve s ti ga ti ons   of   how   pha r m a c e ut ic a ls   a f f e c t  di s e a s e - a s s oc ia t e d  ne twor ks   s in c e   it   ha s   a n  e xt e ns iv e   num be r   of   “ in di c a ti ons , ”   “ c ont r a di c ti ons , ”   a nd  “ of f - la be l  us e ”   dr ug - di s e a s e   e dge s  t h a t  a r e  una va il a bl e  i n ot he r  knowle dge  gr a phs .       2.   M E T H O D   2.1.  P at ie n t - p at ie n t  i n t e r ac t io n s  gr ap h  ( n e t w or k )   I n  th e   r e s e a r c h  c onduc te d  f or   th is   pa pe r ,  pa ti e nt s   a nd  c a r e gi ve r s   s ubm it te d  te xt ua l  pa ti e nt   r e vi e w s ,   w hi c h  w e r e   publ is he d  onl in e   in   H T M L   f or m a t  ( a t  w w w .dr ugl i b.c om ) ,  w it h  a   pr im a r y  f oc us   on  th e   dr ug  s id e   e f f e c ts   s e c ti on.  B e c a us e   it   of f e r s   c om pr e he ns iv e ,  or ga ni z e d  a nd  up - to - da te   dr ug  in f o r m a ti on  in c lu di ng  s id e   e f f e c ts ,  e f f e c ti ve ne s s   a nd   in di vi dua l  r e s pon s e s   f r om   pa ti e nt s ,  da ta   f r om   w w w .dr ugl ib .c om   w a s   ut il iz e d.  B e c a us e   it   f r e que nt ly   or ig in a te s   f r om   c li ni c a l  in ve s ti ga ti ons   a nd  a ut hor iz e d  or ga ni z a ti ons   th e   da ta   is   r e li a bl e   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I S S N :   2252 - 8938   I nt  J  A r ti f   I nt e ll , V ol .  14 , N o.  3 ,   J une   20 25 :  1752 - 1762   1754   w he r e   th is   is   c r uc ia l  f or   a s s ur in g  th e   a c c ur a c y  a nd  pr a c ti c a li ty   of   a na ly s e s   in   r e s e a r c h  in   m e di c in e .  W it h  r e s pe c t  to   pa ti e nt ’ s   pr iv a c y,  a ppr oa c he s   li ke   th e   in te gr a te d  he a lt h  pr of il e   ( I H P )   p r opos e d  by  [ 7]   c a n  be   a dopt e d.  I H P   is   a   de c e nt r a li z e d  a nd  im pe r m e a bl e   pl a tf or m   f or   s a f e ly   s to r in g  a nd  e xc ha ngi ng  m e di c a l  r e c or d s   th a t  m a ke s   us e   of   s m a r t  c ont r a c ts   a nd  bl oc kc h a in   te c hnol ogi e s .  E ve r y  pa ti e nt ’ s   I H P   c a r d,  w hi c h  c ont a in s   a ll   m e di c a l  r e c or ds   li ke   r e por ts ,  pr e s c r ip ti ons   a nd  bi ll s ,  is   a s s ig ne d   w it h  a   uni que   id e nt if ie r .  M e di c a l  pr a c ti ti one r   c a n  s c a n  th e   Q R   c ode   on  th e   I H P   c a r d  to   s ta r t  a   two - pha s e   a u th e nt ic a ti on  pr oc e dur e   th a t  a s ks   th e   pa ti e nt   to   e nt e r   a   one - ti m e   pa s s w or d  ( O T P ) .  B y  li m it in g  a c c e s s   to   c e r ta in   s ha r e d  r e c or ds ,  th is   a ut he nt ic a ti on  pr ot e c ts   pa ti e nt   pr iv a c y  a nd  gua r a nt e e s   s a f e   a nd  m oni to r e d  da ta   a c c e s s .  S a la h  e t  al .   [ 8]   us e d  th e ir   f r a m e w or k  to   e xt r a c t  th e   ne c e s s a r y  da t a   a bout   node s ,  li nks ,  a nd  r e qui r e d  la be ls   in   or de r   to   c r e a te   th e   a s s oc ia te d     P P I s   gr a ph.  T he   hi gh - le ve l  s tr uc tu r e   of   th e s e   di s s a ti s f a c ti o ns   c oul d  be   gr a phi c a ll y  vi s ua li z e d  by  us in g  s e nt im e nt   a na ly s is   te c hni que s   to   e xt r a c t  ( P P I s )   gr a phs .  T hi s   a l lo w e d  f or   a   m or e   c om pl e t e   c om pr e he n s io n  of   th e   in f or m a ti on  hi dde n  in   a   la r ge   qua nt it y  of   th e s e   w r it te n  r e pr e s e nt a ti ons   f or   th e   c or r e s ponding  p a ti e nt s ’   r e vi e w s .  T he   pr in c ip le   be hi nd  th is   a ppr oa c h  is   to   us e   a   gr a ph  to   vi s ua li z e   th e   in te r a c ti ons ’   s tr uc tu r e ,  w it h  pa ti e nt s   pa r ti c ip a ti ng  a s   node s   a nd  in te r a c ti ons   a s   li nks .  B a s e d  on  th e   te xt   s im il a r it y  of   node s ,  li nks   a r e   c r e a te d. S e nt iW or dN e t  3.0 s e nt im e nt  l e xi c on i s  us e d t o c la s s if y  node s  ba s e d on the  pa ti e nt ’ s  a tt it ude  t ow a r d a   c e r ta in   dr ug,  w he th e r   it   be   pos it iv e   or   ne ga ti ve .  N e xt ,  a tt it ud e s   a r e   us e d   to   c la s s if y  th e   gr a ph  li nka ge s   a s   e it he r   in   f a vor   of   or   a ga in s t  dr ug  us e .  I f   th e   two  pa ti e nt s   ha v e   th e   s a m e   a tt it ude   th a t  is ,  a   n e ga ti ve   a tt it ude   r e ga r di ng  s e ve r e   s id e   e f f e c ts   or   a   pos it iv e   a tt it ude   r e ga r di ng  m ode r a te   s id e   e f f e c ts   th e   r e la ti ons hi p  is   de e m e d   s uppor ti ve ;  if   not ,  it   is   de e m e d   oppos in g. T he   c ons e qu e nt   gr a p hs   s how   dr ugs  a s   th e   s ubj e c t  of   a   di s a gr e e m e nt   be twe e n t w o oppos in g gr oups .  T he  P P I s  gr a ph e xt r a c ti on me th odol ogy is  i ll us tr a te d i n F ig ur e  1.           F ig ur e  1. P P I s  gr a ph e xt r a c ti on f r a m e w or k       A c c ut a ne   ( is ot r e ti noi n) ,  one   of   th e   dr ugs   f r om   our   D r ugL ib   pa ti e nt   r e vi e w s   da ta s e t,   i s   us e d  to   ge ne r a te  P P I s  gr a phs . T he  r e s ul ti ng gr a ph i s  pr e s e nt e d i n F ig ur e  2. F ig ur e  2 s how s  a  de s ig na te d node  f or  e a c h   pa ti e nt ,  la be le d  w it h  th e   pa ti e nt ’ s   a ge   ( th e   num be r   be twe e n  pa r e nt he s e s )   a nd  ge nde r   ( F :  f e m a le ,  M :  m a le ) .  F r om   th e   pa ti e nt ’ s   pe r s p e c ti ve   on   th e   dr ug  und e r   c ons id e r a t io n,  a   gr e e n   node   in di c a t e s   a   pa ti e nt   w it h  a   pos it iv e   a tt it ude   ( m ode r a te   s id e   e f f e c t)   a nd  a   r e d  node   in di c a te s   a   pa ti e nt   w it h a   ne ga ti ve   a tt it ude   ( s e ve r e   s id e   e f f e c t) .  W he n  two  li nke d  node s   r e pr e s e nt   two  pa ti e nt s ,  th e   th ic kne s s   of   th e   li nk  be twe e n  th e m   r e f le c ts   how   s im il a r   th e ir   s e m a nt ic   m a te r ia l  is .   T hi s   is   c a lc ul a te d   by  s um m in g  up  a ll   th e   phr a s e s   ( w or ds )   in   bot h   r e vi e w s   th a t  ha ve   non - z e r o  w e ig ht s   f or   te r m   f r e que nc y - in ve r s e   doc um e nt   f r e que nc y  ( TF - I D F )   a nd  a ppe a r   to   be   a bout   th e   s a m e   is s ue .  