Co m pu t er   Science  a nd   I nfo r m a t io n T ec hn o lo g ies   Vo l.  6 ,   No .   2 J u ly   20 25 ,   p p .   1 5 9 ~ 1 6 8   I SS N:  2722 - 3 2 2 1 DOI 1 0 . 1 1 5 9 1 /csi t . v6 i 2 . p p 1 5 9 - 1 6 8          159     J o ur na l ho m ep a g e h ttp : //ia e s p r ime. co m/in d ex . p h p /csi t   Effec ts of hype rp a ra meter  tu ning   o n rando m forest   regres so r in  the  be ef  qua lity p rediction mo de l       Ridwa n Ra a f i'u di n 1, 4 Yo ha nes   Aris P ur wa nto 2 ,   I m a s   Su k a esih   Sita ng g a ng 1 ,   Dew i A pri A s t uti 3   1 D e p a r t me n t   o f   C o m p u t e r   S c i e n c e ,   I P B   U n i v e r si t y ,   B o g o r ,   I n d o n e si a   2 D e p a r t me n t   o f   M e c h a n i c a l   a n d   B i o sy st e En g i n e e r i n g ,   I P B   U n i v e r si t y ,   B o g o r ,   I n d o n e si a   3 D e p a r t me n t   o f   N u t r i t i o n   a n d   F e e d   Te c h n o l o g y ,   I P B   U n i v e r s i t y ,   B o g o r ,   I n d o n e si a   4 D e p a r t me n t   o f   I n f o r mat i c s ,   U P N   V e t e r a n   Ja k a r t a ,   Ja k a r t a ,   I n d o n e s i a       Art icle  I nfo     AB S T RAC T   A r ticle  his to r y:   R ec eiv ed   Au g   12 2 0 2 4   R ev is ed   Mar   11 2 0 2 5   Acc ep ted   May   23 2 0 2 5       P re d ictio n   m o d e ls  f o r   b e e m e a q u a li ty   a re   n e c e ss a ry   b e c a u se   p ro d u c ti o n   a n d   c o n su m p ti o n   we re   sig n if ica n a n d   in c re a sin g   y e a rly .   Th is   stu d y   a ims   to   c re a te  a   p re d ictio n   m o d e fo b e e fre sh n e ss   q u a li t y   u si n g   th e   ra n d o m   fo re st  re g re ss o (RF R)   a lg o rit h m   a n d   t o   imp r o v e   th e   a c c u ra c y   o t h e   p re d ictio n s   u sin g   h y p e rp a ra m e ter  tu n i n g .   T h e   u se   o f   n e a r - i n fra re d   sp e c tr o sc o p y   (NIRS)  in   p re d ict in g   b e e q u a li t y   is  a n   e a sy ,   c h e a p ,   a n d   fa st  tec h n i q u e .   T h is  stu d y   u se d   six   m e a q u a li ty   p a ra m e ters   a p re d ictio n   targ e v a riab les   fo th e   tes t.   Th e     m e tri c   wa u se d   t o   e v a l u a te  th e   p re d icti o n   re su lt a n d   c o m p a re   th e   p e rfo rm a n c e   o th e   RF wit h   d e fa u lt   p a ra m e ters   v e rsu th e   RF with   h y p e r p a ra m e ter  tu n i n g   (Ra n d o m S e a rc h CV).  Us in g   d e fa u lt   p a ra m e ters ,   th e   R - sq u a re d   (R² v a lu e fo c o lo r   ( L* ),   d rip   lo ss   (% ) ,   p H,  st o ra g e   ti m e   (h o u r),   to tal  p late   c o l o n y   (TP in   c f u /g ),   a n d   wa ter  m o istu re   (% we re   0 . 7 8 9 ,   0 . 8 3 9 ,   0 . 7 3 4 ,   0 . 9 0 9 ,   0 . 8 4 5 ,   a n d   0 . 5 4 4 ,   r e sp e c ti v e ly .   Afte a p p ly i n g   h y p e r p a ra m e ter   tu n i n g ,   t h e se     sc o re in c re a se d   to   0 . 8 8 5 ,   0 . 9 3 1 ,   0 . 8 4 3 ,   0 . 9 5 7 ,   0 . 9 0 3 ,   a n d   0 . 7 3 9 ,   in d ica ti n g   a n   o v e ra ll   imp r o v e m e n i n   th e   m o d e l’s  p e rfo rm a n c e .   Th e   a v e ra g e   p e rfo rm a n c e   in c re a se   f o p re d icti o n   re su lt fo a ll   b e e q u a li ty   p a ra m e ters   is 0 . 0 9 9 7   o 1 4 %   h ig h e th a n   t h e   d e fa u lt   p a ra m e ters .   K ey w o r d s :   B ee f   q u ality   p r ed ictio n   Hy p er p ar a m eter   tu n in g   R an d o m   f o r est r eg r ess o r   R an d o m ized Sear ch C V   Sp ec tr o s co p y   T h is i a n   o p e n   a c c e ss   a rticle   u n d e r th e   CC B Y - SA   li c e n se .     C o r r e s p o nd ing   A uth o r :   Yo h an es   Ar is   Pu r wan to   Dep ar tm en t o f   Me ch an ical  an d   B io s y s tem   E n g in ee r in g ,   I PB   Un iv er s ity   B o g o r ,   I n d o n esia   E m ail:  ar is p u r wan to @ ap p s . ip b . ac . id       1.   I NT RO D UCT I O N   Me at  as  s o u r ce   o f   p r o tein   h as  b ee n   wid ely   c o n s u m ed   b y   h u m a n s   in   r ec e n d ec a d es,  an d   its   co n s u m p tio n   is   in cr ea s in g   [ 1 ] .   B ee f   is   th ch o ice  o f   f o o d   p r o d u ct  to   m ee th n ee d   f o r   a n im al  p r o tein   b ec a u s e   it h as a   h ig h   p r o tein   c o n ten [ 2 ] .   Ho wev er ,   b ee f   is   also   f o o d   p r o d u ct  th at  is   ea s ily   p er is h ab le  an d   s p o iled   [ 3 ] Un d er   s p ec if ic   tem p er at u r a n d   e n v ir o n m en tal  c o n d itio n s ,   m icr o b ial   g r o wth   ac ce ler ate s ,   lead in g   to   f aster   b ee f   s p o ilag [ 4 ] ,   [ 5 ] .   Path o g en ic  b ac ter ia  p r esen in   m ea t,  an d   th eir   n u m b er   ex ce e d in g   s af th r esh o ld s   ca n   ca u s co n s u m er s   to   b ec o m e   s ick   [ 6 ] ,   [ 7 ] .   Nea r - in f r a r ed   s p ec tr o s co p y   ( NI R S)  tech n o lo g y   ca n   b e   u s ed   to   d etec th co m p o s itio n   co n tai n ed   in   b ee f   [ 8 ] ,   [ 9 ] .   NI R ca n   d etec s ev er al  m o lecu lar   co n ten ts   in   b ee f ,   s u ch   as  ch em ical  co m p o n en ts ,   tech n o lo g ical  p ar am eter s   o r   elec tr o n ic  eq u ip m en t ,   m in er al  co n ten ts ,   q u ality   tr aits ,   f atty   ac id s ,   an d   m an y   m o r [ 1 0 ] [ 1 2 ] .   T h f r esh n ess   q u ality   o f   b ee f   ca n   ch an g s o   q u ic k ly   th at  to o o r   m et h o d   is   n ee d ed   to   p r ed ict  th f r esh n ess   q u ality   q u ick l y   an d   ac cu r ately .   m eth o d   th at   ca n   b u s ed   to   d o   m o d elin g   is   u s in g   m ac h in e   lear n in g   [ 1 3 ] .   Pre d ictiv m o d elin g   o f   m ea q u ality   attr ib u te s   f r o m   h u m an   s en s in g   lik ten d er n ess ,   ju icin ess ,   an d   f lav o r   h as b ee n   d o n with   m ac h in lear n in g   [ 1 4 ] .   T h e   r a n d o m   f o r est  alg o r ith m   [ 1 5 ]   w as  u s ed   as  th m ain   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 7 2 2 - 3 2 2 1   C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l ,   Vo l.  6 ,   No .   2 J u ly   20 25 159 - 1 6 8   160   m o d el  in   th is   s tu d y .   T h er h a v b ee n   m a n y   im p lem e n tatio n s   o f   m ac h in lear n i n g   in   p r ed i ctin g   o r   class if y in g   th ty p an d   q u ality   o f   b ee f   [ 1 6 ] ,   [ 1 7 ] .   T h r a n d o m   f o r est  r eg r ess o r   ( R FR )   ef f ec tiv ely   p er f o r m s   th r ea l - tim e   p r ed ictio n   o f   p v alu es in   b ee f   with in   b ee f   f r esh n ess   m o n i to r in g   s y s tem   [ 1 8 ] .   I n   th is   s tu d y ,   b ee f   q u ality   p r ed ictio n   u s es  s ix   q u ality   p a r a m eter s co lo r   with   lig h tn ess   v alu ( L * ) ,   d r ip   lo s s   in   p er ce n tag e,   p v alu e,   s to r ag tim in   th h o u r   u n it,  to tal  p late  co lo n y   ( T PC )   in   th co lo n y   f o r m in g   u n it  p er   g r am   ( cf u /g ) ,   an d   wate r   m o is tu r v al u in   t h p er ce n tag e.   Fo r   t h ex p er i m en tal  s ce n ar io ,   th R F R   alg o r ith m   was  u s ed   wit h   d ef au lt  co n f i g u r atio n   [ 1 9 ] ,   an d   th en   it  tr ied   to   im p r o v th alg o r ith m ' s   p er f o r m an ce   b y   p er f o r m in g   h y p er p a r am eter   tu n in g   [ 2 0 ] ,   [ 2 1 ] .   T h h y p er p ar am eter   tu n i n g   m eth o d   u s ed   is   R an d o m ized Sear ch C [ 2 2 ] .       2.   M E T H O D   2 . 1 .     Da t a s et   T h is   s tu d y   u s ed   d ataset  o f   b ee f   q u ality   p ar am eter s   f r o m   p r ev i o u s   r esear ch   [ 2 3 ] .   T h o b ject  ex am in ed   in   th s tu d y   was  f r e s h   b ee f .   T h d ata  ac q u is itio n   p r o ce s s   was  ca r r ied   o u in   two   way s d estru ctiv m eth o d   u s in g   lab o r ato r y   to o l s   an d   n o n - d estru ctiv m eth o d   u s in g   NI R s en s o r s .   T h d estru ctiv m eth o d   p r o d u ce d   d ata  o n   th e   v alu e   o f   m ea q u ality   p ar am eter s ,   wh i ch   b ec am e   th ta r g et  v a r iab le s   o f   th e   m o d elin g .   T h n o n - d estru ctiv e   m eth o d   g en er ate d   s p ec tr o s co p y   d ata  th at  s er v ed   as  tr ain in g   d at in   m o d elin g .   An   ex am p le  o f   m ea q u ality   p a r am eter   d ata  ca n   b o b s er v e d   in   T ab le  1 .   T h ese  d ata  h a v 6   d ata  c o lu m n s   ac co r d in g   to   th p ar am eter s   to   b p r e d icted   an d   8 0   r o ws o f   d ata.   Sp ec tr o s co p ic  d ata  ar e   s im ilar   to   s ig n al  d ata,   b u in   th is   s tu d y   th s p ec tr o s co p y   d ata  is   alr e ad y   in   th e   f o r m   o f   s p r ea d s h ee f ile.   T h d ata  co n s is ts   o f   1 3 6   co lu m n s ,   with   th co lu m n   n am b ein g   th wav ele n g th   v alu o f   th s en s o r   in   n an o m eter s   ( n m )   an d   co n s is ts   o f   7 2 0   r o ws  d ata.   T h is   s p ec tr o s co p y   d ata  was  o b tain ed   f r o m   8 0   s am p les  th at  wer e   s ca n n ed   n in tim es,   an d   an   e x a m p le  o f   s p ec tr o s co p ic   d ata  ca n   b e   s ee n   in   T ab le  2   an d   v is u alize d   as sh o wn   i n   Fig u r 1 .       T ab le  1 .   E x am p le  d ata  f r o m   lab o r ato r y   [ 2 3 ]   N o .   S t o r a g e Ti m e   ( h o u r )   D r i p L o ss   ( %)   C o l o r   ( L* )   pH   W a t e r M o i s t u r e   ( %)   TPC   ( c f u / g )   1   0   0 . 0 0 %   2 9 . 0 9   5 . 4 5   7 6 . 7 8 %   2 1 , 8 0 2 . 1 8   2   1   3 . 9 7 %   3 2 . 4 8   5 . 5 2   7 6 . 9 2 %   7 2 , 8 9 5 . 3 8   3   2   6 . 4 6 %   3 5 . 6 8   5 . 3 2   7 5 . 5 1 %   1 1 0 , 2 0 4 . 6 7                 80   7   1 7 . 0 4 %   3 1 . 2 7   5 . 5 9   7 4 . 8 6 %   2 , 4 5 9 , 8 0 1 . 1 5       T ab le  2 .   NI R S d ata  ex am p le   H o u r   W a v e l e n g t h   ( n m)   2 5 5 6 . 2 4   2 5 3 9 . 3 5     1 3 5 1 . 3 5   1 3 4 6 . 6 1   0   2 . 2 7   2 . 3 7     1 . 4 1   1 . 3 5   1   1 . 9 6   2 . 0 8     1 . 7 2   1 . 9 5   2   1 . 7 8   1 . 8 6     1 . 6 2   1 . 5 3   3   2 . 1 2   2 . 2 2     1 . 8 9   1 . 8 8   4   2 . 1 1   2 . 2 8     1 . 8 5   1 . 7 7   5   1 . 7 1   1 . 8 6     2 . 0 1   2 . 1 1   6   2 . 1 3   2 . 3 0     2 . 8 6   2 . 5 5   7   2 . 8 1   2 . 9 1     3 . 7 9   4 . 0 1           Fig u r 1 .   NI R S   d ata  p lo ttin g   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l     I SS N:   2722 - 3 2 2 1       E ffects o f h yp erp a r a mete r   tu n in g   o n   r a n d o fo r est r eg r es s o r   in   th b ee q u a lity    ( R id w a n   R a a fi'u d i n )   161   2 . 2 .   E x perim ent a l scena rio   I n   th is   s t u d y ,   tw o   s c e n a r i o s   we r e   p r o p o s e d   i n v o lv in g   R FR   wi th   d e f a u l t   p ar am et er s   an d   t h e   a p p lic ati o n   o f   h y p e r p a r a m et e r s ,   as  s h o wn   in   F ig u r 2 .   T h m o d e li n g   p r o ce s s   was  ca r r ie d   o u a lte r n a tel y   o n   ea c h   m ea t   q u ali ty   p a r a m e te r .   A   c o m p ar at iv e   d is t r i b u ti o n   o f   tr ai n i n g   a n d   tes ti n g   d at o f   7   t o   2 ,   as s h o w n   in   T a b le   3 .       O r gi na l   N I R S  D a t a C ol or R F R de f a ul t  pa r a m e t e r P e r f or m a nc e   E va l ua t i on 1 2 4 D r i p l os s pH S t or a ge  t i m e T P C W a t e r  m oi s t ur e R F R  w i t hyp e r pa r a m e t e r  t uni ng 3     Fig u r 2 .   E x p er im e n tal  s ce n ar io       T ab le  3 .   Data s et  d is tr ib u tio n   D a t a s e t   A mo u n t   o f   d a t a   P e r c e n t a g e   ( %)   Tr a i n i n g   d a t a     5 6 0   7 7 . 8   Te st i n g   d a t a     1 6 0   2 2 . 2   S u m   7 2 0   1 0 0 . 0       2 . 3 .   H y perpa ra m e t er   t un ing   co nfig ura t io n   I n   th is   s t u d y ,   t h e   R an d o m iz ed Sea r c h C V   m et h o d   was   u s e d   [ 1 9 ] .   R a n d o m i ze d Se ar ch C V   p r o v i d es   b o th   ' f it'   a n d   ' s co r e'   m e th o d s .   Ad d i ti o n all y ,   it   s u p p o r ts   ' s co r e _ s a m p les' ,   ' p r ed ict' ,   ' p r e d i ct _ p r o b a' ,   ' d e cisi o n _ f u n cti o n ' ,   ' tr a n s f o r m ' ,   a n d   ' in v e r s e _ t r a n s f o r m ' ,   p r o v id ed   th ese   m et h o d s   ar e   a v ai la b l in   t h e   esti m at o r   u t ili ze d .   T h e   esti m at o r ' s   p a r a m et er s   u ti liz e d   f o r   im p l em en ti n g   t h ese   te ch n i q u es   a r e   f i n e - t u n e d   t h r o u g h   c r o s s - v ali d a te d   ex p l o r at io n   ac r o s s   v ar io u s   p ar am ete r   c o n f i g u r a ti o n s .   U n l i k Gr i d S ea r c h C V ,   w h ic h   tes ts   e v e r y   p ar am et er   v al u e,   R a n d o m i ze d Se ar c h C V   s el ec ts   p r e d et e r m i n ed   n u m b er   o f   p a r a m e te r   c o n f i g u r at io n s   r an d o m ly   f r o m   s p e ci f ie d   d is t r i b u ti o n s .   T h e   q u an t it y   o f   c o n f ig u r a ti o n s   t est ed   is   d e te r m in ed   b y   n _ i te r .   W h e n   a ll   p a r a m et er s   ar e   lis te d ,   s am p li n g   wit h o u r e p eti tio n   o cc u r s .   C o n v e r s e ly ,   if   a n y   p ar am ete r   is   d ef in ed   as   a   d i s tr i b u ti o n ,   s a m p li n g   wit h   r e p l ac e m e n t   is   e m p l o y e d .   I t' s   a d v is a b l t o   u tili ze   c o n ti n u o u s   d is t r i b u ti o n s   f o r   c o n ti n u o u s   p a r am ete r s   [ 2 2 ] .   