T he   li nks   w it h  gr e e n  c ol or s   in di c a te   pe opl e   w ho  e ndor s e   or   a r e   in   a ppr ova l,   w hi le   th e   li nks   w it h r e d c ol or s  i ndi c a te  t hos e  w ho a r e   a ga in s t.   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I nt  J  A r ti f   I nt e ll     I S S N :   2252 - 8938       E x pl or in g pati e nt - pat ie nt  i nt e r ac ti ons  gr aphs  b y  ne tw or k  analy s i s   ( Z ahe r  Sal ah )   1755         F ig ur e  2.  P P I s  gr a ph f o r  a c c ut a ne  dr ug ( is ot r e ti noi n)  pr oduc e d f r om  dr ugl ib .c om  pa ti e nt s  r e vi e w s       T he   a ut hor s   w il l  us e   th e   in f or m a ti on  m e nt io ne d  e a r li e r   to   de m ons tr a te   how   P P I s   gr a phs   c a n  be   us e d   to   f a c il it a te   va r io us   le ve l s   of   a na ly s is .  P P I s   gr a phs   c a n  b e   us e d,  in   m or e   de ta il ,  to   e x a m in e :  i)   if   pa ti e nt s   c ons is te nt ly   r e s pond e d  to   th os e  w ho  di d  f it   th e   s a m e   g e nde r   or   a ge   pr of il e   a nd  ii )   if   th e   P P I s   gr a ph  ( ne twor k)   “ c om m uni ty ”   r e f le c t  a   ge nd e r   or   a ge   pr of il e .  T he   c or e   obj e c ti v e   of   th e   r e s e a r c h  w or k  pr e s e nt e d  in   th is   pa pe r   is   to   id e nt if y  th e   s tr uc tu r a l   pr ope r ti e s   a nd  hi ghl ig ht   s om e   of   th e   f e a tu r e s   of   th e   gr a phs ,  s uc h  a s   how   pa ti e nt s   a r e   li ke ly   to   r a nk   th e  s id e  e f f e c ts   of   dr ugs ,   how   p a ti e nt s   in te r a c t   in   th e ir   r e vi e w s ,  a nd   w hi c h  p a ti e nt s  a r e   m or e   in f lu e nt ia l,   by  a ppl yi ng  ne twor k  a na ly s is   te c hni que s   to   th e   gr a phs   s e e   th e   e xa m pl e s   on  c om bi ni ng  s e nt im e nt   a na ly s is   a nd  ne twor ks   a n a ly s is   pr e s e nt e d  in   s tu di e s   [ 9] − [ 17] .  T o  th e   be s t  of   th e   a ut hor ’ s   knowle dge ,  no   e a r li e r   r e s e a r c h  ha s   m a de   a n  a tt e m pt   to   c ha r a c te r iz e   a nd  a na ly z e   pa ti e nt   r e vi e w s   in   th is   w a y   w it h  a   c onc e nt r a ti on  on  s id e   e f f e c ts   in   th e   c ont e xt   of   a   c e r ta in   dr ug.  T he   r e s e a r c h   de s c r ib e d  he r e   a im s   to   a na ly z e   th e   la te nt   gr a ph  s tr uc tu r e s   th a t  a r e   e xi s te nt   in   gr a phs   of   P P I s   in   r e la ti on  to   th e   in te r a c ti ons   be twe e n  th e   in di vi dua l   pa ti e nt s . I s  i t  pos s ib le  t o u s e  a ppl ic a bl e  t e c hni que s  f r om  t he  f ie ld  of  ne twor k a na ly s is  t o r e pr e s e nt  a nd a n a ly z e   P P I s   a s   gr a phs   ( c onc e pt ua li z e d  a s   ne twor ks ) ?   M or e   pr e c is e ly ,   w ha t  ne twor k  a na ly s is   m e tr ic s   a nd  m e th ods   s houl d be  a ppl ie d t o dr a w  a tt e nt io n t o t he  s tr uc tu r a l  c ha r a c t e r is ti c s  of  t he s e  ki nds  of  gr a phs ?   T he   a ut hor s   w il l  e xpl a in   a n  a ppr oa c h  f or   a na ly z in g   P P I s   gr a phs   us in g  n e twor k  m e tr ic s   a nd  c om m uni ty   de te c ti on  a lg or it hm s   in   th e   s e c ti on  th a t  f ol lo w s .  T hi s   a ppr oa c h  is   ba s e d  on   a   pi lo t   s tu dy.  T he   im por ta nc e   of   th is   r e s e a r c h  is   ba s e d  on  th e   f a c t  th a t   by  e xa m in in g  e xi s ti ng  pa tt e r ns   of   c onne c ti ons   a nd   in vol ve m e nt   be twe e n  th e   e xc h a ngi ng  node s   ( pa ti e nt s ) ,  ne tw or k  m e a s ur e m e nt s   a nd  c om m uni ty   de te c ti on   c om put a ti ona l  m e th ods  c a n be  u s e d t o a nt ic ip a te  out c om e s .     2.2.  P P I s  gr ap h  an al ys is   T hi s   s e c ti on  e xpl a in s   how   to   e f f e c ti ve ly   m a ke   us e   of   ( P P I s )   gr a phs   f or   s uppor ti ng  d if f e r e nt   ty pe s   of   a na ly s is ,   a s   th e y  a r e   c ons tr uc te d   us in g  th e   ( P P I s )   gr a ph  e xt r a c ti on  f r a m e w or k.  P P I s   gr a phs   c a n  be   us e d   in   pa r ti c ul a r  t o:  i )  i nve s ti ga te  w he th e r  pa ti e nt s  c ons is te nt ly  r e s pon de d t o ot he r  pa ti e nt s  w ho ha d a  s im il a r  ge nde r   or   a ge   pr of il e ;  a nd  ii )   in ve s ti ga te   w h e th e r   th e   ge nd e r   or   a ge   pr o f il e   of   th e   “ c om m uni ty ”   in s id e   th e   P P I s   gr a ph  ( ne twor k)   is   in di c a te d.  T he   f ir s t,   it   f oc us e s   on  ( P P I s )   gr a phs   a nd  di s c u s s e s   th e   na tu r e   of   th e   a r gum e nt s   be twe e n  th e   two  pa r ti e s   a bout   a n  a s s o c ia te d  dr ug.  T he   s e c ond  de a ls   w it h  r e c ogni ti on  of   c om m uni ti e s   w it hi n   ( P P I s )   gr a phs   a nd  th e   pos s ib le   in te r pr e ta ti ons   of   th e s e   c om m uni ti e s ’   c ha r a c te r is ti c s .  S in c e   th e   th e or y  of   ne twor k  a na ly s is   i s   th e   f ounda ti on  of   bot h  ty pe s   of   in ve s ti ga ti ons   [ 18] ,  ( P P I s )   gr a phs   c a n  be   in te r pr e te d  a s   ne twor ks .  C lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   c on c e pt   is   r e c om m e nde d  f or   th e   f ir s t  ty pe   of   a na ly s is   ( a s s or ta ti vi ty   c a n  a ls o   be  us e d [ 18] ) . D if f e r e nt  ne twor k  c om m uni ty  de te c ti on c om put a ti ona l  m e th ods  c a n be  s uc c e s s f ul ly  a ppl ie d f or   th e  s e c ond type  of  a na ly s is , a s  w il l  be  c ove r e d i n m or e  de ta il  l a t e r  i n t hi s  s e c ti on. W it h r e s pe c t  to  t he  i nt e nde d  ( P P I s )   gr a ph,  th e   f ol lo w in g  e xe m pl a r   que s ti ons   w e r e   ta k e n  i nt o  c ons id e r a ti on  in   or de r   to   de m ons tr a te   th e   us e f ul ne s s  of  t he  gr a ph i n t he  c ont e xt  of  t he  t w o t ype s  of  a na ly s is  m e nt io ne d i n s e c ti on 2.3:   Q 1:  A r e  pa ti e nt s  c ons i s te nt ly  r e s ponding t o pa ti e nt s  be lo ngi ng t o a  s im il a r  ge nde r  a nd/ or  a ge  pr of il e ?   Q 2:  A r e  c om m uni ti e s  f ound in t he  ( P P I s )  ne twor k a bl e  t o i de nt i f y, a t  le a s t  r oughly, a  pa ti e nt ’ s  a ge  or  ge nde r ?     T he  vi s ua l i z a t i on w a s  pr oduc e d u s i ng G e phi  a t  ht t ps : / / ge phi .or g/   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I S S N :   2252 - 8938   I nt  J  A r ti f   I nt e ll , V ol .  