Fo r   th u s o f   R FR   b y   d ef a u lt,  th er ar e   s till   alg o r ith m   p a r am eter s   s et,   wh ile  th d ef a u lt  p ar am eter   s ettin g s   ca n   b e   s ee n   i n   T a b le  4 .   Me an w h ile,   f o r   h y p e r p ar a m eter   s etu p ,   th er e   is   ac tu ally   n o   s tan d a r d   r ef er e n ce   f o r   h o w   m an y   p a r am eter   co m b in atio n s   was  u s ed ,   b u u s u ally ,   th e   m o r p ar am eter   co m b in atio n s   ar u s ed ,   th e   lo n g er   th tr ain i n g   p r o ce s s   in   m ac h in lear n in g .   T h s etu p   f o r   th co m b in atio n   o f   h y p er p ar am eter   tu n i n g   in   th is   s tu d y   ca n   b s ee n   i n   T ab le   5 .     T ab le  4 .   Def a u lt p ar am eter   o f   R F R   [ 2 4 ]   P a r a me t e r   D a t a   t y p e   D e f a u l t   v a l u e   n _ e st i ma t o r s     1 0 0   c r i t e r i o n     sq u a r e d _ e r r o r   max _ d e p t h     N o n e   mi n _ sa mp l e s _ s p l i t     2   mi n _ sa mp l e s _ l e a f     1   mi n _ w e i g h t _ f r a c t i o n _ l e a f   f l o a t   0 . 0   max _ f e a t u r e s   i n t   o r   f l o a t   1 . 0   max _ l e a f _ n o d e s   i n t   N o n e   mi n _ i mp u r i t y _ d e c r e a s e   f l o a t   0 . 0   b o o t st r a p   b o o l   Tr u e   o o b _ sc o r e   b o o l   o r   c a l l a b l e   F a l se   n _ j o b s   i n t   N o n e   r a n d o m _ s t a t e   i n t   N o n e   v e r b o s e   i n t   0   w a r m_ st a r t   b o o l   F a l se   c c p _ a l p h a   n o n - n e g a t i v e   f l o a t   0 . 0   max _ sam p l e s   i n t   o r   f l o a t   N o n e   mo n o t o n i c _ c st   a r r a y - l i k e   o f   i n t   o f   sh a p e   ( n _ f e a t u r e s )   N o n e     Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 7 2 2 - 3 2 2 1   C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l ,   Vo l.  6 ,   No .   2 J u ly   20 25 159 - 1 6 8   162   T ab le  5 .   Hy p er p ar a m eter   co n f ig u r atio n   P a r a me t e r   V a l u e s   n _ e st i ma t o r s   [ 2 0 0 ,   4 0 0 ,   6 0 0 ,   8 0 0 ,   1 0 0 0 ,   1 2 0 0 ,   1 4 0 0 ,   1 6 0 0 ,   1 8 0 0 ,   2 0 0 0 ]   max _ d e p t h   [ 1 0 ,   2 0 ,   3 0 ,   4 0 ,   5 0 ,   6 0 ,   7 0 ,   8 0 ,   9 0 ,   1 0 0 ,   1 1 0 ,   N o n e ]   max _ f e a t u r e s   [ 'l o g 2 ' ,   's q r t ',   N o n e ]   b o o t st r a p   [ Tr u e ,   F a l s e ]   mi n _ sa mp l e s _ s p l i t   [ 2 ,   5 ,   1 0 ]   mi n _ sa mp l e s _ l e a f   [ 1 ,   2 ,   4 ]       2 . 4 .   M o del e v a lua t i o n   T h i s   m o d e l i n g   wa s   e v al u a t e d   u s i n g   r o o t   m e a n   s q u a r e   e r r o r   ( R MS E )   a n d   R - s q u a r e d   ( R ² )   t o   m e a s u r e   i ts   p e r f o r m a n c e .   R M S E   a n d   R ²   a r e   u s e d   t o   a s s es s   h o w   w e l l   t h e   m o d e l   p r e d i c t s   d a ta .   T h e   s el e c ti o n   o f   R M S E   a n d   R ²  a s   e v a l u a ti o n   m e t r i c s   is   b a s e d   o n   t h e i r   a b i l i t y   t o   p r o v i d e   c o m p r e h e n s i v e   u n d e r s t a n d i n g   o f   t h e   m o d e l ' s   p r e d i c t i o n   a c c u r a c y .   R M SE   w a s   c h o s e n   b e c a u s e   i t   c a n   s h o w   h o w   f a r   t h e   p r e d i c t e d   v a l u e   d e v i a t e s   f r o m   a c t u a l   v a l u e   i n   s a m e   u n i t   a s   d a t a ,   m a k i n g   i t   ea s y   t o   i n t e r p r e t .   R MS E   i s   m o r e   s e n s it i v e   t o   l a r g e   e r r o r s   b e c a u s e   i t   c a l c u l at es   t h e   s q u a r e   m e a n   o f   e r r o r s ,   w h i c h   m a k e s   i t   s u i ta b l e   f o r   d e t e ct i n g   m o d e l s   w it h   s i g n i f i c a n t   p r e d i cti o n   e r r o r s   [ 2 5 ] .   Me an wh ile,   R ²  was  ch o s en   b e ca u s it  was   ab le  to   s h o th p r o p o r tio n   o f   v ar ian ce   f r o m   th d ata  th at  th m o d el  co u ld   e x p lain .     is   co m m o n ly   u s ed   ev alu atio n   m etr ic  in   r eg r ess io n   b ec au s it  g iv es  an   id ea   o f   h o well  th m o d el  f its   ag ai n s th d ata  [ 2 6 ] .   T h h ig h er   th R ²  v alu e,   th e   b etter   th m o d el  is   ab le  to   ac co u n f o r   v a r iatio n s   in   th d ata.   T h R MSE   f o r m u la  ca n   b e   s ee n   in   ( 1 )   an d   f o r m u la  R ²  ca n   b s ee n   in   ( 2 ) .     R M SE = 1 = 1 ( ˆ ) 2   ( 1 )     2 = 1 = 1 ( ˆ ) 2 = 1 ( ) 2   ( 2 )     W h er   =   ac tu al  d ata,   ˆ   =   p r ed i cted   d ata,   ̅   =   m ea n   o f   ac tu al  d a ta ,   an d   n   =   n u m b er   o f   d ata .       3.   RE SU L T S AN D I SCU SS I O N   T h m o d el  was  ev alu ated   u s in g   R MSE   an d   R ²   to   as s es s   it s   p r ed ictiv p er f o r m an ce .   Hy p e r p ar am eter   tu n in g   r esu lted   in   th b est  s et  o f   co n f ig u r atio n s ,   as  in d icate d   b y   th s m allest  R M SE  v a lu an d   g r ea ter   R ²   test in g   r esu lts   f o r   ea ch   m ea q u ality   p ar am eter .   As  co m p ar is o n   an d   to   s ee   th ef f ec t   o f   h y p er p ar am eter   tu n in g ,   th m o d elin g   ac cu r ac y   r esu lts   co m p ar th r esu lts   o f   R FR   with   th d ef au lt  co n f ig u r atio n   an d   th e   r esu lts   o f   h y p er p ar am eter   tu n in g .   T h r esu lts   o f   t h d e f au l co n f ig u r atio n   an d   u s in g   h y p er p ar am eter   tu n in g   ca n   b s ee n   in   T a b le  6 .   B ased   o n   th e   d ata  in   T a b le  6 ,   it  c an   b s ee n   th at  th p er f o r m a n ce   o f   th m o d elin g   im p r o v e d   f r o m   th e   o n e   u s in g   th d ef au lt  c o n f i g u r atio n   to   th r esu lt  o f   h y p e r p ar am ete r   tu n in g .   T h in c r ea s e   ca n   b s ee n   f r o m   th s m aller   R MSE   v alu an d   th in cr ea s i n g   R ²  v alu e.   T h in cr ea s in   p er f o r m an ce   in   t h e   in cr ea s in g   R ²  v alu with   an   a v er ag in c r ea s o f   0 . 0 9 9 7   o r   1 4 ca n   b s ee n   i n   T ab le  7 .   R ²  d ef au lt  s h o ws  th r esu lts   o f   th m o d el  ev alu ati o n   f o r   all  m ea q u ality   p ar am eter s ,   wh ile  R 2   h y p er p ar a m eter   is   th ev alu atio n   r esu lts   o f   th r an d o m   f o r est  m o d el  th at  h as im p lem e n ted   h y p er p ar am eter   tu n in g .       T ab le  6 .   Pre d ictio n   r esu lts   B e e f   q u a l i t y   p a r a me t e r   D e f a u l t   c o n f i g u r a t i o n   H y p e r p a r a me t e r   t u n i n g   R M S E     R M S E     c o l o r   2 . 0 3 0   0 . 7 8 9   1 . 1 1 0   0 . 8 8 5   d r i p   l o ss   0 . 0 0 0 7   0 . 8 3 9   0 . 0 0 0 3   0 . 9 3 1   pH   0 . 0 1 0   0 . 7 3 4   0 . 0 0 6   0 . 8 4 3   st o r a g e   t i me   0 . 4 8 0   0 . 9 0 9   0 . 2 2 7   0 . 9 5 7   TPC   6 8 1 0 4 2 4 2 0 8 9 . 2 7 7   0 . 8 4 5   4 2 4 0 1 6 5 1 9 4 8 . 6 4 6   0 . 9 0 3   w a t e r   m o i st u r e   0 . 0 0 0 8   0 . 5 4 4   0 . 0 0 0 5   0 . 7 3 9       T ab le  7 .   R - s q u ar e d   i m p r o v em en t   B e e f   q u a l i t y   p a r a me t e r s   R ²  d e f a u l t   R ²  h y p e r p a r a m e t e r   I mp r o v e m e n t   ΔR 2   ( %)   C o l o r   0 . 7 8 9   0 . 8 8 5   0 . 0 9 6   12   D r i p   l o ss   0 . 8 3 9   0 . 9 3 1   0 . 0 9 2   11   pH   0 . 7 3 4   0 . 8 4 3   0 . 1 0 9   15   S t o r a g e   t i me   0 . 9 0 9   0 . 9 5 7   0 . 0 4 8   5   TPC   0 . 8 4 5   0 . 9 0 3   0 . 0 5 8   7   w a t e r   m o i st u r e   0 . 5 4 4   0 . 7 3 9   0 . 1 9 5   36   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l     I SS N:   2722 - 3 2 2 1       E ffects o f h yp erp a r a mete r   tu n in g   o n   r a n d o fo r est r eg r es s o r   in   th b ee q u a lity    ( R id w a n   R a a fi'u d i n )   163   T h r esu lts   o f   th im p r o v em e n u s in g   h y p er p a r am eter   tu n i n g   o n   th R FR   ar v is u alize d   to   co m p a r e   th r esu lts   b y   u s in g   t h d e f au lt  p ar am eter s   an d   b y   u s in g   h y p er p ar am eter   tu n i n g .   Fo r   th e   m ea co lo r   q u ality   p ar am eter s ,   th p r ed ictio n   co m p ar is o n   r esu lts   ca n   b s ee n   in   Fig u r e s   3   to   8 I n   Fig u r 3 ,   we  ca n   s ee   a   co m p ar is o n   o f   th p r ed ictio n   r esu lts   f o r   th e   co lo r   p a r am ete r ,   wh er e   in   Fig u r 3 ( a) ,   th y ello co lo r ,   wh ich   r ep r esen ts   th p r ed ictio n   d ata ,   ap p ea r s   q u ite  f ar   f r o m   th ac tu al  d ata  lin e,   wh ich   is   b lu e.   Me an wh ile,   th e   r esu lts   o f   th ap p licatio n   o f   h y p er p a r am eter   tu n in g   s h o we d   an   in cr ea s in   ac c u r ac y   b y   s ee in g   th at  th o r an g lin in   Fig u r 3 ( b )   is   clo s er   to   th b lu e   lin e,   wh ich   m ea n s   th at  th p r e d ictio n   er r o r   v alu is   s m aller   with   lar g er   R 2   v alu e.   T h v al u o f   R 2   u s in g   t h d e f au lt  p ar am eter   is   0 . 7 8 9   a n d   th en   in cr ea s es  to   0 . 8 8 5   a f ter   ap p ly in g   h y p er p a r am eter   tu n i n g .   O v er all,   it  ca n   b c o n cl u d ed   th at  h y p er p ar am eter   tu n in g   h as  p o s itiv im p ac o n   th im p r o v em en o f   th m o d el' s   ac cu r ac y   in   p r ed ictin g   th c o lo r   ( L * )   v al u e,   as  s ee n   f r o m   th e   in cr ea s in   th e   R 2   v alu e   an d   t h s h ap e   o f   th p r ed ictio n   lin th at  is   clo s er   to   th e   d ata  p atter n .   An   in cr ea s in   R 2   o f   0 . 0 9 6   o r   an   in c r ea s o f   1 2 %.           ( a)   ( b )     Fig u r 3 .   C o m p a r is o n   o f   co lo r   ( L * )   p r ed ictio n   r esu lts : ( a)   d e f au lt p ar am eter s   an d   ( b )   h y p er p ar am eter   tu n in g       T h e   p r e d icti o n   r es u lts   f o r   th e   d r ip   lo s s   q u a lit y   p a r a m et er   ar s h o w n   i n   Fi g u r e   4 ,   w h e r F ig u r e   4 ( a)   s h o ws   a   g r a p h   o f   t h e   p r e d i cti o n   r es u lts   w it h   a n   R 2   v al u e   o f   0 . 8 3 9   wit h   t h e   o r a n g e   li n e   s t il lo o k i n g   f r u ct u o u s ,   wh i ch   is   s til f ar   f r o m   t h e   ac t u al   d ata   o n   t h e   b l u e   li n e .   W h i le   in   Fi g u r e   4 ( b ) ,   w h i c h   h as   a p p li ed   h y p er p ar am ete r   tu n i n g ,   it   ca n   b e   s e en   th at   t h e r is   a   c h a n g e   w h e r th e   o r an g li n e   is   c lo s er   to   t h b l u e   c o l o r   o f   t h e   a ct u al   d a ta   wit h   a n   R 2   v al u o f   0 . 9 3 1   o r   0 . 0 9 2   g r ea t e r   t h a n   b ef o r e .   I n   t h e   p r e d i cti o n   o f   d r ip   l o s s   q u al ity ,   R 2   i n c r e ase d   b y   1 1 % ,   a n d   i t w as  als o   s ee n   t h at   th e r w as  less   d ev iat io n   o f   t h e   o r a n g c o l o r   li n e   c o m p a r e d   to   Fig u r 4 ( a ) .           ( a)   ( b )     F i g u r e   4 .   C o m p a r is o n   o f   d r i p   l o s s   ( % )   p r e d i c t i o n   r es u l ts :   ( a )   d e f a u l t   p a r a m e t e r s   a n d   ( b )   h y p e r p a r a m e t e r   t u n i n g       T h e   c o m p ar is o n   o f   p r e d i cti o n   r es u lts   in   th e   p H   q u ali ty   p ar am e te r   c an   b e   s ee n   in   F ig u r e   5 ,   wh er e   Fig u r e   5 ( a )   is   a   g r a p h   t h at   s h o ws  t h e   p r e d ic ti o n   r es u l ts   u s i n g   t h e   d e f a u lt   p a r a m e te r   wit h   a n   R 2   v al u e   o f   0 . 7 3 4 ,   wh i ch   is   c o n s i d e r e d   s m al l   b ec au s e   it   is   b el o w   0 . 8 .   W h i le   F ig u r e   5 ( b )   s h o ws   t h e   r es u lts   o f   p q u al it y   p r ed ict io n   af t er   a p p l y i n g   h y p er p a r a m e te r   tu n i n g   w it h   an   R 2   v a lu o f   0 . 8 4 3 ,   wit h   th is   v al u e,   it  ca n   b c o n s i d e r e d   th at   h y p er p ar am ete r   t u n in g   c a n   h av a   s ig n if i ca n t   i m p ac t.   A n   in c r ea s e   i n   t h e   R 2   v al u o f   0 . 1 0 9   o r   1 5 % .   T h is   in c r ea s e   c a n   s m o o t h   t h e   o r an g l in e,   w h i ch   is   t h e   p r ed ict io n   d at a,   a n d   t h e   v al u es   g et   cl o s er   to   t h e   ac tu al   d at a.   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 7 2 2 - 3 2 2 1   C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l ,   Vo l.  6 ,   No .   2 J u ly   20 25 159 - 1 6 8   164       ( a)   ( b )     Fig u r 5 .   C o m p a r is o n   o f   p v alu p r ed ictio n   r esu lts :   ( a)   d ef au lt p ar am eter s   an d   ( b )   h y p er p ar am eter   tu n in g       T h p r ed ictio n   o f   th s to r ag tim q u ality   p ar am eter   is   s h o wn   in   Fig u r 6 ,   s p ec if ically   in   th ac tu al  d ata  tim p r e d ictio n   d ata;  it  l o o k s   lik a   lad d er   b ec au s t h er is   g r o u p   o f   d ata  in   th s am tim p er io d ,   n am ely   at   th e   s am h o u r   as  th d if f e r en ce   o f   1   h o u r   t o   th e   d ata  g r o u p   b e f o r e   an d   af ter .   Actu al  d ata  is   a   d ata   in ter v al  p e r   1   h o u r   ac co r d in g   to   th e   d ata  c o llectio n   tech n iq u e.   