14 , N o.  3 ,   J une   20 25 :  1752 - 1762   1756   2. 3 .  T h e  ac c u t an e  ( is ot r e t in oi n )  n e t w or k   W it h  35  node s   r e pr e s e nt in g   e a c h   pa ti e nt   w ho   pa r ti c ip a te d  i n  th e   dr ug  r e vi e w in g  a nd  86  e dge s   r e pr e s e nt in g  pa ti e nt   in te r a c ti ons ,  th e   a c c ut a ne   dr ug ’ s   ( P P I s )   ne twor k  ( undi r e c te d  gr a ph)   w a s   c ons tr uc te d.  F ig ur e   3  s how s   th e   ne twor k ’ s   de gr e e   di s tr ib ut io n,  w hi le   T a bl e   1  pr ovi de s   in f or m a ti on  on  th e   a c c ut a ne   ( is ot r e ti noi n)   node s .  H ig hl y  c onne c te d  node s   a r e   f e w e r   in   nu m be r   th a n  poor ly   c onne c te d   node s ,  a s   is   to   be   e xpe c te d.  F r om   a   ne twor k  a na ly s is   pe r s pe c ti ve ,  it   m a ke s   s e ns e   to   in ve s ti ga t e   if   a   ne twor k ’ s   de gr e e   di s tr ib ut io n  f it s   a   pow e r - la w   di s tr ib ut io n.  T he   a c c ut a ne   ne tw or k ’ s   de gr e e   di s tr ib ut io n  is   r ig ht - s ke w e d  a nd  r oughly  f ol lo w s   a   pow e r - la w   di s tr ib ut io n,  a s   s how n   by  th e   h is to gr a m   of   de gr e e   di s tr ib ut io ns   in   F ig ur e   3.  S c a le - f r e e  ne twor ks  a r e  de f in e d a s  ne twor k s  ha vi ng de gr e e  di s t r ib ut io ns  t ha t  f ol lo w  a  pow e r  l a w  [ 18] .   A   s ubs e t  of   node s   f r om   a   gr a ph  c onn e c te d  by   a   p a th   is   r e f e r r e d t o  a s   a   w e a kl y   c onne c t e d  c om pone nt   in   gr a ph  th e or y  te r m in ol ogy.  T he r e f or e ,  th e   pr oc e s s   m us t  lo c a te   e ve r y  w e e kl y  c onne c t e d  c om pone nt   of   th e   ne twor k  in   or de r   to   obt a in   th e   li s t  of   node s   th a t   a r e   p a r t  of   th e   s a m e   c lu s te r   or   gr oup  of   ove r la ppi ng  c lu s te r s .  T hi s   pr oc e s s   i s   c a r r ie d  out   a s   a   de pt h - f ir s t  s e a r c h,  w hi c h  in ve s ti ga te s   a   gr a ph  in   it s   e nt ir e   f or m ,  di ggi ng  a s   f a r   a s   pos s ib le   in to   e a c h  of   it s   br a nc he s   be f or e   ba c kt r a c ki ng.  W it h  V   r e pr e s e nt in g  th e   num be r   of   ve r ti c e s   or   node s  a nd  E   r e pr e s e nt in g t he  numbe r  of  e dge s  i n t he  gr a ph, i ts  t im e  c om pl e xi ty  i s   O  ( ∣ V ∣ + ∣ E ∣ ) . T he  node s   a nd  e dge s   f or   e a c h  w e a kl y  c onne c te d   c om pone nt   a r e   a c qui r e d   by  vi s it in g  e ve r y   ve r te x  in   th e   gr a ph  [ 19] .  R e c ons tr uc te d  c lu s te r s   c ons i s t  onl y  of   c onne c te d  c om pone nt s   th a t  ha ve   m or e   th a n  one   node .  A   c onne c te d  c om pone nt   in   s ta ti c   gr a ph s   is   th e   l a r ge s t  po s s ib le   s e t   of   ve r ti c e s   c onne c te d  by   gr a ph  e dg e s .   I n  s im pl e r   te r m s ,   if   th e r e   is   a   pa th   in   th e   g r a ph  c onne c ti ng  two  ve r ti c e s ,  u  a nd  v,  in   th e   c om pone nt ,  th e n  it   e xi s ts .  S tr ongl y   a nd   w e a kl y  li nke d c om pone nt s  c a n  be   us e d  to   e xp a nd  th e   c onc e pt   o f   di r e c te d  gr a phs   in   two  di f f e r e nt   w a y s :  e it he r   th e r e  i s  a  di r e c te d pa th  f r om  u t o v a nd one  f r om  v t o u, or  onl y  one  of  t hos e  pa th s  e xi s ts  [ 20] .           F ig ur e  3. T he  a c c ut a ne   ( is ot r e ti noi n)  gr a ph a ve r a ge  w e ig ht e d d e gr e e :  1.691       T a bl e  1.  T he  a c c ut a ne  ( is ot r e ti noi n)  node s  i nf or m a ti on   G r a ph  e l e m e nt s   S t a t i s t i c a l   s um m a r y   N ode s   35   E dge s   86   A ve r a ge   de gr e e   4.914   A ve r a ge   w e i ght e d de gr e e   1.691   N e t w or k  di a m e t e r   4   G r a ph  de ns i t y   0.145   m odul a r i t y   0.638   A ve r a ge   c l us t e r i ng c oe f f i c i e nt   0.867   A ve r a ge   pa t h l e ngt h   1.398   ◼   M ode r a t e   s i de - e f f e c t s   84.88%   ◼   S e ve r e   s i de - e f f e c t s   15.12%   C onne c t e d  c om pone nt s   6   C om pne nt - 1   34.29%   C om pne nt - 2   25.71%   C om pne nt - 3   20%   C om pne nt - 4   8.57%   C om pne nt - 5   5.71%   C om pne nt - 6   5.71%   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I nt  J  A r ti f   I nt e ll     I S S N :   2252 - 8938       E x pl or in g pati e nt - pat ie nt  i nt e r ac ti ons  gr aphs  b y  ne tw or k  analy s i s   ( Z ahe r  Sal ah )   1757   2. 4 .  A n al ys is  of  ac c u t an e  n e t w or k   I n  th is   r e s e a r c h,   P P I s   gr a phs   a r e   e xa m in e d  u s in g  two  f or m s   of  ne twor k  a na ly s is .   T o a ns w e r   r e s e a r c h   que s ti on  Q 1,  th e   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   is   f i r s t  us e d.  S e c ond,  be twe e nne s s   c e nt r a li ty   is   us e d  f or   c om m uni ty   s tr uc tu r e s  de te c ti on f or  a ns w e r in g r e s e a r c h que s ti on Q 2.     2. 4 .1. C lu s t e r in g c oe f f ic ie n t   A   m e a s ur e   of   how   m u c h  node s   in   a   gr a ph   te nd  to   c lu s te r   to g e th e r   is   c a ll e d  a   c lu s t e r in g  c oe f f ic ie nt   in   th e  c ont e xt  of  gr a ph  t he or y. I t  m e a s ur e s  t he  de gr e e  of  c ohe s io n  in  a  node ’ s  ne ig hbor hood withi n  a  ne twor k.  I t   is   c la s s if ie d  in to   two  c a te gor ie s :  lo c a l  va lu e s ,  w hi c h  qu a nt if y  th e   c ohe s io n s ur r ounding  a   pa r ti c ul a r   node ,  a nd   gl oba l  va lu e s ,   w hi c h  qu a nt if y  th e   c lu s t e r s   w it hi n  th e   ne twor k  a s   a   w hol e .  I t  s houl d  be   unde r li ne d  th a t  onl y   s in gl e - e dge  gr a phs  c a n u s e  bot h of  t he  c lu s te r in g c oe f f ic ie nt ’ s  f or m ul a ti ons . A ddi ti ona ll y, m a ny e dge s  a r e  not   ta ke n i nt o c ons id e r a ti on i n t he  m a jo r it y  of   m e a s ur e m e nt s  i n r e a l - w or ld  ne twor ks . T he y only t a ke  i nt o a c c ount   ba s ic   gr a phs   f r e e   of   lo ops   a nd  m ul ti pl e   e dge s   a s   a   r e s ul t.   F or   w e ig ht e d  gr a phs ,  th e   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   c a n   a ls o be  de r iv e d [ 21] − [ 23] . T he  r a ti o of  e dge s  ne ig hbor in g node s  t o a ll  pot e nt ia l  e dge s  be twe e n t he m  i s  known   a s   th e   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt .  A n  a v e r a ge   m e a s ur e m e nt   of   node   c lu s te r in g  in   a   ne twor k  is   gi ve n  by   th e   gl oba l   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt .  S tr onge r   node   te nde nc y   to   f or m   de ns e ly   c onne c te d   c lu s te r s   is   in di c a te d   by  hi ghe r   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt s .  P r io r   s tu di e s   ha ve   de m on s tr a te d  th a t  ne twor ks   w it h  r a ndom  a nd  s c a le - f r e e   c ha r a c te r is ti c s   ty pi c a ll y  ha ve   poor   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt s .  O n  t he   ot he r   ha nd,  ne twor ks   w it h   la r ge r   c lu s te r in g   c oe f f ic ie nt s  ha ve  pr ove n t o e xhi bi t  a  hi ghe r  l e ve l  of  c or r e la ti on [ 24] .   T he   pr oba bi li ty   th a t  a ny  two  r a ndoml y  s e le c te d  ne ig hbor s   of   a   ve r te x  v ,  of   de gr e e   a t  le a s t  2,  a r e   li nke d  to ge th e r   is   known   a s   th e   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   o f   v .  I f   d( v )   r e pr e s e nt s   th e   num be r   of   ne ig hbor s   of   v ,  th e n  th e   c a lc ul a ti on  is   ( ( ) 2 ) = num be r   of   tr ia ngl e s   c ont a in in g  v   di vi de d  by  num be r   of   pot e nt ia l  e dge s   be twe e n  it s   ne ig hbor s .  T he   a v e r a ge   of   th is   va lu e   f or   a ll   ve r ti c e s   of   de gr e e   a t  le a s t  2  in   th e   gr a ph  m a y  th e n  be   us e d  to   de f in e   th e   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   of   th e   e nt i r e   gr a ph  [ 2 5] .  F ig ur e   4   s how s   th e   a c c ut a ne   ( is ot r e ti noi n )  gr a ph  c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   m e tr ic   r e por t   ( c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   di s tr ib ut io n) :  pa r a m e te r s :  ne twor k   in te r pr e ta ti on:   undi r e c te d,  r e s ul ts :a ve r a ge   c lu s t e r in g  c oe f f ic ie nt :  0.867,  to ta l  tr ia ngl e s :  130,  th e   a ve r a ge   c lu s te r in g c oe f f ic ie nt  i s  t he  m e a n va lu e  of  i ndi vi dua l  c oe f f ic ie n ts .           F ig ur e  4.  T he   a c c ut a ne   ( is ot r e ti noi n )  gr a ph  c lu s te r in g c oe f f ic ie nt  m e tr ic  r e por t       2. 4 .2. C om m u n it y s t r u c t u r e s  d e t e c t io n   I n  s oc ia l  ne twor k  a na ly s is ,  th e   be twe e nne s s   c e nt r a li ty   in de x  is   c r uc ia l,   a lt hough  it   is   e xpe ns iv e   to   c a lc ul a te .  T he   le a s t  ti m e - c ons um in g  m e th ods   a va il a bl e   now   ta ke   O ( n 2 )   s pa c e   a nd  O ( n 3 )   ti m e ,  w he r e   n   is   th e   num be r   of   node s   in   th e   ne twor k.  T he   in c r e a s in g  de m a nd  f or   c e nt r a li ty   m e a s ur e s   on  s pa r s e ,  la r ge - s c a le   ne twor ks   ha s   le d  to   th e   in tr oduc ti on  of   ne w   be twe e nne s s   a lg o r it hm s   in   [ 26] .  F or   unw e ig ht e d  a nd  w e ig ht e d   ne twor ks ,  r e s pe c ti ve ly ,  th e y  ta ke   up  O ( n+m )   s pa c e   a nd  e xe c ut e   in   O ( nm )   a nd   O ( nm +n 2   lo g   n)   ti m e   c om pl e xi ty ,  w he r e   m   is   th e   num b e r   of   li nks .  T hi s   s ig ni f ic a nt ly   br oa de ns   th e   va r ie ty   of   ne twor ks   f or   w hi c h   c e nt r a li ty   a na ly s is   is   pr a c ti c a l,   a s   de m ons tr a te d  by  e xp e r im e nt a l  da ta .  C e nt r a li ty   in di c e s   f or m e d  on  gr a ph  ve r ti c e s   a r e   a   c r uc ia l  to ol   f or   s oc ia l  n e twor k  a na ly s i s .  T h e y  a r e  i nt e nde d  to   r e pr e s e nt   th e   im por ta nc e   of   node s   ta ngl e d  in   a   s oc ia l  s tr uc tu r e   a nd  a r e   us e d   to   r a nk  th e   node s   b a s e d  on  w he r e   th e y  a r e   in   th e   ne twor k.  V a r io us   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I S S N :   2252 - 8938   I nt  J  A r ti f   I nt e ll , V ol .  14 , N o.  3 ,   J une   20 25 :  1752 - 1762   1758   c e nt r a li ty   in di c e s ,  s uc h  a s   th os e   th a t  m e a s ur e   a   node ’ s   a ve r a ge   di s ta nc e   f r om   ot he r   node s   or   th e   r a ti o  o f   s hor te s t  pa th s  t ha t  a  nod e  l ie s  on, a r e  b a s e d on the   s hor te s t  pa th s  t ha t  li nk pa ir s  of  node s .    A n a s s e s s m e nt  of  t he s e  i ndi c e s  i s  a  f unda m e nt a l  c om pone nt  of  m a ny ne twor k - a na ly ti c  r e s e a r c h [ 26] .   A   ne twor k  node ’ s   im por ta nc e   is   m e a s ur e d   by  be twe e nne s s   c e nt r a li ty   [ 24] ,  [ 27] ,  w hi c h  is   ba s e d   on  s hor te s t  pa th s   a nd  r e f le c ts   node s ’   c ont r ib ut io ns   to   s tr uc tu r a l  s ta bi li ty ,  s oc ia l  in f lu e nc e ,  a nd  in f or m a ti on  di f f us io n.   be twe e nne s s   c e nt r a li ty   is   f r e que nt ly   us e d  a c r os s   va r io us   dom a i ns ,  in c lu di ng  in f lu e nc e  e va lu a ti on,  c om m uni ty   di s c ove r y,  a nd  s oc ia l   ne twor k  a na ly s is .  T he   B r a nde ’ s   a lg or it hm   [ 26]   is   th e   m os t   e f f e c ti ve   a lg or it hm   f or   c a lc ul a ti ng  be twe e nn e s s   c e nt r a li ty   qui c kl y.  I t  is   ba s e d  on  th e   obs e r va ti on  th a t  th e   b e twe e nne s s   c e nt r a li ty   va lu e   of   a   node   v   is   e qua l  to   th e   to ta l  of   a ll   th e   f r a c ti ons   of   s ho r te s t  pa th s   f r om   ot he r   node   pa ir s   ( s t)   th a t  pa s s   th r ough  node   v .  U s in g  th is   f or m ul a   a s   a   s ta r ti ng  poi nt ,  th e   B r a nde ’ s   a lg or it hm   di s c ove r s   th e   s hor te s t  pa th s   be twe e n  e a c h  node   v  a nd  e ve r y  ot he r   node ,  doc um e nt in g  th e   f r e que nc y  a nd  num be r   of   e a c h  nod e   a lo ng  th e   s hor te s t  pa th s .  T h e   be twe e nn e s s  c e nt r a li ty   va lu e s   of   e a c h  node ,   s ta r ti ng  w it h  th e   le a f   node s   a nd  e ndi ng  a t  th e   r oot   node ,  a r e   th e n   s um m e d   up  b a s e d   on  th e   in f or m a ti on  ga th e r e d.  