I n   Fig u r e   6 ( a) ,   it  ca n   b s ee n   th at  t h er a r s till   m an y   o r a n g lin es  th at  ar to wer in g   o r   to o   lo d o wn   with   an   R 2   v alu o f   0 . 9 0 9 .   T h d ef au lt  r esu lt  o f   th is   p ar am eter   ca n   b c o n s id er ed   v er y   h ig h   b ec au s it  h as  ex ce ed ed   0 . 9 ,   b u h y p er p a r am eter   tu n in g   is   s till   ap p lied   to   s ee   th e   p er f o r m a n ce   r esu lts .   I n   Fig u r 6 ( b ) ,   th e   g r a p h   s h o ws  th e   p r e d ictio n   r esu lts   af ter   ap p l y in g   h y p er p ar am eter   t u n in g ,   with   t h R 2   r esu lt  b ein g   0 . 9 5 7 .   W ith   th R 2   v alu e,   th is   m o d el   ca n   b s aid   to   b clo s e   to   p er f e ct  in   p r ed ictin g   q u ality   with   th e   s to r ag e   tim p a r a m eter .   T h e   d if f er en ce   in   R 2   i n cr ea s es  u s in g   th e   d ef au lt p ar a m eter ,   an d   af ter   a p p ly in g   th e   h y p er p ar a m eter   tu n in g ,   it is   0 . 0 4 8   o r   5 %.           ( a)   ( b )     F i g u r e   6 .   C o m p a r i s o n   o f   s t o r a g e   t i m e   ( h o u r )   p r e d i c t i o n   r e s u l t s :   ( a )   d e f a u l t   p a r a m e t e r s   a n d   ( b )   h y p e r p a r a m e t e r   t u n i n g       T h n ex p r e d ictio n   r esu lt  is   ab o u b io lo g ical  m ea q u a lity   p ar am eter s ,   n am ely   esti m atin g   th e   n u m b er   o f   b ac ter ial  co lo n ies   u s in g   th T PC   m eth o d   with   co lo n y   f o r m i n g   u n its   p er   g r am   ( cf u /g )   with o u t   p ay in g   atten tio n   to   th e   ty p o f   m icr o b i o lo g y .   I n   Fig u r 7 ( a) ,   th r esu lts   o f   th e   m atch   b etw ee n   th e   ac tu al  d ata   an d   th p r e d icted   d ata  ar s h o wn .   T h er e,   it  ca n   b s ee n   th at  th p r ed ictio n   r esu lts   ar q u ite  g o o d   f o r   s m all  v alu es  b u s ee m   to   b m u ch   d if f er en in   th ac tu al  d ata  with   h ig h   v alu es.  T h is   is   b e ca u s e,   in d ee d ,   th e   m o d elin g   ac c u r ac y   with   an   R 2   v alu is   0 . 8 4 5   f o r   m o d elin g   with   d ef au lt  p ar am eter s ,   an d   th d is tr ib u tio n   o f   ac tu al  d ata  is   m o r at  s m a ll  v alu es.  W h ile  th ac cu r a cy   r esu lts   af ter   ap p ly i n g   th R 2   v alu tu n in g   h y p er p ar am eter   is   0 . 9 0 3 ,   as sh o wn   in   Fig u r e   7 ( b ) ,   th is   r esu lt  g iv es a n   in cr ea s o f   0 . 0 5 8   o r   7 %.   T h n ex r esu lt  is   th p r e d ictio n   f o r   th wate r   m o is tu r m e at  q u ality   p a r am eter   s h o wn   in   Fig u r 8 .   As  f o r   th p r ed ictio n   r esu lts   t h at  u s th d ef au lt  p ar am eter   with   th R 2   r esu lt  o f   0 . 5 4 4 ,   wh ich   ca n   b s ee n   in   Fig u r 8 ( a) ,   th is   v alu ca n   b s aid   to   b p o o r   p r ed ictio n   m o d elin g   r esu lt b ec au s th R 2   v alu is   o n ly   ar o u n d   0 . 5 .   T h a p p licatio n   o f   h y p er p ar am eter   tu n i n g   is   o n o f   th tech n iq u es  to   im p r o v m o d elin g   ac cu r ac y th e   r esu lts   o f   its   ap p licatio n   ca n   b s ee n   in   Fig u r 8 ( b )   with   an   R 2   v alu o f   0 . 7 3 9   o r   an   in c r ea s f r o m   th p r ev i o u s   0 . 1 9 5   o r   an   in cr ea s o f   3 6 %.  W ith   th R 2   in cr ea s v alu e ,   th wate r   m o is tu r p r ed icti o n   m o d elin g   af ter   Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l     I SS N:   2722 - 3 2 2 1       E ffects o f h yp erp a r a mete r   tu n in g   o n   r a n d o fo r est r eg r es s o r   in   th b ee q u a lity    ( R id w a n   R a a fi'u d i n )   165   ap p ly in g   h y p er p ar am eter   tu n in g   h as   th h ig h est  in c r ea s am o n g   o th er   q u ality   p a r am eter   p r e d ictio n s .   I n   Fig u r 8 ( b ) ,   wh ich   ap p lies   h y p er p ar am eter   tu n in g ,   th e   o r a n g lin e   ap p ea r s   to   b s m o o th e r   an d   v e r y   clo s to   th b lu lin e,   c o m p ar ed   to   Fig u r 8 ( a ) ,   wh ich   o n ly   u s es th d ef au lt p ar a m eter s .           ( a)   ( b )     Fig u r 7 .   C o m p a r is o n   o f   T PC   ( cf u /g )   p r ed ictio n   r esu lts : ( a)   d ef au lt  p ar am eter s   an d   ( b )   h y p e r p ar am eter   tu n in g           ( a)   ( b )     F i g u r e   8 .   C o m p a r i s o n   o f   w a t e r   m o i s t u r e   ( % )   p r e d i c t i o n   r e s u l t s :   ( a )   d e f a u l t   p a r a m e t e r s   a n d   ( b )   h y p e r p a r a m e t e r   t u n i n g       B ased   o n   th d ata  p air s   ( a)   an d   ( b )   v is u alize d   in   Fig u r e s   3   t o   8 ,   it  ca n   b s ee n   th at  th o r a n g lin in   ea ch   f ig u r ( b )   ca n   b etter   f o llo th b lu lin p atter n .   T h cl o s er   th o r an g lin is   to   th b lu lin e,   th g r ea ter   th R 2   v alu o r   th s m aller   th er r o r   v alu o f   t h p r e d ictio n   r esu lts .   T h in cr ea s in   th R 2   v alu m ea n s   th at   th ef f ec o f   h y p er p a r am eter   tu n in g   o n   th R FR   ca n   r u n   well.   T h p u r p o s o f   h y p e r p ar a m eter   tu n in g   is   to   s elec th b est  s et  o r   s et  o f   p a r am eter s   in   th R FR .   T h b est  p ar am eter   is   also   s h o wn   as  t h h ig h est  R 2   v alu f r o m   th r an d o m   p ar am eter   s elec tio n   p r o ce s s .   T h e   b est  p a r a m eter s   p r o d u ce d   f r o m   th h y p er p ar am eter   tu n in g   p r o ce s s   ar s h o wn   in   T ab le   8 .   T h r esu lts   o f   th e   h y p er p ar a m eter   tu n in g   s h o w   s ev er al  d if f e r en p a r am eter s   f o r   ea ch   m ea t q u ality   p r ed ictio n   tar g et.   T h d if f e r en t p ar am eter s   in clu d n _ esti m ato r s ,   m ax _ f ea tu r es,  m ax _ d e p th ,   an d   m in _ s am p les_ s p lit.  Ho wev er ,   th er is   n o   d if f er e n ce   b etwe en   m in _ s am p les_ l ea f   an d   b o o ts tr ap   p ar am eter s ,   wh ich   in d icate s   th at  th ey   h av e   n o   e f f ec t o n   th s elec tio n   p r o ce s s   in   h y p er p ar a m eter   tu n in g .       T ab le  8 .   B est p ar am eter s   f r o m   h y p er p ar am eter   t u n in g   R F R   p a r a me t e r   V a l u e s f o r   b e e f   q u a l i t y   p a r a me t e r s   C o l o r   D r i p l e ss   pH   S t o r a g e   t i me   TPC   W a t e r   mo i st u r e   n _ e st i ma t o r s   1 8 0 0   1 6 0 0   4 0 0   1 8 0 0   2 0 0 0   6 0 0   max _ f e a t u r e s   l o g 2   sq r t   l o g 2   l o g 2   sq r t   l o g 2   max _ d e p t h   80   30   30   N o n e   80   60   mi n _ sa mp l e s _ s p l i t   2   2   2   5   2   2   mi n _ sa mp l e s _ l e a f   1   1   1   1   1   1   b o o t st r a p   F a l se   F a l se   F a l se   F a l se   F a l se   F a l se       Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 7 2 2 - 3 2 2 1   C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l ,   Vo l.  6 ,   No .   