W he n   c a lc ul a ti ng   th e   b e twe e nne s s   c e nt r a li ty   of   e ve r y   node   in   a n   unw e ig ht e d  gr a ph,  th e   B r a nde ’ s   a lg or it hm   ne e ds   O ( nm )   ti m e   c om pl e xi ty ,   w he r e   n   is   th e   num be r   of   node s   in   th e   ne twor k  a nd  m   is   th e   num be r   of   e dge s .   T he   B r a nde ’ s   a lg or it hm   ope r a te s   w it h  a n   O ( nm +n 2 lo gn)   ti m e   c om pl e xi ty   f or   w e ig ht e d   gr a phs .  L a r ge - s c a le   n e twor ks   s ti ll   f in d  th e s e   ti m e   c om pl e xi ty   to   be   pr ohi bi ti ve ,  c ons e que nt ly   a   r e li a bl e   a nd  e f f e c ti ve   be twe e nn e s s   c e nt r a li ty   a ppr oxi m a ti on a lg or it hm   is  ne c e s s a r y. L e t G =( V ,E )   be  a  gr a ph.   G   c a n be  e it he r  di r e c te d or  undir e c te d, a nd t he   e dge   w e ig ht s   m us t  be   non - ne ga ti ve .  n =| V |,   m =| E |  a nd  th e   num be r   of   s hor te s t  pa th s   f r om   node   s   to   node   t   is   r e pr e s e nt e d  by  σ st ,  w hi le   th e   num be r   of   s hor te s t  pa th s   th a t  pa s s   vi a   node   v   is   r e pr e s e nt e d  by  σ st ( v ) .  T he   be twe e nne s s  c e nt r a li ty   or  B C   va lu e  of  a  node   v ∈ V   in  a  gr a ph  G =( V , E )  a s  s how n i n ( 1) :      ( ) = ∑  ( )  ≠ ≠ , ∈   (1 )     B a s e d on the   B r a nde ’ s  a lg or it hm ’ s  pa ir  de pe nde nc y, w e  c a n de r iv e   a s  s how n i n ( 2) :      ( ) =  ( )       ∗ ( ) =   ∑  ( ) ≠ ∈ = ∑   ∈ ( ) ∙ ( 1 + ∗ ( ) )   ( 2)     W he r e   th e   s e t  of   a ll   a nt e c e de nt s   of   node   w   is   de not e d  by  r s ( w ) ,  w e   m a y  r e c a lc ul a te   th e   ne w   be tw e e nne s s   c e nt r a li ty  f or m ul a  us in g  ( 1 )   a nd  ( 2 )   a s   s how n   in  ( 3) :      ( ) = ∑ ∗ ( ) ≠ ∈   ( 3)       3.   R E S U L T S  A N D  D I S C U S S I O N   T h e   d e t a il e d  s um m a r y  of   th e   n um e r i c a l  r e s u lt s   of   ne t w or k  a n a ly s is   pr o c e s s e s   c ond uc te d  on  th e   a c c u ta ne   dr ug ’ s   P P I s   n e tw or k   a r e   pr e s e nt e d   in   T a bl e   2.   T h is   P P I s   ne tw or k   c ont a i ne d  35   n od e s   r e pr e s e nt i ng   th e   pa t ie nt s   w h o   p a r ti c i pa te d  in   th e   dr ug   r e vi e w in g  a n d  86   e dg e s   r e pr e s e n ti n g   p a ti e n t  in t e r a c ti o ns   or   s e m a n ti c   r e l a ti on s h ip s   be tw e e n  r e vi e w s   m a de   b y  th o s e   pa ti e nt s .  N od e   a t tr ib u te s   in c l ud e   no de - I D ,   g e n de r   a nd   a g e .   W e   m a y   ga i n   d e e pe r   in s i ght   a b out   t he   ne two r k ’ s   b e h a vi or   a nd   s tr uc t ur e   by   e x a m i ni n g  th e   r e c o r d e d   f i ndi ng s   of   s e v e r a l  im p or t a nt   m e tr ic s   t ha t  w e r e   pr ovi d e d.   E a c h no de   ( pa t ie nt )   i n t h e   P P I s  ne tw or k   w a s   r e pr e s e n te d by  a   r ow   in   th e   t a b le .  L a be l  pr o vi d e d  a ddi t io na l  in f or m a ti on  a bo ut   e a c h  nod e ,  i n c lu di n g  it s   u ni qu e   id e n ti f i e r   ( n od e - I D ) ,   a g e  a nd g e n d e r  ( f or   e x a m pl e , F ( 2 3)  i ndi c a te s   a  f e m a le   no de   a g e d  23,  a n d M ( 21)   in d ic a t e s  a  m a l e  n od e  a g e d 2 1) ,   de g r e e   ( n um b e r   of   c o nn e c ti o n s ) ,   w e i ght e d   de gr e e   ( s tr e n gt h   of   c onn e c ti o n s ) ,   b e t w e e nn e s s   c e nt r a li ty   ( a   m e a s ur e   of   n od e   in f l u e n c e   o ve r   i nf or m a t io n   f l ow ) ,  a n d  c l us te r in g  c o e f f ic i e n t  ( a   m e a s ur e   of   n e ig hb or ho od   n e t w or k  de n s it y) .  I n a d di t io n ,  t he  c o m po ne nt  num be r   ( id e nt if y in g t h e   c on ne c t e d s u bn e t w or k t o w hi c h t h e   n od e   b e lo ng s )   a nd  t he  nu m b e r   of  t r ia ngl e s  ( gr o up s   of   th r e e  c on ne c t e d  no de s )  w e r e  pr ovi de d  by  th e  t a b le .    T he   num be r   of   di r e c t  c onne c ti ons ,  or   e dge s ,  th a t  a   node   h a s   w it h  ot he r   node s   is   c ount e d  by  th e   de gr e e   m e tr ic .  H ig he r   d e gr e e   nod e s   in te r a c t  w it h  ot he r   nod e s   in   th e   ne twor k  m or e   f r e que nt ly .  F ig ur e   5  s ho w s   th e   a c c ut a ne   ( is ot r e ti noi n )  gr a ph  di s ta nc e   r e por t  ( be twe e nne s s   c e nt r a li ty   di s tr ib ut io n ) .  W it h   a   to ta l  de gr e e   of   172  a nd  a n  a ve r a ge   de gr e e   of   4.914  f or   a ll   node s ,  e a c h  node   h a s   r oughly  5  c onne c ti on s   on  a ve r a ge .  W it h  a n  a ve r a ge   of   1.691  a nd  a   to ta l  w e ig ht e d  de gr e e   of   59.192,  it   a ppe a r s   th a t  th e   s tr e ngt h  of   th e   li nks   va r ie s .  T he   two  node s   w it h  th e   hi ghe s t  de gr e e   in   th e   ta bl e ,  node s   1  a nd   3  F ( 23)   a nd   F ( 28) ,   ha ve   10  di r e c t  c onne c ti ons   in   th e  ne twor k, i ndi c a ti ng t ha t  th e y  a r e  a t  th e  c e nt e r  o f  t he  ne twor k a nd i nt e r a c t  w it h 10  ot he r  node s . I n  c ont r a s t,   N ode s   17  ( F ( 24) )   a nd  a   f e w   ot he r s   ha ve   onl y   1  de gr e e ,  in d i c a ti ng  m in im a l  in te r a c ti on.  W e ig ht e d  d e g r e e   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I nt  J  A r ti f   I nt e ll     I S S N :   2252 - 8938       E x pl or in g pati e nt - pat ie nt  i nt e r ac ti ons  gr aphs  b y  ne tw or k  analy s i s   ( Z ahe r  Sal ah )   1759   e nha nc e s   th e   de gr e e   m e a s ur e   by  in c or por a ti ng  e a c h  c onn e c ti o n ’ s   w e ig ht   or   s tr e ngt h  in s te a d  of   b a s ic a ll y  it s   c ount .  W e ig ht s   c a n  b e   us e d  to   r e f le c t  a   c onne c ti on ’ s   im por ta nc e ,  f r e que nc y,  or   in te ns it y.  F or   in s ta nc e ,     node  10 ( F ( 34 ) )  ha s  t he  l a r ge s t  w e ig ht e d de gr e e  of  3.65  i ndi c a ti ng t ha t  th e r e  a r e  a  l ot  of  c onne c ti ons , but  t he y   a r e   a ls o  s tr onge r   th a n  th os e   of   ot he r   node s .  A lt hough   ha vi ng  a   r a w   de gr e e   of   10,   node   1  ( F ( 23) )   ha s   a   w e ig ht e d de gr e e  of  3.49, indi c a ti ng t ha t  it s  c onne c ti on s  a r e  not   a ll  t ha t  s tr ong.        T a bl e  2.  T he   a c c ut a ne  ( is ot r e ti noi n )  s um m a r y of  t he  nume r ic a l  r e s ul ts   N ode - ID   L a be l   D e gr e e   W e i ght e d  de gr e e   B e t w e e ne s s   c e nt r a l i t y   C om pone nt   num be r   C l us t e r i ng  c oe f f i c i e nt   T r i a ngl e s   1   F ( 23)   10   3.49   3.61   1   0.76   34   2   F ( 30)   6   1.51   0.00   1   1.00   15   3   F ( 28)   10   3.12   6.46   1   0.69   31   4   F ( 53)   3   1.13   0.00   2   1.00   3   5   M ( 21)   8   2.69   0.42   1   0.93   26   6   M ( 36)   5   2.08   0.00   3   1.00   10   7   F ( 43)   3   1.13   0.00   2   1.00   3   8   F ( 38)   6   1.56   1.00   3   0.80   12   9   F ( 38)   3   1.45   0.00   2   1.00   3   10   F ( 34)   9   3.65   1.10   1   0.86   31   11   F ( 29)   5   1.31   0.76   1   0.80   8   12   M ( 30)   2   0.83   0.00   4   1.00   1   13   F ( 36)   5   2.03   0.00   3   1.00   10   14   F ( 37)   9   3.25   1.10   1   0.86   31   15   M ( 18)   4   1.63   1.67   2   0.83   5   16   F ( 15)   8   1.91   3.28   1   0.71   20   17   F ( 24)   1   0.15   0.00   2   0.00   0   18   F ( 37)   1   0.16   0.00   5   0.00   0   19   M ( 21)   4   1.54   7.00   2   0.50   3   20   M ( 15)   6   1.23   16.00   2   0.40   6   21   F ( 32)   9   3.24   1.75   1   0.81   29   22   F ( 37)   1   0.16   0.00   5   0.00   0   23   F ( 21)   6   2.05   1.00   3   0.80   12   24   F ( 25)   3   0.91   0.00   3   1.00   3   26   F ( 37)   2   0.90   0.00   4   1.00   1   27   F ( 29)   5   1.84   0.00   3   1.00   10   28   M ( 30)   2   0.61   0.00   4   1.00   1   29   M ( 22)   4   1.47   1.67   2   0.83   5   30   M ( 31)   8   2.62   0.42   1   0.93   26   31   F ( 15)   4   1.56   1.67   2   0.83   5   33   F ( 19)   3   0.82   0.00   1   1.00   3   34   F ( 23)   1   0.71   0.00   6   0.00   0   35   F ( 24)   1   0.71   0.00   6   0.00   0   36   F ( 25)   9   3.65   1.10   1   0.86   31   37   F ( 30)   6   2.06   1.00   3   0.80   12     T ot a l   172   59.192   51.000       26.005   390     A ve r a ge   4.914   1.691   1.457       0.743   11.143           F ig ur e  5. T he  a c c ut a ne   gr a ph di s ta nc e  r e por t  ( be twe e nn e s s   c e nt r a li ty  di s tr ib ut io n) :  pa r a m e te r s :  ne twor k  in te r pr e ta ti on:  undir e c te d, r e s ul ts :  di a m e te r :  4, r a di us :  1, a ve r a g e  pa th  l e ngt h:  1.3984375   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I S S N :   2252 - 8938   I nt  J  A r ti f   I nt e ll , V ol .  14 , N o.  3 ,   J une   20 25 :  1752 - 1762   1760   T he   ne twor k  ha s   a   to ta l  de gr e e   of   172  a nd  a   to ta l  w e ig ht e d  de gr e e   of   59.192.  T hi s   im pl ie s   th e   to ta l   c onne c ti on s tr e ngt h f or  a ll  o f  t he  node s . W it h a n a ve r a ge  de gr e e  of  4.914, e ve r y node  i n  t he  ne twor k i n te r a c ts   w it h r oughly f iv e  ot he r  node s  on a ve r a ge . T he  c lu s te r s  or  s ub - ne twor ks  t o w hi c h t he  node s  be lo ng, or  pa r ts  of   th e  l a r ge r  ne twor k, a r e  r e f e r r e d t o by  th e ir  c om pone nt  numbe r s .  C onne c ti vi ty  e xi s ts  be twe e n node s  w it hi n t he   s a m e   c om pone nt ,  but   di s c onne c ti vi ty   oc c ur s   be tw e e n  node s   lo c a te d  in   s e p a r a te   c om pone nt s .   I t  is   e vi de nt   th a t  th e   ne twor k  is   not   e nt ir e ly   c onne c te d  be c a us e   it   c ons is t s   of   m ul ti pl e   di s c onne c te d  c om pone nt s   ( num be r e d  f r om   1  th r ough  6) .  A lt hough  th e r e   a r e   is ol a te d  node s   ( li ke   node   17  w it h  c om pone nt   num be r   2) ,  th e r e   a r e   a ls o   la r ge  c om pone nt s  l ik e  2 a nd 3. F or  i ns ta nc e , node  1 a nd a ddi ti o na l  node s  l ik e  node  2 a r e  pa r t  of  c om pone nt  1,  in di c a ti ng  th a t  to ge th e r   th e y  c on s ti tu te   a   c ohe r e nt   s ubne twor k.  N ode   12  is   a   m e m be r   of   c om pone nt   4,  w hi c h   m e a ns   it   is   a   s e pa r a te   is ol a te d  c lu s te r .  T r ia ngl e s ,   w hi c h  a r e   c o m pos e d  of   th r e e   c onne c te d  node s ,  r e pr e s e nt   th e   num be r   of   tr ia ngl e   r e la ti ons hi ps   th a t  a   node   is   a   m e m be r   of .  S tr ong  c om m uni ty   s tr uc tu r e   is   in di c a te d  by  hi gh   tr ia ngl e   num be r s .  N ode   1   is   in vol ve d  in   34  tr ia ngl e s ,  in di c a ti ng  a   hi gh  num be r   of   th r e e - w a y   in te r a c ti ons .   N ode s   17  a nd  a   f e w   ot he r   node s ,  on   th e   ot he r   h a nd,  do  not   f or m   a ny  tr ia ngl e s ,  hi ghl ig ht in g  th e ir   i s ol a ti on  or   la c k  of   c om m uni ty   in te r a c ti on.  T he r e   a r e   390  tr ia ngl e s   in   to ta l,   a nd  e a c h  node   ha s   a n  a ve r a ge   of     11.143  tr ia ngl e s ,  in di c a ti ng  th a t  node s   ty pi c a ll y  be lo ng  to   s m a ll   c onne c te d  gr oupi ngs   th a t  r e pr e s e nt   c om m uni ty - li ke  i nt e r a c ti on.   B e twe e nne s s   c e nt r a li ty   qua nt if ie s   a   node ’ s   im por ta nc e   f or   e s t a bl is hi ng  in te r a c ti ons   by  c a lc ul a ti ng  how   f a r   it   is   a lo ng  th e   s hor te s t  pa th s   c onne c ti ng  ot he r   node s .  A   hi gh  be twe e nne s s   c e nt r a li ty   va lu e   in di c a te s   th a t  th e   node   s e r ve s   a s   a   ne twor k  br id ge   w it hi n  th e   ne twor k.  T he   a ve r a ge   be twe e nne s s   c e nt r a li ty   is   1.457,  m e a ni ng  th a t  node s   ha ve   a   m ode r a te   im pa c t  on  e s ta bl is hi ng   c onne c ti ons   be twe e n  ot he r   node s .  T he   to ta l  be twe e nne s s   c e nt r a li ty   is   51.   A s   a n  il lu s tr a ti on,  nod e   3  ( F ( 28) )   ha s   a   c on s id e r a bl e   b e twe e nne s s   c e nt r a li ty   of   6.46,  r e f le c ti ng  it s   s ig ni f ic a nc e   in   c onne c ti ng  to ge th e r   th e   ne t w or k’ s   e ls e w he r e   s e pa r a te d  s e c ti ons .  W it h  a   be twe e nne s s   c e nt r a li ty   of   16.00,  node   20  ( M ( 15) )   ha s   th e   hi ghe s t  be twe e nne s s   a nd  i s   th e r e f or e   ve r y  im por ta nt   to   th e   in f o r m a ti on  f lo w   a c r os s   th e   ne twor k’ s   c om m uni c a ti on  s tr uc tu r e .  O n  th e   o th e r   ha nd,  a   la r ge   num be r   of   node s   ha ve   a   be twe e nne s s   c e nt r a li ty   of   0,  in di c a ti n g  th a t  th e y  a r e   not   c e nt r a l  or   a c t  a s   out s id e r s .  