2 J u ly   20 25 159 - 1 6 8   166   4.   CO NCLU SI O N   T h r esu lts   o f   t h is   s tu d y   p r o v th at  th u s o f   h y p e r p ar am e ter   tu n in g   ca n   im p r o v th e   p e r f o r m a n ce   o f   th R FR   alg o r ith m .   T h p e r f o r m a n ce   im p r o v em e n was  m ea s u r ed   b y   ev alu atin g   an   i n cr ea s in   R 2   v alu es  f o r   all  b ee f   f r esh n ess   q u ality   p r ed ictio n   tar g ets.  T h a v er ag in cr ea s in   R 2   f r o m   all  p r ed ict io n   r esu lts   o f   m ea q u ality   p ar am eter s   is   0 . 0 9 9 7 ,   o r   an   in cr ea s o f   1 4 f r o m   th R 2   v alu with   th d ef au lt  p ar am eter .   T h s tu d y ' s   r esu lts   o n   th e   ap p licatio n   o f   h y p er p ar am eter   tu n in g   s h o w   th at  n o t   all  p ar a m eter   c o n f ig u r atio n s   af f ec m ea t   q u ality   p r ed ictio n   m o d elin g .   T h is   s tu d y   s h o wed   t h at  th e   m in _ s am p les_ leaf ”  o r   t h m i n im u m   n u m b er   o f   s am p les  th at  m u s b p r esen in   ea ch   leaf   n o d an d   b o o ts tr ap   p ar am eter s   d id   n o s h o an y   d if f er e n ce   in   th e   r esu lts   o f   m ea q u ality   p r ed ic tio n ,   wh ich   m e an s   th at  th R FR   p ar am eter   d id   n o af f ec t h h y p er p ar a m eter   tu n in g   p r o ce s s .   So ,   in   th ap p licatio n   o f   th p r ed ictio n   m o d el,   R FR   an d   h y p er p a r am et er   tu n in g   m u s b ad ju s ted   to   t h p a r am eter s   g e n er ated   b y   h y p e r p ar am eter   tu n in g   to   b e   r e - tr ain e d   in   m o d elin g .   E ac h   o f   th e   h ig h est  p r ed ictio n   r esu lts   o n   a ll  m ea q u ality   p ar am ete r s   was  af f ec ted   b y   d if f er e n R FR   p a r am eter s   ac co r d in g   to   th r esu lts   o f   th b est  p ar am eter   o u tp u f r o m   th h y p er p ar am eter   tu n in g   iter atio n   p r o c ess .   Fo r   f u tu r wo r k ,   h y p er p ar am eter   t u n in g   m eth o d s   s u ch   as  Gr id C ca n   a ls o   b u s ed   to   ex p lo r f u r t h er   th a b ilit y   o f   h y p er p ar am eter   tu n in g   to   im p r o v alg o r ith m   p e r f o r m an ce .   T h r esu lts   o f   th is   s tu d y   ca n   a ls o   b co n tin u e d   b y   co m b in in g   h y p e r p ar am eter   tu n in g   with   s ev er al  p r ep r o ce s s   m eth o d s ,   s u ch   as  f ea tu r s elec tio n   an d   NI R d ata  tr an s f o r m atio n .   T h e   co m b i n a tio n   o f   s ev er al  m eth o d s ,   ea ch   o f   wh ich   h as  b ee n   p r o v en   to   im p r o v e   th p er f o r m an ce   o f   th e   alg o r ith m ,   is   ex p ec ted   t o   b e   ab le  to   im p r o v m o r e.   A n   ex am p le  o f   ap p ly in g   c o m b in atio n s   is   co m b in in g   s tar tin g   f r o m   f ea tu r s elec tio n   f o llo wed   b y   th tr an s f o r m atio n   d ata  m et h o d ,   th e n   ap p l y in g   h y p er p ar am eter   tu n in g .       F UNDING   I NF O R M A T I O N   T h is   r esear ch   u s ed   th a u th o r s   p er s o n al  f u n d s .       AUTHO CO NT RI B UT I O NS ST A T E M E N T   T h is   jo u r n al  u s es  th C o n tr ib u to r   R o les  T ax o n o m y   ( C R ed iT)   to   r ec o g n ize  in d iv id u al  au th o r   co n tr ib u tio n s ,   r ed u ce   au th o r s h ip   d is p u tes,  an d   f ac ilit ate  co llab o r atio n .     Na m o f   Aut ho r   C   M   So   Va   Fo   I   R   D   O   E   Vi   Su   P   Fu   R id wan   R aa f i ' u d in                               Yo h an es   Ar is   Pu r wan to                               I m as Su k ae s ih   Sit an g g an g                               Dew i A p r i A s tu ti                                 C     C o n c e p t u a l i z a t i o n   M     M e t h o d o l o g y   So     So f t w a r e   Va     Va l i d a t i o n   Fo     Fo r mal   a n a l y s i s   I     I n v e s t i g a t i o n   R     R e so u r c e s   D   :   D a t a   C u r a t i o n   O   :   W r i t i n g   -   O r i g i n a l   D r a f t   E   :   W r i t i n g   -   R e v i e w   &   E d i t i n g   Vi     Vi su a l i z a t i o n   Su     Su p e r v i s i o n   P     P r o j e c t   a d mi n i st r a t i o n   Fu     Fu n d i n g   a c q u i si t i o n         CO NF L I C T   O F   I N T E R E S T   ST A T E M E NT   Au th o r s   s tate  n o   co n f lict o f   in t er est.       DATA AV AI L AB I L I T Y   T h d ata  th at  s u p p o r th f in d in g s   o f   th is   s tu d y   ar av aila b le  o n   r eq u est  f r o m   th co r r esp o n d in g   au th o r ,   YAP.       RE F E R E NC E S   [ 1 ]   M .   L i ma,   R .   C o s t a ,   I .   R o d r i g u e s,   J .   La me i r a s,   a n d   G .   B o t e l h o ,   A   n a r r a t i v e   r e v i e w   o f   a l t e r n a t i v e   p r o t e i n   s o u r c e s:   h i g h l i g h t s   on  mea t ,   f i s h ,   e g g   a n d   d a i r y   a n a l o g u e s,”   Fo o d s ,   v o l .   1 1 ,   n o .   1 4 ,   2 0 2 2 ,   d o i :   1 0 . 3 3 9 0 / f o o d s 1 1 1 4 2 0 5 3 .   [ 2 ]   M .   M o l f e t t a   e t   a l . ,   P r o t e i n   s o u r c e s   a l t e r n a t i v e   t o   me a t :   s t a t e   o f   t h e   a r t   a n d   i n v o l v e me n t   o f   f e r m e n t a t i o n ,   F o o d s ,   v o l .   1 1 ,   n o .   1 4 ,   2 0 2 2 ,   d o i :   1 0 . 3 3 9 0 / f o o d s1 1 1 4 2 0 6 5 .   [ 3 ]   B .   F l e t c h e r   e t   a l . ,   A d v a n c e s   i n   m e a t   s p o i l a g e   d e t e c t i o n :   a   sh o r t   f o c u o n   r a p i d   m e t h o d s   a n d   t e c h n o l o g i e s ,   C Y T A - J o u r n a l   o f   Fo o d ,   v o l .   1 6 ,   n o .   1 ,   p p .   1 0 3 7 1 0 4 4 ,   2 0 1 8 ,   d o i :   1 0 . 1 0 8 0 / 1 9 4 7 6 3 3 7 . 2 0 1 8 . 1 5 2 5 4 3 2 .     Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l     I SS N:   2722 - 3 2 2 1       E ffects o f h yp erp a r a mete r   tu n in g   o n   r a n d o fo r est r eg r es s o r   in   th b ee q u a lity    ( R id w a n   R a a fi'u d i n )   167   [ 4 ]   V .   Te ss o n ,   M .   F e d e r i g h i ,   E.   C u mm i n s,  J.  d e   O .   M o t a ,   S .   G u i l l o u ,   a n d   G .   B o u é ,   A   s y s t e m a t i c   r e v i e w   o f   b e e f   mea t   q u a n t i t a t i v e   mi c r o b i a l   r i s k   a ss e ssm e n t   mo d e l s,   I n t e rn a t i o n a l   J o u r n a l   o f   En v i r o n m e n t a l   Re se a r c h   a n d   Pu b l i c   H e a l t h ,   v o l .   