T he   c lu s t e r in g  c oe f f ic ie nt   in di c a te s   th e   de gr e e   of   lo c a l  c ohe s i ve ne s s   or   c li qui s hne s s   ( pr oduc in g  a   c om pl e te   c li que )   by  c a lc ul a ti ng   th e   de gr e e   to   w hi c h   a   nod e ’ s   ne ig hbo r s   a r e   c onn e c te d  to   one   a not h e r .  A   c oh e s iv e   c om m uni ty   is   in di c a te d  by  a   hi gh  c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   va lu e .  A   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   of   0.00  ( a s   s e e n  in   node   17)   in di c a te s   th a t  th e   node ’ s   n e ig hbor s   do  not   f or m   a ny  t r ia ngl e s ,  w hi le   a   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   of   1.00  ( a s   in   node   2)   im pl ie s   th a t   a ll   lo c a l  ne ig hbor s   a r e   f ul ly   c onne c te d  a nd  c ont r ib ut in g   to   a   t ig ht ly   bound   ( hi ghl y   c onne c te d)   c lu s te r .  T he   n e twor k’ s   a ve r a ge   c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt   of   0.743  in di c a te s   th a t  node s   a r e   f a ir ly   c lu s te r e d w it h m a ny t ig ht ly  c onne c te d gr oups  a nd  a  hi gh t e nde n c y f or  l oc a l  c lu s te r in g.       4.   C O N C L U S I O N   T hi s   pa pe r   pr e s e nt s   a   s tu dy  on  th e   c onc e pt ua li z a ti on  of   P P I s   g r a ph  a s   a   ne twor k  a nd  a na ly z in g  th is   ne twor k  by  m e a ns   of   s e le c te d  ne twor k  a n a ly s is   a ppr oa c he s   th r ough  th e   e xpl or a ti on  of   th e   hi dde n   pa tt e r ns   of   r e a c ti vi ty   a nd  c onne c ti vi ty   a m ong  in te r c ha ngi ng  node s .  T he   P P I s   ne twor k  of   A c c ut a ne   dr ug  w a s   s e le c te d.   T he   pr oc e s s   of   th e   a na ly s is   of   th is   P P I s   ne twor k  w a s   e xpl a in e d   in   de ta il   a nd  th us   th e   obj e c ti ve   f or   th is   s tu dy  w a s   a ddr e s s e d.   I t  c a n   be   ob s e r ve d  f r om   th e   f or e goi ng  th a t:   i)   r e s e a r c h  que s ti on  ( Q 1:   A r e   p a ti e nt s  c ons is t e nt ly   r e s ponding  to   pa ti e nt s   be lo ngi ng  to   a   s im il a r   ge nde r   a nd/ or   a ge   pr of il e ? )   w a s   a n s w e r e d  ne ga ti ve ly   be c a u s e   th e   ne twor k  e xhi bi te d  hi gh   de gr e e s   of   he te r oge ne it y  w it h   r e s p e c t  to   ge nde r   a nd/ or   a ge   pr of il e   w it h  di f f e r e nt   va lu e s .  T hi s   e m pha s iz e d  a   di s a gr e e m e nt   b e twe e n   ge nde r   a nd   a ge   pr of il e .  P a ti e nt s   te nd   th e r e f or e   to   in te r a c t  w it h  pa ti e nt s   w it h  di f f e r e nt   ge nde r   a nd/ o r   a ge   pr o f il e .  ii )   r e s e a r c h  que s ti on  ( Q 2:   A r e   c om m uni ti e s   f ound  i n   th e   ( P P I s )   ne two r k  a bl e   to   id e nt i f y,  a t  le a s t  r oughly,  a   pa ti e n t ’ s   a ge   or   ge nde r ? )   w a s   a ns w e r e d  ne ga ti ve ly   be c a us e   none   of   th e   c on s id e r e d  c om m uni ty   de te c ti on  a ppr oa c h e s   w a s   a bl e   to   d e te c t  c om m uni ti e s ,  w it hi n  th e   ne twor k, of  m e m be r s  ha vi ng t he  s a m e  ge nde r  or  t he  s a m e  a ge  p r of il e . S om e  c om m uni ti e s  ( e .g., c om pone nt  1)   c ont a in e d  node s   ( pa ti e nt s )   f r om   di f f e r e nt   a ge   a nd  ge nde r   p r of il e s .  O th e r   c om pone nt s   ( li ke   4  a nd  5)   a r e   m uc h   s m a ll e r   a nd c oul d  r e pr e s e nt   m or e   hom oge nou s   gr oups   c ons id e r in g  a ge   or   g e nde r . T hus   it   w a s   c on c lu de d  th a t,   th e   c om m uni ty   s tr uc tu r e   ( id e nt if ie d  by  c om pone nt   num be r s )   c ont a in   node s   w it h  hi gh  c lu s te r in g  c oe f f ic ie nt s   s e e m e d  not   to   be   hi ghl y  c or r e la te d  w it h  a ge   or   ge nde r .  T he s e   c om m uni ti e s   m a y  be   f or m e d  ba s e d  on  ot he r   f a c to r s   li ke   s im il a r it y  be twe e n  pa ti e nt s ’   r e vi e w s   le xi c a l  c o nt e nt s   or   s e nt im e nt s ,  r a th e r   th a n   ge nde r   or   de m ogr a phi c   c ha r a c te r is ti c s ,  i. e .,  a ge   or   ge nde r   w a s   not   a   do m in a nt   f a c to r   in   de te r m in in g  m e m be r s hi p  in   th e s e   c om m uni ti e s .  M a ny  pr om is in g  f ut ur e   r e s e a r c h  di r e c ti ons   pr e s e nt   th e m s e lv e s ,   s o  a s   to   e xt e nd   th e   f unc ti ona li ty   a nd  e nha nc e   th e   ope r a ti on  of   a na ly z in g  la r ge   c ol le c ti ons   of   P P I s   ne twor ks   di r e c tl y  us in g  gr a ph  m in in g a ppr oa c he s  r a th e r  t ha n us in g ba s ic  t a bul a r  da ta  a n a ly s is   te c hni que s .       F U N D I N G  I N F O R M A T I O N   A ut hor s  s ta te  no f undi ng i nvol ve d.   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
I nt  J  A r ti f   I nt e ll     I S S N :   2252 - 8938       E x pl or in g pati e nt - pat ie nt  i nt e r ac ti ons  gr aphs  b y  ne tw or k  analy s i s   ( Z ahe r  Sal ah )   1761   A U T H O R  C O N T R I B U T I O N S  S T A T E M E N T   T hi s   jo ur na l  us e s   th e   C ont r ib ut or   R ol e s   T a xonomy  ( C R e d iT )   to   r e c ogni z e   in di vi dua l  a ut hor   c ont r ib ut io ns , r e duc e  a ut hor s hi p di s put e s ,  a nd f a c il it a te  c ol la bo r a ti on.     N am e  o f  A u t h or   C   M   So   Va   Fo   I   R   D   O   E   Vi   Su   P   Fu   Z a he r  S a la h   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓     E s r a a  A bu E ls oud   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓     ✓     K a m a l  S a la h   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓   ✓     ✓       C   :    C onc e pt ua l i z a t i on   M   :    M e t hodol ogy   So   :    So f t w a r e   Va   :    Va l i da t i on   Fo   :    Fo r m a l  a na l ys i s   I   :    I nve s t i ga t i on   R   :    R e s our c e s   D   :   D a t a  C ur a t i on   O   :   W r i t i ng  -   O r i gi na l  D r a f t   E   :   W r i t i ng  -   R e vi e w  &   E di t i ng   Vi   :    Vi s ua l i z a t i on   Su   :    Su pe r vi s i on   P   :    P r oj e c t  a dm i ni s t r a t i on   Fu   :    Fu ndi ng a c qui s i t i on         C O N F L I C T  O F  I N T E R E S T  S T A T E M E N T   A ut hor s  s ta te  no c onf li c t  of  i nt e r e s t.       