1 7 ,   n o .   3 ,   2 0 2 0 ,     d o i :   1 0 . 3 3 9 0 / i j e r p h 1 7 0 3 0 6 8 8 .   [ 5 ]   W .   B a r r a g á n - H e r n á n d e z ,   L.   M a h e c h a - Le d e sma,   J.  A n g u l o - A r i z a l a ,   a n d   M .   O l i v e r a - A n g e l ,   N e a r - i n f r a r e d   s p e c t r o sc o p y   a a   b e e f   q u a l i t y   t o o l   t o   p r e d i c t   c o n s u mer   a c c e p t a n c e ,   Fo o d s ,   v o l .   9 ,   n o .   8 ,   2 0 2 0 ,   d o i :   1 0 . 3 3 9 0 / f o o d s 9 0 8 0 9 8 4 .   [ 6 ]   G .   R i p o l l   e t   a l . ,   N e a r - i n f r a r e d   r e f l e c t a n c e   s p e c t r o s c o p y   f o r   p r e d i c t i n g   t h e   p h o s p h o l i p i d   f r a c t i o n   a n d   t h e   t o t a l   f a t t y   a c i d   c o m p o si t i o n   o f   f r e e z e - d r i e d   b e e f ,   S e n so rs ,   v o l .   2 1 ,   n o .   1 2 202 1 ,   d o i 1 0 . 3 3 9 0 / s2 1 1 2 4 2 3 0 .   [ 7 ]   A .   S a h a r   e t   a l . ,   O n l i n e   p r e d i c t i o n   o f   p h y s i c o - c h e mi c a l   q u a l i t y   a t t r i b u t e s   o f   b e e f   u s i n g   v i s i b l e - n e a r - i n f r a r e d   s p e c t r o s c o p y   a n d   c h e mo m e t r i c s,   F o o d s ,   v o l .   8 ,   n o .   1 1 ,   2 0 1 9 ,   d o i :   1 0 . 3 3 9 0 / f o o d s8 1 1 0 5 2 5 .   [ 8 ]   N .   P a t e l ,   H .   T o l e d o - A l v a r a d o ,   A .   C e c c h i n a t o ,   a n d   G .   B i t t a n t e ,   P r e d i c t i n g   t h e   c o n t e n t   o f   2 0   m i n e r a l i n   b e e f   b y   d i f f e r e n t   p o r t a b l e   n e a r - i n f r a r e d   ( N I R )   sp e c t r o m e t e r s ,   F o o d s ,   v o l .   9 ,   n o .   1 0 ,   2 0 2 0 ,   d o i :   1 0 . 3 3 9 0 / f o o d s 9 1 0 1 3 8 9 .   [ 9 ]   S .   S a v o i a   e t   a l . ,   P r e d i c t i o n   o f   mea t   q u a l i t y   t r a i t i n   t h e   a b a t t o i r   u si n g   p o r t a b l e   a n d   h a n d - h e l d   n e a r - i n f r a r e d   sp e c t r o me t e r s ,   M e a t   S c i e n c e ,   v o l .   1 6 1 ,   2 0 2 0 ,   d o i :   1 0 . 1 0 1 6 / j . me a t s c i . 2 0 1 9 . 1 0 8 0 1 7 .   [ 1 0 ]   S .   S a v o i a ,   A .   A l b e r a ,   A .   B r u g i a p a g l i a ,   L.   D i   S t a si o ,   A .   C e c c h i n a t o ,   a n d   G .   B i t t a n t e ,   P r e d i c t i o n   o f   me a t   q u a l i t y   t r a i t i n   t h a b a t t o i r   u si n g   p o r t a b l e   n e a r - i n f r a r e d   sp e c t r o m e t e r s:   h e r i t a b i l i t y   o f   p r e d i c t e d   t r a i t s   a n d   g e n e t i c   c o r r e l a t i o n w i t h   l a b o r a t o r y - mea s u r e d   t r a i t s,”   J o u r n a l   o f   A n i m a l   S c i e n c e   a n d   Bi o t e c h n o l o g y ,   v o l .   1 2 ,   n o .   1 ,   2 0 2 1 ,   d o i :   1 0 . 1 1 8 6 / s4 0 1 0 4 - 0 2 1 - 0 0 5 5 5 - 5.   [ 1 1 ]   I .   M .   N .   P e r e z ,   L.   J .   P .   C r u z - T i r a d o ,   A .   T.   B a d a r ó ,   M .   M .   d e   O l i v e i r a ,   a n d   D .   F .   B a r b i n ,   P r e se n t   a n d   f u t u r e   o f   p o r t a b l e / h a n d h e l d   n e a r - i n f r a r e d   s p e c t r o sc o p y   i n   c h i c k e n   mea t   i n d u st r y ,   N I n e w s ,   v o l .   3 0 ,   n o .   5 6 ,   p p .   2 6 2 9 ,   2 0 1 9 ,     d o i :   1 0 . 1 1 7 7 / 0 9 6 0 3 3 6 0 1 9 8 6 1 4 7 6 .   [ 1 2 ]   M .   S i mo n i ,   A .   G o i ,   M .   D e   M a r c h i ,   a n d   F .   R i g h i ,   T h e   u se  o f   v i si b l e / n e a r - i n f r a r e d   s p e c t r o sc o p y   t o   p r e d i c t   f i b r e   f r a c t i o n s ,     f i b r e - b o u n d   n i t r o g e n   a n d   t o t a l - t r a c t   a p p a r e n t   n u t r i e n t s   d i g e s t i b i l i t y   i n   b e e f   c a t t l e   d i e t a n d   f a e c e s ,   I t a l i a n   J o u r n a l   o f   A n i m a l   S c i e n c e ,   v o l .   2 0 ,   n o .   1 ,   p p .   8 1 4 8 2 5 ,   2 0 2 1 ,   d o i :   1 0 . 1 0 8 0 / 1 8 2 8 0 5 1 X . 2 0 2 1 . 1 9 2 4 8 8 4 .   [ 1 3 ]   C .   N .   S á n c h e z ,   M .   T .   O r v a ñ a n o s - G u e r r e r o ,   J .   D o n g u e z - S o b e r a n e s,   a n d   Y .   M .   Á l v a r e z - C i s n e r o s,   A n a l y s i o f   b e e f   q u a l i t y   a c c o r d i n g   t o   c o l o r   c h a n g e u si n g   c o mp u t e r   v i si o n   a n d   w h i t e - b o x   ma c h i n e   l e a r n i n g   t e c h n i q u e s ,   H e l i y o n ,   v o l .   9 ,   n o .   7 ,   2 0 2 3 ,     d o i :   1 0 . 1 0 1 6 / j . h e l i y o n . 2 0 2 3 . e 1 7 9 7 6 .   [ 1 4 ]   T.   Q i a o ,   J.   R e n ,   C .   C r a i g i e ,   J.  Z a b a l z a ,   C .   M a l t i n ,   a n d   S .   M a r sh a l l ,   Q u a n t i t a t i v e   p r e d i c t i o n   o f   b e e f   q u a l i t y   u si n g   v i s i b l e   a n d   N I R   sp e c t r o sc o p y   w i t h   l a r g e   d a t a   s a mp l e s   u n d e r   i n d u st r y   c o n d i t i o n s,   J o u r n a l   o f   A p p l i e d   S p e c t r o s c o p y ,   v o l .   8 2 ,   n o .   1 ,   p p .   1 3 7 1 4 4 ,   2 0 1 5 ,   d o i :   1 0 . 1 0 0 7 / s1 0 8 1 2 - 0 1 5 - 0 0 7 6 - 1.   [ 1 5 ]   G .   B i a u   a n d   E .   S c o r n e t ,   A   r a n d o m f o r e st   g u i d e d   t o u r ,   T e st ,   v o l .   2 5 ,   n o .   2 ,   p p .   1 9 7 2 2 7 ,   2 0 1 6 ,   d o i :   1 0 . 1 0 0 7 / s 1 1 7 4 9 - 0 1 6 - 0 4 8 1 - 7.   [ 1 6 ]   H .   P u ,   J.  Y u ,   D .   W .   S u n ,   Q .   W e i ,   X .   S h e n ,   a n d   Z.   W a n g ,   D i st i n g u i s h i n g   f r e s h   a n d   f r o z e n - t h a w e d   b e e f   u s i n g   h y p e r s p e c t r a l   i ma g i n g   t e c h n o l o g y   c o mb i n e d   w i t h   c o n v o l u t i o n a l   n e u r a l   n e t w o r k s ,   Mi c r o c h e m i c a l   J o u r n a l ,   v o l .   1 8 9 ,   2 0 2 3 ,     d o i :   1 0 . 1 0 1 6 / j . m i c r o c . 2 0 2 3 . 1 0 8 5 5 9 .   [ 1 7 ]   R .   K a s a r d a ,   N .   M o r a v č í k o v á ,   G .   M é szá r o s ,   M .   S i mči č ,   a n d   D .   Za b o r s k i ,   C l a ss i f i c a t i o n   o f   c a t t l e   b r e e d b a se d   o n   t h e   r a n d o m   f o r e st   a p p r o a c h ,   L i v e st o c k   S c i e n c e ,   v o l .   2 6 7 ,   2 0 2 3 ,   d o i :   1 0 . 1 0 1 6 / j . l i v sc i . 2 0 2 2 . 1 0 5 1 4 3 .   [ 1 8 ]   Y .   Li n ,   J.  M a ,   D .   W .   S u n ,   J.  H .   C h e n g ,   a n d   Q .   W a n g ,   A   p H - R e sp o n si v e   c o l o u r i m e t r i c   se n so r   a r r a y   b a se d   o n   mac h i n e   l e a r n i n g   f o r   r e a l - t i me  m o n i t o r i n g   o f   b e e f   f r e sh n e ss ,   Fo o d   C o n t r o l ,   v o l .   1 5 0 ,   2 0 2 3 ,   d o i :   1 0 . 1 0 1 6 / j . f o o d c o n t . 2 0 2 3 . 1 0 9 7 2 9 .   [ 1 9 ]   F .   P e d r e g o s a   e t   a l . ,   S c i k i t - l e a r n :   m a c h i n e   l e a r n i n g   i n   P y t h o n ,   J o u rn a l   o f   M a c h i n e   L e a r n i n g   R e se a rc h ,   v o l .   1 2 ,   p p .   2 8 2 5 2 8 3 0 ,   2 0 1 1 .   [ 2 0 ]   P .   P r o b s t ,   M .   N .   W r i g h t ,   a n d   A .   L .   B o u l e st e i x ,   H y p e r p a r a me t e r a n d   t u n i n g   st r a t e g i e s fo r   r a n d o m f o r e st ,   W i l e y   I n t e r d i sci p l i n a r y   Re v i e w s:   D a t a   M i n i n g   a n d   K n o w l e d g e   D i s c o v e ry ,   v o l .   9 ,   n o .   3 ,   2 0 1 9 ,   d o i :   1 0 . 1 0 0 2 / w i d m . 1 3 0 1 .   [ 2 1 ]   S .   B e r n a r d ,   L.   H e u t t e ,   a n d   S .   A d a m,  I n f l u e n c e   o f   h y p e r p a r a me t e r o n   r a n d o m   f o r e st   a c c u r a c y ,   i n   M u l t i p l e   C l a ssi f i e S y s t e m s B e r l i n ,   H e i d e l b e r g :   S p r i n g e r ,   2 0 0 9 ,   p p .   1 7 1 1 8 0 ,   d o i :   1 0 . 1 0 0 7 / 9 7 8 - 3 - 6 4 2 - 0 2 3 2 6 - 2 _ 1 8 .   [ 2 2 ]   S c i k i t   L e a rn R a n d o mi z e d se a r c h C V ,   S c i k i t   L e a rn .   A c c e s se d :   M a y   1 7 ,   2 0 2 4 .   [ O n l i n e ] .   A v a i l a b l e :   h t t p s : / / sci k i t - l e a r n . o r g / st a b l e / mo d u l e s/ g e n e r a t e d / sk l e a r n . m o d e l _ s e l e c t i o n . R a n d o mi z e d S e a r c h C V . h t m l .   [ 2 3 ]   R .   R a a f i u d i n ,   Y .   A .   P u r w a n t o ,   I .   S .   S i t a n g g a n g ,   a n d   D .   A .   A st u t i ,   F e a t u r e   se l e c t i o n   mo d e l   d e v e l o p me n t   o n   n e a r - i n f r a r e d   sp e c t r o sc o p y   d a t a ,   I n t e r n a t i o n a l   J o u rn a l   o f   A d v a n c e d   C o m p u t e S c i e n c e   a n d   A p p l i c a t i o n s ,   v o l .   1 5 ,   n o .   1 ,   2 0 2 4 ,     d o i :   1 0 . 1 4 5 6 9 / i j a c sa . 2 0 2 4 . 0 1 5 0 1 6 3 .   [ 2 4 ]   S c i k i t   L e a r n R a n d o mF o r e st R e g r e sso r ,   S c i k i t   L e a rn .   A c c e sse d :   M a y   1 7 ,   2 0 2 4 .   [ O n l i n e ] .   A v a i l a b l e :   h t t p s: / / sc i k i t - l e a r n . o r g / st a b l e / mo d u l e s/ g e n e r a t e d / sk l e a r n . e n s e mb l e . R a n d o mF o r e st R e g r e ss o r . h t m l .   [ 2 5 ]   D .   C h i c c o ,   M .   J .   W a r r e n s,  a n d   G .   Ju r man ,   Th e   c o e f f i c i e n t   o f   d e t e r mi n a t i o n   R - sq u a r e d   i s   m o r e   i n f o r ma t i v e   t h a n   S M A P E ,   M A E,   M A P E,   M S a n d   R M S i n   r e g r e ssi o n   a n a l y s i e v a l u a t i o n ,   P e e rJ  C o m p u t e S c i e n c e ,   v o l .   7 ,   p p .   1 2 4 ,   2 0 2 1 ,     d o i :   1 0 . 7 7 1 7 / P EER J - C S . 6 2 3 .   [ 2 6 ]   A .   C h u g h ,   M A E,   M S E ,   R M S E,   c o e f f i c i e n t   o f   d e t e r m i n a t i o n ,   a d j u st e d   R   sq u a r e d w h i c h   me t r i c   i b e t t e r ,   Me d i u m 2 0 2 0 .   A c c e ss e d :   N o v   1 1 ,   2 0 2 4 .   [ O n l i n e ] .   A v a i l a b l e :   h t t p s : / / me d i u m. c o m/ a n a l y t i c s - v i d h y a / ma e - mse - r mse - c o e f f i c i e n t - of - d e t e r m i n a t i o n - a d j u s t e d - r - sq u a r e d - w h i c h - me t r i c - is - b e t t e r - c d 0 3 2 6 a 5 6 9 7 e .       B I O G RAP H I E S O F   AUTH O RS       Rid wa n   Ra a fi' u d in           re c e iv e d   a   B . S c .   d e g re e   fro m   Un i v e rsit a P e m b a n g u n a n   Na sio n a Ve tera n   Ja k a rta  i n   2 0 0 9   a n d   a n   M . C o m .   d e g re e   fro m   Un iv e rsitas   Bu d Lu h u i n   2 0 1 4 ,   a n d   n o a   P h . D.   stu d e n t   a IP Un iv e rsity .   C u rre n tl y ,   h e   is  a   lec tu re r   in   c o m p u ter  sc ien c e   a Un iv e rsitas   P e m b a n g u n a n   Na sio n a Ve tera n   Ja k a rta.  His  re se a r c h   in tere sts  in c lu d e   a rti ficia in telli g e n c e ,   m a c h in e   lea rn in g ,   d e e p   lea rn i n g ,   d a ta  m i n i n g ,   a n d   e m b e d d e d   sy ste m s.   He   c a n   b e   c o n tac ted   a e m a il ri d wa n ra a fiu d in @a p p s.i p b . a c . i d .       Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.
                      I SS N :   2 7 2 2 - 3 2 2 1   C o m p u t Sci  I n f   T ec h n o l ,   Vo l.  6 ,   No .   2 J u ly   20 25 159 - 1 6 8   168     Yo h a n e Ar is  P u r wa n to           re c e iv e d   a   B. En g .   fr o m   IP U n iv e rsi ty   i n   1 9 8 6 ,   M . S c .   a n d   P h . D.  d e g re e s fro m   th e   Un iv e rsity   o To k y o   in   1 9 9 7   a n d   2 0 0 0 .   Cu rre n tl y ,   h e   is a p ro fe ss o r   a IP Un iv e rsit y .   His res e a rc h   in tere sts in c lu d e   a g ric u lt u ra e n g i n e e rin g ,   b io d ies e p r o d u c ti o n ,   NIR,  p a rti a l   lea st  sq u a re s,  sp e c tr o sc o p y   b io p ro c e ss   e n g in e e rin g ,   P LS   b io fu e ls  i n fra re d   n e a r - in fra re d   sp e c tro sc o p y ,   b i o sy ste m   e n g in e e rin g ,   n o n - d e stru c ti v e   m e a su re m e n t,   fin e   b u b b le   tec h n o l o g y ,   a n d   p o sth a rv e st   e n g i n e e rin g .   He   c a n   b e   c o n tac ted   a t   e m a il :   a risp u rwa n to @a p p s.i p b . a c . id .         Im a s S u k a e sih   S ita n g g a n g           re c e iv e d   a   P h . D .   d e g re e   in   c o m p u te sc ien c e   fro m   t h e   F a c u lt y   o Co m p u ter S c ien c e   a n d   In fo rm a ti o n   Tec h n o lo g y ,   Un i v e rsiti   P u tra M a lay sia ,   i n   2 0 1 3 .   S h e   is  a   lec tu re in   De p a rtme n o Co m p u ter  S c ien c e ,   IP U n iv e rsity ,   In d o n e sia .   He m a in   re se a rc h   in tere sts  in c lu d e   sp a ti a l   d a ta  m in in g   a n d   sm a rt  a g ricu lt u re .   S h e   c a n   b e   c o n tac ted   a t   e m a il ima s.sitan g g a n g @a p p s.i p b . a c . id .         De wi  Apri  As tu ti          re c e iv e d   a n   a n ima sc ien c e   d e g re e   fro m   U n iv e rsitas   G a d jah   M a d a   in   1 9 8 4 ,   a   m a ste in   a m in a n u tri t io n   d e g re e   fro m   IP Un iv e rsity   in   1 9 8 8 ,   a n d   a   P h . D.  i n   n u tri t io n   fr o m   IP U n iv e rsit y   i n   1 9 9 5 .   C u rre n tl y ,   s h e   is  a   p ro fe s so a IP B   Un i v e rsity .   He re se a rc h   in tere sts  in c lu d e   a n ima n u tri ti o n .   S h e   c a n   b e   c o n tac ted   a e m a il :   d e wia a @a p p s.ip b . a c . id .     Evaluation Warning : The document was created with Spire.PDF for Python.