DAT A  A V A I L A B I L I T Y   T he   d a ta   th a t   s uppor t  th e   f in di ngs   of   th is   s tu dy   a r e   a va il a bl e   f r om   th e   c or r e s ponding  a ut hor ,  [ Z S ] ,  upon r e a s ona bl e  r e que s t.       R E F E R E N C E S   [ 1]   H . B a of a ng, H . W a ng, L .  W a ng, a nd  W . Y ua n.  “ A dv e r s e  dr ug r e a c t i on pr e di c t i ons  us i ng  s t a c ki ng de e p  h e t e r oge ne ous  i nf or m a t i on   ne t w or k e m be ddi ng a ppr oa c h, ”   M ol e c ul e s , vol .   23, no. 12, 2018, doi :   10.3390/ m ol e c ul e s 23123193 .   [ 2]   X .  Z ha o,  L .  C he n,  Z .   H .   G uo,  a nd  T .  L i u.  “ P r e di c t i ng   dr ug   s i de   e f f e c t s   w i t h   c om pa c t   i nt e gr a t i on  o f   he t e r oge ne ous   ne t w or ks , ”   C ur r e nt  B i oi nf or m at i c s , vol .   14,   no. 8 , pp.  709 - 720 , 2019,   doi :   10.2174/ 1574893614666190220114644 .   [ 3]   H .  B a of a ng,  H .  W a ng,  a nd  Z .  Y u.  “ D r ug  s i de - e f f e c t   pr e di c t i on  vi a   r a ndom   w a l k  on  t he   s i gne d   he t e r oge ne ous   dr ug  ne t w or k , ”   M ol e c ul e s , vol .   24, no. 20 ,  2019 ,   doi :   10.3390/ m ol e c ul e s 24203668 .   [ 4]   C.   C .   Y a ng  a nd  M .   Z ha o.  “ M i ni ng  he t e r oge ne ou s   ne t w or k  f or   dr ug  r e po s i t i oni ng  us i ng  phe not ypi c   i nf or m a t i on  e xt r a c t e d  f r om   s oc i a l   m e di a   a nd  pha r m a c e ut i c a l   d a t a ba s e s , ”   A r t i f i c i al   I nt e l l i ge nc e   i n  M e di c i ne ,  vol .   96 ,  pp.  80 - 92 ,  2019,   doi :   10.1016/ j .a r t m e d.2019.03.003 .   [ 5]   L .  P e ng,  C .  Y a ng,  Y .  C he n,  a nd  W .   L i u.   “ P r e di c t i ng  C i r c R N A - D i s e a s e   a s s oc i a t i ons   vi a   f e a t ur e   c onvol ut i on  l e a r ni ng  w i t h   he t e r oge ne ous  gr a ph a t t e nt i on ne t w or k , ”   I E E E  J our nal  of  B H I   27, no. 6 , pp.  30 72 - 3082 , 2023,   doi :   10.1109/ J B H I .2023.3260863 .   [ 6]   P .  C ha nda k,  K .  H ua ng ,   a nd  M .  Z i t ni k.  “ B ui l di ng  a   know l e dge   gr a ph  t o  e na bl e   pr e c i s i on  m e di c i ne , ”   Sc i e nt i f i c   D at a   10,  no.  1 ,  2023,   doi :   10.1038/ s 41597 - 023 - 01960 - 3 .   [ 7]   G .  K he ka r e ,  S .  G huga r e ,  R .  K ha t r i ,  G .  M a j um de r ,  a nd  U .   K he ka r e ,  “ B l oc kc ha i n  pow e r e d  i nt e gr a t e d  he a l t h  pr of i l e   a nd  r e c or d   m a na ge m e nt  s y s t e m  f or  s e a m l e s s  c ons ul t a t i on l e ve r a gi ng  uni que  i de nt i f i e r s , ”   2 024 Se c ond I nt e r nat i onal  C onf e r e nc e  on E m e r gi n g   T r e nds   i n  I nf or m at i on  T e c hnol ogy   and  E ngi ne e r i ng  ( I C E T I T E ) ,  V e l l or e ,  I ndi a ,  pp.  1 - 9 ,  2024,   doi :   10.1109/ i c - E T I T E 58242.2024.10493266 .   [ 8]   Z .  S a l a h,  E .  E l s oud,  K .   S a l a h,  W .   T .  A l - S i t ,  M .   M a a ya ’ a ,  a nd  A .  A l   K ha w a l de h ,   “ P a t i e nt - pa t i e nt   i nt e r a c t i ons   vi s ua l i z a t i on  f or   dr ug  s i de   e f f e c t s   i n  pa t i e nt s ’   r e vi e w s , ”   I ndone s i an  J our nal   of   E l e c t r i c al   E ngi ne e r i ng  and  C om put e r   Sc i e n c e ,  v ol .   34,  n o.   3,  pp.  2007 - 2020,  J un .   2024,  doi :  10.11591/ i j e e c s .v34.i 3.pp2007 - 2020.   [ 9]   A .  B e r m i ngha m ,  M .  C onw a y,  L .  M c I ne r ne y,  N .  O ’ H a r e ,  a nd  A .   F .  S m e a t on.  “ C om bi ni ng  s oc i a l   ne t w or k  a na l ys i s   a nd  s e nt i m e nt   a na l ys i s   t o   e xpl or e   t he   pot e nt i a l   f or   onl i ne   r a di c a l i s a t i on, ”   I n  P r oc e e di ngs   of   t he   2009  I nt e r nat i onal   C onf e r e nc e   on  A dv anc e s   i n   Soc i al   N e t w or k   A nal y s i s   and  M i ni ng,  A SO N A M   ‘ 09 ,  p p.  231 – 236,  W a s hi ngt on,  D C ,  U S A ,  2009 ,  doi :  10.1109/ A S O N A M .2009.31.   [ 10]   P.   A .  G l oor ,  J .  K r a us s ,  S .  N a nn,  K .  F i s c hba c h ,   a nd  D .  S c hode r ,  “ W e b  s c i e n c e   2.0:   I de nt i f yi ng  t r e nds   t hr ough  s e m a nt i c   s oc i a l   ne t w or k a na l ys i s , ”   2009 i nt e r nat i onal  c onf e r e nc e  on C SE , v ol . 4 ,   I E E E , 2009 ,   doi :   10.1109/ C S E .2009.186 .   [ 11]   J .  R a be l o,  R .   B.   C .  P r ude nc i o ,   a nd  F .  B a r r os ,  “ C ol l e c t i ve   c l a s s i f i c a t i on  f or   s e nt i m e nt   a na l ys i s   i n  s oc i a l   ne t w or ks , ”   I n  P r oc e e di ng s   of   t he   2012  I E E E   24t h  I nt e r nat i onal   C onf e r e nc e   on  T ool s   w i t h  A r t i f i c i al   I nt e l l i ge nc e ,  W a s hi ngt on,  U S A ,  2012,  p p.   958 - 963,  doi :  10.1109/ I C T A I .2012.135.   [ 12]   C .  W a ng,  Z .  X i a o,  Y .   L i u,  Y .   X u,  A .  Z hou ,   a nd  K .  Z ha ng.  “ S e nt i vi e w :   s e nt i m e nt   a na l ys i s   a nd  vi s ua l i z a t i on  f or   i nt e r ne t   popul a r   t opi c s , ”   I E E E  t r ans ac t i ons  on hum an - m ac hi ne  s y s t e m s ,  vol .   43 , no.  6, pp.   620 - 630, 2013 , doi :  10.1109/ T H M S .2013.2285047.   [ 13]   M .  S ha m s ,  M .  S a f f a r ,  A .  S ha ke r y ,   a nd  H .  F a i l i .  “ A ppl yi ng  s e nt i m e nt   a nd  s oc i a l   ne t w or k  a na l ys i s   i n  u s e r   m ode l l i ng , ”   I n   P r oc e e di ngs   of   t h e   13t h  I nt e r nat i onal   C onf e r e n c e   on  C om put at i onal   L i ngui s t i c s   and  I nt e l l i ge nt   T e x t   P r oc e s s i ng,   B e r l i n,   H e i de l be r g,  p p.   526 - 539, 2012 , doi :   10.1007/ 978 - 3 - 642 - 28604 - 9 43.   [ 14]   W .  D e i t r i c k  a nd  W .  H u.  “ M ut ua l l y  e nha nc i ng  c om m uni t y  de t e c t i on  a nd  s e nt i m e nt   a na l ys i s   on  t w i t t e r   ne t w or ks , ”   J our nal   of   D at a   A nal y s i s  and I nf or m at i on P r oc e s s i ng ,  vol .   1 , no.  3 , pp.  19 - 29, 2013 , doi :   10.4236/ j da i p.2013.13004.   [ 15]   H .  D e ng,  J .  H a n,  H .  J i ,  H .  L i ,  Y .  L u ,   a nd  H .  W a ng.  “ E xpl or i ng  a nd  i nf e r r i ng  us e r - us e r   ps e udo - f r i e nds hi p  f or   s e nt i m e nt   a na l y s i s   w i t h  he t e r oge ne ous   ne t w or ks , ”   St at i s t i c al   A nal y s i s   and  D at a  M i ni ng:   T he   A S A   D at a  Sc i e nc e   J our nal ,   vol .   7 ,  no.  4,  pp.  308 - 321 ,  2014,  doi :   10.1002/ s a m .11223.   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.